seq1 = pF1KB8464.tfa, 2379 bp
seq2 = pF1KB8464/gi568815576r_30234597.tfa (gi568815576r:30234597_30456792), 222196 bp

>pF1KB8464 2379
>gi568815576r:30234597_30456792 (Chr22)

(complement)

1-63  (100001-100063)   100% ->
64-185  (103721-103842)   100% ->
186-393  (110274-110481)   100% ->
394-651  (111603-111860)   100% ->
652-726  (113914-113988)   100% ->
727-877  (114443-114593)   100% ->
878-1071  (114908-115101)   100% ->
1072-1189  (115981-116098)   100% ->
1190-1375  (116412-116597)   100% ->
1376-1497  (117542-117663)   100% ->
1498-1743  (117759-118004)   100% ->
1744-1951  (118896-119103)   100% ->
1952-2106  (119613-119767)   100% ->
2107-2208  (121040-121141)   100% ->
2209-2280  (121255-121326)   100% ->
2281-2379  (122098-122196)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCCGGCCGGACCCGTGCAGGCGGTGCCCCCGCCGCCGCCCGTGCCCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCCGGCCGGACCCGTGCAGGCGGTGCCCCCGCCGCCGCCCGTGCCCAC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGAGCCCAAACAG         CCCACAGAAGAAGAAGCATCTTCAAAGG
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GGAGCCCAAACAGGTA...CAGCCCACAGAAGAAGAAGCATCTTCAAAGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 AGGATTCTGCACCTTCTAAGCCAGTTGTGGGGATTATTTACCCTCCTCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103749 AGGATTCTGCACCTTCTAAGCCAGTTGTGGGGATTATTTACCCTCCTCCA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GAGGTCAGAAATATTGTTGACAAGACTGCCAGCTTTGTGGCCAG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 103799 GAGGTCAGAAATATTGTTGACAAGACTGCCAGCTTTGTGGCCAGGTA...

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    186    AAACGGGCCTGAATTTGAAGCTAGGATCCGACAGAACGAGATCAACA
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110271 CAGAAACGGGCCTGAATTTGAAGCTAGGATCCGACAGAACGAGATCAACA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 ACCCCAAGTTCAACTTTCTGAACCCCAATGACCCTTACCATGCCTACTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110321 ACCCCAAGTTCAACTTTCTGAACCCCAATGACCCTTACCATGCCTACTAC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 CGCCACAAGGTCAGCGAGTTCAAGGAAGGGAAGGCTCAGGAGCCGTCCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110371 CGCCACAAGGTCAGCGAGTTCAAGGAAGGGAAGGCTCAGGAGCCGTCCGC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 CGCCATCCCCAAGGTCATGCAGCAGCAGCAGCAGACCACCCAGCAGCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110421 CGCCATCCCCAAGGTCATGCAGCAGCAGCAGCAGACCACCCAGCAGCAGC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 TGCCCCAGAAG         GTCCAAGCCCAAGTAATCCAAGAGACCATC
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 110471 TGCCCCAGAAGGTT...TAGGTCCAAGCCCAAGTAATCCAAGAGACCATC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 GTGCCCAAAGAGCCTCCTCCTGAGTTTGAGTTCATTGCTGATCCTCCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111633 GTGCCCAAAGAGCCTCCTCCTGAGTTTGAGTTCATTGCTGATCCTCCCTC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 TATCTCAGCCTTCGACTTGGATGTGGTGAAGCTGACGGCTCAGTTTGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111683 TATCTCAGCCTTCGACTTGGATGTGGTGAAGCTGACGGCTCAGTTTGTGG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 CCAGGAATGGGCGCCAGTTTCTGACCCAGCTGATGCAGAAAGAGCAGCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111733 CCAGGAATGGGCGCCAGTTTCTGACCCAGCTGATGCAGAAAGAGCAGCGC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 AACTACCAGTTTGACTTTCTCCGCCCACAGCACAGCCTCTTCAACTACTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111783 AACTACCAGTTTGACTTTCTCCGCCCACAGCACAGCCTCTTCAACTACTT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    624 CACGAAGCTAGTGGAACAGTACACCAAG         ATCTTGATTCCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 111833 CACGAAGCTAGTGGAACAGTACACCAAGGTG...CAGATCTTGATTCCAC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 CCAAAGGTTTATTTTCAAAGCTCAAGAAAGAGGCTGAAAACCCCCGAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113927 CCAAAGGTTTATTTTCAAAGCTCAAGAAAGAGGCTGAAAACCCCCGAGAA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    715 GTTTTGGATCAG         GTGTGTTACCGAGTGGAATGGGCCAAATT
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 113977 GTTTTGGATCAGGTA...CAGGTGTGTTACCGAGTGGAATGGGCCAAATT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 CCAGGAACGTGAGAGGAAGAAGGAAGAAGAGGAGAAGGAGAAGGAGCGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114472 CCAGGAACGTGAGAGGAAGAAGGAAGAAGAGGAGAAGGAGAAGGAGCGGG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    806 TGGCCTATGCTCAGATCGACTGGCATGATTTTGTGGTGGTGGAAACAGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114522 TGGCCTATGCTCAGATCGACTGGCATGATTTTGTGGTGGTGGAAACAGTG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    856 GACTTCCAACCCAATGAGCAAG         GGAACTTCCCTCCCCCCAC
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 114572 GACTTCCAACCCAATGAGCAAGGTA...TAGGGAACTTCCCTCCCCCCAC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    897 CACGCCAGAGGAGCTGGGGGCCCGAATCCTCATTCAGGAGCGCTATGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114927 CACGCCAGAGGAGCTGGGGGCCCGAATCCTCATTCAGGAGCGCTATGAAA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    947 AGTTTGGGGAGAGTGAGGAAGTTGAGATGGAGGTCGAGTCTGATGAGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114977 AGTTTGGGGAGAGTGAGGAAGTTGAGATGGAGGTCGAGTCTGATGAGGAG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    997 GATGACAAACAGGAGAAGGCGGAGGAGCCTCCTTCCCAGCTGGACCAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115027 GATGACAAACAGGAGAAGGCGGAGGAGCCTCCTTCCCAGCTGGACCAGGA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1047 CACCCAAGTACAAGATATGGATGAG         GGTTCAGATGATGAAG
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 115077 CACCCAAGTACAAGATATGGATGAGGTA...CAGGGTTCAGATGATGAAG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1088 AAGAAGGGCAGAAAGTGCCCCCACCCCCAGAGACACCCATGCCTCCACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115997 AAGAAGGGCAGAAAGTGCCCCCACCCCCAGAGACACCCATGCCTCCACCT

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1138 CTGCCCCCAACTCCAGACCAAGTCATTGTCCGCAAGGATTATGATCCCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116047 CTGCCCCCAACTCCAGACCAAGTCATTGTCCGCAAGGATTATGATCCCAA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1188 AG         CCTCCAAGCCCTTGCCTCCAGCCCCTGCTCCAGATGAGT
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116097 AGGTA...TAGCCTCCAAGCCCTTGCCTCCAGCCCCTGCTCCAGATGAGT

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1229 ATCTTGTGTCCCCCATTACTGGGGAGAAGATCCCCGCCAGCAAAATGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116451 ATCTTGTGTCCCCCATTACTGGGGAGAAGATCCCCGCCAGCAAAATGCAG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1279 GAACACATGCGCATTGGACTTCTTGACCCTCGCTGGCTGGAGCAGCGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116501 GAACACATGCGCATTGGACTTCTTGACCCTCGCTGGCTGGAGCAGCGGGA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1329 TCGCTCCATCCGTGAGAAGCAGAGCGATGATGAGGTGTACGCACCAG   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 116551 TCGCTCCATCCGTGAGAAGCAGAGCGATGATGAGGTGTACGCACCAGGTG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1376       GTCTGGATATTGAGAGCAGCTTGAAGCAGTTGGCTGAGCGGCGT
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116601 ...CAGGTCTGGATATTGAGAGCAGCTTGAAGCAGTTGGCTGAGCGGCGT

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1420 ACTGACATCTTCGGTGTAGAGGAAACAGCCATTGGTAAGAAGATCGGTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117586 ACTGACATCTTCGGTGTAGAGGAAACAGCCATTGGTAAGAAGATCGGTGA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1470 GGAGGAGATCCAGAAGCCAGAGGAAAAG         GTGACCTGGGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 117636 GGAGGAGATCCAGAAGCCAGAGGAAAAGGTG...CAGGTGACCTGGGATG

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1511 GCCACTCAGGCAGCATGGCCCGGACCCAGCAGGCTGCCCAGGCCAACATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117772 GCCACTCAGGCAGCATGGCCCGGACCCAGCAGGCTGCCCAGGCCAACATC

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1561 ACCCTCCAGGAGCAGATTGAGGCCATTCACAAGGCCAAAGGCCTGGTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117822 ACCCTCCAGGAGCAGATTGAGGCCATTCACAAGGCCAAAGGCCTGGTGCC

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1611 AGAGGATGACACTAAAGAGAAGATTGGCCCCAGCAAGCCCAATGAAATCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117872 AGAGGATGACACTAAAGAGAAGATTGGCCCCAGCAAGCCCAATGAAATCC

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1661 CTCAACAGCCACCGCCACCATCTTCAGCCACCAACATCCCCAGCTCGGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117922 CTCAACAGCCACCGCCACCATCTTCAGCCACCAACATCCCCAGCTCGGCT

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1711 CCACCCATCACTTCAGTGCCCCGACCACCCACA         ATGCCACC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 117972 CCACCCATCACTTCAGTGCCCCGACCACCCACAGTA...CAGATGCCACC

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1752 TCCAGTTCGTACTACAGTTGTCTCCGCAGTACCCGTCATGCCCCGGCCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118904 TCCAGTTCGTACTACAGTTGTCTCCGCAGTACCCGTCATGCCCCGGCCCC

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1802 CAATGGCATCTGTGGTCCGGCTGCCCCCAGGCTCAGTGATCGCCCCCATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118954 CAATGGCATCTGTGGTCCGGCTGCCCCCAGGCTCAGTGATCGCCCCCATG

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1852 CCGCCCATCATCCACGCGCCCAGAATCAACGTGGTGCCCATGCCTCCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119004 CCGCCCATCATCCACGCGCCCAGAATCAACGTGGTGCCCATGCCTCCCTC

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1902 GGCCCCTCCTATTATGGCCCCCCGCCCACCCCCCATGATTGTGCCAACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119054 GGCCCCTCCTATTATGGCCCCCCGCCCACCCCCCATGATTGTGCCAACAG

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1952          CCTTTGTGCCTGCTCCACCTGTGGCACCTGTCCCAGCTCCA
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119104 GTC...CAGCCTTTGTGCCTGCTCCACCTGTGGCACCTGTCCCAGCTCCA

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1993 GCCCCAATGCCCCCTGTGCATCCCCCACCTCCCATGGAAGATGAGCCCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119654 GCCCCAATGCCCCCTGTGCATCCCCCACCTCCCATGGAAGATGAGCCCAC

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2043 CTCCAAAAAACTGAAGACAGAGGACAGCCTCATGCCAGAGGAGGAGTTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119704 CTCCAAAAAACTGAAGACAGAGGACAGCCTCATGCCAGAGGAGGAGTTCC

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2093 TGCGCAGAAACAAG         GGTCCAGTGTCCATCAAAGTCCAGGTG
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 119754 TGCGCAGAAACAAGGTA...TAGGGTCCAGTGTCCATCAAAGTCCAGGTG

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2134 CCCAACATGCAGGATAAGACGGAATGGAAACTGAATGGGCAGGTGCTGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121067 CCCAACATGCAGGATAAGACGGAATGGAAACTGAATGGGCAGGTGCTGGT

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2184 CTTCACCCTCCCACTCACGGACCAG         GTCTCTGTCATTAAGG
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 121117 CTTCACCCTCCCACTCACGGACCAGGTA...CAGGTCTCTGTCATTAAGG

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2225 TGAAGATTCATGAAGCCACAGGCATGCCTGCAGGGAAACAGAAGCTACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121271 TGAAGATTCATGAAGCCACAGGCATGCCTGCAGGGAAACAGAAGCTACAG

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2275 TATGAG         GGTATCTTCATCAAAGATTCCAACTCACTGGCTTA
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121321 TATGAGGTG...CAGGGTATCTTCATCAAAGATTCCAACTCACTGGCTTA

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2316 CTACAACATGGCCAATGGCGCAGTCATCCACCTGGCCCTCAAGGAGAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122133 CTACAACATGGCCAATGGCGCAGTCATCCACCTGGCCCTCAAGGAGAGAG

   2500     .    :
   2366 GCGGGAGGAAGAAG
        ||||||||||||||
 122183 GCGGGAGGAAGAAG