seq1 = pF1KB8453.tfa, 963 bp
seq2 = pF1KB8453/gi568815576r_37369966.tfa (gi568815576r:37369966_37586177), 216212 bp

>pF1KB8453 963
>gi568815576r:37369966_37586177 (Chr22)

(complement)

1-255  (100001-100255)   100% ->
256-304  (105409-105457)   100% ->
305-407  (105879-105981)   100% ->
408-561  (106680-106833)   100% ->
562-647  (109197-109282)   100% ->
648-813  (111501-111666)   100% ->
814-899  (113650-113735)   100% ->
900-963  (116149-116212)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCAGTGCCGGCTCCCGCGGGGCCTGGCTGGAGCCCTCCTCACCCTCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCAGTGCCGGCTCCCGCGGGGCCTGGCTGGAGCCCTCCTCACCCTCCT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GTGCATGGGGCTCCTGTGTCTGCGGTACCACTTGAACCTGTCCCCGCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GTGCATGGGGCTCCTGTGTCTGCGGTACCACTTGAACCTGTCCCCGCAGC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GGGTACAAGGGACCCCCGAGCTGAGCCAGCCGAACCCGGGGCCCCCTAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GGGTACAAGGGACCCCCGAGCTGAGCCAGCCGAACCCGGGGCCCCCTAAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CTACAGCTACACGATGTCTTCATTGCAGTGAAGACGACCCGGGCTTTCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CTACAGCTACACGATGTCTTCATTGCAGTGAAGACGACCCGGGCTTTCCA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CCGCTTGCGCCTGGAGCTGCTGCTTGACACGTGGGTTTCCAGGACCAGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CCGCTTGCGCCTGGAGCTGCTGCTTGACACGTGGGTTTCCAGGACCAGGG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 AACAG         ACATTTGTCTTCACCGACAGCCCAGACAAAGGCCTC
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 AACAGGTG...TAGACATTTGTCTTCACCGACAGCCCAGACAAAGGCCTC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 CAGGAGAGACTGG         GGTCCCACCTTGTGGTCACCAACTGCTC
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 105445 CAGGAGAGACTGGGTA...CAGGGTCCCACCTTGTGGTCACCAACTGCTC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 CGCGGAACACAGCCACCCAGCTCTGTCCTGCAAGATGGCTGCTGAGTTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105907 CGCGGAACACAGCCACCCAGCTCTGTCCTGCAAGATGGCTGCTGAGTTCG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 ACACCTTCTTGGCCAGTGGGCTTAG         GTGGTTCTGCCATGTG
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 105957 ACACCTTCTTGGCCAGTGGGCTTAGGCG...CAGGTGGTTCTGCCATGTG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 GACGATGACAACTATGTGAACCCAAGGGCGCTGCTGCAGCTTCTGAGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106696 GACGATGACAACTATGTGAACCCAAGGGCGCTGCTGCAGCTTCTGAGAGC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 CTTCCCGCTGGCCCGCGACGTCTATGTGGGAAGGCCCAGCCTGAACCGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106746 CTTCCCGCTGGCCCGCGACGTCTATGTGGGAAGGCCCAGCCTGAACCGGC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 CCATCCATGCCTCAGAGCCACAGCCCCACAACCGCACG         AGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 106796 CCATCCATGCCTCAGAGCCACAGCCCCACAACCGCACGGTG...CAGAGG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 CTGGTACAGTTCTGGTTTGCCACTGGGGGTGCTGGCTTCTGCATCAATCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109200 CTGGTACAGTTCTGGTTTGCCACTGGGGGTGCTGGCTTCTGCATCAATCG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 CAAACTGGCTTTGAAGATGGCTCCGTGGGCCAG         TGGCTCCC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 109250 CAAACTGGCTTTGAAGATGGCTCCGTGGGCCAGGTA...CAGTGGCTCCC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    656 GTTTCATGGACACATCTGCTCTCATCCGGCTGCCTGATGACTGCACCATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111509 GTTTCATGGACACATCTGCTCTCATCCGGCTGCCTGATGACTGCACCATG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 GGCTATATCATTGAGTGCAAGCTGGGCGGCCGCCTGCAGCCCAGCCCCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111559 GGCTATATCATTGAGTGCAAGCTGGGCGGCCGCCTGCAGCCCAGCCCCCT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 CTTTCACTCCCACCTGGAGACCCTGCAGCTGCTGAGGACTGCACAGCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111609 CTTTCACTCCCACCTGGAGACCCTGCAGCTGCTGAGGACTGCACAGCTCC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    806 CAGAACAG         GTCACCCTCAGCTACGGTGTCTTTGAGGGGAAA
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 111659 CAGAACAGGTG...CAGGTCACCCTCAGCTACGGTGTCTTTGAGGGGAAA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    847 CTCAACGTCATTAAGCTACAGGGCCCCTTCTCCCCGGAGGAGGACCCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113683 CTCAACGTCATTAAGCTACAGGGCCCCTTCTCCCCGGAGGAGGACCCCTC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    897 CAG         ATTTCGCTCCCTCCATTGTCTGCTCTATCCAGATACAC
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113733 CAGGTG...CAGATTTCGCTCCCTCCATTGTCTGCTCTATCCAGATACAC

   1000     .    :    .    :    .
    938 CCTGGTGTCCCCAGCTGGGTGCCCGA
        ||||||||||||||||||||||||||
 116187 CCTGGTGTCCCCAGCTGGGTGCCCGA