Result of SIM4 for
pF1KB8573
seq1 = pF1KB8573.tfa, 2670 bp
seq2 = pF1KB8573/gi568815593f_138079681.tfa (gi568815593f:138079681_138287410), 207730 bp
>pF1KB8573 2670
>gi568815593f:138079681_138287410 (Chr5)
1-165 (100001-100165) 100% ->
166-255 (101742-101831) 100% ->
256-375 (101929-102048) 100% ->
376-514 (102643-102781) 100% ->
515-702 (102906-103093) 100% ->
703-832 (103181-103310) 100% ->
833-1027 (103489-103683) 100% ->
1028-1139 (103790-103901) 100% ->
1140-1208 (104008-104076) 100% ->
1209-1352 (104282-104425) 100% ->
1353-1518 (104559-104724) 100% ->
1519-1683 (104832-104996) 100% ->
1684-1823 (105127-105266) 100% ->
1824-1926 (105415-105517) 100% ->
1927-2125 (105832-106030) 100% ->
2126-2217 (106281-106372) 100% ->
2218-2355 (106614-106751) 100% ->
2356-2670 (107416-107730) 100%
0 . : . : . : . : . :
1 ATGTCGCAAGGGATCCTTTCTCCGCCAGCGGGCTTGCTGTCCGATGACGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100001 ATGTCGCAAGGGATCCTTTCTCCGCCAGCGGGCTTGCTGTCCGATGACGA
50 . : . : . : . : . :
51 TGTCGTAGTTTCTCCCATGTTTGAGTCCACAGCTGCAGATTTGGGGTCTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100051 TGTCGTAGTTTCTCCCATGTTTGAGTCCACAGCTGCAGATTTGGGGTCTG
100 . : . : . : . : . :
101 TGGTACGCAAGAACCTGCTATCAGACTGCTCTGTCGTCTCTACCTCCCTA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100101 TGGTACGCAAGAACCTGCTATCAGACTGCTCTGTCGTCTCTACCTCCCTA
150 . : . : . : . : . :
151 GAGGACAAGCAGCAG GTTCCATCTGAGGACAGTATGGAGAA
|||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
100151 GAGGACAAGCAGCAGGTA...CAGGTTCCATCTGAGGACAGTATGGAGAA
200 . : . : . : . : . :
192 GGTGAAAGTATACTTGAGGGTTAGGCCCTTGTTACCTTCAGAGTTGGAAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101768 GGTGAAAGTATACTTGAGGGTTAGGCCCTTGTTACCTTCAGAGTTGGAAC
250 . : . : . : . : . :
242 GACAGGAAGATCAG GGTTGTGTCCGTATTGAGAATGTGGAG
||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
101818 GACAGGAAGATCAGGTA...CAGGGTTGTGTCCGTATTGAGAATGTGGAG
300 . : . : . : . : . :
283 ACCCTTGTTCTACAAGCACCCAAGGACTCTTTTGCCCTGAAGAGCAATGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101956 ACCCTTGTTCTACAAGCACCCAAGGACTCTTTTGCCCTGAAGAGCAATGA
350 . : . : . : . : . :
333 ACGGGGAATTGGCCAAGCCACACACAGGTTCACCTTTTCCCAG
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
102006 ACGGGGAATTGGCCAAGCCACACACAGGTTCACCTTTTCCCAGGTA...T
400 . : . : . : . : . :
376 ATCTTTGGGCCAGAAGTGGGACAGGCATCCTTCTTCAACCTAACTGTG
>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
102641 AGATCTTTGGGCCAGAAGTGGGACAGGCATCCTTCTTCAACCTAACTGTG
450 . : . : . : . : . :
424 AAGGAGATGGTAAAGGATGTACTCAAAGGGCAGAACTGGCTCATCTATAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
102691 AAGGAGATGGTAAAGGATGTACTCAAAGGGCAGAACTGGCTCATCTATAC
500 . : . : . : . : . :
474 ATATGGAGTCACTAACTCAGGGAAAACCCACACGATTCAAG
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
102741 ATATGGAGTCACTAACTCAGGGAAAACCCACACGATTCAAGGTG...CAG
550 . : . : . : . : . :
515 GTACCATCAAGGATGGAGGGATTCTCCCCCGGTCCCTGGCGCTGATCTTC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
102906 GTACCATCAAGGATGGAGGGATTCTCCCCCGGTCCCTGGCGCTGATCTTC
600 . : . : . : . : . :
565 AATAGCCTCCAAGGCCAACTTCATCCAACACCTGATCTGAAGCCCTTGCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
102956 AATAGCCTCCAAGGCCAACTTCATCCAACACCTGATCTGAAGCCCTTGCT
650 . : . : . : . : . :
615 CTCCAATGAGGTAATCTGGCTAGACAGCAAGCAGATCCGACAGGAGGAAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
103006 CTCCAATGAGGTAATCTGGCTAGACAGCAAGCAGATCCGACAGGAGGAAA
700 . : . : . : . : . :
665 TGAAGAAGCTGTCCCTGCTAAATGGAGGCCTCCAAGAG GAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
103056 TGAAGAAGCTGTCCCTGCTAAATGGAGGCCTCCAAGAGGTA...CAGGAG
750 . : . : . : . : . :
706 GAGCTGTCCACTTCCTTGAAGAGGAGTGTCTACATCGAAAGTCGGATAGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
103184 GAGCTGTCCACTTCCTTGAAGAGGAGTGTCTACATCGAAAGTCGGATAGG
800 . : . : . : . : . :
756 TACCAGCACCAGCTTCGACAGTGGCATTGCTGGGCTCTCTTCTATCAGTC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
103234 TACCAGCACCAGCTTCGACAGTGGCATTGCTGGGCTCTCTTCTATCAGTC
850 . : . : . : . : . :
806 AGTGTACCAGCAGTAGCCAGCTGGATG AAACAAGTCATCGA
|||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
103284 AGTGTACCAGCAGTAGCCAGCTGGATGGTA...CAGAAACAAGTCATCGA
900 . : . : . : . : . :
847 TGGGCACAGCCAGACACTGCCCCACTACCTGTCCCGGCAAACATTCGCTT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
103503 TGGGCACAGCCAGACACTGCCCCACTACCTGTCCCGGCAAACATTCGCTT
950 . : . : . : . : . :
897 CTCCATCTGGATCTCATTCTTTGAGATCTACAACGAACTGCTTTATGACC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
103553 CTCCATCTGGATCTCATTCTTTGAGATCTACAACGAACTGCTTTATGACC
1000 . : . : . : . : . :
947 TATTAGAACCGCCTAGCCAACAGCGCAAGAGGCAGACTTTGCGGCTATGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
103603 TATTAGAACCGCCTAGCCAACAGCGCAAGAGGCAGACTTTGCGGCTATGC
1050 . : . : . : . : . :
997 GAGGATCAAAATGGCAATCCCTATGTGAAAG ATCTCAACTG
|||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
103653 GAGGATCAAAATGGCAATCCCTATGTGAAAGGTA...CAGATCTCAACTG
1100 . : . : . : . : . :
1038 GATTCATGTGCAAGATGCTGAGGAGGCCTGGAAGCTCCTAAAAGTGGGTC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
103800 GATTCATGTGCAAGATGCTGAGGAGGCCTGGAAGCTCCTAAAAGTGGGTC
1150 . : . : . : . : . :
1088 GTAAGAACCAGAGCTTTGCCAGCACCCACCTCAACCAGAACTCCAGCCGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
103850 GTAAGAACCAGAGCTTTGCCAGCACCCACCTCAACCAGAACTCCAGCCGC
1200 . : . : . : . : . :
1138 AG TCACAGCATCTTCTCAATCAGGATCCTACACCTTCAGGG
||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
103900 AGGTG...CAGTCACAGCATCTTCTCAATCAGGATCCTACACCTTCAGGG
1250 . : . : . : . : . :
1179 GGAAGGAGATATAGTCCCCAAGATCAGCGA GCTGTCACTCT
||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
104047 GGAAGGAGATATAGTCCCCAAGATCAGCGAGTA...TAGGCTGTCACTCT
1300 . : . : . : . : . :
1220 GTGATCTGGCTGGCTCAGAGCGCTGCAAAGATCAGAAGAGTGGTGAACGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
104293 GTGATCTGGCTGGCTCAGAGCGCTGCAAAGATCAGAAGAGTGGTGAACGG
1350 . : . : . : . : . :
1270 TTGAAGGAAGCAGGAAACATTAACACCTCTCTACACACCCTGGGCCGCTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
104343 TTGAAGGAAGCAGGAAACATTAACACCTCTCTACACACCCTGGGCCGCTG
1400 . : . : . : . : . :
1320 TATTGCTGCCCTTCGTCAAAACCAGCAGAACCG GTCAAAGC
|||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
104393 TATTGCTGCCCTTCGTCAAAACCAGCAGAACCGGTG...CAGGTCAAAGC
1450 . : . : . : . : . :
1361 AGAACCTGGTTCCCTTCCGTGACAGCAAGTTGACTCGAGTGTTCCAAGGT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
104567 AGAACCTGGTTCCCTTCCGTGACAGCAAGTTGACTCGAGTGTTCCAAGGT
1500 . : . : . : . : . :
1411 TTCTTCACAGGCCGAGGCCGTTCCTGCATGATTGTCAATGTGAATCCCTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
104617 TTCTTCACAGGCCGAGGCCGTTCCTGCATGATTGTCAATGTGAATCCCTG
1550 . : . : . : . : . :
1461 TGCATCTACCTATGATGAAACTCTTCATGTGGCCAAGTTCTCAGCCATTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
104667 TGCATCTACCTATGATGAAACTCTTCATGTGGCCAAGTTCTCAGCCATTG
1600 . : . : . : . : . :
1511 CTAGCCAG CTTGTGCATGCCCCACCTATGCAACTGGGATTC
||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
104717 CTAGCCAGGTG...TAGCTTGTGCATGCCCCACCTATGCAACTGGGATTC
1650 . : . : . : . : . :
1552 CCATCCCTGCACTCGTTCATCAAGGAACATAGTCTTCAGGTATCCCCCAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
104865 CCATCCCTGCACTCGTTCATCAAGGAACATAGTCTTCAGGTATCCCCCAG
1700 . : . : . : . : . :
1602 CTTAGAGAAAGGGGCTAAGGCAGACACAGGCCTTGATGATGATATTGAAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
104915 CTTAGAGAAAGGGGCTAAGGCAGACACAGGCCTTGATGATGATATTGAAA
1750 . : . : . : . : . :
1652 ATGAAGCTGACATCTCCATGTATGGCAAAGAG GAGCTCCTA
||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
104965 ATGAAGCTGACATCTCCATGTATGGCAAAGAGGTG...TAGGAGCTCCTA
1800 . : . : . : . : . :
1693 CAAGTTGTGGAAGCCATGAAGACACTGCTTTTGAAGGAACGACAGGAAAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
105136 CAAGTTGTGGAAGCCATGAAGACACTGCTTTTGAAGGAACGACAGGAAAA
1850 . : . : . : . : . :
1743 GCTACAGCTGGAGATGCATCTCCGAGATGAAATTTGCAATGAGATGGTAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
105186 GCTACAGCTGGAGATGCATCTCCGAGATGAAATTTGCAATGAGATGGTAG
1900 . : . : . : . : . :
1793 AACAGATGCAACAGCGGGAACAGTGGTGCAG TGAACATTTG
|||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
105236 AACAGATGCAACAGCGGGAACAGTGGTGCAGGTA...CAGTGAACATTTG
1950 . : . : . : . : . :
1834 GACACCCAAAAGGAACTATTGGAGGAAATGTATGAAGAAAAACTAAATAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
105425 GACACCCAAAAGGAACTATTGGAGGAAATGTATGAAGAAAAACTAAATAT
2000 . : . : . : . : . :
1884 CCTCAAGGAGTCACTGACAAGTTTTTACCAAGAAGAGATTCAG
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
105475 CCTCAAGGAGTCACTGACAAGTTTTTACCAAGAAGAGATTCAGGTG...T
2050 . : . : . : . : . :
1927 GAGCGGGATGAAAAGATTGAAGAGCTAGAAGCTCTCTTGCAGGAAGCC
>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
105830 AGGAGCGGGATGAAAAGATTGAAGAGCTAGAAGCTCTCTTGCAGGAAGCC
2100 . : . : . : . : . :
1975 AGACAACAGTCAGTGGCCCATCAGCAATCAGGGTCTGAATTGGCCCTACG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
105880 AGACAACAGTCAGTGGCCCATCAGCAATCAGGGTCTGAATTGGCCCTACG
2150 . : . : . : . : . :
2025 GCGGTCACAAAGGTTGGCAGCTTCTGCCTCCACCCAGCAGCTTCAGGAGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
105930 GCGGTCACAAAGGTTGGCAGCTTCTGCCTCCACCCAGCAGCTTCAGGAGG
2200 . : . : . : . : . :
2075 TTAAAGCTAAATTACAGCAGTGCAAAGCAGAGCTAAACTCTACCACTGAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
105980 TTAAAGCTAAATTACAGCAGTGCAAAGCAGAGCTAAACTCTACCACTGAA
2250 . : . : . : . : . :
2125 G AGTTGCATAAGTATCAGAAAATGTTAGAACCACCACCCTC
|>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
106030 GGTG...CAGAGTTGCATAAGTATCAGAAAATGTTAGAACCACCACCCTC
2300 . : . : . : . : . :
2166 AGCCAAGCCCTTCACCATTGATGTGGACAAGAAGTTAGAAGAGGGCCAGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
106321 AGCCAAGCCCTTCACCATTGATGTGGACAAGAAGTTAGAAGAGGGCCAGA
2350 . : . : . : . : . :
2216 AG AATATAAGGCTGTTGCGGACAGAGCTTCAGAAACTTGGT
||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
106371 AGGTA...CAGAATATAAGGCTGTTGCGGACAGAGCTTCAGAAACTTGGT
2400 . : . : . : . : . :
2257 GAGTCTCTCCAATCAGCAGAGAGAGCTTGTTGCCACAGCACTGGGGCAGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
106653 GAGTCTCTCCAATCAGCAGAGAGAGCTTGTTGCCACAGCACTGGGGCAGG
2450 . : . : . : . : . :
2307 AAAACTTCGTCAAGCCTTGACCACTTGTGATGACATCTTAATCAAACAG
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
106703 AAAACTTCGTCAAGCCTTGACCACTTGTGATGACATCTTAATCAAACAGG
2500 . : . : . : . : . :
2356 GACCAGACTCTGGCTGAACTGCAGAACAACATGGTGCTAGTG
>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
106753 TT...TAGGACCAGACTCTGGCTGAACTGCAGAACAACATGGTGCTAGTG
2550 . : . : . : . : . :
2398 AAACTGGACCTTCGGAAGAAGGCAGCATGTATTGCTGAGCAGTATCATAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
107458 AAACTGGACCTTCGGAAGAAGGCAGCATGTATTGCTGAGCAGTATCATAC
2600 . : . : . : . : . :
2448 TGTGTTGAAACTCCAAGGCCAGGTTTCTGCCAAAAAGCGCCTTGGTACCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
107508 TGTGTTGAAACTCCAAGGCCAGGTTTCTGCCAAAAAGCGCCTTGGTACCA
2650 . : . : . : . : . :
2498 ACCAGGAAAATCAGCAACCAAACCAACAACCACCAGGGAAGAAACCATTC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
107558 ACCAGGAAAATCAGCAACCAAACCAACAACCACCAGGGAAGAAACCATTC
2700 . : . : . : . : . :
2548 CTTCGAAATTTACTTCCCCGAACACCAACCTGCCAAAGCTCAACAGACTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
107608 CTTCGAAATTTACTTCCCCGAACACCAACCTGCCAAAGCTCAACAGACTG
2750 . : . : . : . : . :
2598 CAGCCCTTATGCCCGGATCCTACGCTCACGGCGTTCCCCTTTACTCAAAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
107658 CAGCCCTTATGCCCGGATCCTACGCTCACGGCGTTCCCCTTTACTCAAAT
2800 . : . :
2648 CTGGGCCTTTTGGCAAAAAGTAC
|||||||||||||||||||||||
107708 CTGGGCCTTTTGGCAAAAAGTAC