seq1 = pF1KB8581.tfa, 1566 bp
seq2 = pF1KB8581/gi568815579r_49808242.tfa (gi568815579r:49808242_50009807), 201566 bp

>pF1KB8581 1566
>gi568815579r:49808242_50009807 (Chr19)

(complement)

1-1566  (100001-101566)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAGCGGGTTTAATTTTGGAGGCACTGGGGCCCCTACAGGCGGGTTCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAGCGGGTTTAATTTTGGAGGCACTGGGGCCCCTACAGGCGGGTTCAC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GTTTGGCACTGCAAAGACGGCAACAACCACACCTGCTACAGGGTTTTCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GTTTGGCACTGCAAAGACGGCAACAACCACACCTGCTACAGGGTTTTCTT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TCTCCACCTCTGGCACTGGAGGGTTTAATTTTGGGGCTCCCTTCCAACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TCTCCACCTCTGGCACTGGAGGGTTTAATTTTGGGGCTCCCTTCCAACCA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GCCACAAGTACCCCTTCCACCGGCCTGTTCTCACTTGCCACCCAGACTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GCCACAAGTACCCCTTCCACCGGCCTGTTCTCACTTGCCACCCAGACTCC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GGCCACACAGACGACAGGCTTCACTTTTGGAACAGCGACTCTTGCTTCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 GGCCACACAGACGACAGGCTTCACTTTTGGAACAGCGACTCTTGCTTCGG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 GGGGAACTGGATTTTCTTTGGGGATCGGTGCTTCAAAGCTCAACTTGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 GGGGAACTGGATTTTCTTTGGGGATCGGTGCTTCAAAGCTCAACTTGAGC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 AACACAGCTGCCACCCCAGCCATGGCAAACCCCAGCGGCTTTGGGCTGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 AACACAGCTGCCACCCCAGCCATGGCAAACCCCAGCGGCTTTGGGCTGGG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CAGCAGCAACCTCACTAATGCCATATCGAGCACCGTCACCTCCAGCCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 CAGCAGCAACCTCACTAATGCCATATCGAGCACCGTCACCTCCAGCCAGG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 GCACAGCACCCACCGGCTTTGTGTTTGGCCCCTCCACCACCTCTGTGGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 GCACAGCACCCACCGGCTTTGTGTTTGGCCCCTCCACCACCTCTGTGGCT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 CCAGCTACCACATCTGGAGGCTTCTCATTCACTGGTGGAAGCACGGCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 CCAGCTACCACATCTGGAGGCTTCTCATTCACTGGTGGAAGCACGGCCCA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 ACCCTCCGGTTTCAACATTGGCTCAGCAGGGAATTCAGCCCAGCCCACGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 ACCCTCCGGTTTCAACATTGGCTCAGCAGGGAATTCAGCCCAGCCCACGG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 CACCTGCCACGTTGCCCTTCACTCCGGCCACGCCAGCAGCCACCACAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 CACCTGCCACGTTGCCCTTCACTCCGGCCACGCCAGCAGCCACCACAGCA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 GGTGCCACACAGCCAGCTGCTCCCACACCCACAGCCACCATCACCAGTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
 100601 GGTGCCACACAGCCAGCTGCTCCCACACCCACAGCCACCATCACCAGCAC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 TGGGCCCAGCCTCTTTGCGTCAATAGCAACTGCTCCAACCTCATCTGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 TGGGCCCAGCCTCTTTGCGTCAATAGCAACTGCTCCAACCTCATCTGCCA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 CCACTGGACTCTCCCTCTGTACCCCTGTGACCACAGCGGGCGCCCCCACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 CCACTGGACTCTCCCTCTGTACCCCTGTGACCACAGCGGGCGCCCCCACT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 GCTGGGACACAGGGCTTCAGCTTAAAGGCACCTGGAGCAGCTTCCGGCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 GCTGGGACACAGGGCTTCAGCTTAAAGGCACCTGGAGCAGCTTCCGGCAC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 CTCCACAACAACATCCACCGCTGCCACCGCCACCGCCACCACCACCACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
 100801 CTCCACAACAACATCCACCGCTGCCACCGCCACCGCCACCACCACCAGCA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 GCAGCAGCACCACCGGCTTTGCCTTGAATTTAAAACCACTGGCGCCAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 GCAGCAGCACCACCGGCTTTGCCTTGAATTTAAAACCACTGGCGCCAGCC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 GGGATCCCCAGCAATACAGCAGCTGCCGTGACCGCTCCACCTGGCCCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 GGGATCCCCAGCAATACAGCAGCTGCCGTGACCGCTCCACCTGGCCCTGG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    951 CGCAGCTGCAGGGGCGGCTGCCAGCTCCGCCATGACCTACGCGCAGCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100951 CGCAGCTGCAGGGGCGGCTGCCAGCTCCGCCATGACCTACGCGCAGCTGG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1001 AGAGCCTGATCAACAAATGGAGCCTGGAGCTAGAGGACCAGGAGCGGCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101001 AGAGCCTGATCAACAAATGGAGCCTGGAGCTAGAGGACCAGGAGCGGCAC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1051 TTCCTCCAGCAGGCCACCCAGGTCAACGCCTGGGACCGCACGCTGATCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101051 TTCCTCCAGCAGGCCACCCAGGTCAACGCCTGGGACCGCACGCTGATCGA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1101 GAATGGAGAAAAGATCACCAGCCTGCACCGCGAGGTGGAGAAGGTGAAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101101 GAATGGAGAAAAGATCACCAGCCTGCACCGCGAGGTGGAGAAGGTGAAGC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1151 TGGACCAGAAGAGGCTGGACCAGGAGCTCGACTTCATCCTGTCCCAGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101151 TGGACCAGAAGAGGCTGGACCAGGAGCTCGACTTCATCCTGTCCCAGCAG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1201 AAGGAGCTGGAAGACCTGCTGAGCCCACTGGAGGAGTTGGTCAAGGAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101201 AAGGAGCTGGAAGACCTGCTGAGCCCACTGGAGGAGTTGGTCAAGGAGCA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1251 GAGCGGGACCATCTACCTGCAGCACGCGGATGAGGAGCGTGAGAAAACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101251 GAGCGGGACCATCTACCTGCAGCACGCGGATGAGGAGCGTGAGAAAACCT

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1301 ACAAGCTGGCTGAGAACATCGACGCACAGCTCAAGCGCATGGCCCAGGAT
        |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
 101301 ACAAGCTGGCTGAGAACATCGATGCACAGCTCAAGCGCATGGCCCAGGAT

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1351 CTCAAGGACATCATCGAGCACCTGAACACGTCCGGGGCCCCCGCCGACAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101351 CTCAAGGACATCATCGAGCACCTGAACACGTCCGGGGCCCCCGCCGACAC

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1401 CAGTGACCCACTGCAGCAGATCTGCAAGATCCTCAATGCGCACATGGACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101401 CAGTGACCCACTGCAGCAGATCTGCAAGATCCTCAATGCGCACATGGACT

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1451 CACTGCAGTGGATCGACCAGAACTCGGCCCTGCTGCAGAGGAAGGTGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101451 CACTGCAGTGGATCGACCAGAACTCGGCCCTGCTGCAGAGGAAGGTGGAG

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1501 GAGGTGACCAAGGTGTGCGAGGGCCGGCGCAAGGAGCAGGAGCGCAGCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101501 GAGGTGACCAAGGTGTGCGAGGGCCGGCGCAAGGAGCAGGAGCGCAGCTT

   1550     .    :    .
   1551 CCGGATCACCTTTGAC
        ||||||||||||||||
 101551 CCGGATCACCTTTGAC