seq1 = pF1KB8398.tfa, 1884 bp
seq2 = pF1KB8398/gi568815597r_205203453.tfa (gi568815597r:205203453_205421628), 218176 bp

>pF1KB8398 1884
>gi568815597r:205203453_205421628 (Chr1)

(complement)

1-231  (100001-100231)   100% ->
232-352  (109804-109924)   100% ->
353-504  (112897-113048)   100% ->
505-570  (113399-113464)   100% ->
571-690  (115322-115441)   99% ->
691-823  (116298-116430)   100% ->
824-1884  (117116-118176)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGAGTCGCTGGTTTTCGCGCGGCGCTCCGGCCCCACTCCCTCGGCCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGAGTCGCTGGTTTTCGCGCGGCGCTCCGGCCCCACTCCCTCGGCCGC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 AGAGCTAGCCCGGCCGCTGGCGGAAGGGCTGATCAAGTCGCCCAAGCCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 AGAGCTAGCCCGGCCGCTGGCGGAAGGGCTGATCAAGTCGCCCAAGCCCC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TAATGAAGAAGCAGGCGGTGAAGCGGCACCACCACAAGCACAACCTGCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TAATGAAGAAGCAGGCGGTGAAGCGGCACCACCACAAGCACAACCTGCGG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CACCGCTACGAGTTCCTGGAGACCCTGGGCAAAGGCACCTACGGGAAGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CACCGCTACGAGTTCCTGGAGACCCTGGGCAAAGGCACCTACGGGAAGGT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GAAGAAGGCGCGGGAGAGCTCGGGGCGCCTG         GTGGCCATCA
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 100201 GAAGAAGGCGCGGGAGAGCTCGGGGCGCCTGGTG...CAGGTGGCCATCA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 AGTCAATCCGGAAGGACAAAATCAAAGATGAGCAAGATCTGATGCACATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109814 AGTCAATCCGGAAGGACAAAATCAAAGATGAGCAAGATCTGATGCACATA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 CGGAGGGAGATTGAGATCATGTCATCACTCAACCACCCTCACATCATTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109864 CGGAGGGAGATTGAGATCATGTCATCACTCAACCACCCTCACATCATTGC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 CATCCATGAAG         TGTTTGAGAACAGCAGCAAGATCGTGATCG
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 109914 CATCCATGAAGGTA...CAGTGTTTGAGAACAGCAGCAAGATCGTGATCG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 TCATGGAGTATGCCAGCCGGGGCGACCTTTATGACTACATCAGCGAGCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112927 TCATGGAGTATGCCAGCCGGGGCGACCTTTATGACTACATCAGCGAGCGG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 CAGCAGCTCAGTGAGCGCGAAGCTAGGCATTTCTTCCGGCAGATCGTCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112977 CAGCAGCTCAGTGAGCGCGAAGCTAGGCATTTCTTCCGGCAGATCGTCTC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 TGCCGTGCACTATTGCCATCAG         AACAGAGTTGTCCACCGAG
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 113027 TGCCGTGCACTATTGCCATCAGGTG...CAGAACAGAGTTGTCCACCGAG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 ATCTCAAGCTGGAGAACATCCTCTTGGATGCCAATGGGAATATCAAG   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 113418 ATCTCAAGCTGGAGAACATCCTCTTGGATGCCAATGGGAATATCAAGGTG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    571       ATTGCTGACTTCGGCCTCTCCAACCTCTACCATCAAGGCAAGTT
        ...>>>|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
 113468 ...CAGATTGCTGACTTCGGTCTCTCCAACCTCTACCATCAAGGCAAGTT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 CCTGCAGACATTCTGTGGGAGCCCCCTCTATGCCTCGCCAGAGATTGTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115366 CCTGCAGACATTCTGTGGGAGCCCCCTCTATGCCTCGCCAGAGATTGTCA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 ATGGGAAGCCCTACACAGGCCCAGAG         GTGGACAGCTGGTCC
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 115416 ATGGGAAGCCCTACACAGGCCCAGAGGTA...CAGGTGGACAGCTGGTCC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 CTGGGTGTTCTCCTCTACATCCTGGTGCATGGCACCATGCCCTTTGATGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116313 CTGGGTGTTCTCCTCTACATCCTGGTGCATGGCACCATGCCCTTTGATGG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 GCATGACCATAAGATCCTAGTGAAACAGATCAGCAACGGGGCCTACCGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116363 GCATGACCATAAGATCCTAGTGAAACAGATCAGCAACGGGGCCTACCGGG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    806 AGCCACCTAAACCCTCTG         ATGCCTGTGGCCTGATCCGGTGG
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 116413 AGCCACCTAAACCCTCTGGTG...CAGATGCCTGTGGCCTGATCCGGTGG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    847 CTGTTGATGGTGAACCCCACCCGCCGGGCCACCCTGGAGGATGTGGCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117139 CTGTTGATGGTGAACCCCACCCGCCGGGCCACCCTGGAGGATGTGGCCAG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    897 TCACTGGTGGGTCAACTGGGGCTACGCCACCCGAGTGGGAGAGCAGGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117189 TCACTGGTGGGTCAACTGGGGCTACGCCACCCGAGTGGGAGAGCAGGAGG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    947 CTCCGCATGAGGGTGGGCACCCTGGCAGTGACTCTGCCCGCGCCTCCATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117239 CTCCGCATGAGGGTGGGCACCCTGGCAGTGACTCTGCCCGCGCCTCCATG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    997 GCTGACTGGCTCCGGCGTTCCTCCCGCCCCCTCCTGGAGAATGGGGCCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117289 GCTGACTGGCTCCGGCGTTCCTCCCGCCCCCTCCTGGAGAATGGGGCCAA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1047 GGTGTGCAGCTTCTTCAAGCAGCATGCACCTGGTGGGGGAAGCACCACCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117339 GGTGTGCAGCTTCTTCAAGCAGCATGCACCTGGTGGGGGAAGCACCACCC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1097 CTGGCCTGGAGCGCCAGCATTCGCTCAAGAAGTCCCGCAAGGAGAATGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117389 CTGGCCTGGAGCGCCAGCATTCGCTCAAGAAGTCCCGCAAGGAGAATGAC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1147 ATGGCCCAGTCTCTCCACAGTGACACGGCTGATGACACTGCCCATCGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117439 ATGGCCCAGTCTCTCCACAGTGACACGGCTGATGACACTGCCCATCGCCC

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1197 TGGCAAGAGCAACCTCAAGCTGCCAAAGGGCATTCTCAAGAAGAAGGTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117489 TGGCAAGAGCAACCTCAAGCTGCCAAAGGGCATTCTCAAGAAGAAGGTGT

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1247 CAGCCTCTGCAGAAGGGGTACAGGAGGACCCTCCGGAGCTCAGCCCAATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117539 CAGCCTCTGCAGAAGGGGTACAGGAGGACCCTCCGGAGCTCAGCCCAATC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1297 CCTGCGAGCCCAGGGCAGGCTGCCCCGCTGCTCCCCAAGAAGGGCATTCT
        |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
 117589 CCTGCGAGCCCAGGGCAGGCTGCCCCCCTGCTCCCCAAGAAGGGCATTCT

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1347 CAAGAAGCCCCGACAGCGCGAGTCTGGCTACTACTCCTCTCCCGAGCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117639 CAAGAAGCCCCGACAGCGCGAGTCTGGCTACTACTCCTCTCCCGAGCCCA

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1397 GTGAATCTGGGGAGCTCTTGGACGCAGGCGACGTGTTTGTGAGTGGGGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117689 GTGAATCTGGGGAGCTCTTGGACGCAGGCGACGTGTTTGTGAGTGGGGAT

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1447 CCCAAGGAGCAGAAGCCTCCGCAAGCTTCAGGGCTGCTCCTCCATCGCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117739 CCCAAGGAGCAGAAGCCTCCGCAAGCTTCAGGGCTGCTCCTCCATCGCAA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1497 AGGCATCCTCAAACTCAATGGCAAGTTCTCCCAGACAGCCTTGGAGCTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117789 AGGCATCCTCAAACTCAATGGCAAGTTCTCCCAGACAGCCTTGGAGCTCG

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1547 CGGCCCCCACCACCTTCGGCTCCCTGGATGAACTCGCCCCACCTCGCCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117839 CGGCCCCCACCACCTTCGGCTCCCTGGATGAACTCGCCCCACCTCGCCCC

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1597 CTGGCCCGGGCCAGCCGACCCTCAGGGGCTGTGAGCGAGGACAGCATCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117889 CTGGCCCGGGCCAGCCGACCCTCAGGGGCTGTGAGCGAGGACAGCATCCT

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1647 GTCCTCTGAGTCCTTTGACCAGCTGGACTTGCCTGAACGGCTCCCAGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117939 GTCCTCTGAGTCCTTTGACCAGCTGGACTTGCCTGAACGGCTCCCAGAGC

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1697 CCCCACTGCGGGGCTGTGTGTCTGTGGACAACCTCACGGGGCTTGAGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117989 CCCCACTGCGGGGCTGTGTGTCTGTGGACAACCTCACGGGGCTTGAGGAG

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1747 CCCCCCTCAGAGGGCCCTGGAAGCTGCCTGAGGCGCTGGCGGCAGGATCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118039 CCCCCCTCAGAGGGCCCTGGAAGCTGCCTGAGGCGCTGGCGGCAGGATCC

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1797 TTTGGGGGACAGCTGCTTTTCCCTGACAGACTGCCAGGAGGTGACAGCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118089 TTTGGGGGACAGCTGCTTTTCCCTGACAGACTGCCAGGAGGTGACAGCGA

   1900     .    :    .    :    .    :    .
   1847 CCTACCGACAGGCACTGAGGGTCTGCTCAAAGCTCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118139 CCTACCGACAGGCACTGAGGGTCTGCTCAAAGCTCACC