seq1 = pF1KB8481.tfa, 2748 bp
seq2 = pF1KB8481/gi568815590f_24813794.tfa (gi568815590f:24813794_25018603), 204810 bp

>pF1KB8481 2748
>gi568815590f:24813794_25018603 (Chr8)

1-1080  (100001-101080)   99% ->
1081-1205  (101812-101936)   100% ->
1206-2748  (103268-104810)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAGCTACACGTTGGACTCGCTGGGCAACCCGTCCGCCTACCGGCGGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAGCTACACGTTGGACTCGCTGGGCAACCCGTCCGCCTACCGGCGGGT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 AACCGAGACCCGCTCGAGCTTCAGCCGCGTCAGCGGCTCCCCGTCCAGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 AACCGAGACCCGCTCGAGCTTCAGCCGCGTCAGCGGCTCCCCGTCCAGTG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GCTTCCGCTCGCAGTCGTGGTCCCGCGGCTCGCCCAGCACCGTGTCCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GCTTCCGCTCGCAGTCGTGGTCCCGCGGCTCGCCCAGCACCGTGTCCTCC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 TCCTATAAGCGCAGCATGCTCGCCCCGCGCCTCGCTTACAGCTCGGCCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 TCCTATAAGCGCAGCATGCTCGCCCCGCGCCTCGCTTACAGCTCGGCCAT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GCTCAGCTCCGCCGAGAGCAGCCTTGACTTCAGCCAGTCCTCGTCCCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 GCTCAGCTCCGCCGAGAGCAGCCTTGACTTCAGCCAGTCCTCGTCCCTGC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TCAACGGCGGCTCCGGACCCGGCGGCGACTACAAGCTGTCCCGCTCCAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 TCAACGGCGGCTCCGGACCCGGCGGCGACTACAAGCTGTCCCGCTCCAAC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 GAGAAGGAGCAGCTGCAGGGGCTGAACGACCGCTTTGCCGGCTACATAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 GAGAAGGAGCAGCTGCAGGGGCTGAACGACCGCTTTGCCGGCTACATAGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 GAAGGTGCACTACCTGGAGCAGCAGAATAAGGAGATTGAGGCGGAGATCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 GAAGGTGCACTACCTGGAGCAGCAGAATAAGGAGATTGAGGCGGAGATCC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 AGGCGCTGCGGCAGAAGCAGGCCTCGCACGCCCAGCTGGGCGACGCGTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 AGGCGCTGCGGCAGAAGCAGGCCTCGCACGCCCAGCTGGGCGACGCGTAC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 GACCAGGAGATCCGCGAGCTGCGCGCCACCCTGGAGATGGTGAACCACGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 GACCAGGAGATCCGCGAGCTGCGCGCCACCCTGGAGATGGTGAACCACGA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 GAAGGCTCAGGTGCAGCTGGACTCGGACCACCTGGAGGAAGACATCCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 GAAGGCTCAGGTGCAGCTGGACTCGGACCACCTGGAGGAAGACATCCACC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 GGCTCAAGGAGCGCTTTGAGGAGGAGGCGCGGTTGCGCGACGACACTGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 GGCTCAAGGAGCGCTTTGAGGAGGAGGCGCGGTTGCGCGACGACACTGAG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 GCGGCCATCCGCGCGCTGCGCAAAGACATCGAGGAGGCGTCGCTGGTTAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
 100601 GCGGCCATCCGCGCGCTGCGCAAAGACATCGAGGAGGCGTCGCTGGTCAA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 GGTGGAGCTGGACAAGAAGGTGCAGTCGCTGCAGGATGAGGTGGCCTTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 GGTGGAGCTGGACAAGAAGGTGCAGTCGCTGCAGGATGAGGTGGCCTTCC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 TGCGGAGCAACCACGAGGAGGAGGTGGCCGACCTTCTGGCCCAGATCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 TGCGGAGCAACCACGAGGAGGAGGTGGCCGACCTTCTGGCCCAGATCCAG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 GCATCGCACATCACGGTGGAGCGCAAAGACTACCTGAAGACAGACATCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 GCATCGCACATCACGGTGGAGCGCAAAGACTACCTGAAGACAGACATCTC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 GACGGCGCTGAAGGAAATCCGCTCCCAGCTCGAAAGCCACTCAGACCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 GACGGCGCTGAAGGAAATCCGCTCCCAGCTCGAAAGCCACTCAGACCAGA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 ATATGCACCAGGCCGAAGAGTGGTTCAAATGCCGCTACGCCAAGCTCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 ATATGCACCAGGCCGAAGAGTGGTTCAAATGCCGCTACGCCAAGCTCACC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 GAGGCGGCCGAGCAGAACAAGGAGGCCATCCGCTCCGCCAAGGAAGAGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 GAGGCGGCCGAGCAGAACAAGGAGGCCATCCGCTCCGCCAAGGAAGAGAT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    951 CGCCGAGTACCGGCGCCAGCTGCAGTCCAAGAGCATCGAGCTAGAGTCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100951 CGCCGAGTACCGGCGCCAGCTGCAGTCCAAGAGCATCGAGCTAGAGTCGG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1001 TGCGCGGCACCAAGGAGTCCCTGGAGCGGCAGCTCAGCGACATCGAGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101001 TGCGCGGCACCAAGGAGTCCCTGGAGCGGCAGCTCAGCGACATCGAGGAG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1051 CGCCACAACCACGACCTCAGCAGCTACCAG         GACACCATCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 101051 CGCCACAACCACGACCTCAGCAGCTACCAGGTA...CAGGACACCATCCA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1092 GCAGCTGGAAAATGAGCTTCGGGGCACAAAGTGGGAAATGGCTCGTCATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101823 GCAGCTGGAAAATGAGCTTCGGGGCACAAAGTGGGAAATGGCTCGTCATT

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1142 TGCGCGAATACCAGGACCTCCTCAACGTCAAGATGGCTCTGGATATAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101873 TGCGCGAATACCAGGACCTCCTCAACGTCAAGATGGCTCTGGATATAGAA

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1192 ATCGCTGCGTACAG         AAAACTCCTGGAGGGTGAAGAGACTAG
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 101923 ATCGCTGCGTACAGGTA...TAGAAAACTCCTGGAGGGTGAAGAGACTAG

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1233 ATTTAGCACATTTGCAGGAAGCATCACTGGGCCACTGTATACACACCGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103295 ATTTAGCACATTTGCAGGAAGCATCACTGGGCCACTGTATACACACCGAC

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1283 CCCCAATCACAATATCCAGTAAGATTCAGAAAACCAAGGTGGAAGCTCCC
        |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
 103345 CCCCAATCACAATATCCAGTAAGATTCAGAAACCCAAGGTGGAAGCTCCC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1333 AAGCTTAAGGTCCAACACAAATTTGTCGAGGAGATCATAGAGGAAACCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103395 AAGCTTAAGGTCCAACACAAATTTGTCGAGGAGATCATAGAGGAAACCAA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1383 AGTGGAGGATGAGAAGTCAGAAATGGAAGAGGCCCTGACAGCCATTACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103445 AGTGGAGGATGAGAAGTCAGAAATGGAAGAGGCCCTGACAGCCATTACAG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1433 AGGAATTGGCCGTTTCCATGAAGGAAGAGAAGAAAGAAGCAGCAGAAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103495 AGGAATTGGCCGTTTCCATGAAGGAAGAGAAGAAAGAAGCAGCAGAAGAA

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1483 AAGGAAGAGGAACCCGAAGCTGAAGAAGAAGAAGTAGCTGCCAAAAAGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103545 AAGGAAGAGGAACCCGAAGCTGAAGAAGAAGAAGTAGCTGCCAAAAAGTC

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1533 TCCAGTGAAAGCAACTGCACCTGAAGTTAAAGAAGAGGAAGGGGAAAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103595 TCCAGTGAAAGCAACTGCACCTGAAGTTAAAGAAGAGGAAGGGGAAAAGG

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1583 AGGAAGAAGAAGGCCAGGAAGAAGAGGAGGAAGAAGATGAGGGAGCTAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103645 AGGAAGAAGAAGGCCAGGAAGAAGAGGAGGAAGAAGATGAGGGAGCTAAG

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1633 TCAGACCAAGCCGAAGAGGGAGGATCCGAGAAGGAAGGCTCTAGTGAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103695 TCAGACCAAGCCGAAGAGGGAGGATCCGAGAAGGAAGGCTCTAGTGAAAA

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1683 AGAGGAAGGTGAGCAGGAAGAAGGAGAAACAGAAGCTGAAGCTGAAGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103745 AGAGGAAGGTGAGCAGGAAGAAGGAGAAACAGAAGCTGAAGCTGAAGGAG

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1733 AGGAAGCCGAAGCTAAAGAGGAAAAGAAAGTGGAGGAAAAGAGTGAGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103795 AGGAAGCCGAAGCTAAAGAGGAAAAGAAAGTGGAGGAAAAGAGTGAGGAA

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1783 GTGGCTACCAAGGAGGAGCTGGTGGCAGATGCCAAGGTGGAAAAGCCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103845 GTGGCTACCAAGGAGGAGCTGGTGGCAGATGCCAAGGTGGAAAAGCCAGA

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1833 AAAAGCCAAGTCTCCTGTGCCAAAATCACCAGTGGAAGAGAAAGGCAAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103895 AAAAGCCAAGTCTCCTGTGCCAAAATCACCAGTGGAAGAGAAAGGCAAGT

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1883 CTCCTGTGCCCAAGTCACCAGTGGAAGAGAAAGGCAAGTCTCCTGTGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103945 CTCCTGTGCCCAAGTCACCAGTGGAAGAGAAAGGCAAGTCTCCTGTGCCC

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1933 AAGTCACCAGTGGAAGAGAAAGGCAAGTCTCCTGTGCCGAAATCACCAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103995 AAGTCACCAGTGGAAGAGAAAGGCAAGTCTCCTGTGCCGAAATCACCAGT

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1983 GGAAGAGAAAGGCAAGTCTCCTGTGTCAAAATCACCAGTGGAAGAGAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104045 GGAAGAGAAAGGCAAGTCTCCTGTGTCAAAATCACCAGTGGAAGAGAAAG

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2033 CCAAATCTCCTGTGCCAAAATCACCAGTGGAAGAGGCAAAGTCAAAAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104095 CCAAATCTCCTGTGCCAAAATCACCAGTGGAAGAGGCAAAGTCAAAAGCA

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2083 GAAGTGGGGAAAGGTGAACAGAAAGAGGAAGAAGAAAAGGAAGTCAAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104145 GAAGTGGGGAAAGGTGAACAGAAAGAGGAAGAAGAAAAGGAAGTCAAGGA

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2133 AGCTCCCAAGGAAGAGAAGGTAGAGAAAAAGGAAGAGAAACCAAAGGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104195 AGCTCCCAAGGAAGAGAAGGTAGAGAAAAAGGAAGAGAAACCAAAGGATG

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2183 TGCCAGAGAAGAAGAAAGCTGAGTCCCCTGTAAAGGAGGAAGCTGTGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104245 TGCCAGAGAAGAAGAAAGCTGAGTCCCCTGTAAAGGAGGAAGCTGTGGCA

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2233 GAGGTGGTCACCATCACCAAATCGGTAAAGGTGCACTTGGAGAAAGAGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104295 GAGGTGGTCACCATCACCAAATCGGTAAAGGTGCACTTGGAGAAAGAGAC

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2283 CAAAGAAGAGGGGAAGCCACTGCAGCAGGAGAAAGAGAAGGAGAAAGCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104345 CAAAGAAGAGGGGAAGCCACTGCAGCAGGAGAAAGAGAAGGAGAAAGCGG

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2333 GAGGAGAGGGAGGAAGTGAGGAGGAAGGGAGTGATAAAGGTGCCAAGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104395 GAGGAGAGGGAGGAAGTGAGGAGGAAGGGAGTGATAAAGGTGCCAAGGGA

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2383 TCCAGGAAGGAAGACATAGCTGTCAATGGGGAGGTAGAAGGAAAAGAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104445 TCCAGGAAGGAAGACATAGCTGTCAATGGGGAGGTAGAAGGAAAAGAGGA

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2433 GGTAGAGCAGGAGACCAAGGAAAAAGGCAGTGGGAGGGAAGAGGAGAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104495 GGTAGAGCAGGAGACCAAGGAAAAAGGCAGTGGGAGGGAAGAGGAGAAAG

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2483 GCGTTGTCACCAATGGCCTAGACTTGAGCCCAGCAGATGAAAAGAAGGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104545 GCGTTGTCACCAATGGCCTAGACTTGAGCCCAGCAGATGAAAAGAAGGGG

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2533 GGTGATAAAAGTGAGGAGAAAGTGGTGGTGACCAAAACGGTAGAAAAAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104595 GGTGATAAAAGTGAGGAGAAAGTGGTGGTGACCAAAACGGTAGAAAAAAT

   2600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2583 CACCAGTGAGGGGGGAGATGGTGCTACCAAATACATCACTAAATCTGTAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104645 CACCAGTGAGGGGGGAGATGGTGCTACCAAATACATCACTAAATCTGTAA

   2650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2633 CCGTCACTCAAAAGGTTGAAGAGCATGAAGAGACCTTTGAGGAGAAACTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104695 CCGTCACTCAAAAGGTTGAAGAGCATGAAGAGACCTTTGAGGAGAAACTA

   2700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2683 GTGTCTACTAAAAAGGTAGAAAAAGTCACTTCACACGCCATAGTAAAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104745 GTGTCTACTAAAAAGGTAGAAAAAGTCACTTCACACGCCATAGTAAAGGA

   2750     .    :    .
   2733 AGTCACCCAGAGTGAC
        ||||||||||||||||
 104795 AGTCACCCAGAGTGAC