seq1 = pF1KB8525.tfa, 2883 bp
seq2 = pF1KB8525/gi568815592r_29503546.tfa (gi568815592r:29503546_29732385), 228840 bp

>pF1KB8525 2883
>gi568815592r:29503546_29732385 (Chr6)

(complement)

1-85  (100001-100085)   100% ->
86-289  (100787-100990)   100% ->
290-475  (101743-101928)   100% ->
476-496  (103279-103299)   100% ->
497-657  (104740-104900)   100% ->
658-792  (108362-108496)   100% ->
793-963  (108911-109081)   100% ->
964-1065  (110181-110282)   100% ->
1066-1131  (110569-110634)   100% ->
1132-1323  (111094-111285)   100% ->
1324-1566  (118901-119143)   100% ->
1567-1630  (119772-119835)   100% ->
1631-1708  (121385-121462)   100% ->
1709-1859  (123007-123157)   100% ->
1860-1992  (123653-123785)   100% ->
1993-2109  (125168-125284)   100% ->
2110-2217  (125382-125489)   100% ->
2218-2311  (125902-125995)   100% ->
2312-2439  (126690-126817)   100% ->
2440-2568  (127398-127526)   100% ->
2569-2712  (127749-127892)   100% ->
2713-2883  (128670-128840)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTTGCTGCTGCTGCTACTGGCGCCACTCTTCCTCCGCCCCCCGGGCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTTGCTGCTGCTGCTACTGGCGCCACTCTTCCTCCGCCCCCCGGGCGC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGGCGGGGCGCAGACCCCCAACGCCACCTCAGAAG         GTTGCC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 100051 GGGCGGGGCGCAGACCCCCAACGCCACCTCAGAAGGTG...TAGGTTGCC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 AGATCATACACCCGCCCTGGGAAGGGGGCATCAGGTACCGGGGCCTGACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100793 AGATCATACACCCGCCCTGGGAAGGGGGCATCAGGTACCGGGGCCTGACT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 CGGGACCAGGTGAAGGCTATCAACTTCCTGCCAGTGGACTATGAGATTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100843 CGGGACCAGGTGAAGGCTATCAACTTCCTGCCAGTGGACTATGAGATTGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 GTATGTGTGCCGGGGGGAGCGCGAGGTGGTGGGGCCCAAGGTCCGCAAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100893 GTATGTGTGCCGGGGGGAGCGCGAGGTGGTGGGGCCCAAGGTCCGCAAGT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 GCCTGGCCAACGGCTCCTGGACAGATATGGACACACCCAGCCGCTGTG  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 100943 GCCTGGCCAACGGCTCCTGGACAGATATGGACACACCCAGCCGCTGTGGT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    290        TCCGAATCTGCTCCAAGTCTTATTTGACCCTGGAAAATGGGAA
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100993 G...CAGTCCGAATCTGCTCCAAGTCTTATTTGACCCTGGAAAATGGGAA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 GGTTTTCCTGACGGGTGGGGACCTCCCAGCTCTGGACGGAGCCCGGGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101786 GGTTTTCCTGACGGGTGGGGACCTCCCAGCTCTGGACGGAGCCCGGGTGG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 ATTTCCGGTGTGACCCCGACTTCCATCTGGTGGGCAGCTCCCGGAGCATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101836 ATTTCCGGTGTGACCCCGACTTCCATCTGGTGGGCAGCTCCCGGAGCATC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 TGTAGTCAGGGCCAGTGGAGCACCCCCAAGCCCCACTGCCAGG       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 101886 TGTAGTCAGGGCCAGTGGAGCACCCCCAAGCCCCACTGCCAGGGTG...C

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    476   TGAATCGAACGCCACACTCAG         AACGGCGCGCAGTGTACA
        >>|||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 103277 AGTGAATCGAACGCCACACTCAGGTG...CAGAACGGCGCGCAGTGTACA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 TCGGGGCACTGTTTCCCATGAGCGGGGGCTGGCCAGGGGGCCAGGCCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104758 TCGGGGCACTGTTTCCCATGAGCGGGGGCTGGCCAGGGGGCCAGGCCTGC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 CAGCCCGCGGTGGAGATGGCGCTGGAGGACGTGAATAGCCGCAGGGACAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104808 CAGCCCGCGGTGGAGATGGCGCTGGAGGACGTGAATAGCCGCAGGGACAT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 CCTGCCGGACTATGAGCTCAAGCTCATCCACCACGACAGCAAG       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 104858 CCTGCCGGACTATGAGCTCAAGCTCATCCACCACGACAGCAAGGTA...C

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    658   TGTGATCCAGGCCAAGCCACCAAGTACCTATATGAGCTGCTCTACAAC
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108360 AGTGTGATCCAGGCCAAGCCACCAAGTACCTATATGAGCTGCTCTACAAC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 GACCCTATCAAGATCATCCTTATGCCTGGCTGCAGCTCTGTCTCCACGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108410 GACCCTATCAAGATCATCCTTATGCCTGGCTGCAGCTCTGTCTCCACGCT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 GGTGGCTGAGGCTGCTAGGATGTGGAACCTCATTGTG         CTTT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 108460 GGTGGCTGAGGCTGCTAGGATGTGGAACCTCATTGTGGTA...CAGCTTT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    797 CCTATGGCTCCAGCTCACCAGCCCTGTCAAACCGGCAGCGTTTCCCCACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108915 CCTATGGCTCCAGCTCACCAGCCCTGTCAAACCGGCAGCGTTTCCCCACT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    847 TTCTTCCGAACGCACCCATCAGCCACACTCCACAACCCTACCCGCGTGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108965 TTCTTCCGAACGCACCCATCAGCCACACTCCACAACCCTACCCGCGTGAA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    897 ACTCTTTGAAAAGTGGGGCTGGAAGAAGATTGCTACCATCCAGCAGACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109015 ACTCTTTGAAAAGTGGGGCTGGAAGAAGATTGCTACCATCCAGCAGACCA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    947 CTGAGGTCTTCACTTCG         ACTCTGGACGACCTGGAGGAACGA
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 109065 CTGAGGTCTTCACTTCGGTG...AAGACTCTGGACGACCTGGAGGAACGA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    988 GTGAAGGAGGCTGGAATTGAGATTACTTTCCGCCAGAGTTTCTTCTCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110205 GTGAAGGAGGCTGGAATTGAGATTACTTTCCGCCAGAGTTTCTTCTCAGA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1038 TCCAGCTGTGCCCGTCAAAAACCTGAAG         CGCCAGGATGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 110255 TCCAGCTGTGCCCGTCAAAAACCTGAAGGTC...TAGCGCCAGGATGCCC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1079 GAATCATCGTGGGACTTTTCTATGAGACTGAAGCCCGGAAAGTTTTTTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110582 GAATCATCGTGGGACTTTTCTATGAGACTGAAGCCCGGAAAGTTTTTTGT

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1129 GAG         GTGTACAAGGAGCGTCTCTTTGGGAAGAAGTACGTCTG
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110632 GAGGTG...CAGGTGTACAAGGAGCGTCTCTTTGGGAAGAAGTACGTCTG

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1170 GTTCCTCATTGGGTGGTATGCTGACAATTGGTTCAAGATCTACGACCCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111132 GTTCCTCATTGGGTGGTATGCTGACAATTGGTTCAAGATCTACGACCCTT

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1220 CTATCAACTGCACAGTGGATGAGATGACTGAGGCGGTGGAGGGCCACATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111182 CTATCAACTGCACAGTGGATGAGATGACTGAGGCGGTGGAGGGCCACATC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1270 ACAACTGAGATTGTCATGCTGAATCCTGCCAATACCCGCAGCATTTCCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111232 ACAACTGAGATTGTCATGCTGAATCCTGCCAATACCCGCAGCATTTCCAA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1320 CATG         ACATCCCAGGAATTTGTGGAGAAACTAACCAAGCGAC
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111282 CATGGTG...AAGACATCCCAGGAATTTGTGGAGAAACTAACCAAGCGAC

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1361 TGAAAAGACACCCTGAGGAGACAGGAGGCTTCCAGGAGGCACCGCTGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118938 TGAAAAGACACCCTGAGGAGACAGGAGGCTTCCAGGAGGCACCGCTGGCC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1411 TATGATGCCATCTGGGCCTTGGCACTGGCCCTGAACAAGACATCTGGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118988 TATGATGCCATCTGGGCCTTGGCACTGGCCCTGAACAAGACATCTGGAGG

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1461 AGGCGGCCGTTCTGGTGTGCGCCTGGAGGACTTCAACTACAACAACCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119038 AGGCGGCCGTTCTGGTGTGCGCCTGGAGGACTTCAACTACAACAACCAGA

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1511 CCATTACCGACCAAATCTACCGGGCAATGAACTCTTCGTCCTTTGAGGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119088 CCATTACCGACCAAATCTACCGGGCAATGAACTCTTCGTCCTTTGAGGGT

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1561 GTCTCT         GGCCATGTGGTGTTTGATGCCAGCGGCTCTCGGAT
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119138 GTCTCTGTG...CAGGGCCATGTGGTGTTTGATGCCAGCGGCTCTCGGAT

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1602 GGCATGGACGCTTATCGAGCAGCTTCAGG         GTGGCAGCTACA
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 119807 GGCATGGACGCTTATCGAGCAGCTTCAGGGTT...CAGGTGGCAGCTACA

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1643 AGAAGATTGGCTACTATGACAGCACCAAGGATGATCTTTCCTGGTCCAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121397 AGAAGATTGGCTACTATGACAGCACCAAGGATGATCTTTCCTGGTCCAAA

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1693 ACAGATAAATGGATTG         GAGGGTCCCCCCCAGCTGACCAGAC
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 121447 ACAGATAAATGGATTGGTG...CAGGAGGGTCCCCCCCAGCTGACCAGAC

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1734 CCTGGTCATCAAGACATTCCGCTTCCTGTCACAGAAACTCTTTATCTCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123032 CCTGGTCATCAAGACATTCCGCTTCCTGTCACAGAAACTCTTTATCTCCG

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1784 TCTCAGTTCTCTCCAGCCTGGGCATTGTCCTAGCTGTTGTCTGTCTGTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123082 TCTCAGTTCTCTCCAGCCTGGGCATTGTCCTAGCTGTTGTCTGTCTGTCC

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1834 TTTAACATCTACAACTCACATGTCCG         TTATATCCAGAACTC
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 123132 TTTAACATCTACAACTCACATGTCCGGTA...TAGTTATATCCAGAACTC

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1875 ACAGCCCAACCTGAACAACCTGACTGCTGTGGGCTGCTCACTGGCTTTAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123668 ACAGCCCAACCTGAACAACCTGACTGCTGTGGGCTGCTCACTGGCTTTAG

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1925 CTGCTGTCTTCCCCCTGGGGCTCGATGGTTACCACATTGGGAGGAACCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123718 CTGCTGTCTTCCCCCTGGGGCTCGATGGTTACCACATTGGGAGGAACCAG

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1975 TTTCCTTTCGTCTGCCAG         GCCCGCCTCTGGCTCCTGGGCCT
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 123768 TTTCCTTTCGTCTGCCAGGTG...TAGGCCCGCCTCTGGCTCCTGGGCCT

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2016 GGGCTTTAGTCTGGGCTACGGTTCCATGTTCACCAAGATTTGGTGGGTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125191 GGGCTTTAGTCTGGGCTACGGTTCCATGTTCACCAAGATTTGGTGGGTCC

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2066 ACACGGTCTTCACAAAGAAGGAAGAAAAGAAGGAGTGGAGGAAG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 125241 ACACGGTCTTCACAAAGAAGGAAGAAAAGAAGGAGTGGAGGAAGGTG...

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2110    ACTCTGGAACCCTGGAAGCTGTATGCCACAGTGGGCCTGCTGGTGGG
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125379 CAGACTCTGGAACCCTGGAAGCTGTATGCCACAGTGGGCCTGCTGGTGGG

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2157 CATGGATGTCCTCACTCTCGCCATCTGGCAGATCGTGGACCCTCTGCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125429 CATGGATGTCCTCACTCTCGCCATCTGGCAGATCGTGGACCCTCTGCACC

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2207 GGACCATTGAG         ACATTTGCCAAGGAGGAACCTAAGGAAGAT
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 125479 GGACCATTGAGGTA...TAGACATTTGCCAAGGAGGAACCTAAGGAAGAT

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2248 ATTGACGTCTCTATTCTGCCCCAGCTGGAGCATTGCAGCTCCAGGAAGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125932 ATTGACGTCTCTATTCTGCCCCAGCTGGAGCATTGCAGCTCCAGGAAGAT

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2298 GAATACATGGCTTG         GCATTTTCTATGGTTACAAGGGGCTGC
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 125982 GAATACATGGCTTGGTG...TAGGCATTTTCTATGGTTACAAGGGGCTGC

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2339 TGCTGCTGCTGGGAATCTTCCTTGCTTATGAGACCAAGAGTGTGTCCACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126717 TGCTGCTGCTGGGAATCTTCCTTGCTTATGAGACCAAGAGTGTGTCCACT

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2389 GAGAAGATCAATGATCACCGGGCTGTGGGCATGGCTATCTACAATGTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126767 GAGAAGATCAATGATCACCGGGCTGTGGGCATGGCTATCTACAATGTGGC

   2600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2439 A         GTCCTGTGCCTCATCACTGCTCCTGTCACCATGATTCTGT
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126817 AGTG...TAGGTCCTGTGCCTCATCACTGCTCCTGTCACCATGATTCTGT

   2650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2480 CCAGCCAGCAGGATGCAGCCTTTGCCTTTGCCTCTCTTGCCATAGTTTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127438 CCAGCCAGCAGGATGCAGCCTTTGCCTTTGCCTCTCTTGCCATAGTTTTC

   2700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2530 TCCTCCTATATCACTCTTGTTGTGCTCTTTGTGCCCAAG         AT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 127488 TCCTCCTATATCACTCTTGTTGTGCTCTTTGTGCCCAAGGTA...CAGAT

   2750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2571 GCGCAGGCTGATCACCCGAGGGGAATGGCAGTCGGAGGCGCAGGACACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127751 GCGCAGGCTGATCACCCGAGGGGAATGGCAGTCGGAGGCGCAGGACACCA

   2800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2621 TGAAGACAGGGTCATCGACCAACAACAACGAGGAGGAGAAGTCCCGGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127801 TGAAGACAGGGTCATCGACCAACAACAACGAGGAGGAGAAGTCCCGGCTG

   2850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2671 TTGGAGAAGGAGAACCGTGAACTGGAAAAGATCATTGCTGAG        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 127851 TTGGAGAAGGAGAACCGTGAACTGGAAAAGATCATTGCTGAGGTG...CA

   2900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2713  AAAGAGGAGCGTGTCTCTGAACTGCGCCATCAACTCCAGTCTCGGCAGC
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128669 GAAAGAGGAGCGTGTCTCTGAACTGCGCCATCAACTCCAGTCTCGGCAGC

   2950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2762 AGCTCCGCTCCCGGCGCCACCCACCGACACCCCCAGAACCCTCTGGGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128719 AGCTCCGCTCCCGGCGCCACCCACCGACACCCCCAGAACCCTCTGGGGGC

   3000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2812 CTGCCCAGGGGACCCCCTGAGCCCCCCGACCGGCTTAGCTGTGATGGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128769 CTGCCCAGGGGACCCCCTGAGCCCCCCGACCGGCTTAGCTGTGATGGGAG

   3050     .    :    .    :
   2862 TCGAGTGCATTTGCTTTATAAG
        ||||||||||||||||||||||
 128819 TCGAGTGCATTTGCTTTATAAG