seq1 = pF1KB8566.tfa, 762 bp
seq2 = pF1KB8566/gi568815596f_129880116.tfa (gi568815596f:129880116_130080877), 200762 bp

>pF1KB8566 762
>gi568815596f:129880116_130080877 (Chr2)

1-762  (100001-100762)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTCCGCGGGCGGAGACTTCGGGAATCCGCTGAGGAAATTCAAGCTGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTCCGCGGGCGGAGACTTCGGGAATCCGCTGAGGAAATTCAAGCTGGT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GTTCCTGGGGGAGCAAAGCGTTGCAAAGACATCTTTGATCACCAGATTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GTTCCTGGGGGAGCAAAGCGTTGCAAAGACATCTTTGATCACCAGATTCA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GGTATGACAGTTTTGACAACACCTATCAGGCAATAATTGGCATTGACTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GGTATGACAGTTTTGACAACACCTATCAGGCAATAATTGGCATTGACTTT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 TTATCAAAAACTATGTACTTGGAGGATGGAACAATCGGGCTTCGGCTGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 TTATCAAAAACTATGTACTTGGAGGATGGAACAATCGGGCTTCGGCTGTG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GGATACGGCGGGTCAGGAACGTCTCCGTAGCCTCATTCCCAGGTACATCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 GGATACGGCGGGTCAGGAACGTCTCCGTAGCCTCATTCCCAGGTACATCC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 GTGATTCTGCTGCAGCTGTAGTAGTTTACGATATCACAAATGTTAACTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 GTGATTCTGCTGCAGCTGTAGTAGTTTACGATATCACAAATGTTAACTCA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 TTCCAGCAAACTACAAAGTGGATTGATGATGTCAGAACAGAAAGAGGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 TTCCAGCAAACTACAAAGTGGATTGATGATGTCAGAACAGAAAGAGGAAG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 TGATGTTATCATCACGCTAGTAGGAAATAGAACAGATCTTGCTGACAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 TGATGTTATCATCACGCTAGTAGGAAATAGAACAGATCTTGCTGACAAGA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 GGCAAGTGTCAGTTGAGGAGGGAGAGAGGAAAGCCAAAGGGCTGAATGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 GGCAAGTGTCAGTTGAGGAGGGAGAGAGGAAAGCCAAAGGGCTGAATGTT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 ACGTTTATTGAAACTAGGGCAAAAACTGGATACAATGTAAAGCAGCTCTT
        |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
 100451 ACGTTTATTGAAACTAGGGCAAAAGCTGGATACAATGTAAAGCAGCTCTT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 TCGACGTGTAGCAGCAGCTTTGCCGGGAATGGAAAGCACACAGGACGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 TCGACGTGTAGCAGCAGCTTTGCCGGGAATGGAAAGCACACAGGACGGAA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 GCAGAGAAGACATGAGTGACATAAAACTGGAAAAGCCTCAGGAGCAAACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 GCAGAGAAGACATGAGTGACATAAAACTGGAAAAGCCTCAGGAGCAAACA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 GTCAGCGAAGGGGGTTGTTCCTGCTACTCTCCCATGTCATCTTCAACCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 GTCAGCGAAGGGGGTTGTTCCTGCTACTCTCCCATGTCATCTTCAACCCT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 TCCTCAGAAGCCCCCTTACTCTTTCATTGACTGCAGTGTGAATATTGGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 TCCTCAGAAGCCCCCTTACTCTTTCATTGACTGCAGTGTGAATATTGGCT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 TGAACCTTTTCCCTTCATTAATAACGTTTTGCAATTCATCATTGCTGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 TGAACCTTTTCCCTTCATTAATAACGTTTTGCAATTCATCATTGCTGCCT

    750     .    :
    751 GTCTCGTGGAGG
        ||||||||||||
 100751 GTCTCGTGGAGG