Result of SIM4 for
pF1KB8474
seq1 = pF1KB8474.tfa, 2523 bp
seq2 = pF1KB8474/gi568815575r_48874196.tfa (gi568815575r:48874196_49102229), 228034 bp
>pF1KB8474 2523
>gi568815575r:48874196_49102229 (ChrX)
(complement)
1-42 (100001-100042) 100% ->
43-109 (102726-102792) 100% ->
110-171 (102931-102992) 100% ->
172-198 (104050-104076) 100% ->
199-306 (104873-104980) 100% ->
307-457 (108652-108802) 100% ->
458-642 (111120-111304) 99% ->
643-690 (111498-111545) 100% ->
691-722 (112227-112258) 100% ->
723-770 (112348-112395) 100% ->
771-870 (112520-112619) 100% ->
871-948 (114032-114109) 100% ->
949-1041 (114353-114445) 100% ->
1042-1176 (116828-116962) 100% ->
1177-1272 (118360-118455) 100% ->
1273-1485 (118790-119002) 100% ->
1486-1599 (119138-119251) 100% ->
1600-1677 (120358-120435) 100% ->
1678-1773 (120539-120634) 100% ->
1774-1830 (120758-120814) 100% ->
1831-1930 (120916-121015) 100% ->
1931-2061 (123795-123925) 99% ->
2062-2184 (125867-125989) 100% ->
2185-2278 (126119-126212) 100% ->
2279-2433 (126921-127075) 99% ->
2434-2523 (127945-128034) 100%
0 . : . : . : . : . :
1 ATGGCGCAAGCTCTGTCTGAGGAGGAGTTTCAGCGGATGCAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
100001 ATGGCGCAAGCTCTGTCTGAGGAGGAGTTTCAGCGGATGCAGGTG...AA
50 . : . : . : . : . :
43 GCTCAGCTCCTGGAACTCCGGACAAACAACTACCAGCTTTCAGATGAAC
>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
102725 GGCTCAGCTCCTGGAACTCCGGACAAACAACTACCAGCTTTCAGATGAAC
100 . : . : . : . : . :
92 TACGCAAGAATGGTGTTG AACTCACCAGTCTTCGACAGAAG
||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
102775 TACGCAAGAATGGTGTTGGTG...CAGAACTCACCAGTCTTCGACAGAAG
150 . : . : . : . : . :
133 GTCGCCTACTTGGATAAGGAGTTCAGCAAAGCTCAGAAG GC
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
102954 GTCGCCTACTTGGATAAGGAGTTCAGCAAAGCTCAGAAGGTA...TAGGC
200 . : . : . : . : . :
174 ACTGAGCAAGAGCAAGAAAGCTCAG GAAGTCGAGGTATTGC
|||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
104052 ACTGAGCAAGAGCAAGAAAGCTCAGGTA...CAGGAAGTCGAGGTATTGC
250 . : . : . : . : . :
215 TGAGTGAAAATGAGATGCTGCAGGCAAAGCTGCACAGCCAGGAGGAGGAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
104889 TGAGTGAAAATGAGATGCTGCAGGCAAAGCTGCACAGCCAGGAGGAGGAC
300 . : . : . : . : . :
265 TTCCGTTTGCAGAACAGCACACTAATGGCCGAGTTCAGCAAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
104939 TTCCGTTTGCAGAACAGCACACTAATGGCCGAGTTCAGCAAGGTG...CA
350 . : . : . : . : . :
307 CTCTGCAGCCAGATGGAACAGCTGGAGCAAGAGAACCAGCAACTGAAGG
>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
108651 GCTCTGCAGCCAGATGGAACAGCTGGAGCAAGAGAACCAGCAACTGAAGG
400 . : . : . : . : . :
356 AGGGGGCTGCAGGAGCAGGGGTTGCCCAAGCTGGGCCCCTCGTGGATGGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
108701 AGGGGGCTGCAGGAGCAGGGGTTGCCCAAGCTGGGCCCCTCGTGGATGGG
450 . : . : . : . : . :
406 GAGCTGCTGAGGCTACAGGCTGAAAACACAGCCTTGCAGAAGAACGTGGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
108751 GAGCTGCTGAGGCTACAGGCTGAAAACACAGCCTTGCAGAAGAACGTGGC
500 . : . : . : . : . :
456 AG CCCTGCAGGAACGCTATGGGAAAGAAGCCGGGAAGTTCT
||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
108801 AGGTG...CAGCCCTGCAGGAACGCTATGGGAAAGAAGCCGGGAAGTTCT
550 . : . : . : . : . :
497 CAGCTGTCAGTGAGGGCCAGGGGGATCCCCCAGGGGGCCCGGCCCCCACC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
111159 CAGCTGTCAGTGAGGGCCAGGGGGATCCCCCAGGGGGCCTGGCCCCCACC
600 . : . : . : . : . :
547 GTCCTGGCCCCCATGCCGTTGGCAGAGGTGGAGCTGAAATGGGAAATGGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
111209 GTCCTGGCCCCCATGCCGTTGGCAGAGGTGGAGCTGAAATGGGAAATGGA
650 . : . : . : . : . :
597 GAAAGAGGAGAAGAGATTGCTCTGGGAACAGCTGCAAGGCTTAGAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
111259 GAAAGAGGAGAAGAGATTGCTCTGGGAACAGCTGCAAGGCTTAGAGGTG.
700 . : . : . : . : . :
643 AGCTCAAAGCAGGCCGAAACATCCAGGCTGCAGGAGGAACTTGCT
..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
111309 ..CAGAGCTCAAAGCAGGCCGAAACATCCAGGCTGCAGGAGGAACTTGCT
750 . : . : . : . : . :
688 AAG CTCTCCGAGAAACTGAAAAAGAAACAAGAAAG
|||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
111543 AAGGTG...CAGCTCTCCGAGAAACTGAAAAAGAAACAAGAAAGGTA...
800 . : . : . : . : . :
723 TTTTTGCCGTCTGCAGACAGAAAAGGAGACTCTGTTTAATGACAGCA
>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
112345 CAGTTTTTGCCGTCTGCAGACAGAAAAGGAGACTCTGTTTAATGACAGCA
850 . : . : . : . : . :
770 G GAACAAGATTGAGGAATTACAACAACGGAAGGAAGCTGAT
|>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
112395 GGTA...TAGGAACAAGATTGAGGAATTACAACAACGGAAGGAAGCTGAT
900 . : . : . : . : . :
811 CACAAAGCCCAGTTGGCTCGAACCCAGAAGCTGCAGCAGGAACTTGAGGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
112560 CACAAAGCCCAGTTGGCTCGAACCCAGAAGCTGCAGCAGGAACTTGAGGC
950 . : . : . : . : . :
861 TGCCAATCAG AGCTTGGCAGAGCTGAGAGATCAGCGGCAGG
||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
112610 TGCCAATCAGGTG...CAGAGCTTGGCAGAGCTGAGAGATCAGCGGCAGG
1000 . : . : . : . : . :
902 GGGAGCGCCTGGAACATGCAGCAGCTTTGCGGGCCCTACAAGATCAG
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
114063 GGGAGCGCCTGGAACATGCAGCAGCTTTGCGGGCCCTACAAGATCAGGTA
1050 . : . : . : . : . :
949 GTATCCATCCAGAGTGCAGATGCACAGGAACAAGTGGAAGGGCT
...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
114113 ...CAGGTATCCATCCAGAGTGCAGATGCACAGGAACAAGTGGAAGGGCT
1100 . : . : . : . : . :
993 TTTGGCTGAGAACAATGCCTTGAGGACTAGCCTGGCTGCCCTGGAGCAG
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
114397 TTTGGCTGAGAACAATGCCTTGAGGACTAGCCTGGCTGCCCTGGAGCAGG
1150 . : . : . : . : . :
1042 ATCCAAACAGCAAAGACCCAAGAACTGAATATGCTCCGGGAA
>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
114447 TA...CAGATCCAAACAGCAAAGACCCAAGAACTGAATATGCTCCGGGAA
1200 . : . : . : . : . :
1084 CAGACCACTGGGCTGGCAGCTGAGTTGCAGCAGCAGCAGGCTGAGTACGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
116870 CAGACCACTGGGCTGGCAGCTGAGTTGCAGCAGCAGCAGGCTGAGTACGA
1250 . : . : . : . : . :
1134 GGACCTTATGGGACAGAAAGATGACCTCAACTCCCAGCTCCAG
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
116920 GGACCTTATGGGACAGAAAGATGACCTCAACTCCCAGCTCCAGGTA...T
1300 . : . : . : . : . :
1177 GAGTCATTACGGGCCAATAGTCGACTGCTGGAACAACTTCAAGAAATA
>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
118358 AGGAGTCATTACGGGCCAATAGTCGACTGCTGGAACAACTTCAAGAAATA
1350 . : . : . : . : . :
1225 GGGCAGGAGAAGGAGCAGTTGACCCAGGAATTACAGGAGGCTCGGAAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
118408 GGGCAGGAGAAGGAGCAGTTGACCCAGGAATTACAGGAGGCTCGGAAGGT
1400 . : . : . : . : . :
1273 AGTGCGGAGAAGCGGAAGGCCATGCTGGATGAGCTAGCAATGG
>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
118458 A...CAGAGTGCGGAGAAGCGGAAGGCCATGCTGGATGAGCTAGCAATGG
1450 . : . : . : . : . :
1316 AAACGCTGCAAGAGAAGTCCCAGCACAAGGAAGAGCTGGGAGCAGTTCGT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
118833 AAACGCTGCAAGAGAAGTCCCAGCACAAGGAAGAGCTGGGAGCAGTTCGT
1500 . : . : . : . : . :
1366 CTACGGCATGAGAAGGAGGTGCTGGGGGTGCGTGCCCGCTATGAGCGTGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
118883 CTACGGCATGAGAAGGAGGTGCTGGGGGTGCGTGCCCGCTATGAGCGTGA
1550 . : . : . : . : . :
1416 GCTCCGAGAGCTGCATGAAGACAAGAAGCGTCAGGAGGAGGAGCTCCGTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
118933 GCTCCGAGAGCTGCATGAAGACAAGAAGCGTCAGGAGGAGGAGCTCCGTG
1600 . : . : . : . : . :
1466 GGCAGATCCGGGAGGAGAAG GCCCGGACACGGGAGCTGGAG
||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
118983 GGCAGATCCGGGAGGAGAAGGTG...CAGGCCCGGACACGGGAGCTGGAG
1650 . : . : . : . : . :
1507 ACTCTCCAGCAGACAGTGGAAGAACTTCAAGCTCAGGTACATTCCATGGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
119159 ACTCTCCAGCAGACAGTGGAAGAACTTCAAGCTCAGGTACATTCCATGGA
1700 . : . : . : . : . :
1557 TGGAGCCAAGGGCTGGTTTGAACGGCGCTTGAAGGAAGCCGAG
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
119209 TGGAGCCAAGGGCTGGTTTGAACGGCGCTTGAAGGAAGCCGAGGTG...T
1750 . : . : . : . : . :
1600 GAATCCCTGCAGCAGCAGCAGCAGGAACAAGAGGAAGCCCTCAAGCAG
>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
120356 AGGAATCCCTGCAGCAGCAGCAGCAGGAACAAGAGGAAGCCCTCAAGCAG
1800 . : . : . : . : . :
1648 TGTCGGGAGCAGCACGCTGCCGAGCTGAAG GGCAAGGAGGA
||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
120406 TGTCGGGAGCAGCACGCTGCCGAGCTGAAGGTG...CAGGGCAAGGAGGA
1850 . : . : . : . : . :
1689 GGAGCTACAGGATGTACGGGATCAGCTCGAGCAGGCCCAGGAGGAGCGGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
120550 GGAGCTACAGGATGTACGGGATCAGCTCGAGCAGGCCCAGGAGGAGCGGG
1900 . : . : . : . : . :
1739 ACTGCCACCTGAAGACCATTAGCAGCCTGAAGCAG GAGGTG
|||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
120600 ACTGCCACCTGAAGACCATTAGCAGCCTGAAGCAGGTC...CAGGAGGTG
1950 . : . : . : . : . :
1780 AAGGACACAGTGGATGGGCAGAGGATCCTGGAGAAGAAGGGCAGTGCTGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
120764 AAGGACACAGTGGATGGGCAGAGGATCCTGGAGAAGAAGGGCAGTGCTGC
2000 . : . : . : . : . :
1830 G CTCAAGGACCTCAAGCGGCAGCTGCATTTGGAGCGGAAAC
|>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
120814 GGTA...CAGCTCAAGGACCTCAAGCGGCAGCTGCATTTGGAGCGGAAAC
2050 . : . : . : . : . :
1871 GGGCAGATAAGCTGCAGGAGCGACTGCAGGACATCCTCACTAACAGCAAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
120956 GGGCAGATAAGCTGCAGGAGCGACTGCAGGACATCCTCACTAACAGCAAG
2100 . : . : . : . : . :
1921 AGCCGCTCAG GCCTTGAGGAGTTGGTTCTCTCAGAGATGAA
||||||||||>>>...>>>||||||||||| |||||||||||||||||||
121006 AGCCGCTCAGGTG...CAGGCCTTGAGGAGCTGGTTCTCTCAGAGATGAA
2150 . : . : . : . : . :
1962 CTCACCAAGCCGGACCCAGACAGGGGACAGCAGTAGCATCTCCTCCTTCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
123826 CTCACCAAGCCGGACCCAGACAGGGGACAGCAGTAGCATCTCCTCCTTCA
2200 . : . : . : . : . :
2012 GCTACCGGGAGATCTTGCGGGAAAAGGAGAGCTCGGCTGTTCCAGCCAGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
123876 GCTACCGGGAGATCTTGCGGGAAAAGGAGAGCTCGGCTGTTCCAGCCAGG
2250 . : . : . : . : . :
2062 TCCTTATCCAGCAGCCCTCAAGCCCAGCCCCCTCGGCCAGC
>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
123926 GTA...CAGTCCTTATCCAGCAGCCCTCAAGCCCAGCCCCCTCGGCCAGC
2300 . : . : . : . : . :
2103 AGAGCTGTCAGATGAGGAAGTGGCTGAGCTCTTTCAGCGGCTGGCAGAGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
125908 AGAGCTGTCAGATGAGGAAGTGGCTGAGCTCTTTCAGCGGCTGGCAGAGA
2350 . : . : . : . : . :
2153 CACAGCAGGAGAAATGGATGCTGGAGGAGAAG GTGAAGCAC
||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
125958 CACAGCAGGAGAAATGGATGCTGGAGGAGAAGGTG...CAGGTGAAGCAC
2400 . : . : . : . : . :
2194 CTGGAAGTGAGCAGTGCTTCCATGGCAGAGGACCTCTGCCGGAAGAGCGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
126128 CTGGAAGTGAGCAGTGCTTCCATGGCAGAGGACCTCTGCCGGAAGAGCGC
2450 . : . : . : . : . :
2244 CATCATTGAGACCTACGTCATGGACAGCCGGATCG ATGTGT
|||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
126178 CATCATTGAGACCTACGTCATGGACAGCCGGATCGGTC...CAGATGTGT
2500 . : . : . : . : . :
2285 CTGTGGCAGCAGGCCACACAGACCGCAGCGGGCTGGGCAGCGTCCTGAGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
126927 CTGTGGCAGCAGGCCACACAGACCGCAGCGGGCTGGGCAGCGTCCTGAGA
2550 . : . : . : . : . :
2335 GACCTAGTGAAGCCAGGCGACGAGAACCTTCGGGAGATGAACAAGAAGCT
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
126977 GACCTAGTGAAGCCAGGTGACGAGAACCTTCGGGAGATGAACAAGAAGCT
2600 . : . : . : . : . :
2385 GCAGAACATGCTGGAGGAGCAGCTCACCAAGAATATGCACTTGCACAAG
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
127027 GCAGAACATGCTGGAGGAGCAGCTCACCAAGAATATGCACTTGCACAAGG
2650 . : . : . : . : . :
2434 GATATGGAAGTTCTGTCCCAGGAAATTGTGCGGCTCAGCAAG
>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
127077 CA...TAGGATATGGAAGTTCTGTCCCAGGAAATTGTGCGGCTCAGCAAG
2700 . : . : . : . : .
2476 GAGTGCGTGGGGCCTCCTGACCCAGACCTAGAGCCAGGAGAAACCAGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
127987 GAGTGCGTGGGGCCTCCTGACCCAGACCTAGAGCCAGGAGAAACCAGC