seq1 = pF1KB8444.tfa, 909 bp
seq2 = pF1KB8444/gi568815576f_20817935.tfa (gi568815576f:20817935_21049842), 231908 bp

>pF1KB8444 909
>gi568815576f:20817935_21049842 (Chr22)

1-311  (100001-100311)   100% ->
312-777  (115845-116310)   100% ->
778-909  (131777-131908)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTCCTCCGCCAGGTTCGACTCCTCGGACCGCTCCGCCTGGTATATGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTCCTCCGCCAGGTTCGACTCCTCGGACCGCTCCGCCTGGTATATGGG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GCCGGTGTCTCGCCAGGAGGCGCAGACCCGGCTCCAGGGCCAGCGCCACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GCCGGTGTCTCGCCAGGAGGCGCAGACCCGGCTCCAGGGCCAGCGCCACG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GTATGTTCCTCGTCCGCGATTCTTCCACCTGCCCTGGGGACTATGTGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GTATGTTCCTCGTCCGCGATTCTTCCACCTGCCCTGGGGACTATGTGCTG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 TCGGTGTCCGAGAACTCGCGGGTCTCCCACTACATCATCAACTCGCTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 TCGGTGTCCGAGAACTCGCGGGTCTCCCACTACATCATCAACTCGCTGCC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CAACCGCCGTTTTAAGATCGGGGACCAGGAATTTGACCATTTGCCGGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CAACCGCCGTTTTAAGATCGGGGACCAGGAATTTGACCATTTGCCGGCCC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TGCTGGAGTTTTACAAGATCCACTACCTGGACACCACCACCCTCATCGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 TGCTGGAGTTTTACAAGATCCACTACCTGGACACCACCACCCTCATCGAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 CCTGCGCCCAG         GTATCCAAGCCCACCAATGGGATCTGTCTC
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 CCTGCGCCCAGGTA...AAGGTATCCAAGCCCACCAATGGGATCTGTCTC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 AGCACCCAACCTGCCTACAGCAGAAGATAACCTGGAATATGTACGGACTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115875 AGCACCCAACCTGCCTACAGCAGAAGATAACCTGGAATATGTACGGACTC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 TGTATGATTTTCCTGGGAATGATGCCGAAGACCTGCCCTTTAAAAAGGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115925 TGTATGATTTTCCTGGGAATGATGCCGAAGACCTGCCCTTTAAAAAGGGT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 GAGATCCTAGTGATAATAGAGAAGCCTGAAGAACAGTGGTGGAGTGCCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115975 GAGATCCTAGTGATAATAGAGAAGCCTGAAGAACAGTGGTGGAGTGCCCG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    492 GAACAAGGATGGCCGGGTTGGGATGATTCCTGTCCCTTATGTCGAAAAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116025 GAACAAGGATGGCCGGGTTGGGATGATTCCTGTCCCTTATGTCGAAAAGC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    542 TTGTGAGATCCTCACCACACGGAAAGCATGGAAATAGGAATTCCAACAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116075 TTGTGAGATCCTCACCACACGGAAAGCATGGAAATAGGAATTCCAACAGT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    592 TATGGGATCCCAGAACCTGCTCATGCATACGCTCAACCTCAGACCACAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116125 TATGGGATCCCAGAACCTGCTCATGCATACGCTCAACCTCAGACCACAAC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    642 TCCTCTACCTGCAGTTTCCGGTTCTCCTGGGGCAGCAATCACCCCTTTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116175 TCCTCTACCTGCAGTTTCCGGTTCTCCTGGGGCAGCAATCACCCCTTTGC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    692 CATCCACACAGAATGGACCTGTCTTTGCGAAAGCAATCCAGAAAAGAGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116225 CATCCACACAGAATGGACCTGTCTTTGCGAAAGCAATCCAGAAAAGAGTA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    742 CCCTGTGCTTATGACAAGACTGCCTTGGCATTAGAG         GTTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 116275 CCCTGTGCTTATGACAAGACTGCCTTGGCATTAGAGGTA...CAGGTTGG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    783 TGACATCGTGAAAGTCACAAGGATGAATATAAATGGCCAGTGGGAAGGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131782 TGACATCGTGAAAGTCACAAGGATGAATATAAATGGCCAGTGGGAAGGCG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    833 AAGTGAACGGGCGCAAAGGGCTTTTCCCCTTTACGCACGTCAAAATCTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131832 AAGTGAACGGGCGCAAAGGGCTTTTCCCCTTTACGCACGTCAAAATCTTT

    900     .    :    .    :    .
    883 GACCCTCAAAACCCAGATGAAAACGAG
        |||||||||||||||||||||||||||
 131882 GACCCTCAAAACCCAGATGAAAACGAG