seq1 = pF1KB8561.tfa, 2901 bp
seq2 = pF1KB8561/gi568815590f_27297585.tfa (gi568815590f:27297585_27558506), 260922 bp

>pF1KB8561 2901
>gi568815590f:27297585_27558506 (Chr8)

1-204  (100001-100204)   98% ->
205-383  (122311-122489)   100% ->
384-471  (123073-123160)   100% ->
472-551  (124720-124799)   100% ->
552-614  (132509-132571)   100% ->
615-669  (132780-132834)   100% ->
670-810  (133292-133432)   100% ->
811-885  (133814-133888)   100% ->
886-987  (134676-134777)   100% ->
988-1105  (135851-135968)   100% ->
1106-1145  (136509-136548)   100% ->
1146-1192  (136929-136975)   100% ->
1193-1243  (138159-138209)   100% ->
1244-1341  (138667-138764)   100% ->
1342-1426  (139538-139622)   100% ->
1427-1527  (139812-139912)   100% ->
1528-1643  (140181-140296)   100% ->
1644-1744  (141447-141547)   100% ->
1745-1834  (141725-141814)   100% ->
1835-2039  (142653-142857)   100% ->
2040-2148  (145291-145399)   100% ->
2149-2214  (146622-146687)   100% ->
2215-2361  (153165-153311)   100% ->
2362-2397  (153459-153494)   97% ->
2398-2422  (153901-153925)   100% ->
2423-2469  (155530-155576)   100% ->
2470-2607  (156570-156707)   100% ->
2608-2688  (156947-157027)   100% ->
2689-2901  (160710-160922)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTCTGGGGTGTCCGAGCCCCTGAGCCGAGTAAAGTTGGGCACATTACG
        |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||
 100001 ATGTCTGGGGTGTCCGAGCCCCTGAGTCGAGTAAAGTTGGGCACGTTACG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CCGGCCTGAAGGCCCTGCAGAGCCCATGGTGGTGGTACCAGTAGATGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CCGGCCTGAAGGCCCTGCAGAGCCCATGGTGGTGGTACCAGTAGATGTGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 AAAAGGAGGACGTGCGTATCCTCAAGGTCTGCTTCTATAGCAACAGCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 AAAAGGAGGACGTGCGTATCCTCAAGGTCTGCTTCTATAGCAACAGCTTC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 AATCCTGGGAAGAACTTCAAACTGGTCAAATGCACTGTCCAGACGGAGAT
        ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 AATCCTGGGAAAAACTTCAAACTGGTCAAATGCACTGTCCAGACGGAGAT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CCGG         GAGATCATCACCTCCATCCTGCTGAGCGGGCGGATCG
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CCGGGTA...CAGGAGATCATCACCTCCATCCTGCTGAGCGGGCGGATCG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 GGCCCAACATCCGGTTGGCTGAGTGCTATGGGCTGAGGCTGAAGCACATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122348 GGCCCAACATCCGGTTGGCTGAGTGCTATGGGCTGAGGCTGAAGCACATG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 AAGTCCGATGAGATCCACTGGCTGCACCCACAGATGACGGTGGGTGAGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122398 AAGTCCGATGAGATCCACTGGCTGCACCCACAGATGACGGTGGGTGAGGT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 GCAGGACAAGTATGAGTGTCTGCACGTGGAAGCCGAGTGGAG        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 122448 GCAGGACAAGTATGAGTGTCTGCACGTGGAAGCCGAGTGGAGGTA...CA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    384  GTATGACCTTCAAATCCGCTACTTGCCAGAAGACTTCATGGAGAGCCTG
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123072 GGTATGACCTTCAAATCCGCTACTTGCCAGAAGACTTCATGGAGAGCCTG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 AAGGAGGACAGGACCACGCTGCTCTATTTTTACCAACAG         CT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 123122 AAGGAGGACAGGACCACGCTGCTCTATTTTTACCAACAGGTA...CAGCT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 CCGGAACGACTACATGCAGCGCTACGCCAGCAAGGTCAGCGAGGGCATGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124722 CCGGAACGACTACATGCAGCGCTACGCCAGCAAGGTCAGCGAGGGCATGG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 CCCTGCAGCTGGGCTGCCTGGAGCTCAG         GCGGTTCTTCAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 124772 CCCTGCAGCTGGGCTGCCTGGAGCTCAGGTA...CAGGCGGTTCTTCAAG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 GATATGCCCCACAATGCACTTGACAAGAAGTCCAACTTCGAGCTCCTAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132522 GATATGCCCCACAATGCACTTGACAAGAAGTCCAACTTCGAGCTCCTAGA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615          AAAGGAAGTGGGGCTGGACTTGTTTTTCCCAAAGCAGATGC
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132572 GTA...CAGAAAGGAAGTGGGGCTGGACTTGTTTTTCCCAAAGCAGATGC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    656 AGGAGAACTTAAAG         CCCAAACAGTTCCGGAAGATGATCCAG
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 132821 AGGAGAACTTAAAGGTG...CAGCCCAAACAGTTCCGGAAGATGATCCAG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    697 CAGACCTTCCAGCAGTACGCCTCGCTCAGGGAGGAGGAGTGCGTCATGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133319 CAGACCTTCCAGCAGTACGCCTCGCTCAGGGAGGAGGAGTGCGTCATGAA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    747 GTTCTTCAACACTCTCGCCGGCTTCGCCAACATCGACCAGGAGACCTACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133369 GTTCTTCAACACTCTCGCCGGCTTCGCCAACATCGACCAGGAGACCTACC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    797 GCTGTGAACTCATT         CAAGGATGGAACATTACTGTGGACCTG
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 133419 GCTGTGAACTCATTGTA...CAGCAAGGATGGAACATTACTGTGGACCTG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    838 GTCATTGGCCCTAAAGGGATCCGCCAGCTGACTAGTCAGGACGCAAAG  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 133841 GTCATTGGCCCTAAAGGGATCCGCCAGCTGACTAGTCAGGACGCAAAGGT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    886        CCCACCTGCCTGGCCGAGTTCAAGCAGATCAGGTCCATCAGGT
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133891 A...CAGCCCACCTGCCTGGCCGAGTTCAAGCAGATCAGGTCCATCAGGT

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    929 GCCTCCCGCTGGAGGAGGGCCAGGCAGTACTTCAGCTGGGCATTGAAGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134719 GCCTCCCGCTGGAGGAGGGCCAGGCAGTACTTCAGCTGGGCATTGAAGGT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    979 GCCCCCCAG         GCCTTGTCCATCAAAACCTCATCCCTAGCAGA
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 134769 GCCCCCCAGGTG...CAGGCCTTGTCCATCAAAACCTCATCCCTAGCAGA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1020 GGCTGAGAACATGGCTGACCTCATAGACGGCTACTGCCGGCTGCAGGGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 135883 GGCTGAGAACATGGCTGACCTCATAGACGGCTACTGCCGGCTGCAGGGTG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1070 AGCACCAAGGCTCTCTCATCATCCATCCTAGGAAAG         ATGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 135933 AGCACCAAGGCTCTCTCATCATCCATCCTAGGAAAGGTG...TAGATGGT

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1111 GAGAAGCGGAACAGCCTGCCCCAGATCCCCATGCT         AAACCT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 136514 GAGAAGCGGAACAGCCTGCCCCAGATCCCCATGCTGTG...CAGAAACCT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1152 GGAGGCCCGGCGGTCCCACCTCTCAGAGAGCTGCAGCATAG         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 136935 GGAGGCCCGGCGGTCCCACCTCTCAGAGAGCTGCAGCATAGGTG...CAG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1193 AGTCAGACATCTACGCAGAGATTCCCGACGAAACCCTGCGAAGGCCCGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 138159 AGTCAGACATCTACGCAGAGATTCCCGACGAAACCCTGCGAAGGCCCGGA

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1243 G         GTCCACAGTATGGCATTGCCCGTGAAGATGTGGTCCTGAA
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 138209 GGTA...CAGGTCCACAGTATGGCATTGCCCGTGAAGATGTGGTCCTGAA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1284 TCGTATTCTTGGGGAAGGCTTTTTTGGGGAGGTCTATGAAGGTGTCTACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 138707 TCGTATTCTTGGGGAAGGCTTTTTTGGGGAGGTCTATGAAGGTGTCTACA

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1334 CAAATCAC         AAAGGGGAGAAAATCAATGTAGCTGTCAAGACC
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 138757 CAAATCACGTG...CAGAAAGGGGAGAAAATCAATGTAGCTGTCAAGACC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1375 TGCAAGAAAGACTGCACTCTGGACAACAAGGAGAAGTTCATGAGCGAGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139571 TGCAAGAAAGACTGCACTCTGGACAACAAGGAGAAGTTCATGAGCGAGGC

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1425 AG         TGATCATGAAGAACCTCGACCACCCGCACATCGTGAAGC
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139621 AGGTA...CAGTGATCATGAAGAACCTCGACCACCCGCACATCGTGAAGC

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1466 TGATCGGCATCATTGAAGAGGAGCCCACCTGGATCATCATGGAATTGTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139851 TGATCGGCATCATTGAAGAGGAGCCCACCTGGATCATCATGGAATTGTAT

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1516 CCCTATGGGGAG         CTGGGCCACTACCTGGAGCGGAACAAGAA
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 139901 CCCTATGGGGAGGTG...CAGCTGGGCCACTACCTGGAGCGGAACAAGAA

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1557 CTCCCTGAAGGTGCTCACCCTCGTGCTGTACTCACTGCAGATATGCAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 140210 CTCCCTGAAGGTGCTCACCCTCGTGCTGTACTCACTGCAGATATGCAAAG

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1607 CCATGGCCTACCTGGAGAGCATCAACTGCGTGCACAG         GGAC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 140260 CCATGGCCTACCTGGAGAGCATCAACTGCGTGCACAGGTA...CAGGGAC

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1648 ATTGCTGTCCGGAACATCCTGGTGGCCTCCCCTGAGTGTGTGAAGCTGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141451 ATTGCTGTCCGGAACATCCTGGTGGCCTCCCCTGAGTGTGTGAAGCTGGG

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1698 GGACTTTGGTCTTTCCCGGTACATTGAGGACGAGGACTATTACAAAG   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 141501 GGACTTTGGTCTTTCCCGGTACATTGAGGACGAGGACTATTACAAAGGTG

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1745       CCTCTGTGACTCGTCTCCCCATCAAATGGATGTCCCCAGAGTCC
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141551 ...AAGCCTCTGTGACTCGTCTCCCCATCAAATGGATGTCCCCAGAGTCC

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1789 ATTAACTTCCGACGCTTCACGACAGCCAGTGACGTCTGGATGTTCG    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 141769 ATTAACTTCCGACGCTTCACGACAGCCAGTGACGTCTGGATGTTCGGTG.

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1835      CCGTGTGCATGTGGGAGATCCTGAGCTTTGGGAAGCAGCCCTTCT
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141819 ..CAGCCGTGTGCATGTGGGAGATCCTGAGCTTTGGGAAGCAGCCCTTCT

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1880 TCTGGCTGGAGAACAAGGATGTCATCGGGGTGCTGGAGAAAGGAGACCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 142698 TCTGGCTGGAGAACAAGGATGTCATCGGGGTGCTGGAGAAAGGAGACCGG

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1930 CTGCCCAAGCCTGATCTCTGTCCACCGGTCCTTTATACCCTCATGACCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 142748 CTGCCCAAGCCTGATCTCTGTCCACCGGTCCTTTATACCCTCATGACCCG

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1980 CTGCTGGGACTACGACCCCAGTGACCGGCCCCGCTTCACCGAGCTGGTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 142798 CTGCTGGGACTACGACCCCAGTGACCGGCCCCGCTTCACCGAGCTGGTGT

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2030 GCAGCCTCAG         TGACGTTTATCAGATGGAGAAGGACATTGCC
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 142848 GCAGCCTCAGGTG...CAGTGACGTTTATCAGATGGAGAAGGACATTGCC

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2071 ATGGAGCAAGAGAGGAATGCTCGCTACCGAACCCCCAAAATCTTGGAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 145322 ATGGAGCAAGAGAGGAATGCTCGCTACCGAACCCCCAAAATCTTGGAGCC

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2121 CACAGCCTTCCAGGAACCCCCACCCAAG         CCCAGCCGACCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 145372 CACAGCCTTCCAGGAACCCCCACCCAAGGTA...CAGCCCAGCCGACCTA

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2162 AGTACAGACCCCCTCCGCAAACCAACCTCCTGGCTCCAAAGCTGCAGTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 146635 AGTACAGACCCCCTCCGCAAACCAACCTCCTGGCTCCAAAGCTGCAGTTC

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2212 CAG         GAGGAGGACTTCATCCAACCCAGCAGCCGAGAAGAGGC
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 146685 CAGGTA...CAGGAGGAGGACTTCATCCAACCCAGCAGCCGAGAAGAGGC

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2253 CCAGCAGCTGTGGGAGGCTGAAAAGGTCAAAATGCGGCAAATCCTGGACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 153203 CCAGCAGCTGTGGGAGGCTGAAAAGGTCAAAATGCGGCAAATCCTGGACA

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2303 AACAGCAGAAGCAGATGGTGGAGGACTACCAGTGGCTCAGGCAGGAGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 153253 AACAGCAGAAGCAGATGGTGGAGGACTACCAGTGGCTCAGGCAGGAGGAG

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2353 AAGTCCCTG         GACCCCATGGTTTATATGAATGATACGTCCCC
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||| ||||||
 153303 AAGTCCCTGGTG...CAGGACCCCATGGTTTATATGAATGATAAGTCCCC

   2600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2394 ATTG         ACGCCAGAGAAGGAGGTCGGCTACC         TGG
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 153491 ATTGGTG...CAGACGCCAGAGAAGGAGGTCGGCTACCGTG...CAGTGG

   2650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2426 AGTTCACAGGGCCCCCACAGAAGCCCCCGAGGCTGGGCGCACAG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 155533 AGTTCACAGGGCCCCCACAGAAGCCCCCGAGGCTGGGCGCACAGGTA...

   2700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2470    TCCATCCAGCCCACAGCTAACCTGGACCGGACTGATGACCTGGTGTA
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 156567 CAGTCCATCCAGCCCACAGCTAACCTGGACCGGACTGATGACCTGGTGTA

   2750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2517 CCTCAATGTCATGGAGCTGGTGCGGGCCGTGCTGGAGCTCAAGAATGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 156617 CCTCAATGTCATGGAGCTGGTGCGGGCCGTGCTGGAGCTCAAGAATGAGC

   2800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2567 TCTGTCAGCTGCCCCCCGAGGGCTACGTGGTGGTGGTGAAG         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 156667 TCTGTCAGCTGCCCCCCGAGGGCTACGTGGTGGTGGTGAAGGTG...CAG

   2850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2608 AATGTGGGGCTGACCCTGCGGAAGCTCATCGGGAGCGTGGATGATCTCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 156947 AATGTGGGGCTGACCCTGCGGAAGCTCATCGGGAGCGTGGATGATCTCCT

   2900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2658 GCCTTCCTTGCCGTCATCTTCACGGACAGAG         ATCGAGGGCA
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 156997 GCCTTCCTTGCCGTCATCTTCACGGACAGAGGTG...CAGATCGAGGGCA

   2950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2699 CCCAGAAACTGCTCAACAAAGACCTGGCAGAGCTCATCAACAAGATGCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 160720 CCCAGAAACTGCTCAACAAAGACCTGGCAGAGCTCATCAACAAGATGCGG

   3000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2749 CTGGCACAGCAGAACGCCGTGACCTCCCTAAGTGAGGAGTGCAAGAGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 160770 CTGGCACAGCAGAACGCCGTGACCTCCCTAAGTGAGGAGTGCAAGAGGCA

   3050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2799 GATGCTGACGGCTTCACACACCCTGGCTGTGGACGCCAAGAACCTGCTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 160820 GATGCTGACGGCTTCACACACCCTGGCTGTGGACGCCAAGAACCTGCTCG

   3100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2849 ACGCTGTGGACCAGGCCAAGGTTCTGGCCAATCTGGCCCACCCACCTGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 160870 ACGCTGTGGACCAGGCCAAGGTTCTGGCCAATCTGGCCCACCCACCTGCA

   3150 
   2899 GAG
        |||
 160920 GAG