seq1 = pF1KB8602.tfa, 636 bp
seq2 = pF1KB8602/gi568815596r_237475022.tfa (gi568815596r:237475022_237686102), 211081 bp

>pF1KB8602 636
>gi568815596r:237475022_237686102 (Chr2)

(complement)

1-157  (99949-100105)   100% ->
158-309  (107948-108099)   100% ->
310-435  (108721-108846)   100% ->
436-529  (110623-110716)   98% ->
530-636  (110975-111081)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCACAGGCACACAGGACCCCCCAGCCCAGGGCTGCCCCCAGCCAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  99949 ATGGCACAGGCACACAGGACCCCCCAGCCCAGGGCTGCCCCCAGCCAGCC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CCGTGTGTTCAAGCTGGTTCTCCTGGGAAGTGGCTCCGTGGGTAAGTCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  99999 CCGTGTGTTCAAGCTGGTTCTCCTGGGAAGTGGCTCCGTGGGTAAGTCCA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GCTTGGCTCTTCGGTACGTGAAGAACGACTTCAAGAGTATCCTGCCTACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100049 GCTTGGCTCTTCGGTACGTGAAGAACGACTTCAAGAGTATCCTGCCTACG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GTGGGCT         GTGCGTTCTTCACAAAGGTGGTGGATGTGGGTGC
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100099 GTGGGCTGTA...CAGGTGCGTTCTTCACAAAGGTGGTGGATGTGGGTGC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CACCTCTCTGAAGCTTGAGATCTGGGACACAGCTGGCCAGGAGAAGTACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107982 CACCTCTCTGAAGCTTGAGATCTGGGACACAGCTGGCCAGGAGAAGTACC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 ACAGCGTCTGCCACCTCTACTTCAGGGGTGCCAACGCTGCGCTTCTGGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108032 ACAGCGTCTGCCACCTCTACTTCAGGGGTGCCAACGCTGCGCTTCTGGTG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 TACGACATCACCAGGAAG         GATTCCTTCCTCAAGGCTCAGCA
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 108082 TACGACATCACCAGGAAGGTA...TAGGATTCCTTCCTCAAGGCTCAGCA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 GTGGCTGAAGGACCTGGAGGAGGAGCTGCACCCAGGAGAAGTCCTGGTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108744 GTGGCTGAAGGACCTGGAGGAGGAGCTGCACCCAGGAGAAGTCCTGGTGA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 TGCTGGTGGGCAACAAGACGGACCTCAGCCAGGAGCGGGAGGTGACCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108794 TGCTGGTGGGCAACAAGACGGACCTCAGCCAGGAGCGGGAGGTGACCTTC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 CAG         GAAGGGAAGGAGTTTGCCGACAGCCAGAAGTTGCCGTT
        |||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
 108844 CAGGTA...CAGGAAGGGAAGGAGTTTGCCGACAGCCAGAAGTTGCTGTT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 CATGGAAACTTCGGCCAAACTGAACCACCAGGTGTCGGAGGTGTTCAATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110661 CATGGAAACTTCGGCCAAACTGAACCACCAGGTGTCGGAGGTGTTCAATA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 CAGTGG         CCCAAGAGCTACTGCAGAGAAGCGACGAGGAGGGC
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110711 CAGTGGGTG...CAGCCCAAGAGCTACTGCAGAGAAGCGACGAGGAGGGC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 CAGGCTCTACGGGGGGATGCAGCTGTGGCTCTGAACAAGGGGCCCGCGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111010 CAGGCTCTACGGGGGGATGCAGCTGTGGCTCTGAACAAGGGGCCCGCGAG

    650     .    :    .    :
    615 GCAGGCCAAATGCTGCGCCCAC
        ||||||||||||||||||||||
 111060 GCAGGCCAAATGCTGCGCCCAC