seq1 = pF1KB8556.tfa, 2730 bp
seq2 = pF1KB8556/gi568815579r_16255708.tfa (gi568815579r:16255708_16542222), 286515 bp

>pF1KB8556 2730
>gi568815579r:16255708_16542222 (Chr19)

(complement)

1-33  (70278-70310)   100% ->
34-75  (100004-100045)   100% ->
76-165  (100242-100331)   100% ->
166-213  (101314-101361)   100% ->
214-309  (104358-104453)   100% ->
310-372  (105224-105286)   100% ->
373-498  (107733-107858)   100% ->
499-558  (113462-113521)   100% ->
559-792  (116907-117140)   100% ->
793-950  (120747-120904)   100% ->
951-1107  (124119-124275)   100% ->
1108-1193  (124586-124671)   100% ->
1194-1266  (128378-128450)   100% ->
1267-1428  (137474-137635)   100% ->
1429-1626  (138293-138490)   100% ->
1627-1791  (139738-139902)   100% ->
1792-1915  (146756-146879)   100% ->
1916-1966  (148222-148272)   100% ->
1967-2103  (149783-149919)   100% ->
2104-2164  (155992-156052)   100% ->
2165-2247  (157012-157094)   100% ->
2248-2380  (164969-165101)   100% ->
2381-2586  (180239-180444)   100% ->
2587-2730  (186372-186515)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCGGCGCCGCTCATCCCCCTCTCCCAGCAG         ATTCCCAC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
  70278 ATGGCGGCGCCGCTCATCCCCCTCTCCCAGCAGGTA...CAGATTCCCAC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     42 TGGAAATTCGTTGTATGAATCTTATTACAAGCAG         GTCGATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 100012 TGGAAATTCGTTGTATGAATCTTATTACAAGCAGGTA...CAGGTCGATC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     83 CGGCATACACAGGGAGGGTGGGGGCGAGTGAAGCTGCGCTTTTTCTAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100249 CGGCATACACAGGGAGGGTGGGGGCGAGTGAAGCTGCGCTTTTTCTAAAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    133 AAGTCTGGCCTCTCGGACATTATCCTTGGGAAG         ATATGGGA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 100299 AAGTCTGGCCTCTCGGACATTATCCTTGGGAAGGTA...CAGATATGGGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    174 CTTGGCCGATCCAGAAGGTAAAGGGTTCTTGGACAAACAG         G
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 101322 CTTGGCCGATCCAGAAGGTAAAGGGTTCTTGGACAAACAGGTA...CAGG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    215 GTTTCTATGTTGCACTGAGACTGGTGGCCTGTGCACAGAGTGGCCATGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104359 GTTTCTATGTTGCACTGAGACTGGTGGCCTGTGCACAGAGTGGCCATGAA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    265 GTTACCTTGAGCAATCTGAATTTGAGCATGCCACCGCCTAAATTT     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 104409 GTTACCTTGAGCAATCTGAATTTGAGCATGCCACCGCCTAAATTTGTG..

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    310     CACGACACCAGCAGCCCTCTGATGGTCACACCGCCCTCTGCAGAGG
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104459 .CAGCACGACACCAGCAGCCCTCTGATGGTCACACCGCCCTCTGCAGAGG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    356 CCCACTGGGCTGTGAGG         GTGGAAGAAAAGGCCAAATTTGAT
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 105270 CCCACTGGGCTGTGAGGGTA...TAGGTGGAAGAAAAGGCCAAATTTGAT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    397 GGGATTTTTGAAAGCCTCTTGCCCATCAATGGTTTGCTCTCTGGAGACAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107757 GGGATTTTTGAAAGCCTCTTGCCCATCAATGGTTTGCTCTCTGGAGACAA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    447 AGTCAAGCCAGTCCTCATGAACTCAAAGCTGCCTCTTGATGTCCTGGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107807 AGTCAAGCCAGTCCTCATGAACTCAAAGCTGCCTCTTGATGTCCTGGGCA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    497 GG         GTCTGGGACCTCAGTGACATTGACAAGGATGGGCACTTG
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107857 GGGTA...CAGGTCTGGGACCTCAGTGACATTGACAAGGATGGGCACTTG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    538 GATCGAGATGAGTTCGCTGTG         GCCATGCACTTGGTGTACCG
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 113501 GATCGAGATGAGTTCGCTGTGGTA...CAGGCCATGCACTTGGTGTACCG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    579 AGCCCTGGAGAAGGAGCCCGTGCCCTCCGCCCTGCCCCCGTCCCTCATCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116927 AGCCCTGGAGAAGGAGCCCGTGCCCTCCGCCCTGCCCCCGTCCCTCATCC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    629 CACCCTCCAAGAGAAAGAAGACTGTGTTCCCTGGCGCCGTCCCCGTCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116977 CACCCTCCAAGAGAAAGAAGACTGTGTTCCCTGGCGCCGTCCCCGTCCTG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    679 CCTGCCAGCCCCCCACCAAAAGACAGCCTCCGCTCCACGCCGTCCCACGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117027 CCTGCCAGCCCCCCACCAAAAGACAGCCTCCGCTCCACGCCGTCCCACGG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    729 CAGCGTCAGCAGCCTCAACAGCACAGGGAGCCTGTCCCCCAAGCACAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117077 CAGCGTCAGCAGCCTCAACAGCACAGGGAGCCTGTCCCCCAAGCACAGCC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    779 TCAAGCAAACACAG         CCAACAGTGAACTGGGTGGTGCCCGTG
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 117127 TCAAGCAAACACAGGTA...CAGCCAACAGTGAACTGGGTGGTGCCCGTG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    820 GCAGACAAGATGCGATTTGATGAGATATTCCTGAAGACCGACCTGGACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120774 GCAGACAAGATGCGATTTGATGAGATATTCCTGAAGACCGACCTGGACCT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    870 GGATGGCTACGTGAGTGGCCAGGAGGTGAAGGAGATCTTCATGCACTCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120824 GGATGGCTACGTGAGTGGCCAGGAGGTGAAGGAGATCTTCATGCACTCGG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    920 GCCTCACCCAGAACCTTCTAGCACACATATG         GGCCCTGGCC
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 120874 GCCTCACCCAGAACCTTCTAGCACACATATGGTA...CAGGGCCCTGGCC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    961 GATACGAGGCAAACGGGGAAGTTAAGCAAAGACCAATTCGCGTTAGCTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124129 GATACGAGGCAAACGGGGAAGTTAAGCAAAGACCAATTCGCGTTAGCTAT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1011 GTATTTCATTCAGCAGAAGGTCAGTAAAGGCATCGACCCTCCTCAAGTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124179 GTATTTCATTCAGCAGAAGGTCAGTAAAGGCATCGACCCTCCTCAAGTCC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1061 TCTCGCCGGACATGGTCCCGCCTTCGGAGAGAGGCACGCCCGGCCCG   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 124229 TCTCGCCGGACATGGTCCCGCCTTCGGAGAGAGGCACGCCCGGCCCGGTG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1108       GACAGTTCAGGCTCTCTCGGCTCCGGGGAGTTTACTGGCGTGAA
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124279 ...TAGGACAGTTCAGGCTCTCTCGGCTCCGGGGAGTTTACTGGCGTGAA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1152 GGAGCTTGATGACATCAGTCAAGAGATTGCCCAGTTACAAAG        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 124630 GGAGCTTGATGACATCAGTCAAGAGATTGCCCAGTTACAAAGGTA...CA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1194  AGAGAAATATTCACTGGAACAAGACATTCGAGAAAAGGAAGAGGCAATC
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128377 GAGAGAAATATTCACTGGAACAAGACATTCGAGAAAAGGAAGAGGCAATC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1243 AGACAGAAAACCAGCGAGGTGCAG         GAATTACAAAATGACCT
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 128427 AGACAGAAAACCAGCGAGGTGCAGGTA...TAGGAATTACAAAATGACCT

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1284 AGACCGGGAAACAAGCAGTTTGCAGGAGCTCGAGGCTCAGAAACAGGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 137491 AGACCGGGAAACAAGCAGTTTGCAGGAGCTCGAGGCTCAGAAACAGGATG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1334 CTCAAGACCGCCTGGACGAGATGGACCAGCAGAAGGCCAAGCTCCGAGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 137541 CTCAAGACCGCCTGGACGAGATGGACCAGCAGAAGGCCAAGCTCCGAGAC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1384 ATGCTGAGCGACGTCCGGCAGAAGTGCCAGGATGAGACTCAGATG     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 137591 ATGCTGAGCGACGTCCGGCAGAAGTGCCAGGATGAGACTCAGATGGTG..

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1429     ATCTCATCACTGAAAACGCAAATCCAATCTCAGGAATCTGACTTAA
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 137641 .CAGATCTCATCACTGAAAACGCAAATCCAATCTCAGGAATCTGACTTAA

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1475 AGTCCCAGGAAGACGATCTGAACCGAGCCAAGTCGGAGCTGAACCGATTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 138339 AGTCCCAGGAAGACGATCTGAACCGAGCCAAGTCGGAGCTGAACCGATTG

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1525 CAGCAGGAGGAAACCCAGCTGGAGCAGAGCATTCAGGCTGGGCGAGTCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 138389 CAGCAGGAGGAAACCCAGCTGGAGCAGAGCATTCAGGCTGGGCGAGTCCA

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1575 GCTGGAAACCATCATCAAGTCCCTGAAGTCAACGCAAGACGAAATCAACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 138439 GCTGGAAACCATCATCAAGTCCCTGAAGTCAACGCAAGACGAAATCAACC

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1625 AG         GCAAGGAGCAAACTTTCCCAGCTGCATGAAAGCCGCCAG
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 138489 AGGTA...CAGGCAAGGAGCAAACTTTCCCAGCTGCATGAAAGCCGCCAG

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1666 GAGGCCCACAGGAGCCTGGAGCAGTATGACCAGGTGCTCGATGGAGCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139777 GAGGCCCACAGGAGCCTGGAGCAGTATGACCAGGTGCTCGATGGAGCCCA

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1716 TGGTGCCAGCCTGACCGACCTGGCCAACCTGAGCGAAGGCGTCTCCCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139827 TGGTGCCAGCCTGACCGACCTGGCCAACCTGAGCGAAGGCGTCTCCCTGG

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1766 CAGAGAGGGGCAGTTTTGGAGCCATG         GATGATCCTTTCAAA
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 139877 CAGAGAGGGGCAGTTTTGGAGCCATGGTA...TAGGATGATCCTTTCAAA

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1807 AATAAAGCCTTGTTATTTAGCAACAACACGCAAGAGTTGCATCCGGATCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 146771 AATAAAGCCTTGTTATTTAGCAACAACACGCAAGAGTTGCATCCGGATCC

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1857 TTTCCAGACAGAAGACCCCTTCAAATCTGACCCATTTAAAGGAGCTGACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 146821 TTTCCAGACAGAAGACCCCTTCAAATCTGACCCATTTAAAGGAGCTGACC

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1907 CCTTCAAAG         GCGACCCGTTCCAGAATGACCCCTTTGCAGAA
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 146871 CCTTCAAAGGTA...CAGGCGACCCGTTCCAGAATGACCCCTTTGCAGAA

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1948 CAGCAGACAACTTCAACAG         ATCCATTTGGAGGGGACCCTTT
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 148254 CAGCAGACAACTTCAACAGGTA...TAGATCCATTTGGAGGGGACCCTTT

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1989 CAAAGAAAGTGACCCATTCCGTGGCTCTGCCACTGACGACTTCTTCAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 149805 CAAAGAAAGTGACCCATTCCGTGGCTCTGCCACTGACGACTTCTTCAAGA

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2039 AACAGACAAAGAATGACCCATTTACCTCGGATCCATTCACGAAAAACCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 149855 AACAGACAAAGAATGACCCATTTACCTCGGATCCATTCACGAAAAACCCT

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2089 TCCTTACCTTCGAAG         CTCGACCCCTTTGAATCCAGTGATCC
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 149905 TCCTTACCTTCGAAGGTG...TAGCTCGACCCCTTTGAATCCAGTGATCC

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2130 CTTTTCATCCTCCAGTGTCTCCTCAAAAGGATCAG         ATCCCT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 156018 CTTTTCATCCTCCAGTGTCTCCTCAAAAGGATCAGGTG...CAGATCCCT

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2171 TTGGAACCTTAGATCCCTTCGGAAGTGGGTCCTTCAATAGTGCTGAAGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 157018 TTGGAACCTTAGATCCCTTCGGAAGTGGGTCCTTCAATAGTGCTGAAGGC

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2221 TTTGCCGACTTCAGCCAGATGTCCAAG         CCCCCACCTTCTGG
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 157068 TTTGCCGACTTCAGCCAGATGTCCAAGGTA...CAGCCCCCACCTTCTGG

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2262 CCCTTTCACCTCCTCCTTGGGAGGGGCAGGATTCTCAGATGACCCCTTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 164983 CCCTTTCACCTCCTCCTTGGGAGGGGCAGGATTCTCAGATGACCCCTTTA

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2312 AAAGTAAACAGGACACTCCTGCTCTGCCTCCGAAGAAACCTGCTCCTCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 165033 AAAGTAAACAGGACACTCCTGCTCTGCCTCCGAAGAAACCTGCTCCTCCA

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2362 CGGCCTAAACCGCCCAGCG         GTAAAAGTACACCTGTAAGCCA
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 165083 CGGCCTAAACCGCCCAGCGGTC...CAGGTAAAAGTACACCTGTAAGCCA

   2600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2403 GCTTGGTTCCGCAGACTTTCCCGAGGCCCCCGATCCATTCCAGCCACTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 180261 GCTTGGTTCCGCAGACTTTCCCGAGGCCCCCGATCCATTCCAGCCACTCG

   2650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2453 GGGCTGACAGCGGCGACCCGTTCCAAAGTAAAAAGGGGTTTGGGGACCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 180311 GGGCTGACAGCGGCGACCCGTTCCAAAGTAAAAAGGGGTTTGGGGACCCG

   2700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2503 TTTAGTGGAAAAGACCCATTTGTCCCCTCCTCTGCAGCTAAACCTTCTAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 180361 TTTAGTGGAAAAGACCCATTTGTCCCCTCCTCTGCAGCTAAACCTTCTAA

   2750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2553 GGCCTCTGCCTCGGGCTTTGCAGACTTCACCTCT         TTTGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 180411 GGCCTCTGCCTCGGGCTTTGCAGACTTCACCTCTGTA...CAGTTTGGCA

   2800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2594 ATGAGGAGCAGCAGCTGGCGTGGGCCAAGCGGGAGAGCGAGAAGGCGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 186379 ATGAGGAGCAGCAGCTGGCGTGGGCCAAGCGGGAGAGCGAGAAGGCGGAA

   2850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2644 CAGGAGAGGCTGGCGCGGCTGCGGCGGCAGGAGCAGGAGGACCTGGAACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 186429 CAGGAGAGGCTGGCGCGGCTGCGGCGGCAGGAGCAGGAGGACCTGGAACT

   2900     .    :    .    :    .    :    .
   2694 GGCCATCGCGCTCAGCAAGGCTGACATGCCTGCCGCC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 186479 GGCCATCGCGCTCAGCAAGGCTGACATGCCTGCCGCC