seq1 = pF1KB8485.tfa, 2769 bp
seq2 = pF1KB8485/gi568815593r_176781076.tfa (gi568815593r:176781076_176996159), 215084 bp

>pF1KB8485 2769
>gi568815593r:176781076_176996159 (Chr5)

(complement)

1-96  (100001-100096)   100% ->
97-259  (104610-104772)   100% ->
260-414  (104969-105123)   100% ->
415-534  (105219-105338)   100% ->
535-630  (105430-105525)   100% ->
631-730  (106416-106515)   100% ->
731-914  (106596-106779)   100% ->
915-1070  (107296-107451)   100% ->
1071-1304  (107595-107828)   100% ->
1305-1600  (108414-108709)   100% ->
1601-1737  (108823-108959)   100% ->
1738-1857  (109039-109158)   100% ->
1858-1953  (112026-112121)   100% ->
1954-2053  (112291-112390)   100% ->
2054-2237  (114033-114216)   100% ->
2238-2393  (114313-114468)   100% ->
2394-2627  (114625-114858)   100% ->
2628-2769  (114943-115084)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGACTCCATTGGGTCTTCAGGGTTGCGGCAGGGGGAAGAAACCCTGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGACTCCATTGGGTCTTCAGGGTTGCGGCAGGGGGAAGAAACCCTGAG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TTGCTCTGAGGAGGGCTTGCCCGGGCCCTCAGACAGCTCAGAGCTG    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 100051 TTGCTCTGAGGAGGGCTTGCCCGGGCCCTCAGACAGCTCAGAGCTGGTA.

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     97      GTGCAGGAGTGCCTGCAGCAGTTCAAGGTGACAAGGGCACAGCTA
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 ..CAGGTGCAGGAGTGCCTGCAGCAGTTCAAGGTGACAAGGGCACAGCTA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 CAGCAGATCCAAGCCAGCCTCTTGGGTTCCATGGAGCAGGCGCTGAGGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104655 CAGCAGATCCAAGCCAGCCTCTTGGGTTCCATGGAGCAGGCGCTGAGGGG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 ACAGGCCAGCCCTGCCCCTGCGGTCCGGATGCTGCCTACATACGTGGGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104705 ACAGGCCAGCCCTGCCCCTGCGGTCCGGATGCTGCCTACATACGTGGGGT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 CCACCCCACATGGCACTG         AGCAAGGAGACTTCGTGGTGCTG
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 104755 CCACCCCACATGGCACTGGTG...CAGAGCAAGGAGACTTCGTGGTGCTG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 GAGCTGGGGGCCACAGGGGCCTCACTGCGTGTTTTGTGGGTGACTCTAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104992 GAGCTGGGGGCCACAGGGGCCTCACTGCGTGTTTTGTGGGTGACTCTAAC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 TGGCATTGAGGGGCATAGGGTGGAGCCCAGAAGCCAGGAGTTTGTGATCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105042 TGGCATTGAGGGGCATAGGGTGGAGCCCAGAAGCCAGGAGTTTGTGATCC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 CCCAAGAGGTGATGCTGGGTGCTGGCCAGCAG         CTCTTTGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 105092 CCCAAGAGGTGATGCTGGGTGCTGGCCAGCAGGTA...CAGCTCTTTGAC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 TTTGCTGCCCACTGCCTGTCTGAGTTCCTGGATGCGCAGCCTGTGAACAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105228 TTTGCTGCCCACTGCCTGTCTGAGTTCCTGGATGCGCAGCCTGTGAACAA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 ACAGGGTCTGCAGCTTGGCTTCAGCTTCTCTTTCCCTTGTCACCAGACGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105278 ACAGGGTCTGCAGCTTGGCTTCAGCTTCTCTTTCCCTTGTCACCAGACGG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 GCTTGGACAGG         AGCACCCTCATTTCCTGGACCAAAGGTTTT
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 105328 GCTTGGACAGGGTG...CAGAGCACCCTCATTTCCTGGACCAAAGGTTTT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 AGGTGCAGTGGTGTGGAAGGCCAGGATGTGGTCCAGCTGCTGAGAGATGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105460 AGGTGCAGTGGTGTGGAAGGCCAGGATGTGGTCCAGCTGCTGAGAGATGC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 CATTCGGAGGCAGGGG         GCCTACAACATCGACGTGGTTGCTG
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 105510 CATTCGGAGGCAGGGGGTG...TAGGCCTACAACATCGACGTGGTTGCTG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    656 TGGTGAACGACACAGTGGGCACCATGATGGGCTGTGAGCCGGGGGTCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106441 TGGTGAACGACACAGTGGGCACCATGATGGGCTGTGAGCCGGGGGTCAGG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 CCGTGTGAGGTTGGGCTAGTTGTAG         ACACGGGCACCAACGC
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 106491 CCGTGTGAGGTTGGGCTAGTTGTAGGTG...CAGACACGGGCACCAACGC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    747 GTGTTACATGGAGGAGGCACGGCATGTGGCAGTGCTGGACGAAGACCGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106612 GTGTTACATGGAGGAGGCACGGCATGTGGCAGTGCTGGACGAAGACCGGG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    797 GCCGCGTCTGCGTCAGCGTCGAGTGGGGCTCCTTCAGCGATGATGGGGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106662 GCCGCGTCTGCGTCAGCGTCGAGTGGGGCTCCTTCAGCGATGATGGGGCG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    847 CTGGGACCAGTGCTGACCACCTTCGACCATACCCTGGACCATGAGTCCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106712 CTGGGACCAGTGCTGACCACCTTCGACCATACCCTGGACCATGAGTCCCT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    897 GAATCCTGGTGCTCAGAG         GTTTGAGAAGATGATCGGAGGCC
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 106762 GAATCCTGGTGCTCAGAGGTG...CAGGTTTGAGAAGATGATCGGAGGCC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    938 TGTACCTGGGTGAGCTGGTGCGGCTGGTGCTGGCTCACTTGGCCCGGTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107319 TGTACCTGGGTGAGCTGGTGCGGCTGGTGCTGGCTCACTTGGCCCGGTGT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    988 GGGGTCCTCTTTGGTGGCTGCACCTCCCCTGCCCTGCTGAGCCAAGGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107369 GGGGTCCTCTTTGGTGGCTGCACCTCCCCTGCCCTGCTGAGCCAAGGCAG

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1038 CATCCTCCTGGAACACGTGGCTGAGATGGAGGA         CCCCTCTA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 107419 CATCCTCCTGGAACACGTGGCTGAGATGGAGGAGTG...CAGCCCCTCTA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1079 CTGGGGCAGCCCGTGTCCATGCTATCCTGCAGGACTTGGGCCTGAGCCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107603 CTGGGGCAGCCCGTGTCCATGCTATCCTGCAGGACTTGGGCCTGAGCCCT

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1129 GGGGCTTCGGATGTTGAGCTTGTGCAGCACGTCTGTGCGGCCGTGTGCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107653 GGGGCTTCGGATGTTGAGCTTGTGCAGCACGTCTGTGCGGCCGTGTGCAC

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1179 GCGGGCTGCCCAGCTCTGTGCTGCCGCCCTGGCCGCTGTTCTCTCCTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107703 GCGGGCTGCCCAGCTCTGTGCTGCCGCCCTGGCCGCTGTTCTCTCCTGCC

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1229 TCCAGCACAGCCGGGAGCAACAAACACTCCAGGTTGCTGTGGCCACCGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107753 TCCAGCACAGCCGGGAGCAACAAACACTCCAGGTTGCTGTGGCCACCGGA

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1279 GGCCGAGTGTGTGAGCGGCACCCCAG         GTTCTGCAGCGTCCT
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 107803 GGCCGAGTGTGTGAGCGGCACCCCAGGTA...TAGGTTCTGCAGCGTCCT

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1320 GCAGGGGACAGTGATGCTCCTGGCCCCGGAATGCGATGTCTCCTTAATCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108429 GCAGGGGACAGTGATGCTCCTGGCCCCGGAATGCGATGTCTCCTTAATCC

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1370 CCTCTGTGGATGGTGGTGGCCGGGGAGTGGCGATGGTGACTGCCGTGGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108479 CCTCTGTGGATGGTGGTGGCCGGGGAGTGGCGATGGTGACTGCCGTGGCT

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1420 GCCCGTCTGGCTGCCCACCGGCGCCTGCTGGAGGAGACCCTGGCCCCATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108529 GCCCGTCTGGCTGCCCACCGGCGCCTGCTGGAGGAGACCCTGGCCCCATT

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1470 CCGGTTGAACCATGATCAACTGGCTGCGGTTCAGGCACAGATGCGGAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108579 CCGGTTGAACCATGATCAACTGGCTGCGGTTCAGGCACAGATGCGGAAGG

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1520 CCATGGCCAAGGGGCTCCGAGGGGAGGCCTCCTCCCTTCGCATGCTGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108629 CCATGGCCAAGGGGCTCCGAGGGGAGGCCTCCTCCCTTCGCATGCTGCCC

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1570 ACTTTCGTCCGGGCCACCCCTGACGGCAGCG         AGCGAGGGGA
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 108679 ACTTTCGTCCGGGCCACCCCTGACGGCAGCGGTA...CAGAGCGAGGGGA

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1611 TTTCCTGGCCCTGGACCTCGGGGGCACGAACTTCCGTGTCCTCCTGGTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108833 TTTCCTGGCCCTGGACCTCGGGGGCACGAACTTCCGTGTCCTCCTGGTAC

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1661 GTGTGACCACAGGCGTGCAGATCACCAGCGAGATCTACTCCATTCCCGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108883 GTGTGACCACAGGCGTGCAGATCACCAGCGAGATCTACTCCATTCCCGAG

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1711 ACTGTGGCCCAGGGTTCTGGGCAGCAG         CTCTTTGACCACAT
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 108933 ACTGTGGCCCAGGGTTCTGGGCAGCAGGTA...CAGCTCTTTGACCACAT

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1752 CGTGGACTGCATCGTGGACTTCCAGCAGAAGCAGGGCCTGAGCGGGCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109053 CGTGGACTGCATCGTGGACTTCCAGCAGAAGCAGGGCCTGAGCGGGCAGA

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1802 GCCTCCCACTGGGTTTTACCTTCTCCTTCCCATGTAGGCAGCTTGGCCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109103 GCCTCCCACTGGGTTTTACCTTCTCCTTCCCATGTAGGCAGCTTGGCCTA

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1852 GACCAG         GGCATCCTCCTGAACTGGACCAAGGGTTTCAAGGC
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109153 GACCAGGTG...CAGGGCATCCTCCTGAACTGGACCAAGGGTTTCAAGGC

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1893 ATCAGACTGCGAGGGCCAAGATGTCGTGAGTCTGTTGCGGGAAGCCATCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112061 ATCAGACTGCGAGGGCCAAGATGTCGTGAGTCTGTTGCGGGAAGCCATCA

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1943 CTCGCAGACAG         GCAGTGGAGCTGAATGTGGTTGCCATTGTC
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 112111 CTCGCAGACAGGTA...CAGGCAGTGGAGCTGAATGTGGTTGCCATTGTC

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1984 AATGACACGGTGGGGACCATGATGTCCTGTGGCTATGAGGACCCCCGTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112321 AATGACACGGTGGGGACCATGATGTCCTGTGGCTATGAGGACCCCCGTTG

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2034 CGAGATAGGCCTCATTGTCG         GAACCGGCACCAATGCCTGCT
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 112371 CGAGATAGGCCTCATTGTCGGTG...CAGGAACCGGCACCAATGCCTGCT

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2075 ACATGGAGGAGCTCCGGAATGTGGCGGGCGTGCCTGGGGACTCAGGCCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114054 ACATGGAGGAGCTCCGGAATGTGGCGGGCGTGCCTGGGGACTCAGGCCGC

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2125 ATGTGCATCAACATGGAGTGGGGCGCCTTTGGGGACGATGGCTCTCTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114104 ATGTGCATCAACATGGAGTGGGGCGCCTTTGGGGACGATGGCTCTCTGGC

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2175 CATGCTCAGCACCCGCTTTGATGCAAGTGTGGACCAGGCGTCCATCAACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114154 CATGCTCAGCACCCGCTTTGATGCAAGTGTGGACCAGGCGTCCATCAACC

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2225 CCGGCAAGCAGAG         GTTTGAAAAGATGATCAGCGGCATGTAC
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 114204 CCGGCAAGCAGAGGTG...CAGGTTTGAAAAGATGATCAGCGGCATGTAC

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2266 CTGGGGGAGATCGTCCGCCACATCCTTTTACATTTAACCAGCCTTGGCGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114341 CTGGGGGAGATCGTCCGCCACATCCTTTTACATTTAACCAGCCTTGGCGT

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2316 TCTCTTCCGGGGCCAGCAGATCCAGCGCCTTCAGACCAGGGACATCTTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114391 TCTCTTCCGGGGCCAGCAGATCCAGCGCCTTCAGACCAGGGACATCTTCA

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2366 AGACCAAGTTCCTCTCTGAGATCGAAAG         TGACAGCCTGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 114441 AGACCAAGTTCCTCTCTGAGATCGAAAGGTG...CAGTGACAGCCTGGCC

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2407 CTGCGGCAGGTCCGAGCCATCCTAGAGGATCTGGGGCTACCCCTGACCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114638 CTGCGGCAGGTCCGAGCCATCCTAGAGGATCTGGGGCTACCCCTGACCTC

   2600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2457 AGATGACGCCCTGATGGTGCTAGAGGTGTGCCAGGCTGTGTCCCAGAGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114688 AGATGACGCCCTGATGGTGCTAGAGGTGTGCCAGGCTGTGTCCCAGAGGG

   2650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2507 CTGCCCAGCTCTGTGGGGCGGGTGTAGCTGCCGTGGTGGAGAAGATCCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114738 CTGCCCAGCTCTGTGGGGCGGGTGTAGCTGCCGTGGTGGAGAAGATCCGG

   2700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2557 GAGAACCGGGGCCTGGAAGAGCTGGCAGTGTCTGTGGGGGTGGATGGAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114788 GAGAACCGGGGCCTGGAAGAGCTGGCAGTGTCTGTGGGGGTGGATGGAAC

   2750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2607 GCTCTACAAGCTGCACCCGCG         CTTCTCCAGCCTGGTGGCGG
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 114838 GCTCTACAAGCTGCACCCGCGGTG...CAGCTTCTCCAGCCTGGTGGCGG

   2800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2648 CCACAGTGCGGGAGCTGGCCCCTCGCTGTGTGGTCACGTTCCTGCAGTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114963 CCACAGTGCGGGAGCTGGCCCCTCGCTGTGTGGTCACGTTCCTGCAGTCA

   2850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2698 GAGGATGGGTCCGGCAAAGGTGCGGCCCTGGTCACCGCTGTTGCCTGCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115013 GAGGATGGGTCCGGCAAAGGTGCGGCCCTGGTCACCGCTGTTGCCTGCCG

   2900     .    :    .    :
   2748 CCTTGCGCAGTTGACTCGTGTC
        ||||||||||||||||||||||
 115063 CCTTGCGCAGTTGACTCGTGTC