seq1 = pF1KB8388.tfa, 1746 bp
seq2 = pF1KB8388/gi568815581r_2286904.tfa (gi568815581r:2286904_2500712), 213809 bp

>pF1KB8388 1746
>gi568815581r:2286904_2500712 (Chr17)

(complement)

1-73  (100001-100073)   100% ->
74-653  (105259-105838)   100% ->
654-695  (106367-106408)   100% ->
696-807  (106559-106670)   100% ->
808-1000  (112664-112856)   100% ->
1001-1746  (113064-113809)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAGCATAGAGACGCTACTGGAGGCGGCCCGCTTCCTGGAATGGCAAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAGCATAGAGACGCTACTGGAGGCGGCCCGCTTCCTGGAATGGCAAGC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GCAGCAACAACAGAGAGCACGTG         AGGAGCAGGAGCGGCTTC
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 100051 GCAGCAACAACAGAGAGCACGTGGTG...TAGAGGAGCAGGAGCGGCTTC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 GCTTGGAGCAGGAGCGAGAGCAGGAACAGAAGAAGGCCAATAGCCTGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105277 GCTTGGAGCAGGAGCGAGAGCAGGAACAGAAGAAGGCCAATAGCCTGGCC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 AGGCTGGCACATACCCTTCCTGTGGAGGAACCCCGCATGGAGGCGCCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105327 AGGCTGGCACATACCCTTCCTGTGGAGGAACCCCGCATGGAGGCGCCACC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CCTGCCTCTGTCTCCACCGGCTCCCCCGCCGGCACCCCCACCACCACTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105377 CCTGCCTCTGTCTCCACCGGCTCCCCCGCCGGCACCCCCACCACCACTTG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 CCACCCCTGCCCCACTGACTGTCATCCCTATCCCTGTGGTGACCAACTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105427 CCACCCCTGCCCCACTGACTGTCATCCCTATCCCTGTGGTGACCAACTCC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 CCTCAGCCTCTACCCCCACCCCCACCCTTGCCCGCGGCAGCCCAGCCTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105477 CCTCAGCCTCTACCCCCACCCCCACCCTTGCCCGCGGCAGCCCAGCCTCT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 GCCCCTGGCGCCTCGTCAGCCGGCCCTGGTTGGCGCCCCCGGACTCAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105527 GCCCCTGGCGCCTCGTCAGCCGGCCCTGGTTGGCGCCCCCGGACTCAGCA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 TTAAGGAGCCTGCCCCCCTGCCCAGCAGGCCGCAGGTGCCCACCCCTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105577 TTAAGGAGCCTGCCCCCCTGCCCAGCAGGCCGCAGGTGCCCACCCCTGCT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 CCCCTACTGCCGGACTCGAAGGCCACCATTCCACCCAATGGCAGCCCCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105627 CCCCTACTGCCGGACTCGAAGGCCACCATTCCACCCAATGGCAGCCCCAA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    492 GCCTTTGCAGCCCCTCCCCACGCCTGTCCTGACCATAGCGCCACACCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105677 GCCTTTGCAGCCCCTCCCCACGCCTGTCCTGACCATAGCGCCACACCCTG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    542 GAGTCCAGCCTCAGCTGGCCCCCCAGCAGCCGCCCCCACCCACGCTGGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105727 GAGTCCAGCCTCAGCTGGCCCCCCAGCAGCCGCCCCCACCCACGCTGGGG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    592 ACCCTGAAGTTGGCACCAGCTGAAGAAGTCAAATCCAGTGAACAGAAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105777 ACCCTGAAGTTGGCACCAGCTGAAGAAGTCAAATCCAGTGAACAGAAGAA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    642 GAGGCCCGGGGG         GATCGGAACCAGAGAAGTCCACAACAAAT
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 105827 GAGGCCCGGGGGGTG...CAGGATCGGAACCAGAGAAGTCCACAACAAAT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    683 TGGAGAAGAACAG         GAGGGCCCATCTGAAAGAGTGCTTTGAG
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 106396 TGGAGAAGAACAGGTG...CAGGAGGGCCCATCTGAAAGAGTGCTTTGAG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    724 ACCCTGAAGCGGAACATCCCCAACGTGGATGACAAGAAGACGTCCAATCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106587 ACCCTGAAGCGGAACATCCCCAACGTGGATGACAAGAAGACGTCCAATCT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    774 GAGCGTGCTGCGGACGGCGCTGCGGTACATCCAG         TCCCTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 106637 GAGCGTGCTGCGGACGGCGCTGCGGTACATCCAGGTA...CAGTCCCTGA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    815 AGAGGAAGGAGAAGGAATATGAGCATGAAATGGAGCGGCTGGCACGTGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112671 AGAGGAAGGAGAAGGAATATGAGCATGAAATGGAGCGGCTGGCACGTGAG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    865 AAGATTGCCACGCAGCAGCGGCTGGCAGAGCTCAAGCACGAGCTGAGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112721 AAGATTGCCACGCAGCAGCGGCTGGCAGAGCTCAAGCACGAGCTGAGCCA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    915 GTGGATGGACGTACTGGAGATTGACCGCGTGCTGCGGCAGACGGGCCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112771 GTGGATGGACGTACTGGAGATTGACCGCGTGCTGCGGCAGACGGGCCAGC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    965 CCGAGGATGACCAGGCCTCCACCTCCACCGCCTCTG         AGGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 112821 CCGAGGATGACCAGGCCTCCACCTCCACCGCCTCTGGTG...CAGAGGGT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1006 GAGGACAACATAGACGAGGATATGGAGGAGGACCGGGCGGGCCTGGGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113069 GAGGACAACATAGACGAGGATATGGAGGAGGACCGGGCGGGCCTGGGCCC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1056 ACCTAAGCTGAGCCATCGTCCCCAGCCGGAGCTGCTGAAGTCCACCCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113119 ACCTAAGCTGAGCCATCGTCCCCAGCCGGAGCTGCTGAAGTCCACCCTGC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1106 CACCCCCCAGCACCACCCCTGCGCCTCTGCCTCCACACCCACACCCTCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113169 CACCCCCCAGCACCACCCCTGCGCCTCTGCCTCCACACCCACACCCTCAC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1156 CCCCACTCCGTGGCCCTACCTCCTGCCCACCTCCCCGTGCAGCAGCAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113219 CCCCACTCCGTGGCCCTACCTCCTGCCCACCTCCCCGTGCAGCAGCAGCA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1206 GCCACAGCAGAAGACCCCTCTGCCAGCCCCTCCTCCCCCACCGGCTGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113269 GCCACAGCAGAAGACCCCTCTGCCAGCCCCTCCTCCCCCACCGGCTGCCC

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1256 CTGCCCAGACACTGGTGCCAGCTCCAGCCCATCTGGTGGCGACGGCTGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113319 CTGCCCAGACACTGGTGCCAGCTCCAGCCCATCTGGTGGCGACGGCTGGG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1306 GGTGGCTCCACGGTCATCGCCCACACAGCCACCACTCACGCTTCAGTCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113369 GGTGGCTCCACGGTCATCGCCCACACAGCCACCACTCACGCTTCAGTCAT

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1356 CCAGACTGTGAACCACGTTCTGCAGGGGCCAGGCGGCAAGCACATCGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113419 CCAGACTGTGAACCACGTTCTGCAGGGGCCAGGCGGCAAGCACATCGCCC

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1406 ACATCGCCCCCTCGGCCCCCAGCCCTGCGGTGCAACTGGCGCCTGCCACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113469 ACATCGCCCCCTCGGCCCCCAGCCCTGCGGTGCAACTGGCGCCTGCCACA

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1456 CCCCCCATTGGGCACATCACTGTGCACCCTGCCACCCTCAACCATGTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113519 CCCCCCATTGGGCACATCACTGTGCACCCTGCCACCCTCAACCATGTGGC

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1506 CCACCTGGGCTCCCAGCTGCCCTTGTACCCGCAGCCCGTGGCAGTGAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113569 CCACCTGGGCTCCCAGCTGCCCTTGTACCCGCAGCCCGTGGCAGTGAGCC

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1556 ACATCGCCCACACCCTCTCGCACCAGCAAGTCAACGGCACGGCCGGCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113619 ACATCGCCCACACCCTCTCGCACCAGCAAGTCAACGGCACGGCCGGCCTG

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1606 GGGCCCCCGGCTACTGTCATGGCAAAGCCGGCCGTGGGGGCTCAGGTGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113669 GGGCCCCCGGCTACTGTCATGGCAAAGCCGGCCGTGGGGGCTCAGGTGGT

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1656 GCACCACCCCCAGCTGGTGGGCCAGACCGTGCTCAACCCTGTGACCATGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113719 GCACCACCCCCAGCTGGTGGGCCAGACCGTGCTCAACCCTGTGACCATGG

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :
   1706 TCACCATGCCCTCCTTCCCAGTCAGCACACTCAAGCTGGCT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113769 TCACCATGCCCTCCTTCCCAGTCAGCACACTCAAGCTGGCT