seq1 = pF1KB8570.tfa, 2469 bp
seq2 = pF1KB8570/gi568815589f_40123397.tfa (gi568815589f:40123397_40365462), 242066 bp

>pF1KB8570 2469
>gi568815589f:40123397_40365462 (Chr9)

1-203  (100001-100203)   100% ->
204-318  (103511-103625)   100% ->
319-492  (103788-103961)   99% ->
493-599  (107847-107953)   99% ->
600-737  (109000-109137)   100% ->
738-793  (111737-111792)   100% ->
794-824  (118333-118363)   100% ->
825-894  (121050-121119)   100% ->
895-979  (125068-125152)   100% ->
980-1008  (127861-127889)   100% ->
1009-1081  (127981-128053)   98% ->
1082-1152  (134024-134094)   100% ->
1153-1316  (138153-138316)   100% ->
1317-1497  (139744-139924)   100% ->
1498-2469  (141095-142066)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAAGTTATTCGGCTTCGGGAGCCGCAGGGGCCAGACGGCCCAGGGCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAAGTTATTCGGCTTCGGGAGCCGCAGGGGCCAGACGGCCCAGGGCTC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CATAGACCACGTCTACACGGGTTCCGGATACCGAATCCGGGACTCCGAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CATAGACCACGTCTACACGGGTTCCGGATACCGAATCCGGGACTCCGAAC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TGCAGAAGATCCACAGGGCAGCTGTCAAAGGCGACGCCGCGGAGGTGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TGCAGAAGATCCACAGGGCAGCTGTCAAAGGCGACGCCGCGGAGGTGGAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CGCTGCTTGGCGCGCAGGAGCGGAGACCTGGACGCCCTGGACAAGCAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CGCTGCTTGGCGCGCAGGAGCGGAGACCTGGACGCCCTGGACAAGCAGCA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CAG         AACTGCTCTACACTTGGCCTGTGCCAGTGGCCATGTGC
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CAGGTA...TAGAACTGCTCTACACTTGGCCTGTGCCAGTGGCCATGTGC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 AAGTGGTCACTCTCCTGGTTAACAGAAAATGCCAGATTGATGTCTGTGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103549 AAGTGGTCACTCTCCTGGTTAACAGAAAATGCCAGATTGATGTCTGTGAC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 AAAGAAAACAGAACGCCTTTGATACAG         GCTGTCCATTGCCA
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 103599 AAAGAAAACAGAACGCCTTTGATACAGGTA...CAGGCTGTCCATTGCCA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 GGAAGAGGCTTGTGCCGTTATTCTGCTGGAACATGGCGCCAATCCAAACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
 103802 GGAAGAGGCTTGTGCCGTTATTCTGCTGGAACATGGCGCCAATCCAAACC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 TTAAGGATATCTACGGCAACACTGCTCTCCATTATGCCGTGTATAGTGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103852 TTAAGGATATCTACGGCAACACTGCTCTCCATTATGCCGTGTATAGTGAG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 AGCACCTCACTGGCAGAAAAACTGCTTTCCCATGGTGCACATATTGAAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103902 AGCACCTCACTGGCAGAAAAACTGCTTTCCCATGGTGCACATATTGAAGC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 ACTGGACAAG         GACAATAATACCCCACTTTTATTTGCTATAA
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 103952 ACTGGACAAGGTA...TAGGACAATAATACCCCACTTTTATTTGCTATAA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 TTTGCAAGAAAGAGAAAATGGTGGAATTTTTATTGAAAAAGAAAGCAAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
 107878 TTTGCAAGAAAGAGAAAATGGTGGAATTTTTATTGAAAAGGAAAGCAAGT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 TCACATGCCGTTGATAGGCTGAGACG         GTCAGCTCTCATGCT
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 107928 TCACATGCCGTTGATAGGCTGAGACGGTA...TAGGTCAGCTCTCATGCT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 TGCTGTATACTATGACTCACCAGGTATTGTCAATATCCTTCTTAAGCAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109015 TGCTGTATACTATGACTCACCAGGTATTGTCAATATCCTTCTTAAGCAAA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 ATATTGATGTCTTCGCTCAAGACATGTGTGGACGAGATGCAGAAGATTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109065 ATATTGATGTCTTCGCTCAAGACATGTGTGGACGAGATGCAGAAGATTAT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    715 GCTATTTCTCATCATTTGACAAA         AATTCAACAACAAATTTT
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 109115 GCTATTTCTCATCATTTGACAAAGTA...TAGAATTCAACAACAAATTTT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 GGAACATAAAAAGAAGATACTTAAAAAGGAGAAATCAG         ATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 111755 GGAACATAAAAAGAAGATACTTAAAAAGGAGAAATCAGGTA...TAGATG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    797 TTGGAAGTTCTGATGAATCTGCAGTCAG         CATTTTCCATGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 118336 TTGGAAGTTCTGATGAATCTGCAGTCAGGTA...AAGCATTTTCCATGAA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    838 CTGCGTGTGGATTCATTGCCTGCATCGGATGACAAAGACTTGAATGTTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121063 CTGCGTGTGGATTCATTGCCTGCATCGGATGACAAAGACTTGAATGTTGC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    888 TACTAAG         CAGTGTGTCCCCGAGAAAGTGTCAGAGCCTTTAC
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121113 TACTAAGGTA...TAGCAGTGTGTCCCCGAGAAAGTGTCAGAGCCTTTAC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    929 CTGGATCTTCGCATGAAAAAGGAAACAGAATAGTCAATGGACAAGGAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125102 CTGGATCTTCGCATGAAAAAGGAAACAGAATAGTCAATGGACAAGGAGAA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    979 G         GGCCTCCTGCAAAACATCCTTCCTTGAAG         CC
        |>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 125152 GGTG...TAGGGCCTCCTGCAAAACATCCTTCCTTGAAGGTA...CAGCC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1011 TAGCACTGAAGTGGAAGATCCTGCTGTGAAAGGAGCAGTACAAAGAAAGA
        |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127983 TAGCACTGAAGTAGAAGATCCTGCTGTGAAAGGAGCAGTACAAAGAAAGA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1061 ATGTACAGACATTGAGAGCAG         AACAAGCCTTACCAGTGGCT
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 128033 ATGTACAGACATTGAGAGCAGGTA...CAGAACAAGCCTTACCAGTGGCT

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1102 TCAGAGGAAGAGCAAGAAAGGCATGAAAGAAGTGAAAAGAAGCAACCACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134044 TCAGAGGAAGAGCAAGAAAGGCATGAAAGAAGTGAAAAGAAGCAACCACA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1152 G         GTCAAAGAAGGAAATAATACAAACAAAAGTGAAAAAATAC
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134094 GGTA...AAGGTCAAAGAAGGAAATAATACAAACAAAAGTGAAAAAATAC

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1193 AACTTTCAGAAAATATATGTGATAGTACATCTTCTGCTGCTGCTGGCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 138193 AACTTTCAGAAAATATATGTGATAGTACATCTTCTGCTGCTGCTGGCAGA

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1243 TTAACCCAACAAAGAAAGATTGGGAAAACGTATCCTCAGCAATTTCCCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 138243 TTAACCCAACAAAGAAAGATTGGGAAAACGTATCCTCAGCAATTTCCCAA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1293 GAAGCTGAAGGAAGAGCATGATAG         ATGCACCTTAAAACAAG
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 138293 GAAGCTGAAGGAAGAGCATGATAGGTA...CAGATGCACCTTAAAACAAG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1334 AAAATGAAGAAAAAACAAATGTTAATATGCTGTACAAAAAAAATAGAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139761 AAAATGAAGAAAAAACAAATGTTAATATGCTGTACAAAAAAAATAGAGAA

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1384 GAATTAGAAAGGAAAGAGAAACAATATAAGAAAGAAGTTGAAGCAAAACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139811 GAATTAGAAAGGAAAGAGAAACAATATAAGAAAGAAGTTGAAGCAAAACA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1434 ACTTGAACCAACTGTTCAGTCACTAGAGATGAAATCAAAGACTGCAAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139861 ACTTGAACCAACTGTTCAGTCACTAGAGATGAAATCAAAGACTGCAAGAA

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1484 ATACTCCAAATCGG         GATTTTCATAATCATGAAGAAATGAAA
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 139911 ATACTCCAAATCGGGTA...TAGGATTTTCATAATCATGAAGAAATGAAA

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1525 GGTCTGATGGATGAAAATTGCATTTTGAAGGCAGATATTGCTATACTCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141122 GGTCTGATGGATGAAAATTGCATTTTGAAGGCAGATATTGCTATACTCAG

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1575 ACAGGAAATATGTACAATGAAAAATGACAACTTGGAAAAAGAAAATAAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141172 ACAGGAAATATGTACAATGAAAAATGACAACTTGGAAAAAGAAAATAAAT

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1625 ATCTTAAGGACATTAAAATTGTTAAAGAAACAAATGCTGCCCTTGAAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141222 ATCTTAAGGACATTAAAATTGTTAAAGAAACAAATGCTGCCCTTGAAAAG

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1675 TATATAAAACTCAATGAGGAAATGATAACAGAAACAGCATTCCGGTATCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141272 TATATAAAACTCAATGAGGAAATGATAACAGAAACAGCATTCCGGTATCA

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1725 ACAAGAGCTTAATGATCTCAAGGCTGAGAATACAAGGCTCAATGCCGAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141322 ACAAGAGCTTAATGATCTCAAGGCTGAGAATACAAGGCTCAATGCCGAAC

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1775 TGTTGAAGGAAAAAGAAAGCAAGAAAAGACTGGAAGCTGACATTGAATCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141372 TGTTGAAGGAAAAAGAAAGCAAGAAAAGACTGGAAGCTGACATTGAATCT

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1825 TATCAGTCTAGACTGGCTGCTGCTATAAGCAAACACAGTGAAAGTGTGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141422 TATCAGTCTAGACTGGCTGCTGCTATAAGCAAACACAGTGAAAGTGTGAA

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1875 AACAGAAAGAAACCTAAAACTTGCTTTAGAGAGAACACGAGATGTTTCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141472 AACAGAAAGAAACCTAAAACTTGCTTTAGAGAGAACACGAGATGTTTCTG

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1925 TACAAGTAGAAATGAGTTCTGCTATTTCCAAAGTAAAAGCTGAGAATGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
 141522 TACAAGTAGAAATGAGTTCTGCTATTTCCAAAGTAAAAGATGAGAATGAG

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1975 TTTCTTACTGAACAACTTTCTGAAACACAAATTAAATTCAATGCCTTAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141572 TTTCTTACTGAACAACTTTCTGAAACACAAATTAAATTCAATGCCTTAAA

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2025 AGATAAGTTCTGTAAGACAAGAGATAGTCTCAGAAAAAAGTCATTGGCTT
        |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141622 AGATAAGTTCCGTAAGACAAGAGATAGTCTCAGAAAAAAGTCATTGGCTT

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2075 TAGAAACTGTACAAAACGACCTAAGCCAAACACAGCAGCAAACACAGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141672 TAGAAACTGTACAAAACGACCTAAGCCAAACACAGCAGCAAACACAGGAA

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2125 ATGAAAGAGATGTATCAAAATGCAGAAGCTAAAGTGAATAATTCCACTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141722 ATGAAAGAGATGTATCAAAATGCAGAAGCTAAAGTGAATAATTCCACTGG

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2175 AAAGTGGAACTGTGTAGAAGAGAGGATATGTCACCTCCAACGTGAAAATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141772 AAAGTGGAACTGTGTAGAAGAGAGGATATGTCACCTCCAACGTGAAAATG

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2225 CGTGGCTTGTACAGCAACTAGATGACGTTCATCAGAAAGAGGATCATAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141822 CGTGGCTTGTACAGCAACTAGATGACGTTCATCAGAAAGAGGATCATAAA

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2275 GAGATAGTAACTAATATCCAAAGAGGCTTTATTGAGAGTGAAAAGAAAGA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
 141872 GAGATAGTAACTAATATCCAAAGAGGCTTTATTGAGAGTGGAAAGAAAGA

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2325 CCTCGTGCTAGAAGAGAAAAGTAAGAAGCTAATGAATGAATGTGATCATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141922 CCTCGTGCTAGAAGAGAAAAGTAAGAAGCTAATGAATGAATGTGATCATT

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2375 TAAAAGAAAGTCTCTTTCAGTATGAGAGAGAGAAAACAGGAGGAGTAGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
 141972 TAAAAGAAAGTCTCTTTCAGTATGAGAGAGAGAAAACAGAAGGAGTAGTA

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .
   2425 AGTATCAAGGAAGATAAATATTTTCAAACTTCTAGAAAGACAATT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
 142022 AGTATCAAGGAAGATAAATATTTTCAAACTTCTAGAAAGAAAATT