seq1 = pF1KB8456.tfa, 1455 bp
seq2 = pF1KB8456/gi568815576f_17555712.tfa (gi568815576f:17555712_17827531), 271820 bp

>pF1KB8456 1455
>gi568815576f:17555712_17827531 (Chr22)

1-121  (100001-100121)   100% ->
122-229  (127503-127610)   100% ->
230-386  (133275-133431)   100% ->
387-456  (140430-140499)   100% ->
457-600  (146532-146675)   100% ->
601-1455  (170966-171820)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCGTCCTCTTCTACTGTGCCTCTGGGATTTCACTATGAAACAAAGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCGTCCTCTTCTACTGTGCCTCTGGGATTTCACTATGAAACAAAGTA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TGTTGTTCTCAGCTACTTGGGACTCCTCTCTCAAGAGAAGCTGCAAGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TGTTGTTCTCAGCTACTTGGGACTCCTCTCTCAAGAGAAGCTGCAAGAGC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 AACATCTTTCCTCACCCCAAG         GGGTTCAACTAGATATAGCT
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 100101 AACATCTTTCCTCACCCCAAGGTA...CAGGGGTTCAACTAGATATAGCT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 TCACAATCTCTGGATCAAGAAATTTTATTAAAAGTTAAAACTGAAATTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127523 TCACAATCTCTGGATCAAGAAATTTTATTAAAAGTTAAAACTGAAATTGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 AGAAGAGCTAAAATCTCTGGACAAAGAAATTTCTGAAG         CCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 127573 AGAAGAGCTAAAATCTCTGGACAAAGAAATTTCTGAAGGTC...CAGCCT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 TCACCAGCACAGGCTTTGACCGTCACACTTCTCCAGTGTTCAGCCCTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133278 TCACCAGCACAGGCTTTGACCGTCACACTTCTCCAGTGTTCAGCCCTGCC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 AATCCAGAAAGCTCAATGGAAGACTGCTTGGCCCATCTTGGAGAAAAAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133328 AATCCAGAAAGCTCAATGGAAGACTGCTTGGCCCATCTTGGAGAAAAAGT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 GTCCCAGGAACTGAAAGAGCCTCTCCATAAAGCATTGCAAATGCTCCTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133378 GTCCCAGGAACTGAAAGAGCCTCTCCATAAAGCATTGCAAATGCTCCTGA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 GCCA         GCCAGTGACATATCAGGCATTTCGGGAATGTACACTG
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133428 GCCAGTG...CAGGCCAGTGACATATCAGGCATTTCGGGAATGTACACTG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 GAGACCACAGTTCATGCCAGCGGCTGGAATAAG         ATTTTGGT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 140467 GAGACCACAGTTCATGCCAGCGGCTGGAATAAGGTA...AAGATTTTGGT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 GCCTCTGGTTTTGCTACGACAAATGCTTTTGGAATTGACAAGACGTGGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 146540 GCCTCTGGTTTTGCTACGACAAATGCTTTTGGAATTGACAAGACGTGGTC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 AAGAACCTTTGAGCGCACTGCTGCAGTTTGGCGTGACATACCTGGAGGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 146590 AAGAACCTTTGAGCGCACTGCTGCAGTTTGGCGTGACATACCTGGAGGAC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 TATTCGGCAGAGTACATCATTCAGCAAGGTGGCTGG         GGCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 146640 TATTCGGCAGAGTACATCATTCAGCAAGGTGGCTGGGTA...TAGGGCAC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 TGTGTTTAGTCTTGAGTCAGAGGAGGAGGAATACCCTGGAATCACTGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 170971 TGTGTTTAGTCTTGAGTCAGAGGAGGAGGAATACCCTGGAATCACTGCAG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    656 AAGATAGCAATGACATTTACATCCTGCCCAGCGACAACTCTGGACAAGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 171021 AAGATAGCAATGACATTTACATCCTGCCCAGCGACAACTCTGGACAAGTC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 AGTCCCCCAGAGTCTCCAACTGTGACCACTTCCTGGCAGTCTGAGAGCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 171071 AGTCCCCCAGAGTCTCCAACTGTGACCACTTCCTGGCAGTCTGAGAGCTT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 ACCTGTGTCACTGTCGGCTAGCCAGAGTTGGCACACAGAAAGCCTGCCAG
        ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
 171121 ACCTGTGTCACTGTCAGCTAGCCAGAGTTGGCACACAGAAAGCCTGCCAG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    806 TGTCACTAGGCCCTGAGTCCTGGCAGCAGATTGCAATGGATCCTGAAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 171171 TGTCACTAGGCCCTGAGTCCTGGCAGCAGATTGCAATGGATCCTGAAGAA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    856 GTGAAAAGCTTAGACAGCAACGGAGCTGGAGAGAAGAGTGAGAACAACTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 171221 GTGAAAAGCTTAGACAGCAACGGAGCTGGAGAGAAGAGTGAGAACAACTC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    906 CTCTAATTCTGACATTGTGCACGTGGAGAAAGAAGAGGTGCCCGAGGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 171271 CTCTAATTCTGACATTGTGCACGTGGAGAAAGAAGAGGTGCCCGAGGGCA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    956 TGGAAGAGGCTGCTGTGGCTTCTGTGGTCTTGCCAGCGCGGGAGCTGCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 171321 TGGAAGAGGCTGCTGTGGCTTCTGTGGTCTTGCCAGCGCGGGAGCTGCAA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1006 GAGGCACTTCCTGAAGCCCCAGCTCCCTTGCTTCCACATATCACTGCCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 171371 GAGGCACTTCCTGAAGCCCCAGCTCCCTTGCTTCCACATATCACTGCCAC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1056 CTCCCTGCTGGGGACAAGGGAACCTGACACAGAAGTGATCACAGTTGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 171421 CTCCCTGCTGGGGACAAGGGAACCTGACACAGAAGTGATCACAGTTGAGA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1106 AATCCAGCCCTGCTACATCTCTGTTTGTAGAACTTGATGAAGAAGAGGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 171471 AATCCAGCCCTGCTACATCTCTGTTTGTAGAACTTGATGAAGAAGAGGTG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1156 AAAGCAGCAACAACTGAACCTACTGAAGTGGAGGAGGTGGTCCCCGCACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 171521 AAAGCAGCAACAACTGAACCTACTGAAGTGGAGGAGGTGGTCCCCGCACT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1206 GGAACCCACAGAAACGCTGCTGAGTGAGAAGGAGATAAACGCAAGGGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 171571 GGAACCCACAGAAACGCTGCTGAGTGAGAAGGAGATAAACGCAAGGGAAG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1256 AGAGCCTTGTGGAAGAGCTGTCCCCTGCCAGCGAGAAGAAGCCCGTGCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 171621 AGAGCCTTGTGGAAGAGCTGTCCCCTGCCAGCGAGAAGAAGCCCGTGCCG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1306 CCGTCTGAGGGCAAGTCTAGACTGTCCCCCGCCGGTGAGATGAAGCCCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 171671 CCGTCTGAGGGCAAGTCTAGACTGTCCCCCGCCGGTGAGATGAAGCCCAT

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1356 GCCGCTGTCTGAGGGCAAGTCTATACTGCTGTTTGGAGGGGCTGCTGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 171721 GCCGCTGTCTGAGGGCAAGTCTATACTGCTGTTTGGAGGGGCTGCTGCTG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1406 TTGCCATCCTGGCAGTGGCCATCGGGGTAGCCCTGGCTCTGAGAAAGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 171771 TTGCCATCCTGGCAGTGGCCATCGGGGTAGCCCTGGCTCTGAGAAAGAAA