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seq2 = pF1KB8387/gi568815594f_41890652.tfa (gi568815594f:41890652_42186123), 295472 bp

>pF1KB8387 1704
>gi568815594f:41890652_42186123 (Chr4)

1-109  (100001-100109)   100% ->
110-274  (110965-111129)   99% ->
275-334  (127460-127519)   98% ->
335-434  (129765-129864)   99% ->
435-527  (132187-132279)   100% ->
528-610  (132651-132733)   100% ->
611-669  (144624-144682)   100% ->
670-737  (148335-148402)   100% ->
738-840  (158726-158828)   100% ->
841-896  (169540-169595)   100% ->
897-1032  (172335-172470)   100% ->
1033-1072  (174659-174698)   100% ->
1073-1144  (175899-175970)   100% ->
1145-1252  (176434-176541)   100% ->
1253-1418  (179875-180040)   100% ->
1419-1548  (185006-185135)   100% ->
1549-1662  (187561-187674)   100% ->
1663-1704  (195431-195472)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTTACCCGGCTTGGCCGCCGCCGCGGCCCACAGATGTAGCTGGTCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTTACCCGGCTTGGCCGCCGCCGCGGCCCACAGATGTAGCTGGTCCTC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CCTGTGCCGGCTCCGTCTGCGATGCAGGGCGGCGGCCTGTAATCCCAGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CCTGTGCCGGCTCCGTCTGCGATGCAGGGCGGCGGCCTGTAATCCCAGCG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 ACCGCCAGG         AGTGGCAGAATTTAGTGACATTTGGAAGCTTT
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 ACCGCCAGGGTG...TAGAGTGGCAGAATTTAGTGACATTTGGAAGCTTT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 TCAAACGTGGTTCCCTGTAGTCATCCATATATTGGTACCCTGAGTCAAGT
        |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110997 TCAAACATGGTTCCCTGTAGTCATCCATATATTGGTACCCTGAGTCAAGT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 AAAGTTGTACTCCACAAATGTTCAGAAAGAAGGACAGGGATCACAAACAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111047 AAAGTTGTACTCCACAAATGTTCAGAAAGAAGGACAGGGATCACAAACAC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 TCAGAGTGGAAAAAGTACCATCATTTGAAACAG         CAGAAGGT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 111097 TCAGAGTGGAAAAAGTACCATCATTTGAAACAGGTA...CAGCAGAAGGT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 ATAGGCGCAGAACTCAAAGCTCCACTTAAGCAAGAACCTCTCCAAGTAAG
        |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127468 ATAGGCACAGAACTCAAAGCTCCACTTAAGCAAGAACCTCTCCAAGTAAG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 AG         TTAAAGCAGTCCTTAAGAAAAGGGAGTATGGATCAAAGT
        ||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
 127518 AGGTA...TAGTTAAAGCAGTCCTTAAGAAAAGGGAGTATGGCTCAAAGT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 ACACTCAGAATAATTTCATCACTGGAGTCAGAGCGATAAATGAGTTCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129804 ACACTCAGAATAATTTCATCACTGGAGTCAGAGCGATAAATGAGTTCTGC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 CTCAAATCCAG         TGATCTAGAACAACTTCGAAAAATCAGACG
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 129854 CTCAAATCCAGGTA...TAGTGATCTAGAACAACTTCGAAAAATCAGACG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 ACGAAGTCCCCATGAAGATACTGAGTCTTTTACTGTATACTTGAGATCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132217 ACGAAGTCCCCATGAAGATACTGAGTCTTTTACTGTATACTTGAGATCAG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 ATGTGGAAGCAAA         ATCTTTGGAAGTTTGGGGAAGCCCTGAA
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 132267 ATGTGGAAGCAAAGTA...CAGATCTTTGGAAGTTTGGGGAAGCCCTGAA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    556 GCTCTTGCCAGAGAGAAAAAATTGCGTAAGGAAGCAGAAATAGAATACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132679 GCTCTTGCCAGAGAGAAAAAATTGCGTAAGGAAGCAGAAATAGAATACAG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 AGAAA         GGCTATTTAGAAACCAAAAAATATTAAGAGAATACA
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132729 AGAAAGTA...CAGGGCTATTTAGAAACCAAAAAATATTAAGAGAATACA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    647 GAGATTTCTTGGGAAATACCAAG         CCACGCTCCAGAACAGCA
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 144660 GAGATTTCTTGGGAAATACCAAGGTA...CAGCCACGCTCCAGAACAGCA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    688 TCAGTGTTTTTTAAGGGACCAGGAAAAGTGGTGATGGTTGCAATTTGCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 148353 TCAGTGTTTTTTAAGGGACCAGGAAAAGTGGTGATGGTTGCAATTTGCAT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    738          CAATGGATTAAACTGCTTCTTTAAATTTCTTGCCTGGATTT
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 148403 GTA...TAGCAATGGATTAAACTGCTTCTTTAAATTTCTTGCCTGGATTT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    779 ATACCGGTTCAGCAAGTATGTTCTCAGAAGCTATACACTCATTATCTGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 158767 ATACCGGTTCAGCAAGTATGTTCTCAGAAGCTATACACTCATTATCTGAT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    829 ACTTGTAATCAG         GGTTTACTAGCATTGGGCATCAGTAAGTC
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 158817 ACTTGTAATCAGGTG...TAGGGTTTACTAGCATTGGGCATCAGTAAGTC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    870 TGTTCAAACACCAGATCCTTCTCATCC         GTACGGATTTTCAA
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 169569 TGTTCAAACACCAGATCCTTCTCATCCGTA...CAGGTACGGATTTTCAA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    911 ATATGCGCTATATTTCTTCGCTAATTAGTGGTGTTGGTATTTTCATGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 172349 ATATGCGCTATATTTCTTCGCTAATTAGTGGTGTTGGTATTTTCATGATG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    961 GGTGCAGGACTATCTTGGTACCATGGAGTCATGGGATTGCTTCATCCTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 172399 GGTGCAGGACTATCTTGGTACCATGGAGTCATGGGATTGCTTCATCCTCA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1011 ACCAATAGAATCCCTTCTATGG         GCATATTGTATTTTAGCAG
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 172449 ACCAATAGAATCCCTTCTATGGGTA...TAGGCATATTGTATTTTAGCAG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1052 GATCATTAGTATCTGAAGGAG         CAACACTTCTTGTTGCTGTA
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 174678 GATCATTAGTATCTGAAGGAGGTA...TAGCAACACTTCTTGTTGCTGTA

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1093 AATGAACTTCGTAGGAATGCTCGGGCTAAAGGAATGTCATTTTACAAGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 175919 AATGAACTTCGTAGGAATGCTCGGGCTAAAGGAATGTCATTTTACAAGTA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1143 TG         TAATGGAAAGTCGTGATCCTAGTACAAATGTGATATTAT
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 175969 TGGTA...TAGTAATGGAAAGTCGTGATCCTAGTACAAATGTGATATTAT

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1184 TGGAGGATACTGCTGCAGTCTTGGGAGTTATAATAGCAGCCACTTGCATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 176473 TGGAGGATACTGCTGCAGTCTTGGGAGTTATAATAGCAGCCACTTGCATG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1234 GGCCTTACTTCTATAACAG         GCAATCCACTGTATGACAGCCT
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 176523 GGCCTTACTTCTATAACAGGTA...TAGGCAATCCACTGTATGACAGCCT

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1275 AGGTTCTTTGGGTGTGGGCACCTTATTAGGCATGGTCTCAGCATTCCTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 179897 AGGTTCTTTGGGTGTGGGCACCTTATTAGGCATGGTCTCAGCATTCCTCA

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1325 TCTACACTAACACAGAAGCACTCTTAGGGCGGTCCATCCAGCCAGAACAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 179947 TCTACACTAACACAGAAGCACTCTTAGGGCGGTCCATCCAGCCAGAACAA

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1375 GTACAACGGCTCACTGAACTCCTGGAGAATGACCCATCAGTAAG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 179997 GTACAACGGCTCACTGAACTCCTGGAGAATGACCCATCAGTAAGGTC...

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1419    GGCAATTCATGATGTTAAAGCCACAGATCTGGGATTAGGTAAAGTAA
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 185003 CAGGGCAATTCATGATGTTAAAGCCACAGATCTGGGATTAGGTAAAGTAA

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1466 GATTTAAGGCAGAAGTAGATTTTGATGGGCGAGTTGTTACAAGATCATAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 185053 GATTTAAGGCAGAAGTAGATTTTGATGGGCGAGTTGTTACAAGATCATAT

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1516 TTGGAAAAACAAGATTTTGACCAAATGTTACAA         GAAATTCA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 185103 TTGGAAAAACAAGATTTTGACCAAATGTTACAAGTA...TAGGAAATTCA

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1557 AGAAGTGAAAACTCCTGAAGAACTAGAGACCTTTATGCTTAAACATGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 187569 AGAAGTGAAAACTCCTGAAGAACTAGAGACCTTTATGCTTAAACATGGAG

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1607 AAAATATTATTGATACTTTAGGAGCTGAAGTAGATAGACTTGAGAAGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 187619 AAAATATTATTGATACTTTAGGAGCTGAAGTAGATAGACTTGAGAAGGAA

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1657 CTGAAA         AAACGAAATCCTGAAGTTCGACATGTAGATTTGGA
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 187669 CTGAAAGTA...CAGAAACGAAATCCTGAAGTTCGACATGTAGATTTGGA

   1850     .
   1698 GATACTG
        |||||||
 195466 GATACTG