Result of SIM4 for
pF1KB8416
seq1 = pF1KB8416.tfa, 3156 bp
seq2 = pF1KB8416/gi568815594r_67519000.tfa (gi568815594r:67519000_67801119), 282120 bp
>pF1KB8416 3156
>gi568815594r:67519000_67801119 (Chr4)
(complement)
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72-134 (104413-104475) 100% ->
135-229 (118907-119001) 100% ->
230-258 (119529-119557) 100% ->
259-353 (122587-122681) 100% ->
354-465 (123398-123509) 100% ->
466-546 (127343-127423) 100% ->
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670-793 (132446-132569) 99% ->
794-897 (135828-135931) 100% ->
898-960 (137173-137235) 100% ->
961-1037 (137905-137981) 100% ->
1038-1104 (138865-138931) 100% ->
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1317-1395 (155104-155182) 100% ->
1396-1476 (156342-156422) 100% ->
1477-1554 (159892-159969) 100% ->
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1737-1842 (165562-165667) 100% ->
1843-1932 (166602-166691) 100% ->
1933-2013 (166798-166878) 100% ->
2014-2142 (167647-167775) 100% ->
2143-2194 (169212-169263) 100% ->
2195-2258 (169349-169412) 100% ->
2259-2328 (170585-170654) 100% ->
2329-2400 (171978-172049) 100% ->
2401-2518 (174643-174760) 99% ->
2519-2712 (175933-176126) 100% ->
2713-2840 (176867-176994) 99% ->
2841-2928 (177898-177985) 100% ->
2929-3023 (178195-178289) 100% ->
3024-3156 (181988-182120) 100%
0 . : . : . : . : . :
1 ATGGAAGGATCCGAGCCTGTGGCCGCCCATCAGGGGGAAGAGGCGTCCTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100001 ATGGAAGGATCCGAGCCTGTGGCCGCCCATCAGGGGGAAGAGGCGTCCTG
50 . : . : . : . : . :
51 TTCTTCCTGGGGGACTGGCAG CACAAATAAAAATTTGCCCA
|||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
100051 TTCTTCCTGGGGGACTGGCAGGTG...CAGCACAAATAAAAATTTGCCCA
100 . : . : . : . : . :
92 TTATGTCAACAGCATCTGTGGAAATCGATGATGCATTGTATAG
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
104433 TTATGTCAACAGCATCTGTGGAAATCGATGATGCATTGTATAGGTA...T
150 . : . : . : . : . :
135 TCGACAGAGGTACGTTCTTGGAGACACAGCAATGCAGAAGATGGCCAA
>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
118905 AGTCGACAGAGGTACGTTCTTGGAGACACAGCAATGCAGAAGATGGCCAA
200 . : . : . : . : . :
183 GTCCCATGTTTTCTTAAGTGGGATGGGTGGTCTTGGTTTGGAAATTG
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
118955 GTCCCATGTTTTCTTAAGTGGGATGGGTGGTCTTGGTTTGGAAATTGGTA
250 . : . : . : . : . :
230 CAAAGAATCTTGTTCTTGCAGGGATTAAG GCAGTT
...>>>|||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
119005 ...TAGCAAAGAATCTTGTTCTTGCAGGGATTAAGGTA...AAGGCAGTT
300 . : . : . : . : . :
265 ACAATTCATGATACAGAAAAATGCCAAGCATGGGATCTAGGAACCAACTT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
122593 ACAATTCATGATACAGAAAAATGCCAAGCATGGGATCTAGGAACCAACTT
350 . : . : . : . : . :
315 CTTTCTCAGTGAAGATGATGTTGTTAATAAGAGAAACAG GG
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
122643 CTTTCTCAGTGAAGATGATGTTGTTAATAAGAGAAACAGGTA...TAGGG
400 . : . : . : . : . :
356 CTGAAGCTGTACTTAAACATATTGCAGAACTAAATCCATACGTTCATGTC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
123400 CTGAAGCTGTACTTAAACATATTGCAGAACTAAATCCATACGTTCATGTC
450 . : . : . : . : . :
406 ACATCATCTTCTGTTCCTTTCAATGAGACCACAGATCTCTCCTTTTTAGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
123450 ACATCATCTTCTGTTCCTTTCAATGAGACCACAGATCTCTCCTTTTTAGA
500 . : . : . : . : . :
456 TAAATACCAG TGTGTAGTATTGACTGAGATGAAACTTCCAT
||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
123500 TAAATACCAGGTT...CAGTGTGTAGTATTGACTGAGATGAAACTTCCAT
550 . : . : . : . : . :
497 TGCAGAAGAAGATCAATGACTTTTGCCGTTCTCAGTGCCCTCCAATTAAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
127374 TGCAGAAGAAGATCAATGACTTTTGCCGTTCTCAGTGCCCTCCAATTAAG
600 . : . : . : . : . :
547 TTTATCAGTGCAGATGTACATGGAATTTGGTCAAGGTTATT
>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
127424 GTA...CAGTTTATCAGTGCAGATGTACATGGAATTTGGTCAAGGTTATT
650 . : . : . : . : . :
588 TTGTGATTTCGGTGATGAATTTGAAGTTTTAGATACAACAGGAGAAGAAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
130569 TTGTGATTTCGGTGATGAATTTGAAGTTTTAGATACAACAGGAGAAGAAC
700 . : . : . : . : . :
638 CAAAAGAAATTTTCATTTCAAACATAACGCAA GCAAATCCT
||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
130619 CAAAAGAAATTTTCATTTCAAACATAACGCAAGTA...TAGGCAAATCCT
750 . : . : . : . : . :
679 GGCATTGTTACTTGCCTTGAAGATCATCCTCACAAACTGGAGACAGGACA
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
132455 GGCATTGTTACTTGCCTTGAAAATCATCCTCACAAACTGGAGACAGGACA
800 . : . : . : . : . :
729 ATTCCTAACATTTCGAGAAATTAATGGAATGACAGGTTTAAATGGATCTA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
132505 ATTCCTAACATTTCGAGAAATTAATGGAATGACAGGTTTAAATGGATCTA
850 . : . : . : . : . :
779 TACAACAAATAACGG TGATATCGCCATTTTCTTTTAGTATT
|||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
132555 TACAACAAATAACGGGTA...TAGTGATATCGCCATTTTCTTTTAGTATT
900 . : . : . : . : . :
820 GGTGACACCACAGAACTGGAACCATATTTACATGGAGGCATAGCTGTCCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
135854 GGTGACACCACAGAACTGGAACCATATTTACATGGAGGCATAGCTGTCCA
950 . : . : . : . : . :
870 AGTTAAGACTCCTAAAACAGTTTTTTTT GAATCACTGGAGA
||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
135904 AGTTAAGACTCCTAAAACAGTTTTTTTTGTA...CAGGAATCACTGGAGA
1000 . : . : . : . : . :
911 GGCAGTTAAAACATCCAAAGTGCCTTATTGTGGATTTTAGCAACCCTGAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
137186 GGCAGTTAAAACATCCAAAGTGCCTTATTGTGGATTTTAGCAACCCTGAG
1050 . : . : . : . : . :
961 GCACCTTTAGAGATTCACACAGCTATGCTTGCCTTGGACCA
>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
137236 GTA...TAGGCACCTTTAGAGATTCACACAGCTATGCTTGCCTTGGACCA
1100 . : . : . : . : . :
1002 GTTTCAGGAGAAATACAGTCGCAAGCCAAATGTTGG ATGCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
137946 GTTTCAGGAGAAATACAGTCGCAAGCCAAATGTTGGGTA...TAGATGCC
1150 . : . : . : . : . :
1043 AACAAGATTCAGAAGAACTGTTGAAACTAGCAACATCTATAAGTGAAACC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
138870 AACAAGATTCAGAAGAACTGTTGAAACTAGCAACATCTATAAGTGAAACC
1200 . : . : . : . : . :
1093 TTGGAAGAGAAG CCTGATGTAAATGCTGACATTGTGCATTG
||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
138920 TTGGAAGAGAAGGTG...TAGCCTGATGTAAATGCTGACATTGTGCATTG
1250 . : . : . : . : . :
1134 GCTCTCTTGGACTGCCCAAGGCTTTTTATCTCCACTTGCTGCAGCAGTAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
151938 GCTCTCTTGGACTGCCCAAGGCTTTTTATCTCCACTTGCTGCAGCAGTAG
1300 . : . : . : . : . :
1184 GAGGTGTTGCCAGCCAAGAAGTATTGAAAGCTGTAACAGGAAAATTTTCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
151988 GAGGTGTTGCCAGCCAAGAAGTATTGAAAGCTGTAACAGGAAAATTTTCT
1350 . : . : . : . : . :
1234 CCTTTGTGCCAGTGG TTATATCTTGAAGCAGCAGATATTGT
|||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
152038 CCTTTGTGCCAGTGGGTT...AAGTTATATCTTGAAGCAGCAGATATTGT
1400 . : . : . : . : . :
1275 TGAATCACTAGGCAAACCTGAATGTGAAGAATTTCTCCCACG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
154355 TGAATCACTAGGCAAACCTGAATGTGAAGAATTTCTCCCACGGTA...CA
1450 . : . : . : . : . :
1317 AGGAGATAGATATGATGCCTTAAGAGCTTGCATTGGAGACACTTTGTGT
>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
155103 GAGGAGATAGATATGATGCCTTAAGAGCTTGCATTGGAGACACTTTGTGT
1500 . : . : . : . : . :
1366 CAGAAACTGCAAAATTTAAACATCTTCTTA GTAGGGTGTGG
||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
155153 CAGAAACTGCAAAATTTAAACATCTTCTTAGTA...TAGGTAGGGTGTGG
1550 . : . : . : . : . :
1407 AGCCATAGGCTGTGAAATGTTGAAAAATTTTGCTTTACTTGGTGTTGGCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
156353 AGCCATAGGCTGTGAAATGTTGAAAAATTTTGCTTTACTTGGTGTTGGCA
1600 . : . : . : . : . :
1457 CAAGCAAAGAGAAAGGAATG ATTACAGTTACAGATCCTGAC
||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
156403 CAAGCAAAGAGAAAGGAATGGTA...TAGATTACAGTTACAGATCCTGAC
1650 . : . : . : . : . :
1498 TTGATAGAGAAATCCAACTTAAATAGACAGTTCCTATTTCGTCCTCATCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
159913 TTGATAGAGAAATCCAACTTAAATAGACAGTTCCTATTTCGTCCTCATCA
1700 . : . : . : . : . :
1548 CATACAG AAACCTAAAAGCTACACTGCTGCTGATGCTACTC
|||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
159963 CATACAGGTA...TAGAAACCTAAAAGCTACACTGCTGCTGATGCTACTC
1750 . : . : . : . : . :
1589 TGAAAATAAATTCTCAAATAAAGATAGATGCACACCTGAACAAAGTATGT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
162030 TGAAAATAAATTCTCAAATAAAGATAGATGCACACCTGAACAAAGTATGT
1800 . : . : . : . : . :
1639 CCAACCACTGAGACCATTTACAATGATGAGTTCTATACTAAACAAGATGT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
162080 CCAACCACTGAGACCATTTACAATGATGAGTTCTATACTAAACAAGATGT
1850 . : . : . : . : . :
1689 AATTATTACAGCATTAGATAATGTGGAAGCCAGGAGATACGTAGACAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
162130 AATTATTACAGCATTAGATAATGTGGAAGCCAGGAGATACGTAGACAGGT
1900 . : . : . : . : . :
1737 TCGTTGCTTAGCAAATCTAAGGCCTCTTTTAGATTCTGGAACA
>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
162180 A...TAGTCGTTGCTTAGCAAATCTAAGGCCTCTTTTAGATTCTGGAACA
1950 . : . : . : . : . :
1780 ATGGGCACTAAGGGACACACTGAAGTTATTGTACCGCATTTGACTGAGTC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
165605 ATGGGCACTAAGGGACACACTGAAGTTATTGTACCGCATTTGACTGAGTC
2000 . : . : . : . : . :
1830 TTACAATAGTCAT CGGGATCCCCCAGAAGAGGAAATACCAT
|||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
165655 TTACAATAGTCATGTA...TAGCGGGATCCCCCAGAAGAGGAAATACCAT
2050 . : . : . : . : . :
1871 TTTGTACTCTAAAATCCTTTCCAGCTGCTATTGAACATACCATACAGTGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
166630 TTTGTACTCTAAAATCCTTTCCAGCTGCTATTGAACATACCATACAGTGG
2100 . : . : . : . : . :
1921 GCAAGAGATAAG TTTGAAAGTTCCTTTTCCCACAAACCTTC
||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
166680 GCAAGAGATAAGGTA...CAGTTTGAAAGTTCCTTTTCCCACAAACCTTC
2150 . : . : . : . : . :
1962 ATTGTTTAACAAATTTTGGCAAACCTATTCATCTGCAGAAGAAGTCTTAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
166827 ATTGTTTAACAAATTTTGGCAAACCTATTCATCTGCAGAAGAAGTCTTAC
2200 . : . : . : . : . :
2012 AG AAGATACAGAGTGGACACAGTTTAGAAGGCTGTTTTCAA
||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
166877 AGGTA...TAGAAGATACAGAGTGGACACAGTTTAGAAGGCTGTTTTCAA
2250 . : . : . : . : . :
2053 GTTATAAAGTTACTTAGCAGAAGACCTAGAAATTGGTCCCAGTGTGTAGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
167686 GTTATAAAGTTACTTAGCAGAAGACCTAGAAATTGGTCCCAGTGTGTAGA
2300 . : . : . : . : . :
2103 ATTAGCAAGATTAAAGTTTGAAAAATATTTTAACCATAAG G
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
167736 ATTAGCAAGATTAAAGTTTGAAAAATATTTTAACCATAAGGTA...TAGG
2350 . : . : . : . : . :
2144 CTCTTCAGCTTCTTCACTGTTTCCCTCTGGACATACGATTAAAAGATGGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
169213 CTCTTCAGCTTCTTCACTGTTTCCCTCTGGACATACGATTAAAAGATGGC
2400 . : . : . : . : . :
2194 A GTTTATTTTGGCAGTCACCAAAGAGGCCACCCTCTCCAAT
|>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
169263 AGTA...CAGGTTTATTTTGGCAGTCACCAAAGAGGCCACCCTCTCCAAT
2450 . : . : . : . : . :
2235 AAAATTTGATTTAAATGAGCCTTT GCACCTCAGTTTCCTTC
||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
169389 AAAATTTGATTTAAATGAGCCTTTGTA...AAGGCACCTCAGTTTCCTTC
2500 . : . : . : . : . :
2276 AGAATGCTGCAAAACTATATGCTACAGTATATTGTATTCCATTTGCAGAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
170602 AGAATGCTGCAAAACTATATGCTACAGTATATTGTATTCCATTTGCAGAA
2550 . : . : . : . : . :
2326 GAG GACTTATCAGCAGATGCCCTCTTGAATATTCTTTCAGA
|||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
170652 GAGGTA...CAGGACTTATCAGCAGATGCCCTCTTGAATATTCTTTCAGA
2600 . : . : . : . : . :
2367 AGTAAAGATTCAGGAATTCAAGCCTTCCAATAAG GTTGTTC
||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
172016 AGTAAAGATTCAGGAATTCAAGCCTTCCAATAAGGTA...AAGGTTGTTC
2650 . : . : . : . : . :
2408 AAACAGATGAAACTGCAAGGAAACCAGACCATGTTCCTATTAGCAGTGAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
174650 AAACAGATGAAACTGCAAGGAAACCAGACCATGTTCCTATTAGCAGTGAA
2700 . : . : . : . : . :
2458 GATGGGAGGAATGCAATTTTCCAACTAGAAAAGGCTATTTTATCTAATGA
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
174700 GATGAGAGGAATGCAATTTTCCAACTAGAAAAGGCTATTTTATCTAATGA
2750 . : . : . : . : . :
2508 AGCCACCAAAA GTGACCTTCAGATGGCAGTGCTTTCATTTG
|||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
174750 AGCCACCAAAAGTA...CAGGTGACCTTCAGATGGCAGTGCTTTCATTTG
2800 . : . : . : . : . :
2549 AAAAAGATGATGATCATAATGGACACATAGATTTCATCACAGCTGCATCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
175963 AAAAAGATGATGATCATAATGGACACATAGATTTCATCACAGCTGCATCA
2850 . : . : . : . : . :
2599 AATCTTCGTGCCAAAATGTACAGCATTGAACCAGCTGACCGTTTCAAAAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
176013 AATCTTCGTGCCAAAATGTACAGCATTGAACCAGCTGACCGTTTCAAAAC
2900 . : . : . : . : . :
2649 AAAGCGCATAGCTGGTAAAATTATACCTGCTATAGCAACAACCACTGCTA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
176063 AAAGCGCATAGCTGGTAAAATTATACCTGCTATAGCAACAACCACTGCTA
2950 . : . : . : . : . :
2699 CAGTTTCTGGCTTG GTTGCCTTGGAGAAGATCAAAGTAACT
||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||| |||||||||||||
176113 CAGTTTCTGGCTTGGTA...TAGGTTGCCTTGGAGATGATCAAAGTAACT
3000 . : . : . : . : . :
2740 GGTGGCTATCCATTTGAAGCTTACAAAAATTGTTTTCTTAACTTAGCCAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
176894 GGTGGCTATCCATTTGAAGCTTACAAAAATTGTTTTCTTAACTTAGCCAT
3050 . : . : . : . : . :
2790 TCCAATTGTAGTATTTACAGAGACAACTGAAGTAAGGAAAACTAAAATCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
176944 TCCAATTGTAGTATTTACAGAGACAACTGAAGTAAGGAAAACTAAAATCA
3100 . : . : . : . : . :
2840 G AAATGGAATATCATTTACAATTTGGGATCGATGGACCGTA
|>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
176994 GGTA...CAGAAATGGAATATCATTTACAATTTGGGATCGATGGACCGTA
3150 . : . : . : . : . :
2881 CATGGAAAAGAAGATTTCACCCTCTTGGATTTCATAAATGCAGTCAAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
177938 CATGGAAAAGAAGATTTCACCCTCTTGGATTTCATAAATGCAGTCAAAGT
3200 . : . : . : . : . :
2929 GAGAAGTATGGAATTGAGCCAACAATGGTGGTACAGGGAGTCA
>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
177988 G...TAGGAGAAGTATGGAATTGAGCCAACAATGGTGGTACAGGGAGTCA
3250 . : . : . : . : . :
2972 AAATGCTTTATGTTCCTGTAATGCCTGGTCATGCAAAAAGATTGAAGTTA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
178238 AAATGCTTTATGTTCCTGTAATGCCTGGTCATGCAAAAAGATTGAAGTTA
3300 . : . : . : . : . :
3022 AC AATGCATAAACTTGTAAAACCTACTACTGAAAAGAAATA
||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
178288 ACGTA...TAGAATGCATAAACTTGTAAAACCTACTACTGAAAAGAAATA
3350 . : . : . : . : . :
3063 TGTGGATCTTACTGTGTCATTTGCTCCAGACATTGATGGAGATGAAGATT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
182027 TGTGGATCTTACTGTGTCATTTGCTCCAGACATTGATGGAGATGAAGATT
3400 . : . : . : . :
3113 TGCCGGGACCTCCAGTAAGATACTACTTCAGTCATGACACTGAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
182077 TGCCGGGACCTCCAGTAAGATACTACTTCAGTCATGACACTGAT