seq1 = pF1KB8490.tfa, 2577 bp
seq2 = pF1KB8490/gi568815597r_33224868.tfa (gi568815597r:33224868_33475539), 250672 bp

>pF1KB8490 2577
>gi568815597r:33224868_33475539 (Chr1)

(complement)

1-174  (100001-100174)   100% ->
175-333  (103093-103251)   100% ->
334-411  (104446-104523)   100% ->
412-576  (104955-105119)   100% ->
577-663  (106918-107004)   100% ->
664-976  (108112-108424)   100% ->
977-1392  (120287-120702)   100% ->
1393-1558  (120974-121139)   100% ->
1559-1761  (141248-141450)   100% ->
1762-1891  (143136-143265)   100% ->
1892-2006  (144078-144192)   100% ->
2007-2148  (145328-145469)   100% ->
2149-2425  (146394-146670)   100% ->
2426-2577  (150521-150672)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGAGAATGAGCTGCCAGTCCCACATACATCTAGCAGTGCCTGTGCCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGAGAATGAGCTGCCAGTCCCACATACATCTAGCAGTGCCTGTGCCAC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CAGCAGTACCAGCGGGGCCAGTAGCAGCAGTGGCTGCAACAACAGCAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CAGCAGTACCAGCGGGGCCAGTAGCAGCAGTGGCTGCAACAACAGCAGCA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GTGGTGGAAGTGGCCGCCCCACCGGGCCCCAGATTTCTGTGTACAGTGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GTGGTGGAAGTGGCCGCCCCACCGGGCCCCAGATTTCTGTGTACAGTGGT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 ATTCCAGACCGGCAGACCGTGCAG         GTGATCCAGCAGGCCCT
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 100151 ATTCCAGACCGGCAGACCGTGCAGGTA...CAGGTGATCCAGCAGGCCCT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 GCACAGACAGCCCAGCACGGCCGCTCAGTACCTGCAGCAGATGTACGCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103110 GCACAGACAGCCCAGCACGGCCGCTCAGTACCTGCAGCAGATGTACGCCG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 CCCAGCAGCAGCACCTCATGCTGCAGACCGCGGCGCTCCAGCAGCAGCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103160 CCCAGCAGCAGCACCTCATGCTGCAGACCGCGGCGCTCCAGCAGCAGCAC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 CTCAGCAGCGCCCAGCTCCAGAGCCTGGCAGCCGTACAGCAG        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 103210 CTCAGCAGCGCCCAGCTCCAGAGCCTGGCAGCCGTACAGCAGGTG...TA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    334  GCAAGCCTGGTATCCAATAGACAAGGAAGCACTTCAGGCAGCAATGTGT
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104445 GGCAAGCCTGGTATCCAATAGACAAGGAAGCACTTCAGGCAGCAATGTGT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 CTGCGCAGGCCCCGGCCCAGTCATCTTCG         ATCAACCTGGCA
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 104495 CTGCGCAGGCCCCGGCCCAGTCATCTTCGGTG...TAGATCAACCTGGCA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 GCCTCCCCAGCAGCAGCCCAGCTCCTCAACCGGGCCCAGAGTGTGAACTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104967 GCCTCCCCAGCAGCAGCCCAGCTCCTCAACCGGGCCCAGAGTGTGAACTC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 TGCAGCAGCCTCAGGCATCGCTCAGCAGGCTGTGCTCTTGGGCAACACGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105017 TGCAGCAGCCTCAGGCATCGCTCAGCAGGCTGTGCTCTTGGGCAACACGT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 CTTCCCCAGCCCTGACTGCAAGCCAAGCACAGATGTATCTGAGGGCACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105067 CTTCCCCAGCCCTGACTGCAAGCCAAGCACAGATGTATCTGAGGGCACAG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 ATG         CTCATCTTCACGCCCACGGCCACCGTCGCTACTGTGCA
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105117 ATGGTG...CAGCTCATCTTCACGCCCACGGCCACCGTCGCTACTGTGCA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 GCCTGAGCTCGGCACTGGCTCCCCCGCCCGGCCCCCCACCCCCGCCCAG 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 106956 GCCTGAGCTCGGCACTGGCTCCCCCGCCCGGCCCCCCACCCCCGCCCAGG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    664         GTACAGAACTTGACCCTCCGAACACAGCAGACACCAGCGGCA
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107006 TG...CAGGTACAGAACTTGACCCTCCGAACACAGCAGACACCAGCGGCA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 GCAGCCTCGGGCCCCACCCCCACTCAGCCTGTCCTGCCCAGCTTGGCCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108154 GCAGCCTCGGGCCCCACCCCCACTCAGCCTGTCCTGCCCAGCTTGGCCCT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 GAAACCCACGCCGGGCGGTAGCCAGCCTCTGCCTACCCCAGCACAGAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108204 GAAACCCACGCCGGGCGGTAGCCAGCCTCTGCCTACCCCAGCACAGAGCA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    806 GAAATACTGCTCAGGCTTCCCCTGCAGGTGCCAAGCCTGGCATAGCTGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108254 GAAATACTGCTCAGGCTTCCCCTGCAGGTGCCAAGCCTGGCATAGCTGAC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    856 AGTGTGATGGAGCCACACAAGAAAGGAGATGGCAACAGCAGTGTGCCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108304 AGTGTGATGGAGCCACACAAGAAAGGAGATGGCAACAGCAGTGTGCCAGG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    906 GAGCATGGAAGGCCGGGCTGGGCTCAGCCGGACGGTTCCTGCTGTGGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108354 GAGCATGGAAGGCCGGGCTGGGCTCAGCCGGACGGTTCCTGCTGTGGCTG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    956 CCCACCCCCTCATTGCACCAG         CCTATGCTCAGCTGCAGCCA
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 108404 CCCACCCCCTCATTGCACCAGGTA...CAGCCTATGCTCAGCTGCAGCCA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    997 CACCAGCTCCTCCCACAGCCATCCTCAAAGCACCTGCAGCCCCAATTTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120307 CACCAGCTCCTCCCACAGCCATCCTCAAAGCACCTGCAGCCCCAATTTGT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1047 GATCCAGCAGCAGCCACAGCCACAACAGCAGCAGCCGCCGCCCCAGCAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120357 GATCCAGCAGCAGCCACAGCCACAACAGCAGCAGCCGCCGCCCCAGCAGT

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1097 CACGGCCTGTGCTCCAAGCTGAGCCCCACCCCCAGCTCGCCTCAGTCTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120407 CACGGCCTGTGCTCCAAGCTGAGCCCCACCCCCAGCTCGCCTCAGTCTCT

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1147 CCAAGCGTGGCCCTCCAGCCCAGCTCAGAGGCCCATGCCATGCCACTAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120457 CCAAGCGTGGCCCTCCAGCCCAGCTCAGAGGCCCATGCCATGCCACTAGG

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1197 CCCGGTTACACCCGCCCTGCCACTCCAGTGTCCCACTGCCAACCTGCACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120507 CCCGGTTACACCCGCCCTGCCACTCCAGTGTCCCACTGCCAACCTGCACA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1247 AGCCTGGCGGCAGTCAGCAGTGTCACCCTCCCACACCTGATACTGGGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120557 AGCCTGGCGGCAGTCAGCAGTGTCACCCTCCCACACCTGATACTGGGCCT

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1297 CAGAATGGACATCCCGAGGGCGTGCCCCACACCCCTCAACGCAGGTTCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120607 CAGAATGGACATCCCGAGGGCGTGCCCCACACCCCTCAACGCAGGTTCCA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1347 GCACACTTCAGCTGTCATCTTACAACTGCAGCCTGCTTCACCAGTG    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 120657 GCACACTTCAGCTGTCATCTTACAACTGCAGCCTGCTTCACCAGTGGTG.

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1393      CCCCAGCAGTGTGTCCCTGATGACTGGAAAGAAGTGGCACCAGGG
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120707 ..CAGCCCCAGCAGTGTGTCCCTGATGACTGGAAAGAAGTGGCACCAGGG

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1438 GAGAAAAGTGTGCCTGAGACGCGGTCTGGCCCATCACCACATCAGCAGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121019 GAGAAAAGTGTGCCTGAGACGCGGTCTGGCCCATCACCACATCAGCAGGC

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1488 TATTGTCACTGCCATGCCTGGTGGCCTGCCTGTACCCACGAGCCCTAACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121069 TATTGTCACTGCCATGCCTGGTGGCCTGCCTGTACCCACGAGCCCTAACA

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1538 TCCAGCCGTCCCCAGCTCACG         AGACAGGGCAGGGCATTGTT
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 121119 TCCAGCCGTCCCCAGCTCACGGTA...CAGAGACAGGGCAGGGCATTGTT

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1579 CATGCACTGACCGACCTCAGCAGCCCCGGCATGACCTCAGGGAACGGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141268 CATGCACTGACCGACCTCAGCAGCCCCGGCATGACCTCAGGGAACGGAAA

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1629 CTCTGCCTCCAGCATCGCCGGCACTGCCCCCCAGAATGGTGAGAATAAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141318 CTCTGCCTCCAGCATCGCCGGCACTGCCCCCCAGAATGGTGAGAATAAAC

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1679 CACCACAGGCCATTGTGAAACCCCAAATCCTGACGCATGTTATCGAAGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141368 CACCACAGGCCATTGTGAAACCCCAAATCCTGACGCATGTTATCGAAGGG

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1729 TTTGTGATCCAGGAGGGGGCGGAGCCTTTCCCG         GTGGGACG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 141418 TTTGTGATCCAGGAGGGGGCGGAGCCTTTCCCGGTA...TAGGTGGGACG

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1770 CTCGTCCCTGCTGGTGGGGAATCTCAAGAAGAAGTATGCACAGGGGTTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 143144 CTCGTCCCTGCTGGTGGGGAATCTCAAGAAGAAGTATGCACAGGGGTTCC

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1820 TGCCTGAGAAACTTCCACAGCAGGATCACACCACCACCACTGACTCGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 143194 TGCCTGAGAAACTTCCACAGCAGGATCACACCACCACCACTGACTCGGAG

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1870 ATGGAGGAGCCCTATCTGCAAG         AATCCAAAGAGGAGGGTGC
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 143244 ATGGAGGAGCCCTATCTGCAAGGTG...CAGAATCCAAAGAGGAGGGTGC

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1911 TCCCCTCAAACTCAAGTGTGAGCTCTGTGGCCGGGTGGACTTTGCCTATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 144097 TCCCCTCAAACTCAAGTGTGAGCTCTGTGGCCGGGTGGACTTTGCCTATA

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1961 AGTTCAAGCGTTCCAAGCGCTTCTGTTCCATGGCTTGTGCAAAGAG    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 144147 AGTTCAAGCGTTCCAAGCGCTTCTGTTCCATGGCTTGTGCAAAGAGGTG.

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2007      GTACAACGTGGGATGCACCAAACGGGTGGGACTTTTCCACTCAGA
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 144197 ..AAGGTACAACGTGGGATGCACCAAACGGGTGGGACTTTTCCACTCAGA

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2052 CCGGAGCAAGCTGCAGAAGGCAGGAGCTGCGACCCACAACCGCCGTCGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 145373 CCGGAGCAAGCTGCAGAAGGCAGGAGCTGCGACCCACAACCGCCGTCGGG

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2102 CCAGCAAAGCCAGTCTGCCACCACTTACCAAGGATACCAAGAAGCAG   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 145423 CCAGCAAAGCCAGTCTGCCACCACTTACCAAGGATACCAAGAAGCAGGTA

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2149       CCAACAGGCACTGTGCCCCTTTCGGTTACTGCTGCTTTGCAGCT
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 145473 ...CAGCCAACAGGCACTGTGCCCCTTTCGGTTACTGCTGCTTTGCAGCT

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2193 AACACACAGCCAGGAAGACTCCAGCCGTTGCTCAGATAACTCAAGCTATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 146438 AACACACAGCCAGGAAGACTCCAGCCGTTGCTCAGATAACTCAAGCTATG

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2243 AGGAACCCTTGTCACCCATCTCAGCCAGCTCATCTACTTCCCGCCGGCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 146488 AGGAACCCTTGTCACCCATCTCAGCCAGCTCATCTACTTCCCGCCGGCGA

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2293 CAAGGCCAGCGGGACCTGGAGCTCCCCGACATGCATATGCGGGACCTGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 146538 CAAGGCCAGCGGGACCTGGAGCTCCCCGACATGCATATGCGGGACCTGGT

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2343 GGGCATGGGACACCACTTCCTGCCAAGTGAGCCCACCAAGTGGAATGTAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 146588 GGGCATGGGACACCACTTCCTGCCAAGTGAGCCCACCAAGTGGAATGTAG

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2393 AAGACGTCTACGAATTCATCCGCTCTCTGCCAG         GCTGCCAG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 146638 AAGACGTCTACGAATTCATCCGCTCTCTGCCAGGTA...CAGGCTGCCAG

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2434 GAGATAGCAGAGGAATTCCGTGCCCAGGAAATCGACGGGCAAGCCCTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 150529 GAGATAGCAGAGGAATTCCGTGCCCAGGAAATCGACGGGCAAGCCCTGCT

   2600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2484 GCTGCTCAAGGAGGACCACCTGATGAGCGCCATGAACATCAAGCTGGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 150579 GCTGCTCAAGGAGGACCACCTGATGAGCGCCATGAACATCAAGCTGGGGC

   2650     .    :    .    :    .    :    .    :
   2534 CCGCCCTGAAGATCTACGCCCGCATCAGCATGCTCAAGGACTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 150629 CCGCCCTGAAGATCTACGCCCGCATCAGCATGCTCAAGGACTCC