seq1 = pF1KB8524.tfa, 2511 bp
seq2 = pF1KB8524/gi568815586r_32692427.tfa (gi568815586r:32692427_32996731), 304305 bp

>pF1KB8524 2511
>gi568815586r:32692427_32996731 (Chr12)

(complement)

1-223  (100001-100223)   100% ->
224-336  (117700-117812)   100% ->
337-1034  (118189-118886)   100% ->
1035-1170  (127670-127805)   100% ->
1171-1378  (145759-145966)   100% ->
1379-1556  (155527-155704)   100% ->
1557-1674  (172570-172687)   100% ->
1675-1839  (174101-174265)   100% ->
1840-2013  (175203-175376)   100% ->
2014-2167  (194176-194329)   100% ->
2168-2357  (200434-200623)   100% ->
2358-2445  (204001-204088)   100% ->
2446-2511  (204240-204305)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCAGCCCCCGGCGCCCCAGCTGAGTACGGCTACATCCGGACCGTCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCAGCCCCCGGCGCCCCAGCTGAGTACGGCTACATCCGGACCGTCCT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGGCCAGCAGATCCTGGGACAACTGGACAGCTCCAGCCTGGCGCTGCCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GGGCCAGCAGATCCTGGGACAACTGGACAGCTCCAGCCTGGCGCTGCCCT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CCGAGGCCAAGCTGAAGCTGGCGGGGAGCAGCGGCCGCGGCGGCCAGACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CCGAGGCCAAGCTGAAGCTGGCGGGGAGCAGCGGCCGCGGCGGCCAGACA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GTCAAGAGCCTGCGGATCCAGGAGCAGGTGCAGCAGACCCTCGCCCGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GTCAAGAGCCTGCGGATCCAGGAGCAGGTGCAGCAGACCCTCGCCCGGAA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GGGCCGCAGCTCCGTGGGCAACG         GAAATCTTCACCGAACCA
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 100201 GGGCCGCAGCTCCGTGGGCAACGGTG...CAGGAAATCTTCACCGAACCA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 GCAGTGTTCCTGAGTATGTCTACAACCTACACTTGGTTGAAAATGATTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117718 GCAGTGTTCCTGAGTATGTCTACAACCTACACTTGGTTGAAAATGATTTT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 GTTGGAGGCCGTTCCCCTGTTCCTAAAACCTATGACATGCTAAAG     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 117768 GTTGGAGGCCGTTCCCCTGTTCCTAAAACCTATGACATGCTAAAGGTA..

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    337     GCTGGCACAACTGCCACTTATGAAGGTCGCTGGGGAAGAGGAACAG
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117818 .CAGGCTGGCACAACTGCCACTTATGAAGGTCGCTGGGGAAGAGGAACAG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 CACAGTACAGCTCCCAGAAGTCCGTGGAAGAAAGGTCCTTGAGGCATCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118235 CACAGTACAGCTCCCAGAAGTCCGTGGAAGAAAGGTCCTTGAGGCATCCT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 CTGAGGAGACTGGAGATTTCTCCTGACAGCAGCCCGGAGAGGGCTCACTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118285 CTGAGGAGACTGGAGATTTCTCCTGACAGCAGCCCGGAGAGGGCTCACTA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 CACGCACAGCGATTACCAGTACAGCCAGAGAAGCCAGGCTGGGCACACCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118335 CACGCACAGCGATTACCAGTACAGCCAGAGAAGCCAGGCTGGGCACACCC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 TGCACCACCAAGAAAGCAGGCGGGCCGCCCTCCTAGTGCCACCGAGATAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118385 TGCACCACCAAGAAAGCAGGCGGGCCGCCCTCCTAGTGCCACCGAGATAT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    583 GCTCGTTCCGAGATCGTGGGGGTCAGCCGTGCTGGCACCACAAGCAGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118435 GCTCGTTCCGAGATCGTGGGGGTCAGCCGTGCTGGCACCACAAGCAGGCA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    633 GCGCCACTTTGACACATACCACAGACAGTACCAGCATGGCTCTGTTAGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118485 GCGCCACTTTGACACATACCACAGACAGTACCAGCATGGCTCTGTTAGCG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    683 ACACCGTTTTTGACAGCATCCCTGCCAACCCGGCCCTGCTCACGTACCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118535 ACACCGTTTTTGACAGCATCCCTGCCAACCCGGCCCTGCTCACGTACCCC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    733 AGGCCAGGGACCAGCCGCAGCATGGGCAACCTCTTGGAGAAGGAGAACTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118585 AGGCCAGGGACCAGCCGCAGCATGGGCAACCTCTTGGAGAAGGAGAACTA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    783 CCTGACGGCAGGGCTCACTGTCGGGCAGGTCAGGCCGCTGGTGCCCCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118635 CCTGACGGCAGGGCTCACTGTCGGGCAGGTCAGGCCGCTGGTGCCCCTGC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    833 AGCCCGTCACTCAGAACAGGGCTTCCAGGTCCTCCTGGCATCAGAGCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118685 AGCCCGTCACTCAGAACAGGGCTTCCAGGTCCTCCTGGCATCAGAGCTCC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    883 TTCCACAGCACCCGCACGCTGAGGGAAGCTGGGCCCAGTGTCGCCGTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118735 TTCCACAGCACCCGCACGCTGAGGGAAGCTGGGCCCAGTGTCGCCGTGGA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    933 TTCCAGCGGGAGGAGAGCGCACTTGACTGTCGGCCAGGCGGCCGCAGGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118785 TTCCAGCGGGAGGAGAGCGCACTTGACTGTCGGCCAGGCGGCCGCAGGGG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    983 GAAGTGGGAATCTGCTCACTGAGAGAAGCACTTTCACTGACTCCCAGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118835 GAAGTGGGAATCTGCTCACTGAGAGAAGCACTTTCACTGACTCCCAGCTG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1033 GG         GAATGCAGACATGGAGATGACTCTGGAGCGAGCAGTGAG
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118885 GGGTA...TAGGAATGCAGACATGGAGATGACTCTGGAGCGAGCAGTGAG

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1074 TATGCTCGAGGCAGACCACATGCTGCCATCCAGGATTTCTGCTGCAGCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127709 TATGCTCGAGGCAGACCACATGCTGCCATCCAGGATTTCTGCTGCAGCTA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1124 CTTTCATACAGCACGAGTGCTTCCAGAAATCTGAAGCTCGGAAGAGG   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 127759 CTTTCATACAGCACGAGTGCTTCCAGAAATCTGAAGCTCGGAAGAGGGTG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1171       GTTAACCAGCTTCGTGGCATCCTCAAGCTTCTGCAGCTCCTAAA
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127809 ...CAGGTTAACCAGCTTCGTGGCATCCTCAAGCTTCTGCAGCTCCTAAA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1215 AGTTCAGAATGAAGACGTTCAGCGAGCTGTGTGTGGGGCCTTGAGAAACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 145803 AGTTCAGAATGAAGACGTTCAGCGAGCTGTGTGTGGGGCCTTGAGAAACT

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1265 TAGTATTTGAAGACAATGACAACAAATTGGAGGTGGCTGAACTAAATGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 145853 TAGTATTTGAAGACAATGACAACAAATTGGAGGTGGCTGAACTAAATGGG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1315 GTACCTCGGCTGCTCCAGGTGCTGAAGCAAACCAGAGACTTGGAGACTAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 145903 GTACCTCGGCTGCTCCAGGTGCTGAAGCAAACCAGAGACTTGGAGACTAA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1365 AAAACAAATAACAG         GTTTGCTGTGGAATTTGTCATCTAATG
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 145953 AAAACAAATAACAGGTA...TAGGTTTGCTGTGGAATTTGTCATCTAATG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1406 ACAAACTCAAGAATCTCATGATAACAGAAGCATTGCTTACGCTGACGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 155554 ACAAACTCAAGAATCTCATGATAACAGAAGCATTGCTTACGCTGACGGAG

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1456 AATATCATCATCCCCTTTTCTGGGTGGCCTGAAGGAGACTACCCAAAAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 155604 AATATCATCATCCCCTTTTCTGGGTGGCCTGAAGGAGACTACCCAAAAGC

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1506 AAATGGTTTGCTCGATTTTGACATATTCTACAACGTCACTGGATGCCTAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 155654 AAATGGTTTGCTCGATTTTGACATATTCTACAACGTCACTGGATGCCTAA

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1556 G         AAACATGAGTTCTGCTGGCGCTGATGGGAGAAAAGCGATG
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 155704 GGTA...TAGAAACATGAGTTCTGCTGGCGCTGATGGGAGAAAAGCGATG

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1597 AGAAGATGTGACGGACTCATTGACTCACTGGTCCATTATGTCAGAGGAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 172610 AGAAGATGTGACGGACTCATTGACTCACTGGTCCATTATGTCAGAGGAAC

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1647 CATTGCAGATTACCAGCCAGATGACAAG         GCCACGGAGAATT
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 172660 CATTGCAGATTACCAGCCAGATGACAAGGTA...CAGGCCACGGAGAATT

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1688 GTGTGTGCATTCTTCATAACCTCTCCTACCAGCTGGAGGCAGAGCTCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 174114 GTGTGTGCATTCTTCATAACCTCTCCTACCAGCTGGAGGCAGAGCTCCCA

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1738 GAGAAATATTCCCAGAATATCTATATTCAAAACCGGAATATCCAGACTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 174164 GAGAAATATTCCCAGAATATCTATATTCAAAACCGGAATATCCAGACTGA

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1788 CAACAACAAAAGTATTGGATGTTTTGGCAGTCGAAGCAGGAAAGTAAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 174214 CAACAACAAAAGTATTGGATGTTTTGGCAGTCGAAGCAGGAAAGTAAAAG

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1838 AG         CAATACCAGGACGTGCCGATGCCGGAGGAAAAGAGCAAC
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 174264 AGGTA...CAGCAATACCAGGACGTGCCGATGCCGGAGGAAAAGAGCAAC

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1879 CCCAAGGGCGTGGAGTGGCTGTGGCATTCCATTGTTATAAGGATGTATCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 175242 CCCAAGGGCGTGGAGTGGCTGTGGCATTCCATTGTTATAAGGATGTATCT

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1929 GTCCTTGATCGCCAAAAGTGTCCGCAACTACACACAAGAAGCATCCTTAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 175292 GTCCTTGATCGCCAAAAGTGTCCGCAACTACACACAAGAAGCATCCTTAG

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1979 GAGCTCTGCAGAACCTCACGGCCGGAAGTGGACCA         ATGCCG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 175342 GAGCTCTGCAGAACCTCACGGCCGGAAGTGGACCAGTG...CAGATGCCG

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2020 ACATCAGTGGCTCAGACAGTTGTCCAGAAGGAAAGTGGCCTGCAGCACAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 194182 ACATCAGTGGCTCAGACAGTTGTCCAGAAGGAAAGTGGCCTGCAGCACAC

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2070 CCGAAAGATGCTGCATGTTGGTGACCCAAGTGTGAAAAAGACAGCCATCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 194232 CCGAAAGATGCTGCATGTTGGTGACCCAAGTGTGAAAAAGACAGCCATCT

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2120 CGCTGCTGAGGAATCTGTCCCGGAATCTTTCTCTGCAGAATGAAATTG  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 194282 CGCTGCTGAGGAATCTGTCCCGGAATCTTTCTCTGCAGAATGAAATTGGT

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2168        CCAAAGAAACTCTCCCTGATTTGGTTTCCATCATTCCTGACAC
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 194332 G...TAGCCAAAGAAACTCTCCCTGATTTGGTTTCCATCATTCCTGACAC

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2211 AGTCCCGAGTACTGACCTTCTCATTGAAACTACAGCCTCTGCCTGTTACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 200477 AGTCCCGAGTACTGACCTTCTCATTGAAACTACAGCCTCTGCCTGTTACA

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2261 CATTGAACAACATAATCCAAAACAGTTACCAGAATGCACGCGACCTTCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 200527 CATTGAACAACATAATCCAAAACAGTTACCAGAATGCACGCGACCTTCTA

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2311 AACACCGGGGGCATCCAGAAAATTATGGCCATTAGTGCAGGCGATGC   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 200577 AACACCGGGGGCATCCAGAAAATTATGGCCATTAGTGCAGGCGATGCGTA

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2358       CTATGCCTCCAACAAAGCAAGTAAAGCTGCTTCCGTCCTTCTGT
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 200627 ...CAGCTATGCCTCCAACAAAGCAAGTAAAGCTGCTTCCGTCCTTCTGT

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2402 ATTCTCTGTGGGCACACACGGAACTGCATCATGCCTACAAGAAG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 204045 ATTCTCTGTGGGCACACACGGAACTGCATCATGCCTACAAGAAGGTA...

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2446    GCTCAGTTTAAGAAGACAGATTTTGTCAACAGCCGGACTGCCAAAGC
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 204237 AAGGCTCAGTTTAAGAAGACAGATTTTGTCAACAGCCGGACTGCCAAAGC

   2600     .    :    .
   2493 CTACCACTCCCTTAAAGAC
        |||||||||||||||||||
 204287 CTACCACTCCCTTAAAGAC