seq1 = pF1KB8457.tfa, 1173 bp
seq2 = pF1KB8457/gi568815576f_37466350.tfa (gi568815576f:37466350_37668817), 202468 bp

>pF1KB8457 1173
>gi568815576f:37466350_37668817 (Chr22)

1-463  (100001-100463)   100% ->
464-1173  (101759-102468)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCCCGGCCCCCAGGGGGGCAGAGGCGCCGCCACCATGAGCCTGGGCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCCCGGCCCCCAGGGGGGCAGAGGCGCCGCCACCATGAGCCTGGGCAA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GCTCTCGCCTGTGGGCTGGGTGTCCAGTTCACAGGGAAAGAGGCGGCTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GCTCTCGCCTGTGGGCTGGGTGTCCAGTTCACAGGGAAAGAGGCGGCTGA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CTGCAGACATGATCAGCCACCCACTCGGGGACTTCCGCCACACCATGCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CTGCAGACATGATCAGCCACCCACTCGGGGACTTCCGCCACACCATGCAT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GTGGGCCGTGGCGGGGATGTCTTCGGGGACACGTCCTTCCTCAGCAACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GTGGGCCGTGGCGGGGATGTCTTCGGGGACACGTCCTTCCTCAGCAACCA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CGGTGGCAGCTCCGGGAGCACCCATCGCTCACCCCGCAGCTTCCTGGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CGGTGGCAGCTCCGGGAGCACCCATCGCTCACCCCGCAGCTTCCTGGCCA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 AGAAGCTGCAGCTGGTGCGGAGGGTGGGGGCGCCCCCCCGGAGGATGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 AGAAGCTGCAGCTGGTGCGGAGGGTGGGGGCGCCCCCCCGGAGGATGGCA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 TCTCCCCCTGCACCCTCCCCGGCTCCACCGGCCATCTCCCCCATCATCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 TCTCCCCCTGCACCCTCCCCGGCTCCACCGGCCATCTCCCCCATCATCAA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 GAACGCCATCTCCCTGCCCCAGCTCAACCAGGCCGCCTACGACAGCCTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 GAACGCCATCTCCCTGCCCCAGCTCAACCAGGCCGCCTACGACAGCCTCG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 TGGTTGGCAAGCTCAGCTTCGACAGCAGCCCCACCAGCTCCACGGACGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 TGGTTGGCAAGCTCAGCTTCGACAGCAGCCCCACCAGCTCCACGGACGGC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 CACTCCAGCTACG         GCCTGGACTCTGGGTTCTGCACCATCTC
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 100451 CACTCCAGCTACGGTG...TAGGCCTGGACTCTGGGTTCTGCACCATCTC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    492 CCGCCTGCCCCGCTCGGAAAAGCCGCATGACCGAGACCGGGATGGTTCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101787 CCGCCTGCCCCGCTCGGAAAAGCCGCATGACCGAGACCGGGATGGTTCCT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    542 TCCCCTCTGAGCCCGGGCTTCGCCGCTCTGACTCTCTCTTGTCCTTCCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101837 TCCCCTCTGAGCCCGGGCTTCGCCGCTCTGACTCTCTCTTGTCCTTCCGC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    592 CTGGACCTCGACCTTGGGCCCTCACTCCTCAGCGAGCTGCTAGGGGTCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101887 CTGGACCTCGACCTTGGGCCCTCACTCCTCAGCGAGCTGCTAGGGGTCAT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    642 GAGCCTCCCAGAAGCCCCTGCAGCTGAGACTCCAGCCCCCGCTGCAAACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101937 GAGCCTCCCAGAAGCCCCTGCAGCTGAGACTCCAGCCCCCGCTGCAAACC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    692 CCCCAGCCCCTACTGCAAACCCCACGGGTCCTGCTGCAAACCCCCCAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101987 CCCCAGCCCCTACTGCAAACCCCACGGGTCCTGCTGCAAACCCCCCAGCC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    742 ACTACTGCAAACCCCCCAGCGCCTGCTGCAAACCCCTCAGCACCTGCCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102037 ACTACTGCAAACCCCCCAGCGCCTGCTGCAAACCCCTCAGCACCTGCCGC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    792 AACCCCCACGGGTCCTGCTGCAAATCCCCCAGCCCCTGCCGCAAGCTCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102087 AACCCCCACGGGTCCTGCTGCAAATCCCCCAGCCCCTGCCGCAAGCTCCA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    842 CACCCCATGGACACTGTCCCAATGGGGTAACAGCTGGGTTGGGCCCAGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102137 CACCCCATGGACACTGTCCCAATGGGGTAACAGCTGGGTTGGGCCCAGTG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    892 GCTGAGGTGAAGTCCAGCCCAGTGGGAGGGGGTCCCCGAGGACCTGCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102187 GCTGAGGTGAAGTCCAGCCCAGTGGGAGGGGGTCCCCGAGGACCTGCTGG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    942 CCCTGCCCTCGGCAGGCACTGGGGAGCAGGCTGGGATGGCGGCCACCACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102237 CCCTGCCCTCGGCAGGCACTGGGGAGCAGGCTGGGATGGCGGCCACCACT

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    992 ACCCAGAGATGGATGCGCGGCAGGAGCGGGTGGAGGTGCTGCCCCAAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102287 ACCCAGAGATGGATGCGCGGCAGGAGCGGGTGGAGGTGCTGCCCCAAGCC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1042 CGGGCCTCCTGGGAGAGCCTGGACGAAGAGTGGAGGGCGCCCCAGGCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102337 CGGGCCTCCTGGGAGAGCCTGGACGAAGAGTGGAGGGCGCCCCAGGCAGG

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1092 CAGCAGGACCCCAGTGCCCAGCACAGTGCAAGCAAACACCTTTGAATTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102387 CAGCAGGACCCCAGTGCCCAGCACAGTGCAAGCAAACACCTTTGAATTTG

   1150     .    :    .    :    .    :
   1142 CGGATGCTGAGGAGGATGATGAGGTCAAGGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||
 102437 CGGATGCTGAGGAGGATGATGAGGTCAAGGTG