seq1 = pF1KB8590.tfa, 1035 bp
seq2 = pF1KB8590/gi568815588f_84041501.tfa (gi568815588f:84041501_84252345), 210845 bp

>pF1KB8590 1035
>gi568815588f:84041501_84252345 (Chr10)

1-129  (100001-100129)   99% ->
130-229  (101155-101254)   99% ->
230-341  (102495-102606)   100% ->
342-483  (103375-103516)   99% ->
484-592  (107230-107338)   99% ->
593-781  (108555-108743)   100% ->
782-953  (109209-109380)   100% ->
954-1035  (110764-110845)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTTGGCTGTAAGGCTGGTGTGTCTCCGGACACTACCTTCTAGGGTTTT
        |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTTGGCTGCAAGGCTGGTGTGTCTCCGGACACTACCTTCTAGGGTTTT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CCACCCAGCTTTCACCAAGGCCTCCCCTGTTGTGAAGAATTCCATCACGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CCACCCAGCTTTCACCAAGGCCTCCCCTGTTGTGAAGAATTCCATCACGA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 AGAATCAATGGCTGTTAACACCTAGCAGG         GAATATGCCACC
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 100101 AGAATCAATGGCTGTTAACACCTAGCAGGGTA...CAGGAATATGCCACC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 AAAACAAGAATTGGGATCCGGCGTGGGAGAACTGGCCAAGAACTCAAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101167 AAAACAAGAATTGGGATCCGGCGTGGGAGAACTGGCCAAGAACTCAAAGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 GGCAGCATTGGAACCATCGATGGAAAAAATGTTTAAAA         TTG
        |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||>>>...>>>|||
 101217 GGCAGCATTGGAACCATCGATGGAAAAAATATTTAAAAGTA...CAGTTG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 ATCAGATGGGAAGATGGTTTGTTGCTGGAGGGGCTGCTGTTGGTCTTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102498 ATCAGATGGGAAGATGGTTTGTTGCTGGAGGGGCTGCTGTTGGTCTTGGA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 GCATTGTGCTACTATGGCTTGGGACTGTCTAATGAGATTGGAGCTATTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102548 GCATTGTGCTACTATGGCTTGGGACTGTCTAATGAGATTGGAGCTATTGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 AAAGGCTGT         AATTTGGCCTCGGTATGTCAAGGATAGAATTC
        |||||||||>>>...>>>||||||||||| ||||||||||||||||||||
 102598 AAAGGCTGTGTA...CAGAATTTGGCCTCAGTATGTCAAGGATAGAATTC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 ATTCCACCTATATGTACTTAGCAGGGAGTATTGGTTTAACAGCTTTGTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103407 ATTCCACCTATATGTACTTAGCAGGGAGTATTGGTTTAACAGCTTTGTCT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 GCCATAGCAATCAGCAGAACGCCTGTTCTCATGAACTTCATGATGAGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103457 GCCATAGCAATCAGCAGAACGCCTGTTCTCATGAACTTCATGATGAGAGG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 CTCTTGGGTG         ACAATTGGTGTGACCTTTGCAGCCATGGTTG
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 103507 CTCTTGGGTGGTA...CAGACAATTGGTGTGACCTTTGCAGCCATGGTTG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 GAGCTGGAATGCTGGTACGATCAATACCATATGACCAGAGCCCAGGCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107261 GAGCTGGAATGCTGGTACGATCAATACCATATGACCAGAGCCCAGGCCCA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 AAGCACCTTGCTTGGTTGCTACATTCTG         GTGTGATGGGTGC
        ||||| ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 107311 AAGCATCTTGCTTGGTTGCTACATTCTGGTA...CAGGTGTGATGGGTGC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 AGTGGTGGCTCCTCTGACAATATTAGGGGGTCCTCTTCTCATCAGAGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108568 AGTGGTGGCTCCTCTGACAATATTAGGGGGTCCTCTTCTCATCAGAGCTG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    656 CATGGTACACAGCTGGCATTGTGGGAGGCCTCTCCACTGTGGCCATGTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108618 CATGGTACACAGCTGGCATTGTGGGAGGCCTCTCCACTGTGGCCATGTGT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 GCGCCCAGTGAAAAGTTTCTGAACATGGGTGCACCCCTGGGAGTGGGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108668 GCGCCCAGTGAAAAGTTTCTGAACATGGGTGCACCCCTGGGAGTGGGCCT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 GGGTCTCGTCTTTGTGTCCTCATTGG         GATCTATGTTTCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 108718 GGGTCTCGTCTTTGTGTCCTCATTGGGTA...CAGGATCTATGTTTCTTC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    797 CACCTACCACCGTGGCTGGTGCCACTCTTTACTCAGTGGCAATGTACGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109224 CACCTACCACCGTGGCTGGTGCCACTCTTTACTCAGTGGCAATGTACGGT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    847 GGATTAGTTCTTTTCAGCATGTTCCTTCTGTATGATACCCAGAAAGTAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109274 GGATTAGTTCTTTTCAGCATGTTCCTTCTGTATGATACCCAGAAAGTAAT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    897 CAAGCGTGCAGAAGTATCACCAATGTATGGAGTTCAAAAATATGATCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109324 CAAGCGTGCAGAAGTATCACCAATGTATGGAGTTCAAAAATATGATCCCA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    947 TTAACTC         GATGCTGAGTATCTACATGGATACATTAAATATA
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109374 TTAACTCGTA...TAGGATGCTGAGTATCTACATGGATACATTAAATATA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .
    988 TTTATGCGAGTTGCAACTATGCTGGCAACTGGAGGCAACAGAAAGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110798 TTTATGCGAGTTGCAACTATGCTGGCAACTGGAGGCAACAGAAAGAAA