seq1 = pF1KB8579.tfa, 696 bp
seq2 = pF1KB8579/gi568815588f_72174217.tfa (gi568815588f:72174217_72375185), 200969 bp

>pF1KB8579 696
>gi568815588f:72174217_72375185 (Chr10)

1-205  (100001-100205)   100% ->
206-696  (100479-100969)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCCTAGCCTTTGGGACCGCTTCTCGTCGTCGTCCACCTCCTCTTCGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCCTAGCCTTTGGGACCGCTTCTCGTCGTCGTCCACCTCCTCTTCGCC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CTCGTCCTTGCCCCGAACTCCCACCCCAGATCGGCCGCCGCGCTCAGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CTCGTCCTTGCCCCGAACTCCCACCCCAGATCGGCCGCCGCGCTCAGCCT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GGGGGTCGGCGACCCGGGAGGAGGGGTTTGACCGCTCCACGAGCCTGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GGGGGTCGGCGACCCGGGAGGAGGGGTTTGACCGCTCCACGAGCCTGGAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 AGCTCGGACTGCGAGTCCCTGGACAGCAGCAACAGTGGCTTCGGGCCGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 AGCTCGGACTGCGAGTCCCTGGACAGCAGCAACAGTGGCTTCGGGCCGGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GGAAG         ACACGGCTTACCTGGATGGGGTGTCGTTGCCCGACT
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 GGAAGGTG...CAGACACGGCTTACCTGGATGGGGTGTCGTTGCCCGACT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 TCGAGCTGCTCAGTGACCCTGAGGATGAACACTTGTGTGCCAACCTGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100515 TCGAGCTGCTCAGTGACCCTGAGGATGAACACTTGTGTGCCAACCTGATG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 CAGCTGCTGCAGGAGAGCCTGGCCCAGGCGCGGCTGGGCTCTCGACGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100565 CAGCTGCTGCAGGAGAGCCTGGCCCAGGCGCGGCTGGGCTCTCGACGCCC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 TGCGCGCCTGCTGATGCCTAGCCAGTTGGTAAGCCAGGTGGGCAAAGAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100615 TGCGCGCCTGCTGATGCCTAGCCAGTTGGTAAGCCAGGTGGGCAAAGAAC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 TACTGCGCCTGGCCTACAGCGAGCCGTGCGGCCTGCGGGGGGCGCTGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100665 TACTGCGCCTGGCCTACAGCGAGCCGTGCGGCCTGCGGGGGGCGCTGCTG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 GACGTCTGCGTGGAGCAGGGCAAGAGCTGCCACAGCGTGGGCCAGCTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100715 GACGTCTGCGTGGAGCAGGGCAAGAGCTGCCACAGCGTGGGCCAGCTGGC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    492 ACTCGACCCCAGCCTGGTGCCCACCTTCCAGCTGACCCTCGTGCTGCGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100765 ACTCGACCCCAGCCTGGTGCCCACCTTCCAGCTGACCCTCGTGCTGCGCC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    542 TGGACTCACGACTCTGGCCCAAGATCCAGGGGCTGTTTAGCTCCGCCAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100815 TGGACTCACGACTCTGGCCCAAGATCCAGGGGCTGTTTAGCTCCGCCAAC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    592 TCTCCCTTCCTCCCTGGCTTCAGCCAGTCCCTGACGCTGAGCACTGGCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100865 TCTCCCTTCCTCCCTGGCTTCAGCCAGTCCCTGACGCTGAGCACTGGCTT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    642 CCGAGTCATCAAGAAGAAGCTGTACAGCTCGGAACAGCTGCCCATTGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
 100915 CCGAGTCATCAAGAAGAAGCTGTACAGCTCGGAACAGCTGCTCATTGAGG

    700     .
    692 AGTGT
        |||||
 100965 AGTGT