seq1 = pF1KB8522.tfa, 2637 bp
seq2 = pF1KB8522/gi568815591f_86665146.tfa (gi568815591f:86665146_86964352), 299207 bp

>pF1KB8522 2637
>gi568815591f:86665146_86964352 (Chr7)

1-468  (100001-100468)   100% ->
469-1324  (121116-121971)   100% ->
1325-2391  (173694-174760)   100% ->
2392-2566  (185225-185399)   100% ->
2567-2637  (199137-199207)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAAGATGTTGACAAGACTGCAAGTTCTTACCTTAGCTTTGTTTTCAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAAGATGTTGACAAGACTGCAAGTTCTTACCTTAGCTTTGTTTTCAAA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGGATTTTTACTCTCTTTAGGGGACCATAACTTTCTAAGGAGAGAGATTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GGGATTTTTACTCTCTTTAGGGGACCATAACTTTCTAAGGAGAGAGATTA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 AAATAGAAGGTGACCTTGTTTTAGGGGGCCTGTTTCCTATTAACGAAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 AAATAGAAGGTGACCTTGTTTTAGGGGGCCTGTTTCCTATTAACGAAAAA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GGCACTGGAACTGAAGAATGTGGGCGAATCAATGAAGACCGAGGGATTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GGCACTGGAACTGAAGAATGTGGGCGAATCAATGAAGACCGAGGGATTCA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 ACGCCTGGAAGCCATGTTGTTTGCTATTGATGAAATCAACAAAGATGATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 ACGCCTGGAAGCCATGTTGTTTGCTATTGATGAAATCAACAAAGATGATT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 ACTTGCTACCAGGAGTGAAGTTGGGTGTTCACATTTTGGATACATGTTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 ACTTGCTACCAGGAGTGAAGTTGGGTGTTCACATTTTGGATACATGTTCA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 AGGGATACCTATGCATTGGAGCAATCACTGGAGTTTGTCAGGGCATCTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 AGGGATACCTATGCATTGGAGCAATCACTGGAGTTTGTCAGGGCATCTTT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 GACAAAAGTGGATGAAGCTGAGTATATGTGTCCTGATGGATCCTATGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 GACAAAAGTGGATGAAGCTGAGTATATGTGTCCTGATGGATCCTATGCCA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 TTCAAGAAAACATCCCACTTCTCATTGCAGGGGTCATTGGTGGCTCTTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 TTCAAGAAAACATCCCACTTCTCATTGCAGGGGTCATTGGTGGCTCTTAT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 AGCAGTGTTTCCATACAG         GTGGCAAACCTGCTGCGGCTCTT
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 100451 AGCAGTGTTTCCATACAGGTA...TAGGTGGCAAACCTGCTGCGGCTCTT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    492 CCAGATCCCTCAGATCAGCTACGCATCCACCAGCGCCAAACTCAGTGATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121139 CCAGATCCCTCAGATCAGCTACGCATCCACCAGCGCCAAACTCAGTGATA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    542 AGTCGCGCTATGATTACTTTGCCAGGACCGTGCCCCCCGACTTCTACCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121189 AGTCGCGCTATGATTACTTTGCCAGGACCGTGCCCCCCGACTTCTACCAG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    592 GCCAAAGCCATGGCTGAGATCTTGCGCTTCTTCAACTGGACCTACGTGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121239 GCCAAAGCCATGGCTGAGATCTTGCGCTTCTTCAACTGGACCTACGTGTC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    642 CACAGTAGCCTCCGAGGGTGATTACGGGGAGACAGGGATCGAGGCCTTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121289 CACAGTAGCCTCCGAGGGTGATTACGGGGAGACAGGGATCGAGGCCTTCG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    692 AGCAGGAAGCCCGCCTGCGCAACATCTGCATCGCTACGGCGGAGAAGGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121339 AGCAGGAAGCCCGCCTGCGCAACATCTGCATCGCTACGGCGGAGAAGGTG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    742 GGCCGCTCCAACATCCGCAAGTCCTACGACAGCGTGATCCGAGAACTGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121389 GGCCGCTCCAACATCCGCAAGTCCTACGACAGCGTGATCCGAGAACTGTT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    792 GCAGAAGCCCAACGCGCGCGTCGTGGTCCTCTTCATGCGCAGCGACGACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121439 GCAGAAGCCCAACGCGCGCGTCGTGGTCCTCTTCATGCGCAGCGACGACT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    842 CGCGGGAGCTCATTGCAGCCGCCAGCCGCGCCAATGCCTCCTTCACCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121489 CGCGGGAGCTCATTGCAGCCGCCAGCCGCGCCAATGCCTCCTTCACCTGG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    892 GTGGCCAGCGACGGCTGGGGCGCGCAGGAGAGCATCATCAAGGGCAGCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121539 GTGGCCAGCGACGGCTGGGGCGCGCAGGAGAGCATCATCAAGGGCAGCGA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    942 GCATGTGGCCTACGGCGCCATCACCCTGGAGCTGGCCTCCCAGCCTGTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121589 GCATGTGGCCTACGGCGCCATCACCCTGGAGCTGGCCTCCCAGCCTGTCC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    992 GCCAGTTCGACCGCTACTTCCAGAGCCTCAACCCCTACAACAACCACCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121639 GCCAGTTCGACCGCTACTTCCAGAGCCTCAACCCCTACAACAACCACCGC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1042 AACCCCTGGTTCCGGGACTTCTGGGAGCAAAAGTTTCAGTGCAGCCTCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121689 AACCCCTGGTTCCGGGACTTCTGGGAGCAAAAGTTTCAGTGCAGCCTCCA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1092 GAACAAACGCAACCACAGGCGCGTCTGCGACAAGCACCTGGCCATCGACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121739 GAACAAACGCAACCACAGGCGCGTCTGCGACAAGCACCTGGCCATCGACA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1142 GCAGCAACTACGAGCAAGAGTCCAAGATCATGTTTGTGGTGAACGCGGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121789 GCAGCAACTACGAGCAAGAGTCCAAGATCATGTTTGTGGTGAACGCGGTG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1192 TATGCCATGGCCCACGCTTTGCACAAAATGCAGCGCACCCTCTGTCCCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121839 TATGCCATGGCCCACGCTTTGCACAAAATGCAGCGCACCCTCTGTCCCAA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1242 CACTACCAAGCTTTGTGATGCTATGAAGATCCTGGATGGGAAGAAGTTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121889 CACTACCAAGCTTTGTGATGCTATGAAGATCCTGGATGGGAAGAAGTTGT

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1292 ACAAGGATTACTTGCTGAAAATCAACTTCACGG         CTCCATTC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 121939 ACAAGGATTACTTGCTGAAAATCAACTTCACGGGTA...CAGCTCCATTC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1333 AACCCAAATAAAGATGCAGATAGCATAGTCAAGTTTGACACTTTTGGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 173702 AACCCAAATAAAGATGCAGATAGCATAGTCAAGTTTGACACTTTTGGAGA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1383 TGGAATGGGGCGATACAACGTGTTCAATTTCCAAAATGTAGGTGGAAAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 173752 TGGAATGGGGCGATACAACGTGTTCAATTTCCAAAATGTAGGTGGAAAGT

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1433 ATTCCTACTTGAAAGTTGGTCACTGGGCAGAAACCTTATCGCTAGATGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 173802 ATTCCTACTTGAAAGTTGGTCACTGGGCAGAAACCTTATCGCTAGATGTC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1483 AACTCTATCCACTGGTCCCGGAACTCAGTCCCCACTTCCCAGTGCAGCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 173852 AACTCTATCCACTGGTCCCGGAACTCAGTCCCCACTTCCCAGTGCAGCGA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1533 CCCCTGTGCCCCCAATGAAATGAAGAATATGCAACCAGGGGATGTCTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 173902 CCCCTGTGCCCCCAATGAAATGAAGAATATGCAACCAGGGGATGTCTGCT

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1583 GCTGGATTTGCATCCCCTGTGAACCCTACGAATACCTGGCTGATGAGTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 173952 GCTGGATTTGCATCCCCTGTGAACCCTACGAATACCTGGCTGATGAGTTT

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1633 ACCTGTATGGATTGTGGGTCTGGACAGTGGCCCACTGCAGACCTAACTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 174002 ACCTGTATGGATTGTGGGTCTGGACAGTGGCCCACTGCAGACCTAACTGG

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1683 ATGCTATGACCTTCCTGAGGACTACATCAGGTGGGAAGACGCCTGGGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 174052 ATGCTATGACCTTCCTGAGGACTACATCAGGTGGGAAGACGCCTGGGCCA

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1733 TTGGCCCAGTCACCATTGCCTGTCTGGGTTTTATGTGTACATGCATGGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 174102 TTGGCCCAGTCACCATTGCCTGTCTGGGTTTTATGTGTACATGCATGGTT

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1783 GTAACTGTTTTTATCAAGCACAACAACACACCCTTGGTCAAAGCATCGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 174152 GTAACTGTTTTTATCAAGCACAACAACACACCCTTGGTCAAAGCATCGGG

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1833 CCGAGAACTCTGCTACATCTTATTGTTTGGGGTTGGCCTGTCATACTGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 174202 CCGAGAACTCTGCTACATCTTATTGTTTGGGGTTGGCCTGTCATACTGCA

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1883 TGACATTCTTCTTCATTGCCAAGCCATCACCAGTCATCTGTGCATTGCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 174252 TGACATTCTTCTTCATTGCCAAGCCATCACCAGTCATCTGTGCATTGCGC

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1933 CGACTCGGGCTGGGGAGTTCCTTCGCTATCTGTTACTCAGCCCTGCTGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 174302 CGACTCGGGCTGGGGAGTTCCTTCGCTATCTGTTACTCAGCCCTGCTGAC

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1983 CAAGACAAACTGCATTGCCCGCATCTTCGATGGGGTCAAGAATGGCGCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 174352 CAAGACAAACTGCATTGCCCGCATCTTCGATGGGGTCAAGAATGGCGCTC

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2033 AGAGGCCAAAATTCATCAGCCCCAGTTCTCAGGTTTTCATCTGCCTGGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 174402 AGAGGCCAAAATTCATCAGCCCCAGTTCTCAGGTTTTCATCTGCCTGGGT

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2083 CTGATCCTGGTGCAAATTGTGATGGTGTCTGTGTGGCTCATCCTGGAGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 174452 CTGATCCTGGTGCAAATTGTGATGGTGTCTGTGTGGCTCATCCTGGAGGC

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2133 CCCAGGCACCAGGAGGTATACCCTTGCAGAGAAGCGGGAAACAGTCATCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 174502 CCCAGGCACCAGGAGGTATACCCTTGCAGAGAAGCGGGAAACAGTCATCC

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2183 TAAAATGCAATGTCAAAGATTCCAGCATGTTGATCTCTCTTACCTACGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 174552 TAAAATGCAATGTCAAAGATTCCAGCATGTTGATCTCTCTTACCTACGAT

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2233 GTGATCCTGGTGATCTTATGCACTGTGTACGCCTTCAAAACGCGGAAGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 174602 GTGATCCTGGTGATCTTATGCACTGTGTACGCCTTCAAAACGCGGAAGTG

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2283 CCCAGAAAATTTCAACGAAGCTAAGTTCATAGGTTTTACCATGTACACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 174652 CCCAGAAAATTTCAACGAAGCTAAGTTCATAGGTTTTACCATGTACACCA

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2333 CGTGCATCATCTGGTTGGCCTTCCTCCCTATATTTTATGTGACATCAAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 174702 CGTGCATCATCTGGTTGGCCTTCCTCCCTATATTTTATGTGACATCAAGT

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2383 GACTACAGA         GTGCAGACGACAACCATGTGCATCTCTGTCAG
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 174752 GACTACAGAGTA...TAGGTGCAGACGACAACCATGTGCATCTCTGTCAG

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2424 CCTGAGTGGCTTTGTGGTCTTGGGCTGTTTGTTTGCACCCAAGGTTCACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 185257 CCTGAGTGGCTTTGTGGTCTTGGGCTGTTTGTTTGCACCCAAGGTTCACA

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2474 TCATCCTGTTTCAACCCCAGAAGAATGTTGTCACACACAGACTGCACCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 185307 TCATCCTGTTTCAACCCCAGAAGAATGTTGTCACACACAGACTGCACCTC

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2524 AACAGGTTCAGTGTCAGTGGAACTGGGACCACATACTCTCAGT       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 185357 AACAGGTTCAGTGTCAGTGGAACTGGGACCACATACTCTCAGTGTA...C

   2600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2567   CCTCTGCAAGCACGTATGTGCCAACGGTGTGCAATGGGCGGGAAGTCC
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 199135 AGCCTCTGCAAGCACGTATGTGCCAACGGTGTGCAATGGGCGGGAAGTCC

   2650     .    :    .    :
   2615 TCGACTCCACCACCTCATCTCTG
        |||||||||||||||||||||||
 199185 TCGACTCCACCACCTCATCTCTG