seq1 = pF1KB8443.tfa, 1758 bp
seq2 = pF1KB8443/gi568815576r_28587900.tfa (gi568815576r:28587900_28834721), 246822 bp

>pF1KB8443 1758
>gi568815576r:28587900_28834721 (Chr22)

(complement)

1-319  (100001-100319)   100% ->
320-448  (104174-104302)   100% ->
449-573  (109355-109479)   100% ->
574-721  (109598-109745)   100% ->
722-812  (115237-115327)   100% ->
813-921  (122705-122813)   100% ->
922-975  (124663-124716)   100% ->
976-1037  (131156-131217)   100% ->
1038-1137  (134785-134884)   100% ->
1138-1224  (137735-137821)   100% ->
1225-1388  (138849-139012)   100% ->
1389-1504  (139480-139595)   100% ->
1505-1590  (140605-140690)   100% ->
1591-1671  (145507-145587)   100% ->
1672-1758  (146736-146822)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTCTCGGGAGTCGGATGTTGAGGCTCAGCAGTCTCATGGCAGCAGTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTCTCGGGAGTCGGATGTTGAGGCTCAGCAGTCTCATGGCAGCAGTGC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CTGTTCACAGCCCCATGGCAGCGTTACCCAGTCCCAAGGCTCCTCCTCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CTGTTCACAGCCCCATGGCAGCGTTACCCAGTCCCAAGGCTCCTCCTCAC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 AGTCCCAGGGCATATCCAGCTCCTCTACCAGCACGATGCCAAACTCCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 AGTCCCAGGGCATATCCAGCTCCTCTACCAGCACGATGCCAAACTCCAGC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CAGTCCTCTCACTCCAGCTCTGGGACACTGAGCTCCTTAGAGACAGTGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CAGTCCTCTCACTCCAGCTCTGGGACACTGAGCTCCTTAGAGACAGTGTC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CACTCAGGAACTCTATTCTATTCCTGAGGACCAAGAACCTGAGGACCAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CACTCAGGAACTCTATTCTATTCCTGAGGACCAAGAACCTGAGGACCAAG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 AACCTGAGGAGCCTACCCCTGCCCCCTGGGCTCGATTATGGGCCCTTCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 AACCTGAGGAGCCTACCCCTGCCCCCTGGGCTCGATTATGGGCCCTTCAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 GATGGATTTGCCAATCTTG         AGACAGAGTCTGGCCATGTTAC
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 100301 GATGGATTTGCCAATCTTGGTA...TAGAGACAGAGTCTGGCCATGTTAC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 CCAATCTGATCTTGAACTCCTGCTGTCATCTGATCCTCCTGCCTCAGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104196 CCAATCTGATCTTGAACTCCTGCTGTCATCTGATCCTCCTGCCTCAGCCT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 CCCAAAGTGCTGGGATAAGAGGTGTGAGGCACCATCCCCGGCCAGTTTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104246 CCCAAAGTGCTGGGATAAGAGGTGTGAGGCACCATCCCCGGCCAGTTTGC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 AGTCTAA         AATGTGTGAATGACAACTACTGGTTTGGGAGGGA
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104296 AGTCTAAGTA...CAGAATGTGTGAATGACAACTACTGGTTTGGGAGGGA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 CAAAAGCTGTGAATATTGCTTTGATGAACCACTGCTGAAAAGAACAGATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109389 CAAAAGCTGTGAATATTGCTTTGATGAACCACTGCTGAAAAGAACAGATA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 AATACCGAACATACAGCAAGAAACACTTTCGGATTTTCAGG         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 109439 AATACCGAACATACAGCAAGAAACACTTTCGGATTTTCAGGGTA...TAG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 GAAGTGGGTCCTAAAAACTCTTACATTGCATACATAGAAGATCACAGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109598 GAAGTGGGTCCTAAAAACTCTTACATTGCATACATAGAAGATCACAGTGG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    624 CAATGGAACCTTTGTAAATACAGAGCTTGTAGGGAAAGGAAAACGCCGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109648 CAATGGAACCTTTGTAAATACAGAGCTTGTAGGGAAAGGAAAACGCCGTC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    674 CTTTGAATAACAATTCTGAAATTGCACTGTCACTAAGCAGAAATAAAG  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 109698 CTTTGAATAACAATTCTGAAATTGCACTGTCACTAAGCAGAAATAAAGGT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    722        TTTTTGTCTTTTTTGATCTGACTGTAGATGATCAGTCAGTTTA
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109748 A...TAGTTTTTGTCTTTTTTGATCTGACTGTAGATGATCAGTCAGTTTA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    765 TCCTAAGGCATTAAGAGATGAATACATCATGTCAAAAACTCTTGGAAG  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 115280 TCCTAAGGCATTAAGAGATGAATACATCATGTCAAAAACTCTTGGAAGGT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    813        TGGTGCCTGTGGAGAGGTAAAGCTGGCTTTCGAGAGGAAAACA
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115330 A...TAGTGGTGCCTGTGGAGAGGTAAAGCTGGCTTTCGAGAGGAAAACA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    856 TGTAAGAAAGTAGCCATAAAGATCATCAGCAAAAGGAAGTTTGCTATTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122748 TGTAAGAAAGTAGCCATAAAGATCATCAGCAAAAGGAAGTTTGCTATTGG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    906 TTCAGCAAGAGAGGCA         GACCCAGCTCTCAATGTTGAAACAG
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 122798 TTCAGCAAGAGAGGCAGTA...AAGGACCCAGCTCTCAATGTTGAAACAG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    947 AAATAGAAATTTTGAAAAAGCTAAATCAT         CCTTGCATCATC
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 124688 AAATAGAAATTTTGAAAAAGCTAAATCATGTA...TAGCCTTGCATCATC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    988 AAGATTAAAAACTTTTTTGATGCAGAAGATTATTATATTGTTTTGGAATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131168 AAGATTAAAAACTTTTTTGATGCAGAAGATTATTATATTGTTTTGGAATT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1038          GATGGAAGGGGGAGAGCTGTTTGACAAAGTGGTGGGGAATA
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131218 GTA...CAGGATGGAAGGGGGAGAGCTGTTTGACAAAGTGGTGGGGAATA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1079 AACGCCTGAAAGAAGCTACCTGCAAGCTCTATTTTTACCAGATGCTCTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134826 AACGCCTGAAAGAAGCTACCTGCAAGCTCTATTTTTACCAGATGCTCTTG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1129 GCTGTGCAG         TACCTTCATGAAAACGGTATTATACACCGTGA
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 134876 GCTGTGCAGGTA...TAGTACCTTCATGAAAACGGTATTATACACCGTGA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1170 CTTAAAGCCAGAGAATGTTTTACTGTCATCTCAAGAAGAGGACTGTCTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 137767 CTTAAAGCCAGAGAATGTTTTACTGTCATCTCAAGAAGAGGACTGTCTTA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1220 TAAAG         ATTACTGATTTTGGGCACTCCAAGATTTTGGGAGAG
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 137817 TAAAGGTA...TAGATTACTGATTTTGGGCACTCCAAGATTTTGGGAGAG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1261 ACCTCTCTCATGAGAACCTTATGTGGAACCCCCACCTACTTGGCGCCTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 138885 ACCTCTCTCATGAGAACCTTATGTGGAACCCCCACCTACTTGGCGCCTGA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1311 AGTTCTTGTTTCTGTTGGGACTGCTGGGTATAACCGTGCTGTGGACTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 138935 AGTTCTTGTTTCTGTTGGGACTGCTGGGTATAACCGTGCTGTGGACTGCT

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1361 GGAGTTTAGGAGTTATTCTTTTTATCTG         CCTTAGTGGGTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 138985 GGAGTTTAGGAGTTATTCTTTTTATCTGGTA...AAGCCTTAGTGGGTAT

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1402 CCACCTTTCTCTGAGCATAGGACTCAAGTGTCACTGAAGGATCAGATCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139493 CCACCTTTCTCTGAGCATAGGACTCAAGTGTCACTGAAGGATCAGATCAC

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1452 CAGTGGAAAATACAACTTCATTCCTGAAGTCTGGGCAGAAGTCTCAGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139543 CAGTGGAAAATACAACTTCATTCCTGAAGTCTGGGCAGAAGTCTCAGAGA

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1502 AAG         CTCTGGACCTTGTCAAGAAGTTGTTGGTAGTGGATCCA
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139593 AAGGTA...TAGCTCTGGACCTTGTCAAGAAGTTGTTGGTAGTGGATCCA

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1543 AAGGCACGTTTTACGACAGAAGAAGCCTTAAGACACCCGTGGCTTCAG  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 140643 AAGGCACGTTTTACGACAGAAGAAGCCTTAAGACACCCGTGGCTTCAGGT

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1591        GATGAAGACATGAAGAGAAAGTTTCAAGATCTTCTGTCTGAGG
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 140693 G...CAGGATGAAGACATGAAGAGAAAGTTTCAAGATCTTCTGTCTGAGG

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1634 AAAATGAATCCACAGCTCTACCCCAGGTTCTAGCCCAG         CCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 145550 AAAATGAATCCACAGCTCTACCCCAGGTTCTAGCCCAGGTA...CAGCCT

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1675 TCTACTAGTCGAAAGCGGCCCCGTGAAGGGGAAGCCGAGGGTGCCGAGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 146739 TCTACTAGTCGAAAGCGGCCCCGTGAAGGGGAAGCCGAGGGTGCCGAGAC

   1850     .    :    .    :    .    :
   1725 CACAAAGCGCCCAGCTGTGTGTGCTGCTGTGTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||
 146789 CACAAAGCGCCCAGCTGTGTGTGCTGCTGTGTTG