seq1 = pF1KB8523.tfa, 2811 bp
seq2 = pF1KB8523/gi568815590f_97788101.tfa (gi568815590f:97788101_98135709), 347609 bp

>pF1KB8523 2811
>gi568815590f:97788101_98135709 (Chr8)

1-142  (100001-100142)   100% ->
143-712  (142853-143422)   100% ->
713-835  (153677-153799)   98% ->
836-958  (173308-173430)   100% ->
959-1081  (190786-190908)   99% ->
1082-1204  (206380-206502)   100% ->
1205-1327  (215561-215683)   100% ->
1328-1450  (219005-219127)   100% ->
1451-1573  (219379-219501)   100% ->
1574-1696  (228440-228562)   100% ->
1697-1819  (229894-230016)   99% ->
1820-1942  (233105-233227)   100% ->
1943-2356  (239316-239729)   100% ->
2357-2509  (242362-242514)   99% ->
2510-2581  (244146-244217)   100% ->
2582-2659  (244999-245076)   100% ->
2660-2761  (245461-245561)   98% ->
2762-2811  (247560-247609)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGAAAAGATGCTCGCAGGCTGCTTTCTGCTGATCCTCGGACAGATCGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGAAAAGATGCTCGCAGGCTGCTTTCTGCTGATCCTCGGACAGATCGT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CCTCCTCCCTGCCGAGGCCAGGGAGCGGTCACGTGGGAGGTCCATCTCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CCTCCTCCCTGCCGAGGCCAGGGAGCGGTCACGTGGGAGGTCCATCTCTA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GGGGCAGACACGCTCGGACCCACCCGCAGACGGCCCTTCTGG        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 100101 GGGGCAGACACGCTCGGACCCACCCGCAGACGGCCCTTCTGGGTG...CA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    143  AGAGTTCCTGTGAGAACAAGCGGGCAGACCTGGTTTTCATCATTGACAG
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 142852 GAGAGTTCCTGTGAGAACAAGCGGGCAGACCTGGTTTTCATCATTGACAG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CTCTCGCAGTGTCAACACCCATGACTATGCAAAGGTCAAGGAGTTCATCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 142902 CTCTCGCAGTGTCAACACCCATGACTATGCAAAGGTCAAGGAGTTCATCG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 TGGACATCTTGCAATTCTTGGACATTGGTCCTGATGTCACCCGAGTGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 142952 TGGACATCTTGCAATTCTTGGACATTGGTCCTGATGTCACCCGAGTGGGC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 CTGCTCCAATATGGCAGCACTGTCAAGAATGAGTTCTCCCTCAAGACCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 143002 CTGCTCCAATATGGCAGCACTGTCAAGAATGAGTTCTCCCTCAAGACCTT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 CAAGAGGAAGTCCGAGGTGGAGCGTGCTGTCAAGAGGATGCGGCATCTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 143052 CAAGAGGAAGTCCGAGGTGGAGCGTGCTGTCAAGAGGATGCGGCATCTGT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 CCACGGGCACCATGACTGGGCTGGCCATCCAGTATGCCCTGAACATCGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 143102 CCACGGGCACCATGACTGGGCTGGCCATCCAGTATGCCCTGAACATCGCA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 TTCTCAGAAGCAGAGGGGGCCCGGCCCCTGAGGGAGAATGTGCCACGGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 143152 TTCTCAGAAGCAGAGGGGGCCCGGCCCCTGAGGGAGAATGTGCCACGGGT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    492 CATAATGATCGTGACAGATGGGAGACCTCAGGACTCCGTGGCCGAGGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 143202 CATAATGATCGTGACAGATGGGAGACCTCAGGACTCCGTGGCCGAGGTGG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    542 CTGCTAAGGCACGGGACACGGGCATCCTAATCTTTGCCATTGGTGTGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 143252 CTGCTAAGGCACGGGACACGGGCATCCTAATCTTTGCCATTGGTGTGGGC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    592 CAGGTAGACTTCAACACCTTGAAGTCCATTGGGAGTGAGCCCCATGAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 143302 CAGGTAGACTTCAACACCTTGAAGTCCATTGGGAGTGAGCCCCATGAGGA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    642 CCATGTCTTCCTTGTGGCCAATTTCAGCCAGATTGAGACGCTGACCTCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 143352 CCATGTCTTCCTTGTGGCCAATTTCAGCCAGATTGAGACGCTGACCTCCG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    692 TGTTCCAGAAGAAGTTGTGCA         CGGCCCACATGTGCAGCACC
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||| ||||||||||||
 143402 TGTTCCAGAAGAAGTTGTGCAGTA...CAGCGGCCCATATGTGCAGCACC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    733 CTGGAACATAACTGTGCCCACTTCTGCATCAACATCCCTGGCTCATACGT
        ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 153697 CTGGAGCATAACTGTGCCCACTTCTGCATCAACATCCCTGGCTCATACGT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    783 CTGCAGGTGCAAACAAGGCTACATTCTCAACTCGGATCAGACGACTTGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 153747 CTGCAGGTGCAAACAAGGCTACATTCTCAACTCGGATCAGACGACTTGCA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    833 GAA         TCCAGGATCTGTGTGCCATGGAGGACCACAACTGTGAG
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 153797 GAAGTA...CAGTCCAGGATCTGTGTGCCATGGAGGACCACAACTGTGAG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    874 CAGCTCTGTGTGAATGTGCCGGGCTCCTTCGTCTGCCAGTGCTACAGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 173346 CAGCTCTGTGTGAATGTGCCGGGCTCCTTCGTCTGCCAGTGCTACAGTGG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    924 CTACGCCCTGGCTGAGGATGGGAAGAGGTGTGTGG         CTGTGG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 173396 CTACGCCCTGGCTGAGGATGGGAAGAGGTGTGTGGGTG...CAGCTGTGG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    965 ACTACTGTGCCTCAGAAAACCACGGATGTGAACATGAGTGTGTAAATGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 190792 ACTACTGTGCCTCAGAAAACCACGGATGTGAACATGAGTGTGTAAATGCT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1015 GATGGCTCCTACCTTTGCCAGTGCCATGAAGGATTTGCTCTTAACCCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 190842 GATGGCTCCTACCTTTGCCAGTGCCATGAAGGATTTGCTCTTAACCCAGA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1065 TGAAAAAACGTGCACAA         AGATAGACTACTGTGCCTCATCTA
        | |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 190892 TAAAAAAACGTGCACAAGTA...CAGAGATAGACTACTGTGCCTCATCTA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1106 ATCACGGATGTCAGCACGAGTGTGTTAACACAGATGATTCCTATTCCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 206404 ATCACGGATGTCAGCACGAGTGTGTTAACACAGATGATTCCTATTCCTGC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1156 CACTGCCTGAAAGGCTTTACCCTGAATCCAGATAAGAAAACCTGCAGAA 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 206454 CACTGCCTGAAAGGCTTTACCCTGAATCCAGATAAGAAAACCTGCAGAAG

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1205         GGATCAACTACTGTGCACTGAACAAACCGGGCTGTGAGCATG
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 206504 TA...CAGGGATCAACTACTGTGCACTGAACAAACCGGGCTGTGAGCATG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1247 AGTGCGTCAACATGGAGGAGAGCTACTACTGCCGCTGCCACCGTGGCTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 215603 AGTGCGTCAACATGGAGGAGAGCTACTACTGCCGCTGCCACCGTGGCTAC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1297 ACTCTGGACCCCAATGGCAAAACCTGCAGCC         GAGTGGACCA
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 215653 ACTCTGGACCCCAATGGCAAAACCTGCAGCCGTG...CAGGAGTGGACCA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1338 CTGTGCACAGCAGGACCATGGCTGTGAGCAGCTGTGTCTGAACACGGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 219015 CTGTGCACAGCAGGACCATGGCTGTGAGCAGCTGTGTCTGAACACGGAGG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1388 ATTCCTTCGTCTGCCAGTGCTCAGAAGGCTTCCTCATCAACGAGGACCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 219065 ATTCCTTCGTCTGCCAGTGCTCAGAAGGCTTCCTCATCAACGAGGACCTC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1438 AAGACCTGCTCCC         GGGTGGATTACTGCCTGCTGAGTGACCA
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 219115 AAGACCTGCTCCCGTG...CAGGGGTGGATTACTGCCTGCTGAGTGACCA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1479 TGGTTGTGAATACTCCTGTGTCAACATGGACAGATCCTTTGCCTGTCAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 219407 TGGTTGTGAATACTCCTGTGTCAACATGGACAGATCCTTTGCCTGTCAGT

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1529 GTCCTGAGGGACACGTGCTCCGCAGCGATGGGAAGACGTGTGCAA     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 219457 GTCCTGAGGGACACGTGCTCCGCAGCGATGGGAAGACGTGTGCAAGTA..

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1574     AATTGGACTCTTGTGCTCTGGGGGACCACGGTTGTGAACATTCGTG
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 219507 .CAGAATTGGACTCTTGTGCTCTGGGGGACCACGGTTGTGAACATTCGTG

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1620 TGTAAGCAGTGAAGATTCGTTTGTGTGCCAGTGCTTTGAAGGTTATATAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 228486 TGTAAGCAGTGAAGATTCGTTTGTGTGCCAGTGCTTTGAAGGTTATATAC

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1670 TCCGTGAAGATGGAAAAACCTGCAGAA         GGAAAGATGTCTGC
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 228536 TCCGTGAAGATGGAAAAACCTGCAGAAGTA...CAGGGAAAGATGTCTGC

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1711 CAAGCTATAGACCATGGCTGTGAACACATTTGTGTGAACAGTGACGACTC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
 229908 CAAGCTATAGACCATGGCTGTGAACACATTTGTGTGAACAGTGATGACTC

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1761 ATACACGTGCGAGTGCTTGGAGGGATTCCGGCTCGCTGAGGATGGGAAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 229958 ATACACGTGCGAGTGCTTGGAGGGATTCCGGCTCGCTGAGGATGGGAAAC

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1811 GCTGCCGAA         GGAAGGATGTCTGCAAATCAACCCACCATGGC
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 230008 GCTGCCGAAGTA...CAGGGAAGGATGTCTGCAAATCAACCCACCATGGC

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1852 TGCGAACACATTTGTGTTAATAATGGGAATTCCTACATCTGCAAATGCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 233137 TGCGAACACATTTGTGTTAATAATGGGAATTCCTACATCTGCAAATGCTC

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1902 AGAGGGATTTGTTCTAGCTGAGGACGGAAGACGGTGCAAGA         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 233187 AGAGGGATTTGTTCTAGCTGAGGACGGAAGACGGTGCAAGAGTA...TAG

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1943 AATGCACTGAAGGCCCAATTGACCTGGTCTTTGTGATCGATGGATCCAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 239316 AATGCACTGAAGGCCCAATTGACCTGGTCTTTGTGATCGATGGATCCAAG

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1993 AGTCTTGGAGAAGAGAATTTTGAGGTCGTGAAGCAGTTTGTCACTGGAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 239366 AGTCTTGGAGAAGAGAATTTTGAGGTCGTGAAGCAGTTTGTCACTGGAAT

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2043 TATAGATTCCTTGACAATTTCCCCCAAAGCCGCTCGAGTGGGGCTGCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 239416 TATAGATTCCTTGACAATTTCCCCCAAAGCCGCTCGAGTGGGGCTGCTCC

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2093 AGTATTCCACACAGGTCCACACAGAGTTCACTCTGAGAAACTTCAACTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 239466 AGTATTCCACACAGGTCCACACAGAGTTCACTCTGAGAAACTTCAACTCA

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2143 GCCAAAGACATGAAAAAAGCCGTGGCCCACATGAAATACATGGGAAAGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 239516 GCCAAAGACATGAAAAAAGCCGTGGCCCACATGAAATACATGGGAAAGGG

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2193 CTCTATGACTGGGCTGGCCCTGAAACACATGTTTGAGAGAAGTTTTACCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 239566 CTCTATGACTGGGCTGGCCCTGAAACACATGTTTGAGAGAAGTTTTACCC

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2243 AAGGAGAAGGGGCCAGGCCCCTTTCCACAAGGGTGCCCAGAGCAGCCATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 239616 AAGGAGAAGGGGCCAGGCCCCTTTCCACAAGGGTGCCCAGAGCAGCCATT

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2293 GTGTTCACCGACGGACGGGCTCAGGATGACGTCTCCGAGTGGGCCAGTAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 239666 GTGTTCACCGACGGACGGGCTCAGGATGACGTCTCCGAGTGGGCCAGTAA

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2343 AGCCAAGGCCAATG         GTATCACTATGTATGCTGTTGGGGTAG
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 239716 AGCCAAGGCCAATGGTA...TAGGTATCACTATGTATGCTGTTGGGGTAG

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2384 GAAAAGCCATTGAGGAGGAACTACAAGAGATTGCCTCTGAGCCCACAAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 242389 GAAAAGCCATTGAGGAGGAACTACAAGAGATTGCCTCTGAGCCCACAAAC

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2434 AAGCATCTCTTCTATGCCGAAGATTTCAGCACAATGGATGAGATAAGTGA
        ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
 242439 AAGCATCTCTTCTATGCCGAAGACTTCAGCACAATGGATGAGATAAGTGA

   2600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2484 AAAACTCAAGAAAGGCATCTGTGAAG         CTCTAGAAGACTCCG
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 242489 AAAACTCAAGAAAGGCATCTGTGAAGGTA...CAGCTCTAGAAGACTCCG

   2650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2525 ATGGAAGACAGGACTCTCCAGCAGGGGAACTGCCAAAAACGGTCCAACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 244161 ATGGAAGACAGGACTCTCCAGCAGGGGAACTGCCAAAAACGGTCCAACAG

   2700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2575 CCAACAG         TGCAACACAGATATCTGTTTGAAGAAGACAATCT
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 244211 CCAACAGGTA...CAGTGCAACACAGATATCTGTTTGAAGAAGACAATCT

   2750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2616 TTTACGGTCTACACAAAAGCTTTCCCATTCAACAAAACCTTCAG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 245033 TTTACGGTCTACACAAAAGCTTTCCCATTCAACAAAACCTTCAGGTA...

   2800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2660    GAAGCCCTTTGGAAGAAAAACACGATCAATGCAAATGTGAAAACCTT
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 245458 CAGGAAGCCCTTTGGAAGAAAAACACGATCAATGCAAATGTGAAAACCTT

   2850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2707 ATAATGTTCCAGAACCTTGCAAACGAAGAAGTAAGAAAATTAACACAGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 245508 ATAATGTTCCAGAACCTTGCAAACGAAGAAGTAAGAAAATTAACACAGCG

   2900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2757 CTTAG         AAGAAATGACACAGAGAATGGAAGCCCTGGAAAATC
        ||-| >>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 245558 CT ATATC...TAGAAGAAATGACACAGAGAATGGAAGCCCTGGAAAATC

   2950     .    :
   2798 GCCTGAGATACAGA
        ||||||||||||||
 247596 GCCTGAGATACAGA