seq1 = pF1KB8462.tfa, 1128 bp
seq2 = pF1KB8462/gi568815576r_35644208.tfa (gi568815576r:35644208_35910006), 265799 bp

>pF1KB8462 1128
>gi568815576r:35644208_35910006 (Chr22)

(complement)

1-27  (69789-69815)   100% ->
28-252  (100003-100227)   100% ->
253-396  (128264-128407)   100% ->
397-450  (131929-131982)   100% ->
451-543  (141658-141750)   100% ->
544-604  (144524-144584)   100% ->
605-658  (148539-148592)   100% ->
659-751  (148713-148805)   100% ->
752-884  (149987-150119)   100% ->
885-924  (153863-153902)   100% ->
925-1013  (163446-163534)   100% ->
1014-1086  (164012-164084)   100% ->
1087-1128  (165758-165799)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGAGAAAAAGAAAATGGTAACTCAG         GGTAACCAGGAGCC
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
  69789 ATGGAGAAAAAGAAAATGGTAACTCAGGTA...TAGGGTAACCAGGAGCC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     42 GACAACAACTCCTGACGCAATGGTTCAGCCTTTTACTACCATCCCATTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100017 GACAACAACTCCTGACGCAATGGTTCAGCCTTTTACTACCATCCCATTTC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 CACCACCTCCGCAGAATGGAATTCCCACAGAGTATGGGGTGCCACACACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100067 CACCACCTCCGCAGAATGGAATTCCCACAGAGTATGGGGTGCCACACACT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 CAAGACTATGCCGGCCAGACCGGTGAGCATAACCTGACACTCTACGGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100117 CAAGACTATGCCGGCCAGACCGGTGAGCATAACCTGACACTCTACGGAAG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 TACGCAAGCCCACGGGGAGCAGAGCAGCAACTCACCCAGCACACAAAATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100167 TACGCAAGCCCACGGGGAGCAGAGCAGCAACTCACCCAGCACACAAAATG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 GATCTCTTACG         ACAGAAGGTGGAGCACAGACAGACGGCCAG
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 100217 GATCTCTTACGGTA...CAGACAGAAGGTGGAGCACAGACAGACGGCCAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 CAGTCACAGACACAAAGTAGTGAAAATTCAGAGAGTAAATCTACCCCGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128294 CAGTCACAGACACAAAGTAGTGAAAATTCAGAGAGTAAATCTACCCCGAA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 ACGGCTGCATGTCTCTAATATTCCTTTCCGCTTCCGGGACCCTGACCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128344 ACGGCTGCATGTCTCTAATATTCCTTTCCGCTTCCGGGACCCTGACCTCC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 GGCAGATGTTTGGG         CAGTTTGGCAAAATCCTAGATGTAGAA
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 128394 GGCAGATGTTTGGGGTA...CAGCAGTTTGGCAAAATCCTAGATGTAGAA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 ATAATCTTTAATGAACGTGGCTCTAAG         GGATTCGGGTTCGT
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 131956 ATAATCTTTAATGAACGTGGCTCTAAGGTA...CAGGGATTCGGGTTCGT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 AACTTTCGAGAATAGTGCTGATGCAGACAGGGCCAGGGAGAAATTACACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141672 AACTTTCGAGAATAGTGCTGATGCAGACAGGGCCAGGGAGAAATTACACG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 GCACCGTGGTAGAGGGCCGTAAAATCGAG         GTGAATAATGCT
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 141722 GCACCGTGGTAGAGGGCCGTAAAATCGAGGTG...TAGGTGAATAATGCT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    556 ACAGCACGTGTAATGACCAATAAGAAGATGGTCACACCATATGCAAATG 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 144536 ACAGCACGTGTAATGACCAATAAGAAGATGGTCACACCATATGCAAATGG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    605         GTTGGAAATTAAGCCCAGTAGTTGGAGCTGTATATGGTCCGG
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 144586 TA...CAGGTTGGAAATTAAGCCCAGTAGTTGGAGCTGTATATGGTCCGG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    647 AGTTATATGCAG         CATCCAGCTTTCAAGCAGATGTGTCCCTA
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 148581 AGTTATATGCAGGTA...CAGCATCCAGCTTTCAAGCAGATGTGTCCCTA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    688 GGCAATGATGCAGCAGTGCCCCTATCAGGAAGAGGGGGTATCAACACTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 148742 GGCAATGATGCAGCAGTGCCCCTATCAGGAAGAGGGGGTATCAACACTTA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    738 CATTCCTTTAATCA         TTCCTGGCTTCCCTTACCCTACTGCAG
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 148792 CATTCCTTTAATCAGTA...TAGTTCCTGGCTTCCCTTACCCTACTGCAG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    779 CCACCACGGCAGCCGCTTTCAGAGGAGCCCATTTGAGGGGCAGAGGGCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 150014 CCACCACGGCAGCCGCTTTCAGAGGAGCCCATTTGAGGGGCAGAGGGCGG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    829 ACAGTATATGGTGCAGTCCGAGCGGTACCTCCAACAGCCATCCCCGCCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 150064 ACAGTATATGGTGCAGTCCGAGCGGTACCTCCAACAGCCATCCCCGCCTA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    879 TCCAGG         TGTGGTTTACCAGGACGGATTTTACGGTGCTGACC
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 150114 TCCAGGGTA...CAGTGTGGTTTACCAGGACGGATTTTACGGTGCTGACC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    920 TCTAT         GGTGGATATGCAGCCTACAGATATGCACAGCCTGCT
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 153898 TCTATGTA...TAGGGTGGATATGCAGCCTACAGATATGCACAGCCTGCT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    961 ACTGCAACCGCAGCCACCGCTGCTGCAGCCGCTGCAGCCGCTTACAGTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 163482 ACTGCAACCGCAGCCACCGCTGCTGCAGCCGCTGCAGCCGCTTACAGTGA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1011 CGG         TTATGGCAGGGTGTACACAGCCGACCCCTACCATGCCC
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 163532 CGGGTA...CAGTTATGGCAGGGTGTACACAGCCGACCCCTACCATGCCC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1052 TTGCCCCTGCCGCTAGCTATGGAGTTGGCGCTGTG         GCGAGT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 164050 TTGCCCCTGCCGCTAGCTATGGAGTTGGCGCTGTGGTA...CAGGCGAGT

   1200     .    :    .    :    .    :    .
   1093 TTATACCGAGGTGGCTACAGCCGATTTGCCCCCTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 165764 TTATACCGAGGTGGCTACAGCCGATTTGCCCCCTAC