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seq2 = pF1KB8615/gi568815596f_200289245.tfa (gi568815596f:200289245_200578028), 288784 bp

>pF1KB8615 1464
>gi568815596f:200289245_200578028 (Chr2)

1-39  (100001-100039)   100% ->
40-148  (123067-123175)   100% ->
149-195  (127135-127184)   94% ->
196-442  (130006-130252)   100% ->
443-578  (151405-151540)   100% ->
579-637  (170525-170583)   100% ->
638-747  (178046-178155)   100% ->
748-850  (180670-180772)   100% ->
851-1071  (183588-183808)   100% ->
1072-1464  (188392-188784)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCTGAACTCAATACTCATGTGAATGTCAAGGAAAAG         AT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 100001 ATGGCTGAACTCAATACTCATGTGAATGTCAAGGAAAAGGTA...CAGAT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     42 CTATGCAGTTAGATCAGTTGTTCCCAACAAAAGCAATAATGAAATAGTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123069 CTATGCAGTTAGATCAGTTGTTCCCAACAAAAGCAATAATGAAATAGTCC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 TGGTGCTCCAACAGTTTGATTTTAATGTGGATAAAGCCGTGCAAGCCTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123119 TGGTGCTCCAACAGTTTGATTTTAATGTGGATAAAGCCGTGCAAGCCTTT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GTGGATG         GCAGTGCAATTCAAGTTCTAAAAGAATGGAATAT
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123169 GTGGATGGTA...TAGGCAGTGCAATTCAAGTTCTAAAAGAATGGAATAT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 GACAGGAAA   GAAG         AACAATAAAAGAAAAAGAAGCAAGT
        |||||||||---||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 127169 GACAGGAAAAAAGAAGGTA...TAGAACAATAAAAGAAAAAGAAGCAAGT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    221 CCAAGCAGCATCAAGGCAACAAAGATGCTAAAGACAAGGTGGAGAGGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130031 CCAAGCAGCATCAAGGCAACAAAGATGCTAAAGACAAGGTGGAGAGGCCT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    271 GAGGCAGGGCCCCTGCAGCCGCAGCCACCACAGATTCAAAACGGCCCCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130081 GAGGCAGGGCCCCTGCAGCCGCAGCCACCACAGATTCAAAACGGCCCCAT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    321 GAATGGCTGCGAGAAGGACAGCTCGTCCACAGATTCTGCTAACGAAAAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130131 GAATGGCTGCGAGAAGGACAGCTCGTCCACAGATTCTGCTAACGAAAAAC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    371 CAGCCCTTATCCCTCGTGAGAAAAAGATCTCGATACTTGAGGAACCTTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130181 CAGCCCTTATCCCTCGTGAGAAAAAGATCTCGATACTTGAGGAACCTTCA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    421 AAGGCACTTCGTGGGGTCACAG         GCCCAAATATTGAGAAATC
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 130231 AAGGCACTTCGTGGGGTCACAGGTC...TAGGCCCAAATATTGAGAAATC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    462 AGTGAAGGATTTGCAACGCTGCACCGTTTCTCTAACTAGATATCGCGTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 151424 AGTGAAGGATTTGCAACGCTGCACCGTTTCTCTAACTAGATATCGCGTCA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    512 TGATTAAGGAAGAAGTGGATAGTTCCGTGAAGAAGATCAAAGCTGCCTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 151474 TGATTAAGGAAGAAGTGGATAGTTCCGTGAAGAAGATCAAAGCTGCCTTT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    562 GCTGAATTACACAACTG         CATCATTGACAAAGAAGTTTCATT
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 151524 GCTGAATTACACAACTGGTG...CAGCATCATTGACAAAGAAGTTTCATT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    603 AATGGCAGAAATGGATAAAGTTAAAGAAGAAGCCA         TGGAAA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 170549 AATGGCAGAAATGGATAAAGTTAAAGAAGAAGCCAGTA...CAGTGGAAA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    644 TCCTGACTGCTCGTCAGAAGAAAGCAGAAGAACTAAAGAGACTCACTGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 178052 TCCTGACTGCTCGTCAGAAGAAAGCAGAAGAACTAAAGAGACTCACTGAC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    694 CTTGCCAGTCAGATGGCAGAGATGCAGCTGGCCGAACTCAGGGCAGAAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 178102 CTTGCCAGTCAGATGGCAGAGATGCAGCTGGCCGAACTCAGGGCAGAAAT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    744 TAAG         CACTTTGTCAGCGAGCGTAAATATGACGAGGAGCTCG
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 178152 TAAGGTC...CAGCACTTTGTCAGCGAGCGTAAATATGACGAGGAGCTCG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    785 GGAAAGCTGCCCGGTTTTCCTGTGACATCGAACAGCTGAAGGCCCAAATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 180707 GGAAAGCTGCCCGGTTTTCCTGTGACATCGAACAGCTGAAGGCCCAAATC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    835 ATGCTCTGCGGAGAAA         TTACACATCCAAAGAACAACTATTC
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 180757 ATGCTCTGCGGAGAAAGTG...CAGTTACACATCCAAAGAACAACTATTC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    876 CTCAAGAACTCCCTGCAGCTCCCTGCTGCCTCTGCTGAATGCGCACGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 183613 CTCAAGAACTCCCTGCAGCTCCCTGCTGCCTCTGCTGAATGCGCACGCAG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    926 CAACCTCTGGGAAACAGAGTAACTTTTCCCGAAAATCATCCACTCACAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 183663 CAACCTCTGGGAAACAGAGTAACTTTTCCCGAAAATCATCCACTCACAAT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    976 AAGCCCTCTGAAGGCAAAGCGGCAAACCCCAAAATGGTGAGCAGTCTCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 183713 AAGCCCTCTGAAGGCAAAGCGGCAAACCCCAAAATGGTGAGCAGTCTCCC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1026 CAGCACCGCCGACCCCTCTCACCAGACCATGCCGGCCAACAAGCAG    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 183763 CAGCACCGCCGACCCCTCTCACCAGACCATGCCGGCCAACAAGCAGGTA.

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1072      AATGGATCTTCTAACCAAAGACGGAGATTTAATCCACAGTATCAT
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 183813 ..TAGAATGGATCTTCTAACCAAAGACGGAGATTTAATCCACAGTATCAT

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1117 AACAACAGGCTAAATGGGCCTGCCAAGTCGCAGGGCAGTGGGAATGAAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 188437 AACAACAGGCTAAATGGGCCTGCCAAGTCGCAGGGCAGTGGGAATGAAGC

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1167 CGAGCCACTGGGAAAGGGCAACAGCCGCCACGAACACAGAAGACAGCCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 188487 CGAGCCACTGGGAAAGGGCAACAGCCGCCACGAACACAGAAGACAGCCGC

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1217 ACAACGGCTTCCGGCCCAAAAACAAAGGCGGTGCCAAAAATCAAGAGGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 188537 ACAACGGCTTCCGGCCCAAAAACAAAGGCGGTGCCAAAAATCAAGAGGCT

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1267 TCCTTGGGGATGAAGACCCCCGAGGCCCCGGCCCATTCTGAAAAGCCCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 188587 TCCTTGGGGATGAAGACCCCCGAGGCCCCGGCCCATTCTGAAAAGCCCCG

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1317 GCGAAGGCAGCACGCTGCAGACACCTCGGAGGCCAGGCCCTTCCGGGGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 188637 GCGAAGGCAGCACGCTGCAGACACCTCGGAGGCCAGGCCCTTCCGGGGTA

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1367 GTGTCGGTAGGGTTTCACAGTGCAATCTCTGCCCCACGAGAATAGAAGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 188687 GTGTCGGTAGGGTTTCACAGTGCAATCTCTGCCCCACGAGAATAGAAGTT

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .
   1417 TCCACAGATGCAGCAGTTCTCTCAGTCCCGGCTGTGACGTTGGTGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 188737 TCCACAGATGCAGCAGTTCTCTCAGTCCCGGCTGTGACGTTGGTGGCC