seq1 = pF1KB8422.tfa, 2232 bp
seq2 = pF1KB8422/gi568815593r_72343759.tfa (gi568815593r:72343759_72561496), 217738 bp

>pF1KB8422 2232
>gi568815593r:72343759_72561496 (Chr5)

(complement)

1-1332  (100001-101332)   100% ->
1333-1524  (104902-105093)   100% ->
1525-1699  (114080-114254)   100% ->
1700-2232  (117206-117738)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCAGAAGGAAATGAAGATGATCAAAGACGAGGATGTGCATTTCGACTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCAGAAGGAAATGAAGATGATCAAAGACGAGGATGTGCATTTCGACTT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGCTGTGAAGAAGACCCCCTCCTTTCCCCACTGCCTGCAGCCAGTGGCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GGCTGTGAAGAAGACCCCCTCCTTTCCCCACTGCCTGCAGCCAGTGGCTT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CTCGGGGAAAGGCTCCCCAAAGACACCCCTTCCCGGAAGCTCTCCGAGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CTCGGGGAAAGGCTCCCCAAAGACACCCCTTCCCGGAAGCTCTCCGAGGG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CCATTTTCCCAGTTTCGGTATGAACCTCCCCCAGGAGACCTAGATGGGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CCATTTTCCCAGTTTCGGTATGAACCTCCCCCAGGAGACCTAGATGGGTT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CCCCGGGGTCTTCGAAGGAGCAGGGTCTAGGAAACGGAAGAGCATGCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CCCCGGGGTCTTCGAAGGAGCAGGGTCTAGGAAACGGAAGAGCATGCCCA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 CAAAGATGCCCTATAACCACCCTGCAGAAGAAGTCACCCTCGCCCTCCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 CAAAGATGCCCTATAACCACCCTGCAGAAGAAGTCACCCTCGCCCTCCAC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 TCAGAGGAGAACAAAAACCACGGCCTTCCCAACCTCCCTTTGCTGTTCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 TCAGAGGAGAACAAAAACCACGGCCTTCCCAACCTCCCTTTGCTGTTCCC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 GCAGCCCCCGCGCCCCAAGTATGACTCTCAGATGATCGACCTGTGCAACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 GCAGCCCCCGCGCCCCAAGTATGACTCTCAGATGATCGACCTGTGCAACG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 TGGGCTTCCAATTCTACCGCAGCCTGGAACACTTTGGGGGCAAGCCCGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 TGGGCTTCCAATTCTACCGCAGCCTGGAACACTTTGGGGGCAAGCCCGTC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 AAGCAGGAACCCATTAAGCCCAGCGCCGTGTGGCCCCAGCCAACGCCCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 AAGCAGGAACCCATTAAGCCCAGCGCCGTGTGGCCCCAGCCAACGCCCAC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 TCCATTCCTGCCCACGCCCTACCCCTACTACCCCAAAGTCCACCCGGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 TCCATTCCTGCCCACGCCCTACCCCTACTACCCCAAAGTCCACCCGGGCC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 TCATGTTCCCCTTCTTCGTGCCCTCGTCCTCGCCCTTCCCCTTCAGCCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 TCATGTTCCCCTTCTTCGTGCCCTCGTCCTCGCCCTTCCCCTTCAGCCGG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 CACACCTTCCTGCCCAAGCAGCCCCCGGAACCTCTGCTGCCCCGGAAAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 CACACCTTCCTGCCCAAGCAGCCCCCGGAACCTCTGCTGCCCCGGAAAGC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 CGAGCCCCAGGAGAGCGAGGAGACCAAGCAGAAGGTGGAGAGGGTGGACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 CGAGCCCCAGGAGAGCGAGGAGACCAAGCAGAAGGTGGAGAGGGTGGACG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 TGAACGTGCAGATCGATGACAGCTACTACGTGGACGTGGGCGGCTCGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 TGAACGTGCAGATCGATGACAGCTACTACGTGGACGTGGGCGGCTCGCAG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 AAGCGCTGGCAGTGCCCCACCTGCGAGAAGTCCTACACCTCCAAGTACAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 AAGCGCTGGCAGTGCCCCACCTGCGAGAAGTCCTACACCTCCAAGTACAA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 CCTGGTCACCCACATCCTGGGCCACAGTGGGATCAAGCCGCACGCGTGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 CCTGGTCACCCACATCCTGGGCCACAGTGGGATCAAGCCGCACGCGTGCA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 CGCACTGCGGGAAGCTCTTCAAGCAGCTCAGCCACCTGCATACCCACATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 CGCACTGCGGGAAGCTCTTCAAGCAGCTCAGCCACCTGCATACCCACATG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 CTGACCCACCAGGGCACGCGGCCCCACAAGTGCCAGGTGTGCCACAAGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 CTGACCCACCAGGGCACGCGGCCCCACAAGTGCCAGGTGTGCCACAAGGC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    951 CTTCACCCAGACCAGCCACCTGAAGCGCCACATGATGCAGCACAGCGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100951 CTTCACCCAGACCAGCCACCTGAAGCGCCACATGATGCAGCACAGCGAGG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1001 TGAAGCCGCACAACTGCCGCGTGTGCGGCCGCGGCTTTGCCTACCCCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101001 TGAAGCCGCACAACTGCCGCGTGTGCGGCCGCGGCTTTGCCTACCCCAGC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1051 GAGCTCAAGGCCCACGAAGCCAAGCACGCCAGTGGGCGCGAGAACATCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101051 GAGCTCAAGGCCCACGAAGCCAAGCACGCCAGTGGGCGCGAGAACATCTG

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1101 TGTGGAGTGCGGCCTCGACTTCCCCACCTTGGCCCAGCTGAAGAGACACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101101 TGTGGAGTGCGGCCTCGACTTCCCCACCTTGGCCCAGCTGAAGAGACACC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1151 TCACCACGCACCGGGGCCCCATCCAGTACAACTGCTCCGAGTGCGACAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101151 TCACCACGCACCGGGGCCCCATCCAGTACAACTGCTCCGAGTGCGACAAG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1201 ACCTTCCAGTACCCGAGCCAGCTGCAGAACCACATGATGAAGCACAAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101201 ACCTTCCAGTACCCGAGCCAGCTGCAGAACCACATGATGAAGCACAAGGA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1251 CATCCGGCCCTACATCTGCTCAGAGTGTGGCATGGAGTTTGTGCAGCCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101251 CATCCGGCCCTACATCTGCTCAGAGTGTGGCATGGAGTTTGTGCAGCCGC

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1301 ACCACCTCAAGCAGCACTCCCTCACCCACAAG         GGTGTGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 101301 ACCACCTCAAGCAGCACTCCCTCACCCACAAGGTA...CAGGGTGTGAAG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1342 GAGCATAAGTGTGGGATTTGTGGGCGGGAGTTCACCCTGCTGGCCAACAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104911 GAGCATAAGTGTGGGATTTGTGGGCGGGAGTTCACCCTGCTGGCCAACAT

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1392 GAAGCGACACGTGCTGATCCACACCAACATCCGCGCCTACCAGTGTCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104961 GAAGCGACACGTGCTGATCCACACCAACATCCGCGCCTACCAGTGTCACC

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1442 TCTGCTACAAGAGCTTCGTGCAGAAGCAGACCCTCAAGGCACACATGATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105011 TCTGCTACAAGAGCTTCGTGCAGAAGCAGACCCTCAAGGCACACATGATC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1492 GTCCACTCTGACGTGAAGCCTTTCAAATGCAAG         CTTTGTGG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 105061 GTCCACTCTGACGTGAAGCCTTTCAAATGCAAGGTG...CAGCTTTGTGG

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1533 GAAGGAATTCAACCGGATGCACAACCTGATGGGCCACATGCACCTGCACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114088 GAAGGAATTCAACCGGATGCACAACCTGATGGGCCACATGCACCTGCACT

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1583 CAGACAGCAAACCCTTCAAGTGCCTCTATTGCCCAAGCAAATTCACCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114138 CAGACAGCAAACCCTTCAAGTGCCTCTATTGCCCAAGCAAATTCACCCTG

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1633 AAGGGGAACCTGACACGCCACATGAAAGTCAAGCATGGAGTCATGGAGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114188 AAGGGGAACCTGACACGCCACATGAAAGTCAAGCATGGAGTCATGGAGCG

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1683 GGGCCTTCATTCCCAAG         GTCTGGGAAGGGGGAGAATCGCCC
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 114238 GGGCCTTCATTCCCAAGGTA...CAGGTCTGGGAAGGGGGAGAATCGCCC

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1724 TGGCACAGACAGCCGGTGTCCTGAGGAGTCTGGAGCAGGAGGAGCCCTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117230 TGGCACAGACAGCCGGTGTCCTGAGGAGTCTGGAGCAGGAGGAGCCCTTT

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1774 GACCTCTCTCAGAAGCGCCGGGCCAAGGTGCCGGTGTTCCAGTCAGACGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117280 GACCTCTCTCAGAAGCGCCGGGCCAAGGTGCCGGTGTTCCAGTCAGACGG

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1824 GGAGAGTGCCCAGGGCAGCCACTGCCACGAGGAGGAAGAGGAGGATAACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117330 GGAGAGTGCCCAGGGCAGCCACTGCCACGAGGAGGAAGAGGAGGATAACT

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1874 GCTACGAGGTGGAGCCCTACAGCCCTGGCCTGGCCCCCCAGAGCCAGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117380 GCTACGAGGTGGAGCCCTACAGCCCTGGCCTGGCCCCCCAGAGCCAGCAG

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1924 CTCTGCACACCCGAGGATCTGTCCACCAAGTCGGAGCACGCCCCCGAGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117430 CTCTGCACACCCGAGGATCTGTCCACCAAGTCGGAGCACGCCCCCGAGGT

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1974 GCTGGAGGAAGCCTGCAAGGAGGAGAAGGAGGATGCATCCAAGGGAGAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117480 GCTGGAGGAAGCCTGCAAGGAGGAGAAGGAGGATGCATCCAAGGGAGAAT

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2024 GGGAGAAGAGGAGCAAGGGTGACCTTGGGGCAGAGGGCGGCCAGGAGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117530 GGGAGAAGAGGAGCAAGGGTGACCTTGGGGCAGAGGGCGGCCAGGAGAGA

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2074 GACTGTGCCGGCAGAGATGAGTGTCTCAGTCTCAGGGCTTTTCAGAGTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117580 GACTGTGCCGGCAGAGATGAGTGTCTCAGTCTCAGGGCTTTTCAGAGTAC

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2124 CCGGCGGGGCCCCTCTTTTTCTGATTACTTATACTTCAAGCACAGAGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117630 CCGGCGGGGCCCCTCTTTTTCTGATTACTTATACTTCAAGCACAGAGATG

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2174 AGAGTTTGAAAGAATTACTGGAGAGGAAAATGGAAAAACAAGCAGTGCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117680 AGAGTTTGAAAGAATTACTGGAGAGGAAAATGGAAAAACAAGCAGTGCTT

   2250     .
   2224 TTAGGTATC
        |||||||||
 117730 TTAGGTATC