seq1 = pF1KB8468.tfa, 891 bp
seq2 = pF1KB8468/gi568815588f_60680166.tfa (gi568815588f:60680166_60893972), 213807 bp

>pF1KB8468 891
>gi568815588f:60680166_60893972 (Chr10)

1-37  (100001-100037)   100% ->
38-194  (104540-104696)   100% ->
195-318  (105499-105622)   100% ->
319-493  (107895-108069)   98% ->
494-653  (111729-111888)   100% ->
654-795  (111983-112124)   100% ->
796-891  (113712-113807)   98%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGAAGATTATACCAAAATAGAGAAAATTGGAGAAG         GTAC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 100001 ATGGAAGATTATACCAAAATAGAGAAAATTGGAGAAGGTG...CAGGTAC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     42 CTATGGAGTTGTGTATAAGGGTAGACACAAAACTACAGGTCAAGTGGTAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104544 CTATGGAGTTGTGTATAAGGGTAGACACAAAACTACAGGTCAAGTGGTAG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 CCATGAAAAAAATCAGACTAGAAAGTGAAGAGGAAGGGGTTCCTAGTACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104594 CCATGAAAAAAATCAGACTAGAAAGTGAAGAGGAAGGGGTTCCTAGTACT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GCAATTCGGGAAATTTCTCTATTAAAGGAACTTCGTCATCCAAATATAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104644 GCAATTCGGGAAATTTCTCTATTAAAGGAACTTCGTCATCCAAATATAGT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CAG         TCTTCAGGATGTGCTTATGCAGGATTCCAGGTTATATC
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104694 CAGGTA...CAGTCTTCAGGATGTGCTTATGCAGGATTCCAGGTTATATC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 TCATCTTTGAGTTTCTTTCCATGGATCTGAAGAAATACTTGGATTCTATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105537 TCATCTTTGAGTTTCTTTCCATGGATCTGAAGAAATACTTGGATTCTATC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 CCTCCTGGTCAGTACATGGATTCTTCACTTGTTAAG         AGTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 105587 CCTCCTGGTCAGTACATGGATTCTTCACTTGTTAAGGTA...CAGAGTTA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 TTTATACCAAATCCTACAGGGGATTGTGTTTTGTCACTCTAGAAGAGTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107900 TTTATACCAAATCCTACAGGGGATTGTGTTTTGTCACTCTAGAAGAGTTC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 TTCACAGAGACTTAAAACCTCAAAATCTCTTGATTGATGACAAAGGAACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107950 TTCACAGAGACTTAAAACCTCAAAATCTCTTGATTGATGACAAAGGAACA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 ATTAAACTGGCTGATTTTGGCCTTGCCAGAGCTTTTGGAATACCTATCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108000 ATTAAACTGGCTGATTTTGGCCTTGCCAGAGCTTTTGGAATACCTATCAG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 AGTATATACACATGAGGTAG         TAACACTCTGGTACAGATCTC
        ||||||||||||||||| | >>>...>>>|||||||||||||||||||||
 108050 AGTATATACACATGAGGCAAGTG...TAGTAACACTCTGGTACAGATCTC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 CAGAAGTATTGCTGGGGTCAGCTCGTTACTCAACTCCAGTTGACATTTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111750 CAGAAGTATTGCTGGGGTCAGCTCGTTACTCAACTCCAGTTGACATTTGG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 AGTATAGGCACCATATTTGCTGAACTAGCAACTAAGAAACCACTTTTCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111800 AGTATAGGCACCATATTTGCTGAACTAGCAACTAAGAAACCACTTTTCCA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 TGGGGATTCAGAAATTGATCAACTCTTCAGGATTTTCAG         AG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 111850 TGGGGATTCAGAAATTGATCAACTCTTCAGGATTTTCAGGTA...TAGAG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    656 CTTTGGGCACTCCCAATAATGAAGTGTGGCCAGAAGTGGAATCTTTACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111985 CTTTGGGCACTCCCAATAATGAAGTGTGGCCAGAAGTGGAATCTTTACAG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 GACTATAAGAATACATTTCCCAAATGGAAACCAGGAAGCCTAGCATCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112035 GACTATAAGAATACATTTCCCAAATGGAAACCAGGAAGCCTAGCATCCCA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 TGTCAAAAACTTGGATGAAAATGGCTTGGATTTGCTCTCG         A
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 112085 TGTCAAAAACTTGGATGAAAATGGCTTGGATTTGCTCTCGGTA...CAGA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    797 AAATGTTAACCTATGATCCAGCCAAACGAATTTCTGGCAAAATGGCACTG
        ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113713 AAATGTTAATCTATGATCCAGCCAAACGAATTTCTGGCAAAATGGCACTG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .
    847 AATCATCCATATTTTAATGATTTGGACAATCAGATTAAGAAGATG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113763 AATCATCCATATTTTAATGATTTGGACAATCAGATTAAGAAGATG