seq1 = pF1KB8454.tfa, 1599 bp
seq2 = pF1KB8454/gi568815576f_39387348.tfa (gi568815576f:39387348_39588946), 201599 bp

>pF1KB8454 1599
>gi568815576f:39387348_39588946 (Chr22)

1-1599  (100001-101599)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAAGATGAGACGCTACAAGCTCTTTCTCATGTTCTGTATGGCCGGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAAGATGAGACGCTACAAGCTCTTTCTCATGTTCTGTATGGCCGGCCT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GTGCCTCATCTCCTTCCTGCACTTCTTCAAGACCCTGTCCTATGTCACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GTGCCTCATCTCCTTCCTGCACTTCTTCAAGACCCTGTCCTATGTCACCT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TCCCCCGAGAACTGGCCTCCCTCAGCCCTAACCTGGTGTCCAGCTTTTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TCCCCCGAGAACTGGCCTCCCTCAGCCCTAACCTGGTGTCCAGCTTTTTC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 TGGAACAATGCCCCGGTCACGCCCCAGGCCAGCCCCGAGCCAGGAGGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 TGGAACAATGCCCCGGTCACGCCCCAGGCCAGCCCCGAGCCAGGAGGCCC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 TGACCTGCTGCGTACCCCACTCTACTCCCACTCGCCCCTGCTGCAGCCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 TGACCTGCTGCGTACCCCACTCTACTCCCACTCGCCCCTGCTGCAGCCGC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TGCCGCCCAGCAAGGCGGCCGAGGAGCTCCACCGGGTGGACTTGGTGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 TGCCGCCCAGCAAGGCGGCCGAGGAGCTCCACCGGGTGGACTTGGTGCTG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 CCCGAGGACACCACCGAGTATTTCGTGCGCACCAAGGCCGGCGGCGTCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 CCCGAGGACACCACCGAGTATTTCGTGCGCACCAAGGCCGGCGGCGTCTG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CTTCAAACCCGGCACCAAGATGCTGGAGAGGCCGCCCCCGGGACGGCCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 CTTCAAACCCGGCACCAAGATGCTGGAGAGGCCGCCCCCGGGACGGCCGG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 AGGAGAAGCCTGAGGGGGCCAACGGCTCCTCGGCCCGGCGGCCACCCCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 AGGAGAAGCCTGAGGGGGCCAACGGCTCCTCGGCCCGGCGGCCACCCCGG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 TACCTCCTGAGCGCCCGGGAGCGCACGGGGGGCCGAGGCGCCCGGCGCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 TACCTCCTGAGCGCCCGGGAGCGCACGGGGGGCCGAGGCGCCCGGCGCAA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 GTGGGTGGAGTGCGTGTGCCTGCCCGGCTGGCACGGACCCAGCTGCGGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 GTGGGTGGAGTGCGTGTGCCTGCCCGGCTGGCACGGACCCAGCTGCGGCG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 TGCCCACTGTGGTGCAGTACTCCAACCTGCCCACCAAGGAGCGGCTGGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 TGCCCACTGTGGTGCAGTACTCCAACCTGCCCACCAAGGAGCGGCTGGTG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 CCCAGGGAGGTGCCGCGCCGCGTCATCAACGCCATCAACGTCAACCACGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 CCCAGGGAGGTGCCGCGCCGCGTCATCAACGCCATCAACGTCAACCACGA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 GTTCGACCTGCTGGACGTGCGCTTCCACGAGCTGGGCGACGTGGTGGACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 GTTCGACCTGCTGGACGTGCGCTTCCACGAGCTGGGCGACGTGGTGGACG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 CCTTTGTGGTGTGCGAGTCCAACTTCACGGCTTATGGGGAGCCGCGGCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 CCTTTGTGGTGTGCGAGTCCAACTTCACGGCTTATGGGGAGCCGCGGCCG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 CTCAAGTTCCGGGAGATGCTGACCAATGGCACCTTCGAGTACATCCGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 CTCAAGTTCCGGGAGATGCTGACCAATGGCACCTTCGAGTACATCCGCCA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 CAAGGTGCTCTATGTCTTCCTGGACCACTTCCCGCCCGGCGGCCGGCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 CAAGGTGCTCTATGTCTTCCTGGACCACTTCCCGCCCGGCGGCCGGCAGG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 ACGGCTGGATCGCCGACGACTACCTGCGCACCTTCCTCACCCAGGACGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 ACGGCTGGATCGCCGACGACTACCTGCGCACCTTCCTCACCCAGGACGGC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 GTCTCGCGGCTGCGCAACCTGCGGCCCGACGACGTCTTCATCATTGACGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 GTCTCGCGGCTGCGCAACCTGCGGCCCGACGACGTCTTCATCATTGACGA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    951 TGCGGACGAGATCCCGGCCCGTGACGGCGTCCTTTTCCTCAAGCTCTACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100951 TGCGGACGAGATCCCGGCCCGTGACGGCGTCCTTTTCCTCAAGCTCTACG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1001 ATGGCTGGACCGAGCCCTTCGCCTTCCACATGCGCAAGTCGCTCTACGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101001 ATGGCTGGACCGAGCCCTTCGCCTTCCACATGCGCAAGTCGCTCTACGGC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1051 TTCTTCTGGAAGCAGCCGGGCACCCTGGAGGTGGTGTCAGGCTGCACGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101051 TTCTTCTGGAAGCAGCCGGGCACCCTGGAGGTGGTGTCAGGCTGCACGGT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1101 GGACATGCTGCAGGCAGTGTATGGGCTGGACGGCATCCGCCTGCGCCGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101101 GGACATGCTGCAGGCAGTGTATGGGCTGGACGGCATCCGCCTGCGCCGCC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1151 GCCAGTACTACACCATGCCCAACTTCAGACAGTATGAGAACCGCACCGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101151 GCCAGTACTACACCATGCCCAACTTCAGACAGTATGAGAACCGCACCGGC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1201 CACATCCTGGTGCAGTGGTCGCTGGGCAGCCCCCTGCACTTCGCCGGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101201 CACATCCTGGTGCAGTGGTCGCTGGGCAGCCCCCTGCACTTCGCCGGCTG

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1251 GCACTGCTCCTGGTGCTTCACGCCCGAGGGCATCTACTTCAAGCTCGTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101251 GCACTGCTCCTGGTGCTTCACGCCCGAGGGCATCTACTTCAAGCTCGTGT

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1301 CCGCCCAGAATGGCGACTTCCCACGCTGGGGTGACTACGAGGACAAGCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101301 CCGCCCAGAATGGCGACTTCCCACGCTGGGGTGACTACGAGGACAAGCGG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1351 GACCTGAACTACATCCGCGGCCTGATCCGCACCGGGGGCTGGTTCGACGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101351 GACCTGAACTACATCCGCGGCCTGATCCGCACCGGGGGCTGGTTCGACGG

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1401 CACGCAGCAGGAGTACCCGCCTGCAGACCCCAGCGAGCACATGTATGCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101401 CACGCAGCAGGAGTACCCGCCTGCAGACCCCAGCGAGCACATGTATGCGC

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1451 CCAAGTACCTGCTGAAGAACTACGACCGGTTCCACTACCTGCTGGACAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101451 CCAAGTACCTGCTGAAGAACTACGACCGGTTCCACTACCTGCTGGACAAC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1501 CCCTACCAGGAGCCCAGGAGCACGGCGGCGGGCGGGTGGCGCCACAGGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101501 CCCTACCAGGAGCCCAGGAGCACGGCGGCGGGCGGGTGGCGCCACAGGGG

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .
   1551 TCCCGAGGGAAGGCCGCCCGCCCGGGGCAAACTGGACGAGGCGGAAGTC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101551 TCCCGAGGGAAGGCCGCCCGCCCGGGGCAAACTGGACGAGGCGGAAGTC