seq1 = pF1KB8502.tfa, 2592 bp
seq2 = pF1KB8502/gi568815583r_41403999.tfa (gi568815583r:41403999_41613709), 209711 bp

>pF1KB8502 2592
>gi568815583r:41403999_41613709 (Chr15)

(complement)

1-43  (100001-100043)   100% ->
44-187  (100590-100733)   100% ->
188-359  (100832-101003)   100% ->
360-510  (101445-101595)   100% ->
511-657  (101747-101893)   100% ->
658-814  (102132-102288)   100% ->
815-997  (102364-102546)   100% ->
998-1096  (104581-104679)   100% ->
1097-1249  (105489-105641)   100% ->
1250-1345  (106053-106148)   100% ->
1346-1541  (106420-106615)   100% ->
1542-1632  (107705-107795)   100% ->
1633-1697  (107933-107997)   100% ->
1698-1827  (108180-108309)   100% ->
1828-1925  (108405-108502)   100% ->
1926-2018  (108646-108738)   100% ->
2019-2120  (108836-108937)   100% ->
2121-2255  (109070-109204)   100% ->
2256-2346  (109278-109368)   100% ->
2347-2592  (109466-109711)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGGCTGCTGGGGACAGCTGCTGGTGTGGTTCGGAGCCGCGG       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 100001 ATGGGCTGCTGGGGACAGCTGCTGGTGTGGTTCGGAGCCGCGGGTA...C

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     44   GCGCCATTCTCTGCTCTAGCCCGGGGTCCCAGGAGACTTTTCTGCGGT
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100588 AGGCGCCATTCTCTGCTCTAGCCCGGGGTCCCAGGAGACTTTTCTGCGGT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 CCTCGCCCCTGCCGCTGGCAAGTCCCAGCCCCCGGGACCCGAAAGTCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100638 CCTCGCCCCTGCCGCTGGCAAGTCCCAGCCCCCGGGACCCGAAAGTCAGC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GCCCCGCCTAGTATCTTGGAGCCAGCCTCCCCGCTGAATTCTCCGG    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 100688 GCCCCGCCTAGTATCTTGGAGCCAGCCTCCCCGCTGAATTCTCCGGGTG.

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    188      GCACCGAGGGGTCTTGGCTGTTTTCTACCTGCGGGGCCAGCGGCC
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100738 ..CAGGCACCGAGGGGTCTTGGCTGTTTTCTACCTGCGGGGCCAGCGGCC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 GGCATGGGCCCACACAGACACAATGTGACGGGGCGTACGCGGGGACCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100877 GGCATGGGCCCACACAGACACAATGTGACGGGGCGTACGCGGGGACCAGC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 GTGGTGGTGACCGTGGGGGCCGCCGGGCAGCTGAGAGGCGTGCAGCTGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100927 GTGGTGGTGACCGTGGGGGCCGCCGGGCAGCTGAGAGGCGTGCAGCTGTG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 GCGCGTGCCGGGCCCTGGCCAGTATCT         GATCTCAGCCTACG
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 100977 GCGCGTGCCGGGCCCTGGCCAGTATCTGTA...CAGGATCTCAGCCTACG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 GAGCCGCGGGCGGCAAAGGCGCCAAGAACCACCTGTCGCGGGCGCATGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101459 GAGCCGCGGGCGGCAAAGGCGCCAAGAACCACCTGTCGCGGGCGCATGGC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 GTCTTCGTCTCAGCAATCTTCTCCCTCGGTCTCGGGGAGTCGCTGTACAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101509 GTCTTCGTCTCAGCAATCTTCTCCCTCGGTCTCGGGGAGTCGCTGTACAT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 CCTGGTGGGGCAGCAGGGAGAGGACGCCTGTCCCGGA         GGTA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 101559 CCTGGTGGGGCAGCAGGGAGAGGACGCCTGTCCCGGAGTG...CAGGGTA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 GCCCGGAGAGCCAGCTCGTCTGCCTCGGGGAGTCTCGAGCCGTTGAAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101751 GCCCGGAGAGCCAGCTCGTCTGCCTCGGGGAGTCTCGAGCCGTTGAAGAG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 CACGCGGCGATGGATGGGAGCGAAGGGGTCCCGGGGTCGCGGCGCTGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101801 CACGCGGCGATGGATGGGAGCGAAGGGGTCCCGGGGTCGCGGCGCTGGGC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 GGGAGGTGGCGGGGGTGGCGGGGGCGCCACCTACGTTTTCCGG       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 101851 GGGAGGTGGCGGGGGTGGCGGGGGCGCCACCTACGTTTTCCGGGTA...C

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    658   GTGCGCGCTGGCGAGCTGGAACCGTTGCTGGTGGCGGCCGGAGGCGGC
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102130 AGGTGCGCGCTGGCGAGCTGGAACCGTTGCTGGTGGCGGCCGGAGGCGGC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 GGTCGGGCCTACCTGAGGCCGCGGGACCGAGGCCGGACTCAGGCCTCCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102180 GGTCGGGCCTACCTGAGGCCGCGGGACCGAGGCCGGACTCAGGCCTCCCC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 CGAGAAACTGGAGAACCGCTCGGAGGCGCCCGGGAGCGGCGGGAGAGGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102230 CGAGAAACTGGAGAACCGCTCGGAGGCGCCCGGGAGCGGCGGGAGAGGCG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    806 GGGCGGCAG         GTGGTGGGGGCGGCTGGACGTCGCGGGCTCCC
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 102280 GGGCGGCAGGTG...CAGGTGGTGGGGGCGGCTGGACGTCGCGGGCTCCC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    847 TCTCCGCAGGCCGGCCGCTCACTGCAGGAGGGGGCGGAGGGCGGCCAGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102396 TCTCCGCAGGCCGGCCGCTCACTGCAGGAGGGGGCGGAGGGCGGCCAGGG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    897 CTGCTCCGAGGCTTGGGCGACCCTTGGCTGGGCCGCGGCCGGCGGCTTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102446 CTGCTCCGAGGCTTGGGCGACCCTTGGCTGGGCCGCGGCCGGCGGCTTCG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    947 GGGGCGGCGGCGGGGCCTGCACTGCGGGCGGAGGCGGCGGCGGCTACAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102496 GGGGCGGCGGCGGGGCCTGCACTGCGGGCGGAGGCGGCGGCGGCTACAGG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    997 G         GGGGCGACGCTTCAGAGACTGACAACCTCTGGGCTGATGG
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102546 GGTA...CAGGGGGCGACGCTTCAGAGACTGACAACCTCTGGGCTGATGG

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1038 GGAAGATGGAGTATCCTTCATACACCCCAGCAGCGAGCTCTTCCTGCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104621 GGAAGATGGAGTATCCTTCATACACCCCAGCAGCGAGCTCTTCCTGCAGC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1088 CTCTGGCAG         TCACCGAGAACCACGGAGAGGTAGAGATCCGA
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 104671 CTCTGGCAGGTA...CAGTCACCGAGAACCACGGAGAGGTAGAGATCCGA

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1129 AGGCACCTCAACTGCAGTCACTGCCCTTTGAGAGACTGCCAATGGCAGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105521 AGGCACCTCAACTGCAGTCACTGCCCTTTGAGAGACTGCCAATGGCAGGC

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1179 AGAGCTCCAGCTGGCTGAATGCCTGTGCCCAGAAGGCATGGAGCTAGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105571 AGAGCTCCAGCTGGCTGAATGCCTGTGCCCAGAAGGCATGGAGCTAGCTG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1229 TGGATAACGTCACCTGCATGG         ACCTGCACAAGCCCCCAGGC
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 105621 TGGATAACGTCACCTGCATGGGTA...TAGACCTGCACAAGCCCCCAGGC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1270 CCTCTGGTTCTGATGGTGGCTGTGGTGGCAACCTCAACACTGAGCCTCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106073 CCTCTGGTTCTGATGGTGGCTGTGGTGGCAACCTCAACACTGAGCCTCCT

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1320 TATGGTGTGTGGGGTCCTGATTCTGG         TGAAGCAGAAGAAGT
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 106123 TATGGTGTGTGGGGTCCTGATTCTGGGTA...CAGTGAAGCAGAAGAAGT

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1361 GGCAGGGCCTGCAGGAGATGAGGCTGCCGAGCCCTGAGCTTGAGCTGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106435 GGCAGGGCCTGCAGGAGATGAGGCTGCCGAGCCCTGAGCTTGAGCTGAGC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1411 AAGCTTCGAACCTCTGCCATCAGGACAGCCCCCAATCCCTATTATTGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106485 AAGCTTCGAACCTCTGCCATCAGGACAGCCCCCAATCCCTATTATTGCCA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1461 GGTGGGGCTTGGCCCGGCCCAGTCCTGGCCTCTGCCACCAGGTGTCACCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106535 GGTGGGGCTTGGCCCGGCCCAGTCCTGGCCTCTGCCACCAGGTGTCACCG

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1511 AGGTTTCCCCAGCCAATGTTACTCTGCTCAG         AGCCCTGGGC
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 106585 AGGTTTCCCCAGCCAATGTTACTCTGCTCAGGTA...CAGAGCCCTGGGC

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1552 CATGGTGCCTTTGGGGAGGTGTATGAGGGACTGGTAATTGGCCTTCCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107715 CATGGTGCCTTTGGGGAGGTGTATGAGGGACTGGTAATTGGCCTTCCTGG

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1602 GGACTCCAGTCCCCTGCAGGTAGCTATCAAG         ACCCTGCCAG
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 107765 GGACTCCAGTCCCCTGCAGGTAGCTATCAAGGTG...CAGACCCTGCCAG

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1643 AACTCTGCTCGCCTCAGGATGAGCTGGATTTCCTCATGGAGGCCCTCATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107943 AACTCTGCTCGCCTCAGGATGAGCTGGATTTCCTCATGGAGGCCCTCATC

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1693 ATCAG         CAAGTTTCGCCATCAGAACATTGTGCGGTGTGTGGG
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107993 ATCAGGTG...CAGCAAGTTTCGCCATCAGAACATTGTGCGGTGTGTGGG

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1734 GCTCAGCCTCAGGGCCACCCCTCGCCTCATTCTGCTGGAACTGATGTCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108216 GCTCAGCCTCAGGGCCACCCCTCGCCTCATTCTGCTGGAACTGATGTCTG

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1784 GAGGGGACATGAAGAGTTTCCTGAGGCACAGTCGGCCACACCTG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 108266 GAGGGGACATGAAGAGTTTCCTGAGGCACAGTCGGCCACACCTGGTG...

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1828    GGCCAGCCATCACCTCTGGTCATGCGGGACCTGCTGCAACTGGCCCA
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108402 CAGGGCCAGCCATCACCTCTGGTCATGCGGGACCTGCTGCAACTGGCCCA

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1875 GGACATAGCCCAGGGCTGCCACTACCTGGAGGAAAATCACTTCATCCACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108452 GGACATAGCCCAGGGCTGCCACTACCTGGAGGAAAATCACTTCATCCACA

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1925 G         GGATATTGCCGCCCGGAACTGCCTGCTGAGCTGCGCTGGA
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108502 GGTT...TAGGGATATTGCCGCCCGGAACTGCCTGCTGAGCTGCGCTGGA

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1966 CCCAGCCGAGTGGCCAAGATTGGGGACTTTGGGATGGCACGAGATATCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108686 CCCAGCCGAGTGGCCAAGATTGGGGACTTTGGGATGGCACGAGATATCTA

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2016 CCG         GGCCAGTTATTACCGCAGGGGGGACCGGGCCTTGCTCC
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108736 CCGGTG...TAGGGCCAGTTATTACCGCAGGGGGGACCGGGCCTTGCTCC

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2057 CAGTCAAGTGGATGCCCCCAGAGGCCTTCCTGGAGGGCATCTTCACATCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108874 CAGTCAAGTGGATGCCCCCAGAGGCCTTCCTGGAGGGCATCTTCACATCC

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2107 AAGACAGATTCCTG         GTCTTTTGGGGTGCTGCTCTGGGAGAT
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 108924 AAGACAGATTCCTGGTG...CAGGTCTTTTGGGGTGCTGCTCTGGGAGAT

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2148 CTTCTCACTGGGCTACATGCCCTATCCTGGGCGCACCAACCAGGAGGTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109097 CTTCTCACTGGGCTACATGCCCTATCCTGGGCGCACCAACCAGGAGGTGC

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2198 TGGACTTCGTCGTTGGAGGAGGCCGGATGGACCCTCCTAGGGGCTGCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109147 TGGACTTCGTCGTTGGAGGAGGCCGGATGGACCCTCCTAGGGGCTGCCCA

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2248 GGGCCTGT         GTACCGCATCATGACCCAGTGTTGGCAGCACGA
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 109197 GGGCCTGTGTG...CAGGTACCGCATCATGACCCAGTGTTGGCAGCACGA

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2289 GCCTGAGCTCCGCCCTAGCTTTGCCAGCATCTTGGAGCGTCTGCAGTACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109311 GCCTGAGCTCCGCCCTAGCTTTGCCAGCATCTTGGAGCGTCTGCAGTACT

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2339 GCACTCAG         GACCCGGATGTGCTGAATTCACTCCTGCCAATG
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 109361 GCACTCAGGTG...CAGGACCCGGATGTGCTGAATTCACTCCTGCCAATG

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2380 GAGCTGGGGCCCACCCCAGAGGAGGAAGGGACTTCTGGGCTGGGGAACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109499 GAGCTGGGGCCCACCCCAGAGGAGGAAGGGACTTCTGGGCTGGGGAACAG

   2600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2430 ATCTTTGGAGTGCCTAAGACCCCCACAGCCCCAGGAACTGAGTCCAGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109549 ATCTTTGGAGTGCCTAAGACCCCCACAGCCCCAGGAACTGAGTCCAGAGA

   2650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2480 AGTTGAAAAGCTGGGGAGGTAGCCCTCTTGGCCCCTGGCTGTCCTCTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109599 AGTTGAAAAGCTGGGGAGGTAGCCCTCTTGGCCCCTGGCTGTCCTCTGGC

   2700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2530 CTCAAGCCCCTCAAATCCAGGGGCCTCCAACCTCAGAACCTTTGGAATCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109649 CTCAAGCCCCTCAAATCCAGGGGCCTCCAACCTCAGAACCTTTGGAATCC

   2750     .    :
   2580 CACTTATCGCTCC
        |||||||||||||
 109699 CACTTATCGCTCC