seq1 = pF1KB8559.tfa, 3018 bp
seq2 = pF1KB8559/gi568815580f_21641584.tfa (gi568815580f:21641584_21964663), 323080 bp

>pF1KB8559 3018
>gi568815580f:21641584_21964663 (Chr18)

1-229  (100001-100229)   100% ->
230-401  (124189-124360)   100% ->
402-531  (127040-127169)   100% ->
532-636  (132041-132145)   100% ->
637-703  (136520-136586)   100% ->
704-908  (137898-138102)   100% ->
909-1092  (149791-149974)   100% ->
1093-1237  (156501-156645)   100% ->
1238-1371  (158258-158391)   100% ->
1372-1479  (162324-162431)   100% ->
1480-1677  (174033-174230)   100% ->
1678-1829  (177912-178063)   100% ->
1830-1962  (196782-196914)   100% ->
1963-2049  (201548-201634)   100% ->
2050-2211  (202509-202670)   100% ->
2212-2393  (205361-205542)   100% ->
2394-2586  (207613-207805)   100% ->
2587-2665  (211557-211635)   100% ->
2666-2779  (215547-215660)   100% ->
2780-2880  (216963-217063)   100% ->
2881-3018  (222943-223080)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAGTAACTCCCGGAATAACCGGGTGATGGTGGAAGGGGTTGGCGCTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAGTAACTCCCGGAATAACCGGGTGATGGTGGAAGGGGTTGGCGCTCG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGTAGTGCGCGGCCCGGACTGGAAGTGGGGGAAGCAGGACGGCGGCGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GGTAGTGCGCGGCCCGGACTGGAAGTGGGGGAAGCAGGACGGCGGCGAGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GCCATGTGGGCACCGTCCGGAGCTTCGAGAGCCCCGAGGAGGTGGTGGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GCCATGTGGGCACCGTCCGGAGCTTCGAGAGCCCCGAGGAGGTGGTGGTA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GTGTGGGACAACGGCACAGCTGCCAACTACCGCTGCTCCGGGGCTTACGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GTGTGGGACAACGGCACAGCTGCCAACTACCGCTGCTCCGGGGCTTACGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CCTCCGCATCCTGGACAGCGCGCCCACCG         GCATCAAGCATG
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 100201 CCTCCGCATCCTGGACAGCGCGCCCACCGGTA...TAGGCATCAAGCATG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 ATGGAACCATGTGTGATACCTGCCGCCAGCAACCAATCATTGGCATTCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124201 ATGGAACCATGTGTGATACCTGCCGCCAGCAACCAATCATTGGCATTCGA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 TGGAAGTGTGCAGAGTGTACAAATTATGATTTGTGCACAGTGTGTTATCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124251 TGGAAGTGTGCAGAGTGTACAAATTATGATTTGTGCACAGTGTGTTATCA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 TGGAGATAAACATCATTTAAGACATCGCTTTTACCGAATTACTACACCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124301 TGGAGATAAACATCATTTAAGACATCGCTTTTACCGAATTACTACACCGG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 GAAGTGAGAG         GGTTCTGTTAGAGTCTCGTAGGAAATCTAAG
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 124351 GAAGTGAGAGGTA...TAGGGTTCTGTTAGAGTCTCGTAGGAAATCTAAG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 AAGATTACAGCCAGAGGAATCTTTGCAGGTGCCAGAGTGGTGCGAGGAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127071 AAGATTACAGCCAGAGGAATCTTTGCAGGTGCCAGAGTGGTGCGAGGAGT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 GGACTGGCAGTGGGAAGATCAAGATGGAGGAAATGGACGTAGGGGAAAG 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 127121 GGACTGGCAGTGGGAAGATCAAGATGGAGGAAATGGACGTAGGGGAAAGG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    532         GTAACAGAAATCCAGGACTGGAGTGCATCAAGCCCACATAGC
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127171 TA...TAGGTAACAGAAATCCAGGACTGGAGTGCATCAAGCCCACATAGC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 GCAGCATATGTCCTCTGGGATAATGGTGCTAAGAACCTTTACAGAGTTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132083 GCAGCATATGTCCTCTGGGATAATGGTGCTAAGAACCTTTACAGAGTTGG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    624 CTTTGAGGGCATG         TCTGATCTGAAATGTGTCCAGGATGCCA
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 132133 CTTTGAGGGCATGGTA...TAGTCTGATCTGAAATGTGTCCAGGATGCCA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 AGGGAGGTTCTTTCTACAGAGATCACTGCCCTGTGCTAG         GT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 136548 AGGGAGGTTCTTTCTACAGAGATCACTGCCCTGTGCTAGGTG...CAGGT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 GAGCAGAATGGCAACAGGAATCCTGGTGGATTGCAGATTGGTGACCTGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 137900 GAGCAGAATGGCAACAGGAATCCTGGTGGATTGCAGATTGGTGACCTGGT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 AAATATAGATCTCGACCTCGAAATTGTACAGTCTTTGCAGCATGGTCATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 137950 AAATATAGATCTCGACCTCGAAATTGTACAGTCTTTGCAGCATGGTCATG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    806 GAGGATGGACTGATGGAATGTTTGAGACTTTAACTACAACTGGAACTGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 138000 GAGGATGGACTGATGGAATGTTTGAGACTTTAACTACAACTGGAACTGTT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    856 TGTGGCATTGATGAAGATCATGACATTGTAGTACAGTATCCAAGTGGCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 138050 TGTGGCATTGATGAAGATCATGACATTGTAGTACAGTATCCAAGTGGCAA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    906 TAG         GTGGACCTTCAATCCTGCTGTTCTCACTAAAGCGAACA
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 138100 TAGGTG...TAGGTGGACCTTCAATCCTGCTGTTCTCACTAAAGCGAACA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    947 TTGTCCGAAGTGGAGATGCTGCTCAGGGTGCAGAAGGAGGCACCTCGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 149829 TTGTCCGAAGTGGAGATGCTGCTCAGGGTGCAGAAGGAGGCACCTCGCAG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    997 TTTCAAGTGGGTGATCTTGTACAAGTTTGTTATGACCTGGAACGAATTAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 149879 TTTCAAGTGGGTGATCTTGTACAAGTTTGTTATGACCTGGAACGAATTAA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1047 ACTTCTACAAAGAGGACATGGAGAATGGGCTGAAGCGATGCTTCCA    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 149929 ACTTCTACAAAGAGGACATGGAGAATGGGCTGAAGCGATGCTTCCAGTA.

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1093      ACTTTAGGTAAAGTTGGCCGAGTACAACAGATTTATTCAGACAGT
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 149979 ..AAGACTTTAGGTAAAGTTGGCCGAGTACAACAGATTTATTCAGACAGT

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1138 GATTTAAAGGTGGAAGTTTGTGGAACATCTTGGACATACAATCCAGCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 156546 GATTTAAAGGTGGAAGTTTGTGGAACATCTTGGACATACAATCCAGCAGC

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1188 AGTTTCCAAGGTGGCATCTGCAGGATCAGCCATTAGCAATGCATCTGGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 156596 AGTTTCCAAGGTGGCATCTGCAGGATCAGCCATTAGCAATGCATCTGGTG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1238          AAAGACTCTCACAACTCCTGAAGAAATTATTTGAAACCCAA
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 156646 GTA...CAGAAAGACTCTCACAACTCCTGAAGAAATTATTTGAAACCCAA

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1279 GAATCTGGTGACCTCAATGAAGAATTAGTTAAGGCTGCTGCCAATGGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 158299 GAATCTGGTGACCTCAATGAAGAATTAGTTAAGGCTGCTGCCAATGGAGA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1329 TGTTGCTAAAGTGGAAGATTTGCTTAAAAGACCAGATGTGGAT       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 158349 TGTTGCTAAAGTGGAAGATTTGCTTAAAAGACCAGATGTGGATGTG...T

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1372   GTAAATGGGCAATGTGCTGGCCACACAGCTATGCAAGCTGCTAGTCAG
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 162322 AGGTAAATGGGCAATGTGCTGGCCACACAGCTATGCAAGCTGCTAGTCAG

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1420 AATGGACATGTTGACATTTTGAAGTTACTTTTGAAGCAAAACGTGGATGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 162372 AATGGACATGTTGACATTTTGAAGTTACTTTTGAAGCAAAACGTGGATGT

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1470 CGAAGCAGAG         GATAAAGATGGTGATAGAGCAGTTCACCATG
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 162422 CGAAGCAGAGGTA...TAGGATAAAGATGGTGATAGAGCAGTTCACCATG

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1511 CAGCTTTTGGAGATGAAGGCGCTGTTATAGAAGTACTACATCGAGGTAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 174064 CAGCTTTTGGAGATGAAGGCGCTGTTATAGAAGTACTACATCGAGGTAGT

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1561 GCTGATTTGAATGCTCGAAACAAGCGCCGACAGACACCACTTCATATTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 174114 GCTGATTTGAATGCTCGAAACAAGCGCCGACAGACACCACTTCATATTGC

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1611 TGTCAATAAAGGTCATCTTCAAGTTGTGAAGACTTTATTGGACTTTGGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 174164 TGTCAATAAAGGTCATCTTCAAGTTGTGAAGACTTTATTGGACTTTGGCT

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1661 GTCATCCCAGTCTCCAG         GATTCTGAAGGTGATACCCCTCTT
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 174214 GTCATCCCAGTCTCCAGGTA...AAGGATTCTGAAGGTGATACCCCTCTT

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1702 CATGATGCAATAAGTAAGAAACGTGATGATATCCTAGCAGTTCTTTTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 177936 CATGATGCAATAAGTAAGAAACGTGATGATATCCTAGCAGTTCTTTTGGA

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1752 AGCTGGAGCAGATGTTACCATCACAAACAATAATGGATTTAATGCTCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 177986 AGCTGGAGCAGATGTTACCATCACAAACAATAATGGATTTAATGCTCTGC

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1802 ATCATGCTGCACTAAGGGGAAATCCCAG         TGCAATGCGTGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 178036 ATCATGCTGCACTAAGGGGAAATCCCAGGTA...CAGTGCAATGCGTGTT

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1843 TTACTATCTAAATTACCAAGACCATGGATTGTGGATGAGAAGAAAGATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 196795 TTACTATCTAAATTACCAAGACCATGGATTGTGGATGAGAAGAAAGATGA

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1893 TGGTTATACTGCCTTACATCTGGCTGCCCTTAATAATCACGTAGAAGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 196845 TGGTTATACTGCCTTACATCTGGCTGCCCTTAATAATCACGTAGAAGTGG

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1943 CTGAACTGTTGGTACATCAG         GGTAATGCAAACCTGGATATC
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 196895 CTGAACTGTTGGTACATCAGGTA...CAGGGTAATGCAAACCTGGATATC

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1984 CAGAATGTGAACCAACAAACTGCCCTACACCTTGCTGTTGAACGACAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 201569 CAGAATGTGAACCAACAAACTGCCCTACACCTTGCTGTTGAACGACAGCA

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2034 TACCCAGATTGTTAGG         CTTTTGGTCCGTGCAGGTGCCAAGC
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 201619 TACCCAGATTGTTAGGGTA...TAGCTTTTGGTCCGTGCAGGTGCCAAGC

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2075 TTGATATTCAGGATAAGGATGGGGATACTCCTTTGCATGAAGCTCTAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 202534 TTGATATTCAGGATAAGGATGGGGATACTCCTTTGCATGAAGCTCTAAGG

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2125 CATCACACTTTGTCTCAGCTACGTCAGCTCCAAGATATGCAAGATGTGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 202584 CATCACACTTTGTCTCAGCTACGTCAGCTCCAAGATATGCAAGATGTGGG

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2175 GAAGGTGGATGCTGCCTGGGAGCCATCCAAAAACACG         TTAA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 202634 GAAGGTGGATGCTGCCTGGGAGCCATCCAAAAACACGGTG...CAGTTAA

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2216 TAATGGGACTTGGTACCCAGGGGGCAGAGAAGAAGAGTGCAGCATCTATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 205365 TAATGGGACTTGGTACCCAGGGGGCAGAGAAGAAGAGTGCAGCATCTATT

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2266 GCCTGTTTCTTGGCAGCCAATGGTGCTGACCTGAGCATTCGAAATAAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 205415 GCCTGTTTCTTGGCAGCCAATGGTGCTGACCTGAGCATTCGAAATAAGAA

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2316 GGGTCAATCGCCACTTGATCTCTGTCCTGATCCGAATCTCTGCAAAGCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 205465 GGGTCAATCGCCACTTGATCTCTGTCCTGATCCGAATCTCTGCAAAGCAC

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2366 TGGCAAAGTGTCATAAGGAAAAAGTCAG         TGGTCAAGTGGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 205515 TGGCAAAGTGTCATAAGGAAAAAGTCAGGTT...TAGTGGTCAAGTGGGT

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2407 TCTCGGAGTCCTTCTATGATTAGTAATGATTCTGAAACCTTAGAAGAGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 207626 TCTCGGAGTCCTTCTATGATTAGTAATGATTCTGAAACCTTAGAAGAGTG

   2600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2457 TATGGTGTGCTCAGATATGAAGAGAGATACTCTTTTTGGTCCATGTGGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 207676 TATGGTGTGCTCAGATATGAAGAGAGATACTCTTTTTGGTCCATGTGGAC

   2650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2507 ATATTGCTACCTGTTCTTTATGTTCTCCACGTGTCAAGAAATGCCTCATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 207726 ATATTGCTACCTGTTCTTTATGTTCTCCACGTGTCAAGAAATGCCTCATC

   2700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2557 TGTAAAGAACAGGTTCAATCCAGGACAAAG         ATTGAAGAATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 207776 TGTAAAGAACAGGTTCAATCCAGGACAAAGGTA...TAGATTGAAGAATG

   2750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2598 TGTGGTATGCTCTGACAAGAAAGCAGCTGTTCTTTTTCAACCCTGTGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 211568 TGTGGTATGCTCTGACAAGAAAGCAGCTGTTCTTTTTCAACCCTGTGGCC

   2800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2648 ACATGTGTGCTTGTGAGA         ACTGTGCTAACCTGATGAAAAAG
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 211618 ACATGTGTGCTTGTGAGAGTA...CAGACTGTGCTAACCTGATGAAAAAG

   2850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2689 TGTGTGCAGTGTCGAGCAGTAGTTGAACGAAGAGTGCCTTTCATTATGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 215570 TGTGTGCAGTGTCGAGCAGTAGTTGAACGAAGAGTGCCTTTCATTATGTG

   2900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2739 CTGTGGAGGGAAAAGTTCAGAAGATGCCACTGATGATATCT         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 215620 CTGTGGAGGGAAAAGTTCAGAAGATGCCACTGATGATATCTGTA...TAG

   2950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2780 CAAGTGGGAATATTCCAGTATTACAAAAGGACAAGGATAATACCAATGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 216963 CAAGTGGGAATATTCCAGTATTACAAAAGGACAAGGATAATACCAATGTC

   3000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2830 AATGCAGATGTGCAAAAGTTGCAGCAACAGTTACAAGACATTAAAGAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 217013 AATGCAGATGTGCAAAAGTTGCAGCAACAGTTACAAGACATTAAAGAGCA

   3050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2880 G         ACAATGTGCCCTGTGTGTCTAGATCGTCTGAAGAATATGA
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 217063 GGTA...CAGACAATGTGCCCTGTGTGTCTAGATCGTCTGAAGAATATGA

   3100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2921 TTTTCCTTTGTGGTCACGGAACCTGTCAACTCTGTGGAGACCGCATGAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 222983 TTTTCCTTTGTGGTCACGGAACCTGTCAACTCTGTGGAGACCGCATGAGT

   3150     .    :    .    :    .    :    .    :    .
   2971 GAATGTCCTATCTGTCGCAAGGCTATTGAACGAAGGATTCTTTTGTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 223033 GAATGTCCTATCTGTCGCAAGGCTATTGAACGAAGGATTCTTTTGTAT