seq1 = pF1KB8401.tfa, 2859 bp
seq2 = pF1KB8401/gi568815587r_14357827.tfa (gi568815587r:14357827_14598928), 241102 bp

>pF1KB8401 2859
>gi568815587r:14357827_14598928 (Chr11)

(complement)

1-91  (100001-100091)   100% ->
92-321  (104490-104719)   100% ->
322-491  (105118-105287)   100% ->
492-606  (108250-108364)   100% ->
607-699  (110345-110437)   100% ->
700-837  (112425-112562)   100% ->
838-957  (115778-115897)   100% ->
958-1065  (117832-117939)   100% ->
1066-1212  (118024-118170)   100% ->
1213-1358  (119215-119360)   100% ->
1359-1455  (121914-122010)   100% ->
1456-1616  (122984-123144)   100% ->
1617-1737  (124314-124434)   100% ->
1738-1965  (129366-129593)   100% ->
1966-2145  (130069-130248)   100% ->
2146-2290  (132503-132647)   100% ->
2291-2410  (133899-134018)   100% ->
2411-2556  (137598-137743)   100% ->
2557-2646  (138632-138721)   100% ->
2647-2802  (140242-140397)   100% ->
2803-2859  (141046-141102)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGACGGCGGCTGAGAACGTATGCTACACGTTAATTAACGTGCCAATGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGACGGCGGCTGAGAACGTATGCTACACGTTAATTAACGTGCCAATGGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TTCAGAACCACCATCTGAAATTAGCTTAAAAAATGATCTAG         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 100051 TTCAGAACCACCATCTGAAATTAGCTTAAAAAATGATCTAGGTA...CAG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 AAAAAGGAGATGTAAAGTCAAAGACTGAAGCTTTGAAGAAAGTAATCATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104490 AAAAAGGAGATGTAAAGTCAAAGACTGAAGCTTTGAAGAAAGTAATCATT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 ATGATTCTGAATGGTGAAAAACTTCCTGGACTTCTGATGACCATCATTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104540 ATGATTCTGAATGGTGAAAAACTTCCTGGACTTCTGATGACCATCATTCG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 TTTTGTGCTACCTCTTCAGGATCACACTATCAAGAAATTACTTCTGGTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104590 TTTTGTGCTACCTCTTCAGGATCACACTATCAAGAAATTACTTCTGGTAT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 TTTGGGAAATTGTTCCTAAAACAACTCCAGATGGGAGACTTTTACATGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104640 TTTGGGAAATTGTTCCTAAAACAACTCCAGATGGGAGACTTTTACATGAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 ATGATCCTTGTATGTGATGCATACAGAAAG         GATCTTCAACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 104690 ATGATCCTTGTATGTGATGCATACAGAAAGGTA...CAGGATCTTCAACA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 TCCTAATGAATTTATTCGAGGATCTACTCTTCGTTTTCTTTGCAAATTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105129 TCCTAATGAATTTATTCGAGGATCTACTCTTCGTTTTCTTTGCAAATTGA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 AAGAAGCAGAATTGCTAGAACCTTTAATGCCAGCTATTCGTGCATGTTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105179 AAGAAGCAGAATTGCTAGAACCTTTAATGCCAGCTATTCGTGCATGTTTG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 GAGCATCGACACAGCTATGTTAGAAGAAATGCTGTTTTGGCCATCTATAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105229 GAGCATCGACACAGCTATGTTAGAAGAAATGCTGTTTTGGCCATCTATAC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 CATCTATAG         AAATTTTGAACATCTTATACCTGATGCTCCTG
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 105279 CATCTATAGGTA...AAGAAATTTTGAACATCTTATACCTGATGCTCCTG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 AACTGATACATGATTTTCTGGTGAATGAGAAGGATGCAAGTTGCAAAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108282 AACTGATACATGATTTTCTGGTGAATGAGAAGGATGCAAGTTGCAAAAGG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 AATGCATTTATGATGCTAATTCATGCAGATCAG         GATCGAGC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 108332 AATGCATTTATGATGCTAATTCATGCAGATCAGGTG...TAGGATCGAGC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 TTTGGATTACTTAAGTACTTGCATTGATCAAGTTCAAACATTTGGAGACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110353 TTTGGATTACTTAAGTACTTGCATTGATCAAGTTCAAACATTTGGAGACA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 TTCTGCAGCTGGTTATTGTTGAACTGATTTATAAG         GTCTGT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 110403 TTCTGCAGCTGGTTATTGTTGAACTGATTTATAAGGTA...CAGGTCTGT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 CATGCTAATCCATCAGAAAGAGCTCGTTTTATTCGCTGCATCTATAACTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112431 CATGCTAATCCATCAGAAAGAGCTCGTTTTATTCGCTGCATCTATAACTT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 ATTACAGTCATCCAGCCCTGCTGTAAAATATGAAGCTGCTGGGACATTAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112481 ATTACAGTCATCCAGCCCTGCTGTAAAATATGAAGCTGCTGGGACATTAG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    806 TGACACTCTCTAGTGCACCAACTGCAATCAAG         GCTGCTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 112531 TGACACTCTCTAGTGCACCAACTGCAATCAAGGTA...TAGGCTGCTGCT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    847 CAGTGTTACATTGATTTAATTATTAAGGAGAGCGACAACAATGTAAAACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115787 CAGTGTTACATTGATTTAATTATTAAGGAGAGCGACAACAATGTAAAACT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    897 CATAGTTTTGGATCGCTTGATAGAATTAAAAGAGCATCCTGCTCATGAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115837 CATAGTTTTGGATCGCTTGATAGAATTAAAAGAGCATCCTGCTCATGAAC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    947 GAGTACTACAG         GATCTGGTTATGGATATCCTAAGAGTATTG
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 115887 GAGTACTACAGGTA...TAGGATCTGGTTATGGATATCCTAAGAGTATTG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    988 AGCACACCAGACTTAGAAGTACGAAAGAAAACTCTGCAGTTAGCACTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117862 AGCACACCAGACTTAGAAGTACGAAAGAAAACTCTGCAGTTAGCACTGGA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1038 TCTTGTCTCTTCTAGAAATGTTGAAGAG         CTGGTTATTGTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 117912 TCTTGTCTCTTCTAGAAATGTTGAAGAGGTA...AAGCTGGTTATTGTCC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1079 TGAAGAAGGAAGTGATAAAAACAAATAATGTGTCTGAGCATGAAGATACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118037 TGAAGAAGGAAGTGATAAAAACAAATAATGTGTCTGAGCATGAAGATACT

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1129 GACAAATACAGACAACTCCTAGTGCGAACATTGCATTCCTGTTCTGTCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118087 GACAAATACAGACAACTCCTAGTGCGAACATTGCATTCCTGTTCTGTCCG

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1179 ATTTCCAGATATGGCTGCAAATGTTATTCCTGTG         TTAATGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 118137 ATTTCCAGATATGGCTGCAAATGTTATTCCTGTGGTA...TAGTTAATGG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1220 AATTTCTCAGTGACAACAACGAAGCAGCAGCTGCTGATGTCTTGGAGTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119222 AATTTCTCAGTGACAACAACGAAGCAGCAGCTGCTGATGTCTTGGAGTTT

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1270 GTTCGTGAAGCCATTCAGCGCTTTGATAACCTGAGAATGCTTATTGTTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119272 GTTCGTGAAGCCATTCAGCGCTTTGATAACCTGAGAATGCTTATTGTTGA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1320 GAAGATGCTTGAAGTCTTTCATGCTATTAAATCTGTCAA         GA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 119322 GAAGATGCTTGAAGTCTTTCATGCTATTAAATCTGTCAAGTA...TAGGA

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1361 TTTACCGAGGAGCATTATGGATCCTGGGAGAATACTGTAGTACCAAGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121916 TTTACCGAGGAGCATTATGGATCCTGGGAGAATACTGTAGTACCAAGGAA

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1411 GACATTCAGAGTGTGATGACTGAGATCCGCAGGTCCCTTGGAGAG     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 121966 GACATTCAGAGTGTGATGACTGAGATCCGCAGGTCCCTTGGAGAGGTA..

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1456     ATCCCAATTGTAGAGTCAGAAATAAAGAAAGAAGCTGGTGAATTAA
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122016 .TAGATCCCAATTGTAGAGTCAGAAATAAAGAAAGAAGCTGGTGAATTAA

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1502 AACCTGAAGAAGAAATAACTGTAGGGCCAGTTCAGAAATTGGTTACTGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123030 AACCTGAAGAAGAAATAACTGTAGGGCCAGTTCAGAAATTGGTTACTGAA

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1552 ATGGGTACCTATGCAACTCAGAGTGCCCTTAGCAGTTCTAGACCCACCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123080 ATGGGTACCTATGCAACTCAGAGTGCCCTTAGCAGTTCTAGACCCACCAA

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1602 GAAAGAGGAAGACAG         ACCTCCCTTGAGAGGATTCCTTCTGG
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 123130 GAAAGAGGAAGACAGGTA...CAGACCTCCCTTGAGAGGATTCCTTCTGG

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1643 ATGGAGATTTCTTTGTTGCTGCCTCCCTTGCCACAACTCTGACCAAGATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124340 ATGGAGATTTCTTTGTTGCTGCCTCCCTTGCCACAACTCTGACCAAGATT

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1693 GCATTGCGCTATGTAGCTTTGGTTCAGGAGAAGAAAAAGCAAAAT     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 124390 GCATTGCGCTATGTAGCTTTGGTTCAGGAGAAGAAAAAGCAAAATGTA..

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1738     TCTTTTGTTGCTGAGGCTATGTTGCTCATGGCTACTATCCTGCATT
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124440 .TAGTCTTTTGTTGCTGAGGCTATGTTGCTCATGGCTACTATCCTGCATT

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1784 TGGGAAAATCCTCTCTTCCTAAGAAGCCAATTACTGATGATGATGTGGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129412 TGGGAAAATCCTCTCTTCCTAAGAAGCCAATTACTGATGATGATGTGGAT

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1834 CGAATTTCCCTGTGCCTCAAGGTCTTGTCTGAATGTTCACCTTTAATGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129462 CGAATTTCCCTGTGCCTCAAGGTCTTGTCTGAATGTTCACCTTTAATGAA

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1884 TGACATTTTCAATAAGGAATGCAGACAGTCCCTTTCTCACATGTTATCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129512 TGACATTTTCAATAAGGAATGCAGACAGTCCCTTTCTCACATGTTATCTG

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1934 CTAAACTAGAAGAAGAGAAATTATCCCAAAAG         AAAGAATCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 129562 CTAAACTAGAAGAAGAGAAATTATCCCAAAAGGTA...CAGAAAGAATCT

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1975 GAAAAGAGGAATGTGACAGTACAGCCTGATGACCCCATTTCCTTCATGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130078 GAAAAGAGGAATGTGACAGTACAGCCTGATGACCCCATTTCCTTCATGCA

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2025 ACTAACTGCTAAGAATGAAATGAACTGCAAGGAAGATCAGTTTCAGCTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130128 ACTAACTGCTAAGAATGAAATGAACTGCAAGGAAGATCAGTTTCAGCTGA

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2075 GTTTACTGGCAGCAATGGGTAACACACAGAGGAAAGAGGCAGCAGATCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130178 GTTTACTGGCAGCAATGGGTAACACACAGAGGAAAGAGGCAGCAGATCCC

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2125 CTAGCATCTAAACTTAACAAG         GTCACCCAATTGACAGGTTT
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 130228 CTAGCATCTAAACTTAACAAGGTA...CAGGTCACCCAATTGACAGGTTT

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2166 CTCAGATCCTGTATATGCAGAAGCTTACGTTCATGTCAACCAATATGATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132523 CTCAGATCCTGTATATGCAGAAGCTTACGTTCATGTCAACCAATATGATA

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2216 TTGTCCTGGATGTACTTGTTGTGAACCAAACCAGTGATACTTTGCAGAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132573 TTGTCCTGGATGTACTTGTTGTGAACCAAACCAGTGATACTTTGCAGAAT

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2266 TGCACATTAGAACTAGCTACACTAG         GGGATCTGAAACTTGT
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 132623 TGCACATTAGAACTAGCTACACTAGGTG...CAGGGGATCTGAAACTTGT

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2307 GGAAAAGCCGTCTCCTTTGACTCTTGCTCCTCATGACTTCGCAAATATTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133915 GGAAAAGCCGTCTCCTTTGACTCTTGCTCCTCATGACTTCGCAAATATTA

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2357 AAGCTAACGTCAAAGTAGCATCAACAGAAAATGGAATAATTTTTGGTAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133965 AAGCTAACGTCAAAGTAGCATCAACAGAAAATGGAATAATTTTTGGTAAT

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2407 ATAG         TTTATGATGTCTCTGGAGCAGCAAGTGACAGAAATTG
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134015 ATAGGTA...CAGTTTATGATGTCTCTGGAGCAGCAAGTGACAGAAATTG

   2600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2448 TGTGGTTCTCAGTGATATTCACATCGACATCATGGACTATATCCAGCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 137635 TGTGGTTCTCAGTGATATTCACATCGACATCATGGACTATATCCAGCCTG

   2650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2498 CAACTTGCACTGATGCAGAATTCCGTCAGATGTGGGCCGAATTTGAATGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 137685 CAACTTGCACTGATGCAGAATTCCGTCAGATGTGGGCCGAATTTGAATGG

   2700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2548 GAAAACAAA         GTGACAGTTAACACCAACATGGTTGATTTAAA
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 137735 GAAAACAAAGTT...CAGGTGACAGTTAACACCAACATGGTTGATTTAAA

   2750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2589 TGACTACTTACAGCACATATTAAAGTCAACCAATATGAAATGCCTGACTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 138664 TGACTACTTACAGCACATATTAAAGTCAACCAATATGAAATGCCTGACTC

   2800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2639 CAGAAAAG         GCCCTTTCTGGTTACTGTGGCTTTATGGCAGCC
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 138714 CAGAAAAGGTA...CAGGCCCTTTCTGGTTACTGTGGCTTTATGGCAGCC

   2850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2680 AACCTTTATGCTCGTTCCATATTTGGTGAAGATGCACTTGCAAATGTCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 140275 AACCTTTATGCTCGTTCCATATTTGGTGAAGATGCACTTGCAAATGTCAG

   2900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2730 CATTGAGAAGCCAATTCACCAGGGACCAGATGCTGCTGTTACCGGCCATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 140325 CATTGAGAAGCCAATTCACCAGGGACCAGATGCTGCTGTTACCGGCCATA

   2950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2780 TAAGAATTCGTGCAAAGAGCCAG         GGAATGGCCTTAAGTCTT
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 140375 TAAGAATTCGTGCAAAGAGCCAGGTA...CAGGGAATGGCCTTAAGTCTT

   3000     .    :    .    :    .    :    .
   2821 GGAGATAAAATCAACTTGTCACAGAAGAAAACTAGTATA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141064 GGAGATAAAATCAACTTGTCACAGAAGAAAACTAGTATA