seq1 = pF1KB8536.tfa, 2685 bp
seq2 = pF1KB8536/gi568815588r_65820333.tfa (gi568815588r:65820333_67747513), 1927181 bp

>pF1KB8536 2685
>gi568815588r:65820333_67747513 (Chr10)

(complement)

1-99  (100001-100099)   100% ->
100-292  (140465-140657)   100% ->
293-459  (207845-208011)   100% ->
460-579  (225553-225672)   100% ->
580-843  (527644-527907)   100% ->
844-1047  (566994-567197)   100% ->
1048-1128  (971990-972070)   100% ->
1129-1283  (981098-981252)   100% ==
1373-1531  (1226739-1226897)   100% ->
1532-1732  (1368162-1368362)   100% ->
1733-1884  (1466893-1467044)   100% ->
1885-1977  (1644265-1644357)   100% ->
1978-2159  (1678025-1678206)   100% ->
2160-2265  (1758717-1758822)   100% ->
2266-2400  (1780768-1780902)   100% ->
2401-2685  (1826897-1827181)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTCAGCTGAAACACCAATCACATTGAATATCGATCCTCAGGATCTGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTCAGCTGAAACACCAATCACATTGAATATCGATCCTCAGGATCTGCA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGTCCAAACATTCACCGTGGAGAAGCTACTGGAGCCTCTCATAATCCAG 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 100051 GGTCCAAACATTCACCGTGGAGAAGCTACTGGAGCCTCTCATAATCCAGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    100         GTTACCACACTTGTAAACTGTCCCCAGAACCCTTCCAGCAGG
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TA...TAGGTTACCACACTTGTAAACTGTCCCCAGAACCCTTCCAGCAGG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 AAAAAAGGACGTTCGAAAAGAGCCAGTGTCCTTCTAGCTTCTGTGGAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 140507 AAAAAAGGACGTTCGAAAAGAGCCAGTGTCCTTCTAGCTTCTGTGGAGGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 AGCAACTTGGAATTTATTAGACAAGGGAGAGAAGATTGCCCAGGAAGCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 140557 AGCAACTTGGAATTTATTAGACAAGGGAGAGAAGATTGCCCAGGAAGCTA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 CAGTTTTAAAGGATGAGCTTACGGCTTCACTTGAGGAAGTTCGCAAAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 140607 CAGTTTTAAAGGATGAGCTTACGGCTTCACTTGAGGAAGTTCGCAAAGAA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 A         GTGAAGCTCTGAAAGTATCAGCTGAGAGATTTACAGATGA
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 140657 AGTG...CAGGTGAAGCTCTGAAAGTATCAGCTGAGAGATTTACAGATGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 CCCCTGTTTTCTCCCAAAAAGGGAGGCTGTGGTTCAAGCTGCCCGTGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 207885 CCCCTGTTTTCTCCCAAAAAGGGAGGCTGTGGTTCAAGCTGCCCGTGCCT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 TGCTGGCTGCGGTGACGAGACTCCTTATCCTTGCGGACATGATTGATGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 207935 TGCTGGCTGCGGTGACGAGACTCCTTATCCTTGCGGACATGATTGATGTC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 ATGTGCCTCTTGCAACATGTGTCAGCT         TTTCAAAGGACATT
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 207985 ATGTGCCTCTTGCAACATGTGTCAGCTGTA...CAGTTTCAAAGGACATT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 TGAGTCTCTCAAAAATGTTGCCAACAAATCTGACCTCCAGAAAACCTACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 225567 TGAGTCTCTCAAAAATGTTGCCAACAAATCTGACCTCCAGAAAACCTACC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 AGAAGCTTGGGAAGGAGCTGGAAAATTTGGATTATTTAGCCTTCAAACGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 225617 AGAAGCTTGGGAAGGAGCTGGAAAATTTGGATTATTTAGCCTTCAAACGT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 CAGCAG         GACTTAAAATCTCCAAATCAGAGAGATGAAATTGC
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 225667 CAGCAGGTA...CAGGACTTAAAATCTCCAAATCAGAGAGATGAAATTGC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 AGGAGCCCGAGCTTCACTGAAGGAGAACTCTCCCCTCTTGCATTCAATTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 527679 AGGAGCCCGAGCTTCACTGAAGGAGAACTCTCCCCTCTTGCATTCAATTT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 GTTCAGCTTGTTTGGAGCATTCTGATGTTGCTTCCCTCAAAGCAAGCAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 527729 GTTCAGCTTGTTTGGAGCATTCTGATGTTGCTTCCCTCAAAGCAAGCAAG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    715 GACACAGTTTGTGAAGAAATTCAGAATGCTCTCAATGTAATTTCAAATGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 527779 GACACAGTTTGTGAAGAAATTCAGAATGCTCTCAATGTAATTTCAAATGC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    765 TTCACAAGGGATCCAGAATATGACAACCCCACCAGAACCTCAGGCAGCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 527829 TTCACAAGGGATCCAGAATATGACAACCCCACCAGAACCTCAGGCAGCAA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    815 CCCTGGGAAGTGCCCTTGATGAGCTGGAG         AATTTAATTGTC
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 527879 CCCTGGGAAGTGCCCTTGATGAGCTGGAGGTA...TAGAATTTAATTGTC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    856 CTGAATCCACTCACAGTAACTGAGGAGGAAATACGACCATCACTAGAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 567006 CTGAATCCACTCACAGTAACTGAGGAGGAAATACGACCATCACTAGAGAA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    906 ACGCCTTGAAGCCATTATCAGTGGGGCTGCTCTGCTGGCGGATTCTTCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 567056 ACGCCTTGAAGCCATTATCAGTGGGGCTGCTCTGCTGGCGGATTCTTCAT

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    956 GTACGAGGGACTTACACCGAGAGCGGATTATCGCAGAATGCAACGCCATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 567106 GTACGAGGGACTTACACCGAGAGCGGATTATCGCAGAATGCAACGCCATT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1006 CGCCAGGCTCTTCAGGATCTGCTTTCAGAGTACATGAACAAC        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 567156 CGCCAGGCTCTTCAGGATCTGCTTTCAGAGTACATGAACAACGTA...CA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1048  GCTGGAAAAAAAGAAAGGAGTAATACCCTGAATATTGCTTTAGACAACA
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 971989 GGCTGGAAAAAAAGAAAGGAGTAATACCCTGAATATTGCTTTAGACAACA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1097 TGTGTAAGAAGACAAGAGACCTTCGCAGACAG         CTCCGCAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 972039 TGTGTAAGAAGACAAGAGACCTTCGCAGACAGGTG...CAGCTCCGCAAG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1138 GCTATTATAGATCATGTGTCAGACTCTTTCCTGGATACGACAGTCCCTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 981107 GCTATTATAGATCATGTGTCAGACTCTTTCCTGGATACGACAGTCCCTCT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1188 TTTGGTTCTCATTGAAGCTGCTAAGAATGGCCGGGAAAAGGAAATAAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 981157 TTTGGTTCTCATTGAAGCTGCTAAGAATGGCCGGGAAAAGGAAATAAAAG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .
   1238 AATATGCTGCGATATTTCATGAACACACCAGCAGGCTTGTAGAGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 981207 AATATGCTGCGATATTTCATGAACACACCAGCAGGCTTGTAGAGGT

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1373 AGATTATTAATGCTGCACTTGCTTTGGCTGCAAGACCCAAAAGTCAAGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1226739 AGATTATTAATGCTGCACTTGCTTTGGCTGCAAGACCCAAAAGTCAAGCG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1423 GTCAAAAACACCATGGAAATGTACAAGCGTACATGGGAGAATCATATACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1226789 GTCAAAAACACCATGGAAATGTACAAGCGTACATGGGAGAATCATATACA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1473 TGTCCTCACTGAAGCCGTAGATGACATTACAAGCATTGATGACTTCCTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1226839 TGTCCTCACTGAAGCCGTAGATGACATTACAAGCATTGATGACTTCCTTG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1523 CTGTATCTG         AAAGCCATATCTTGGAAGATGTCAACAAGTGT
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
1226889 CTGTATCTGGTA...CAGAAAGCCATATCTTGGAAGATGTCAACAAGTGT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1564 ATCATAGCCTTAAGAGACCAGGATGCTGATAATTTAGACCGTGCTGCGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1368194 ATCATAGCCTTAAGAGACCAGGATGCTGATAATTTAGACCGTGCTGCGGG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1614 TGCTATCAGAGGCCGGGCAGCAAGAGTTGCTCACATCGTCACGGGTGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1368244 TGCTATCAGAGGCCGGGCAGCAAGAGTTGCTCACATCGTCACGGGTGAAA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1664 TGGACAGTTACGAGCCAGGGGCTTACACGGAAGGTGTAATGAGAAATGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1368294 TGGACAGTTACGAGCCAGGGGCTTACACGGAAGGTGTAATGAGAAATGTT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1714 AACTTCCTTACAAGTACTG         TAATTCCTGAATTTGTAACACA
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
1368344 AACTTCCTTACAAGTACTGGTA...CAGTAATTCCTGAATTTGTAACACA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1755 AGTGAATGTTGCCTTGGAAGCCTTAAGCAAAAGCTCATTGAATGTGTTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1466915 AGTGAATGTTGCCTTGGAAGCCTTAAGCAAAAGCTCATTGAATGTGTTGG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1805 ATGATAATCAATTTGTGGACATCTCAAAGAAGATCTATGATACAATTCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1466965 ATGATAATCAATTTGTGGACATCTCAAAGAAGATCTATGATACAATTCAT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1855 GATATCAGATGTTCAGTCATGATGATTCGG         ACCCCAGAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
1467015 GATATCAGATGTTCAGTCATGATGATTCGGGTA...TAGACCCCAGAGGA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1896 ACTGGAGGATGTTTCTGACCTTGAAGAGGAACACGAGGTCCGCAGTCACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1644276 ACTGGAGGATGTTTCTGACCTTGAAGAGGAACACGAGGTCCGCAGTCACA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1946 CCAGCATTCAGACCGAAGGGAAAACTGATAGG         GCTAAGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
1644326 CCAGCATTCAGACCGAAGGGAAAACTGATAGGGTA...TAGGCTAAGATG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1987 ACTCAACTGCCTGAGGCAGAAAAAGAAAAGATTGCTGAGCAAGTTGCTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1678034 ACTCAACTGCCTGAGGCAGAAAAAGAAAAGATTGCTGAGCAAGTTGCTGA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2037 TTTCAAGAAAGTAAAGAGTAAGCTGGATGCTGAGATTGAGATATGGGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1678084 TTTCAAGAAAGTAAAGAGTAAGCTGGATGCTGAGATTGAGATATGGGATG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2087 ATACAAGCAACGACATCATTGTTCTGGCCAAGAACATGTGTATGATCATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1678134 ATACAAGCAACGACATCATTGTTCTGGCCAAGAACATGTGTATGATCATG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2137 ATGGAGATGACAGACTTCACTAG         GGGCAAAGGACCACTAAA
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
1678184 ATGGAGATGACAGACTTCACTAGGTA...CAGGGGCAAAGGACCACTAAA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2178 GCATACAACTGATGTGATCTATGCAGCGAAAATGATATCAGAATCAGGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1758735 GCATACAACTGATGTGATCTATGCAGCGAAAATGATATCAGAATCAGGAT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2228 CAAGGATGGATGTCCTTGCTCGGCAGATTGCTAATCAG         TGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
1758785 CAAGGATGGATGTCCTTGCTCGGCAGATTGCTAATCAGGTG...TAGTGC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2269 CCAGATCCATCTTGTAAACAGGACTTGTTGGCCTACCTGGAACAGATTAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1780771 CCAGATCCATCTTGTAAACAGGACTTGTTGGCCTACCTGGAACAGATTAA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2319 GTTCTACTCCCACCAACTGAAAATCTGCAGTCAAGTTAAAGCTGAGATCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1780821 GTTCTACTCCCACCAACTGAAAATCTGCAGTCAAGTTAAAGCTGAGATCC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2369 AGAACCTGGGAGGAGAGCTCATCATGTCAGCT         TTGGACAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
1780871 AGAACCTGGGAGGAGAGCTCATCATGTCAGCTGTG...CAGTTGGACAGT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2410 GTCACATCCCTGATCCAAGCAGCCAAAAATTTAATGAATGCTGTAGTGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1826906 GTCACATCCCTGATCCAAGCAGCCAAAAATTTAATGAATGCTGTAGTGCA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2460 AACAGTGAAAATGTCTTACATTGCCTCAACCAAGATCATCCGAATCCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1826956 AACAGTGAAAATGTCTTACATTGCCTCAACCAAGATCATCCGAATCCAGA

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2510 GTCCTGCTGGGCCCCGGCACCCAGTTGTGATGTGGAGAATGAAGGCTCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1827006 GTCCTGCTGGGCCCCGGCACCCAGTTGTGATGTGGAGAATGAAGGCTCCT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2560 GCAAAAAAACCCTTGATTAAAAGAGAGAAGCCAGAGGAAACGTGTGCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1827056 GCAAAAAAACCCTTGATTAAAAGAGAGAAGCCAGAGGAAACGTGTGCAGC

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2610 TGTCAGACGAGGCTCAGCAAAGAAAAAAATCCATCCATTGCAAGTCATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1827106 TGTCAGACGAGGCTCAGCAAAGAAAAAAATCCATCCATTGCAAGTCATGA

   1350     .    :    .    :    .
   2660 GTGAATTTAGAGGAAGACAAATCTAC
        ||||||||||||||||||||||||||
1827156 GTGAATTTAGAGGAAGACAAATCTAC