seq1 = pF1KB8589.tfa, 1074 bp
seq2 = pF1KB8589/gi568815592f_127186617.tfa (gi568815592f:127186617_127387690), 201074 bp

>pF1KB8589 1074
>gi568815592f:127186617_127387690 (Chr6)

1-1074  (100001-101074)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCTGGCTGTGGTGAAATTGATCATTCAATAAACATGCTTCCTACAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCTGGCTGTGGTGAAATTGATCATTCAATAAACATGCTTCCTACAAA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CAGGAAAGCGAACGAGTCCTGTTCTAATACTGCACCTTCTTTAACCGTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CAGGAAAGCGAACGAGTCCTGTTCTAATACTGCACCTTCTTTAACCGTCC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CTGAATGTGCCATTTGTCTGCAAACATGTGTTCATCCAGTCAGTCTGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CTGAATGTGCCATTTGTCTGCAAACATGTGTTCATCCAGTCAGTCTGCCC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 TGTAAGCACGTTTTCTGCTATCTATGTGTAAAAGGAGCTTCATGGCTTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 TGTAAGCACGTTTTCTGCTATCTATGTGTAAAAGGAGCTTCATGGCTTGG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 AAAGCGGTGTGCTCTTTGTCGACAAGAAATTCCCGAGGATTTCCTTGACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 AAAGCGGTGTGCTCTTTGTCGACAAGAAATTCCCGAGGATTTCCTTGACA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 AGCCAACCTTGTTGTCACCAGAAGAACTCAAGGCAGCAAGTAGAGGAAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 AGCCAACCTTGTTGTCACCAGAAGAACTCAAGGCAGCAAGTAGAGGAAAT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 GGTGAATATGCATGGTATTATGAAGGAAGAAATGGGTGGTGGCAGTACGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 GGTGAATATGCATGGTATTATGAAGGAAGAAATGGGTGGTGGCAGTACGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 TGAGCGCACTAGTAGAGAGCTGGAAGATGCTTTTTCCAAAGGTAAAAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 TGAGCGCACTAGTAGAGAGCTGGAAGATGCTTTTTCCAAAGGTAAAAAGA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 ACACTGAAATGTTAATTGCTGGCTTTCTGTATGTCGCTGATCTTGAAAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 ACACTGAAATGTTAATTGCTGGCTTTCTGTATGTCGCTGATCTTGAAAAC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 ATGGTTCAATATAGGAGAAATGAACATGGACGTCGCAGGAAGATTAAGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 ATGGTTCAATATAGGAGAAATGAACATGGACGTCGCAGGAAGATTAAGCG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 AGATATAATAGATATACCAAAGAAGGGAGTAGCTGGACTTAGGCTAGACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 AGATATAATAGATATACCAAAGAAGGGAGTAGCTGGACTTAGGCTAGACT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 GTGATGCTAATACCGTAAACCTAGCAAGAGAGAGCTCTGCTGACGGAGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 GTGATGCTAATACCGTAAACCTAGCAAGAGAGAGCTCTGCTGACGGAGCG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 GACAGTGTATCAGCACAGAGTGGAGCTTCTGTTCAGCCCCTAGTGTCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 GACAGTGTATCAGCACAGAGTGGAGCTTCTGTTCAGCCCCTAGTGTCTTC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 TGTAAGGCCCCTAACATCAGTAGATGGTCAGTTAACAAGCCCTGCAACAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 TGTAAGGCCCCTAACATCAGTAGATGGTCAGTTAACAAGCCCTGCAACAC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 CATCCCCTGATGCAAGCACTTCTCTGGAAGACTCTTTTGCTCATTTACAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 CATCCCCTGATGCAAGCACTTCTCTGGAAGACTCTTTTGCTCATTTACAA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 CTCAGTGGAGACAACACAGCTGAAAGGAGTCATAGGGGAGAAGGAGAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 CTCAGTGGAGACAACACAGCTGAAAGGAGTCATAGGGGAGAAGGAGAAGA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 AGATCATGAATCACCATCTTCAGGCAGGGTACCAGCACCAGACACCTCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 AGATCATGAATCACCATCTTCAGGCAGGGTACCAGCACCAGACACCTCCA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 TTGAAGAAACTGAATCAGATGCCAGTAGTGATAGTGAGGATGTATCTGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 TTGAAGAAACTGAATCAGATGCCAGTAGTGATAGTGAGGATGTATCTGCA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 GTTGTTGCACAGCACTCCTTGACCCAACAGAGACTTTTGGTTTCTAATGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 GTTGTTGCACAGCACTCCTTGACCCAACAGAGACTTTTGGTTTCTAATGC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    951 AAACCAGACAGTACCCGATCGATCAGATCGATCGGGAACTGATCGATCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100951 AAACCAGACAGTACCCGATCGATCAGATCGATCGGGAACTGATCGATCAG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1001 TAGCAGGGGGTGGAACAGTGAGTGTCAGTGTCAGATCTAGAAGGCCTGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101001 TAGCAGGGGGTGGAACAGTGAGTGTCAGTGTCAGATCTAGAAGGCCTGAT

   1050     .    :    .    :
   1051 GGACAGTGCACAGTAACTGAAGTT
        ||||||||||||||||||||||||
 101051 GGACAGTGCACAGTAACTGAAGTT