seq1 = pF1KB8377.tfa, 1866 bp
seq2 = pF1KB8377/gi568815589r_34974111.tfa (gi568815589r:34974111_35179524), 205414 bp

>pF1KB8377 1866
>gi568815589r:34974111_35179524 (Chr9)

(complement)

1-84  (100001-100084)   100% ->
85-175  (100284-100374)   100% ->
176-307  (100789-100920)   100% ->
308-510  (101182-101384)   100% ->
511-646  (102126-102261)   100% ->
647-777  (102424-102554)   100% ->
778-924  (102655-102801)   100% ->
925-1076  (102942-103093)   100% ->
1077-1143  (103497-103563)   100% ->
1144-1433  (103771-104060)   100% ->
1434-1480  (104200-104246)   100% ->
1481-1636  (104443-104598)   100% ->
1637-1760  (105031-105154)   100% ->
1761-1866  (105309-105414)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTCCCGCCAGACCACCTCTGTGGGCTCCAGCTGCCTGGACCTGTGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTCCCGCCAGACCACCTCTGTGGGCTCCAGCTGCCTGGACCTGTGGAG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGAAAAGAATGACCGGCTCGTTCGACAGGCCAAG         GTGGCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 100051 GGAAAAGAATGACCGGCTCGTTCGACAGGCCAAGGTA...CAGGTGGCTC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 AGAACTCCGGTCTGACTCTGAGGCGACAGCAGTTGGCTCAGGATGCACTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100291 AGAACTCCGGTCTGACTCTGAGGCGACAGCAGTTGGCTCAGGATGCACTG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GAAGGGCTCAGAGGGCTCCTCCATAGTCTGCAAG         GGCTCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 100341 GAAGGGCTCAGAGGGCTCCTCCATAGTCTGCAAGGTA...CAGGGCTCCC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 TGCAGCTGTTCCTGTTCTTCCCTTGGAGCTGACTGTCACCTGCAACTTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100796 TGCAGCTGTTCCTGTTCTTCCCTTGGAGCTGACTGTCACCTGCAACTTCA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 TTATCCTGAGGGCAAGCTTGGCCCAGGGTTTCACAGAGGATCAGGCCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100846 TTATCCTGAGGGCAAGCTTGGCCCAGGGTTTCACAGAGGATCAGGCCCAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 GATATCCAGCGGAGCCTAGAGAGAG         TGCTGGAGACACAGGA
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 100896 GATATCCAGCGGAGCCTAGAGAGAGGTG...CAGTGCTGGAGACACAGGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 GCAGCAGGGGCCCAGGTTGGAACAGGGGCTCAGGGAGCTGTGGGACTCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101198 GCAGCAGGGGCCCAGGTTGGAACAGGGGCTCAGGGAGCTGTGGGACTCTG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 TCCTTCGTGCTTCCTGCCTTCTGCCGGAGCTGCTGTCTGCCCTGCACCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101248 TCCTTCGTGCTTCCTGCCTTCTGCCGGAGCTGCTGTCTGCCCTGCACCGC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 CTGGTTGGCCTGCAGGCTGCCCTCTGGTTGAGTGCTGACCGTCTTGGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101298 CTGGTTGGCCTGCAGGCTGCCCTCTGGTTGAGTGCTGACCGTCTTGGGGA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 CCTGGCCTTGTTACTAGAGACCCTGAATGGCAGCCAG         AGTG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 101348 CCTGGCCTTGTTACTAGAGACCCTGAATGGCAGCCAGGTA...CAGAGTG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 GAGCCTCTAAGGATCTGCTGTTACTTCTGAAAACTTGGAGTCCCCCAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102130 GAGCCTCTAAGGATCTGCTGTTACTTCTGAAAACTTGGAGTCCCCCAGCT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 GAGGAATTAGATGCTCCATTGACCCTGCAGGATGCCCAGGGATTGAAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102180 GAGGAATTAGATGCTCCATTGACCCTGCAGGATGCCCAGGGATTGAAGGA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 TGTCCTCCTGACAGCATTTGCCTACCGCCAAG         GTCTCCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 102230 TGTCCTCCTGACAGCATTTGCCTACCGCCAAGGTC...CAGGTCTCCAGG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    656 AGCTGATCACAGGGAACCCAGACAAGGCACTAAGCAGCCTTCATGAAGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102433 AGCTGATCACAGGGAACCCAGACAAGGCACTAAGCAGCCTTCATGAAGCG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 GCCTCAGGCCTGTGTCCACGGCCTGTGTTGGTCCAGGTGTACACAGCACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102483 GCCTCAGGCCTGTGTCCACGGCCTGTGTTGGTCCAGGTGTACACAGCACT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 GGGGTCCTGTCACCGTAAGATG         GGAAATCCACAGAGAGCAC
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 102533 GGGGTCCTGTCACCGTAAGATGGTA...TAGGGAAATCCACAGAGAGCAC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    797 TGTTGTACTTGGTTGCAGCCCTGAAAGAGGGATCAGCCTGGGGTCCTCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102674 TGTTGTACTTGGTTGCAGCCCTGAAAGAGGGATCAGCCTGGGGTCCTCCA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    847 CTTCTGGAGGCCTCTAGGCTCTATCAGCAACTGGGGGACACAACAGCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102724 CTTCTGGAGGCCTCTAGGCTCTATCAGCAACTGGGGGACACAACAGCAGA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    897 GCTGGAGAGTCTGGAGCTGCTAGTTGAG         GCCTTGAATGTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 102774 GCTGGAGAGTCTGGAGCTGCTAGTTGAGGTA...TAGGCCTTGAATGTCC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    938 CATGCAGTTCCAAAGCCCCGCAGTTTCTCATTGAGGTAGAATTACTACTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102955 CATGCAGTTCCAAAGCCCCGCAGTTTCTCATTGAGGTAGAATTACTACTG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    988 CCACCACCTGACCTAGCCTCACCCCTTCATTGTGGCACTCAGAGCCAGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103005 CCACCACCTGACCTAGCCTCACCCCTTCATTGTGGCACTCAGAGCCAGAC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1038 CAAGCACATACTAGCAAGCAGGTGCCTACAGACGGGGAG         GG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 103055 CAAGCACATACTAGCAAGCAGGTGCCTACAGACGGGGAGGTG...CAGGG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1079 CAGGAGACGCTGCAGAGCATTACTTGGACCTGCTGGCCCTGTTGCTGGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103499 CAGGAGACGCTGCAGAGCATTACTTGGACCTGCTGGCCCTGTTGCTGGAT

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1129 AGCTCGGAGCCAAGG         TTCTCCCCACCCCCCTCCCCTCCAGG
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 103549 AGCTCGGAGCCAAGGGTG...CAGTTCTCCCCACCCCCCTCCCCTCCAGG

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1170 GCCCTGTATGCCTGAGGTGTTTTTGGAGGCAGCGGTAGCACTGATCCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103797 GCCCTGTATGCCTGAGGTGTTTTTGGAGGCAGCGGTAGCACTGATCCAGG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1220 CAGGCAGAGCCCAAGATGCCTTGACTCTATGTGAGGAGTTGCTCAGCCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103847 CAGGCAGAGCCCAAGATGCCTTGACTCTATGTGAGGAGTTGCTCAGCCGC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1270 ACATCATCTCTGCTACCCAAGATGTCCCGGCTGTGGGAAGATGCCAGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103897 ACATCATCTCTGCTACCCAAGATGTCCCGGCTGTGGGAAGATGCCAGAAA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1320 AGGAACCAAGGAACTGCCATACTGCCCACTCTGGGTCTCTGCCACCCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103947 AGGAACCAAGGAACTGCCATACTGCCCACTCTGGGTCTCTGCCACCCACC

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1370 TGCTTCAGGGCCAGGCCTGGGTTCAACTGGGTGCCCAAAAAGTGGCAATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103997 TGCTTCAGGGCCAGGCCTGGGTTCAACTGGGTGCCCAAAAAGTGGCAATT

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1420 AGTGAATTTAGCAG         GTGCCTCGAGCTGCTCTTCCGGGCCAC
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 104047 AGTGAATTTAGCAGGTG...CAGGTGCCTCGAGCTGCTCTTCCGGGCCAC

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1461 ACCTGAGGAAAAAGAACAAG         GGGCAGCTTTCAACTGTGAGC
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 104227 ACCTGAGGAAAAAGAACAAGGTG...CAGGGGCAGCTTTCAACTGTGAGC

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1502 AGGGATGTAAGTCAGATGCGGCACTGCAGCAGCTTCGGGCAGCCGCCCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104464 AGGGATGTAAGTCAGATGCGGCACTGCAGCAGCTTCGGGCAGCCGCCCTA

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1552 ATTAGTCGTGGACTGGAATGGGTAGCCAGCGGCCAGGATACCAAAGCCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104514 ATTAGTCGTGGACTGGAATGGGTAGCCAGCGGCCAGGATACCAAAGCCTT

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1602 ACAGGACTTCCTCCTCAGTGTGCAGATGTGCCCAG         GTAATC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 104564 ACAGGACTTCCTCCTCAGTGTGCAGATGTGCCCAGGTA...CAGGTAATC

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1643 GAGACACTTACTTTCACCTGCTTCAGACTCTGAAGAGGCTAGATCGGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105037 GAGACACTTACTTTCACCTGCTTCAGACTCTGAAGAGGCTAGATCGGAGG

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1693 GATGAGGCCACTGCACTCTGGTGGAGGCTGGAGGCCCAAACTAAGGGGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105087 GATGAGGCCACTGCACTCTGGTGGAGGCTGGAGGCCCAAACTAAGGGGTC

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1743 ACATGAAGATGCTCTGTG         GTCTCTCCCCCTGTACCTAGAAA
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 105137 ACATGAAGATGCTCTGTGGTG...CAGGTCTCTCCCCCTGTACCTAGAAA

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1784 GCTATTTGAGCTGGATCCGTCCCTCTGATCGTGACGCCTTCCTTGAAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105332 GCTATTTGAGCTGGATCCGTCCCTCTGATCGTGACGCCTTCCTTGAAGAA

   1950     .    :    .    :    .    :
   1834 TTTCGGACATCTCTGCCAAAGTCTTGTGACCTG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||
 105382 TTTCGGACATCTCTGCCAAAGTCTTGTGACCTG