seq1 = pF1KB8374.tfa, 1884 bp
seq2 = pF1KB8374/gi568815591f_95704730.tfa (gi568815591f:95704730_96197590), 492861 bp

>pF1KB8374 1884
>gi568815591f:95704730_96197590 (Chr7)

1-108  (100001-100108)   100% ->
109-223  (105663-105777)   100% ->
224-314  (108518-108608)   100% ->
315-374  (123328-123387)   100% ->
375-490  (165154-165269)   100% ->
491-580  (272783-272872)   100% ->
581-743  (280086-280248)   100% ->
744-843  (282327-282426)   100% ->
844-969  (291219-291344)   100% ->
970-1116  (323446-323592)   100% ->
1117-1230  (327938-328051)   100% ->
1231-1364  (330890-331023)   100% ->
1365-1509  (334548-334692)   100% ->
1510-1650  (371328-371468)   100% ->
1651-1776  (375634-375759)   100% ->
1777-1884  (392754-392861)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTCTGACAAAAGTGACTTAAAAGCTGAGCTAGAGCGCAAAAAGCAGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTCTGACAAAAGTGACTTAAAAGCTGAGCTAGAGCGCAAAAAGCAGCG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CTTAGCACAGATAAGAGAAGAGAAGAAACGGAAGGAAGAGGAGAGGAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CTTAGCACAGATAAGAGAAGAGAAGAAACGGAAGGAAGAGGAGAGGAAAA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 AGAAAGAG         GCTGATATGCAGCAGAAGAAAGAACCCGTTCAG
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 AGAAAGAGGTA...TAGGCTGATATGCAGCAGAAGAAAGAACCCGTTCAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GACGACTCTGATCTGGATCGCAAACGACGAGAGACAGAGGCTTTGCTGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105696 GACGACTCTGATCTGGATCGCAAACGACGAGAGACAGAGGCTTTGCTGCA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 AAGCATTGGTATCTCACCGGAGCCGCCTCTAG         TCCCAACCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 105746 AAGCATTGGTATCTCACCGGAGCCGCCTCTAGGTA...TAGTCCCAACCC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 CTATGTCTCCCTCCTCGAAATCAGTGAGCACTCCCAGTGAAGCTGGAAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108527 CTATGTCTCCCTCCTCGAAATCAGTGAGCACTCCCAGTGAAGCTGGAAGC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 CAAGACTCAGGCGATCTGGGGCCATTAACAAG         GACCCTGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 108577 CAAGACTCAGGCGATCTGGGGCCATTAACAAGGTA...TAGGACCCTGCA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 GTGGGACACAGACCCCTCAGTGCTCCAGCTGCAGTCAGACTCAGAACTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123337 GTGGGACACAGACCCCTCAGTGCTCCAGCTGCAGTCAGACTCAGAACTTG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 G         AAGAAGACTGCATAAACTGGGCGTGTCAAAGGTCACCCAA
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123387 GGTA...CAGAAGAAGACTGCATAAACTGGGCGTGTCAAAGGTCACCCAA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    415 GTGGATTTCCTGCCAAGGGAAGTAGTGTCCTACTCAAAGGAGACCCAGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 165194 GTGGATTTCCTGCCAAGGGAAGTAGTGTCCTACTCAAAGGAGACCCAGAC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 TCCTCTTGCCACGCATCAGTCTGAAG         AGGATGAGGAAGATG
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 165244 TCCTCTTGCCACGCATCAGTCTGAAGGTA...TAGAGGATGAGGAAGATG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    506 AGGAAATGGTGGAATCTAAAGTTGGCCAGGACTCAGAACTGGAAAATCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 272798 AGGAAATGGTGGAATCTAAAGTTGGCCAGGACTCAGAACTGGAAAATCAG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    556 GACAAAAAACAGGAAGTGAAGGAAG         CCCCTCCAAGAGAGTT
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 272848 GACAAAAAACAGGAAGTGAAGGAAGGTA...AAGCCCCTCCAAGAGAGTT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    597 GACAGAGGAAGAAAAACAGCAGATCCTTCATTCAGAGGAATTTCTCATCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 280102 GACAGAGGAAGAAAAACAGCAGATCCTTCATTCAGAGGAATTTCTCATCT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    647 TTTTTGACCGGACAATACGGGTAATTGAAAGAGCCCTGGCTGAAGATTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 280152 TTTTTGACCGGACAATACGGGTAATTGAAAGAGCCCTGGCTGAAGATTCC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    697 GACATCTTTTTTGACTACAGCGGCCGAGAGTTAGAGGAAAAAGATGG   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 280202 GACATCTTTTTTGACTACAGCGGCCGAGAGTTAGAGGAAAAAGATGGGTT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    744       GGATGTTCAGGCTGGAGCCAATCTTTCTTTCAATCGTCAGTTCT
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 280252 ...TAGGGATGTTCAGGCTGGAGCCAATCTTTCTTTCAATCGTCAGTTCT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    788 ATGATGAACATTGGTCCAAGCATCGAGTGGTCACTTGTATGGACTGGTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 282371 ATGATGAACATTGGTCCAAGCATCGAGTGGTCACTTGTATGGACTGGTCC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    838 CTCCAG         TACCCTGAGCTGATGGTGGCTTCTTACAACAACAA
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 282421 CTCCAGGTA...TAGTACCCTGAGCTGATGGTGGCTTCTTACAACAACAA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    879 TGAAGATGCTCCCCATGAACCAGATGGAGTGGCCTTGGTTTGGAACATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 291254 TGAAGATGCTCCCCATGAACCAGATGGAGTGGCCTTGGTTTGGAACATGA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    929 AGTTTAAGAAAACCACACCAGAATACGTCTTCCACTGTCAG         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 291304 AGTTTAAGAAAACCACACCAGAATACGTCTTCCACTGTCAGGTA...CAG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    970 TCCTCTGTGATGTCGGTCTGCTTCGCCCGTTTCCATCCTAACTTGGTGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 323446 TCCTCTGTGATGTCGGTCTGCTTCGCCCGTTTCCATCCTAACTTGGTGGT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1020 TGGTGGGACTTACTCGGGCCAGATTGTCCTCTGGGACAATCGCAGTCATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 323496 TGGTGGGACTTACTCGGGCCAGATTGTCCTCTGGGACAATCGCAGTCATC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1070 GAAGGACTCCAGTGCAGCGGACACCCTTATCAGCTGCTGCACACACG   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 323546 GAAGGACTCCAGTGCAGCGGACACCCTTATCAGCTGCTGCACACACGGTA

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1117       CATCCCGTGTACTGTGTAAATGTTGTTGGGACCCAGAATGCTCA
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 323596 ...CAGCATCCCGTGTACTGTGTAAATGTTGTTGGGACCCAGAATGCTCA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1161 TAACCTCATCACTGTCTCCACTGATGGCAAAATGTGTTCCTGGAGCCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 327982 TAACCTCATCACTGTCTCCACTGATGGCAAAATGTGTTCCTGGAGCCTGG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1211 ACATGCTCTCAACTCCACAG         GAGAGCATGGAGCTGGTGTAC
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 328032 ACATGCTCTCAACTCCACAGGTG...TAGGAGAGCATGGAGCTGGTGTAC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1252 AATAAGTCCAAGCCTGTCGCTGTTACCGGAATGGCTTTCCCAACGGGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 330911 AATAAGTCCAAGCCTGTCGCTGTTACCGGAATGGCTTTCCCAACGGGAGA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1302 CGTCAATAACTTCGTGGTTGGCAGTGAGGAAGGTACAGTCTACACGGCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 330961 CGTCAATAACTTCGTGGTTGGCAGTGAGGAAGGTACAGTCTACACGGCTT

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1352 GTCGTCATGGAAG         CAAAGCAGGTATTGGTGAGGTCTTTGAA
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 331011 GTCGTCATGGAAGGTG...CAGCAAAGCAGGTATTGGTGAGGTCTTTGAA

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1393 GGTCACCAAGGGCCAGTGACAGGAATTAACTGCCACATGGCAGTGGGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 334576 GGTCACCAAGGGCCAGTGACAGGAATTAACTGCCACATGGCAGTGGGCCC

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1443 AATCGACTTTTCTCACCTGTTTGTCACATCATCATTTGACTGGACTGTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 334626 AATCGACTTTTCTCACCTGTTTGTCACATCATCATTTGACTGGACTGTCA

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1493 AACTGTGGACCACCAAG         CACAACAAGCCGCTCTACTCCTTT
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 334676 AACTGTGGACCACCAAGGTA...CAGCACAACAAGCCGCTCTACTCCTTT

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1534 GAAGACAATGCAGACTATGTGTACGATGTCATGTGGTCCCCCGTGCATCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 371352 GAAGACAATGCAGACTATGTGTACGATGTCATGTGGTCCCCCGTGCATCC

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1584 TGCGCTTTTTGCCTGCGTGGACGGGATGGGGCGCTTGGACCTCTGGAACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 371402 TGCGCTTTTTGCCTGCGTGGACGGGATGGGGCGCTTGGACCTCTGGAACC

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1634 TCAACAATGACACCGAG         GTTCCAACAGCAAGTGTGGCCATT
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 371452 TCAACAATGACACCGAGGTG...CAGGTTCCAACAGCAAGTGTGGCCATT

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1675 GAGGGGGCATCCGCCCTAAACCGTGTTCGTTGGGCCCAAGCTGGCAAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 375658 GAGGGGGCATCCGCCCTAAACCGTGTTCGTTGGGCCCAAGCTGGCAAAGA

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1725 AGTTGCTGTTGGGGACTCGGAAGGCCGTATTTGGGTCTATGACGTTGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 375708 AGTTGCTGTTGGGGACTCGGAAGGCCGTATTTGGGTCTATGACGTTGGAG

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1775 AG         CTTGCAGTTCCCCACAATGATGAATGGACCCGATTTGCC
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 375758 AGGTA...CAGCTTGCAGTTCCCCACAATGATGAATGGACCCGATTTGCC

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1816 AGGACCCTTGTGGAAATTCGTGCTAACAGAGCTGATAGCGAGGAGGAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 392793 AGGACCCTTGTGGAAATTCGTGCTAACAGAGCTGATAGCGAGGAGGAAGG

   2000     .    :    .
   1866 CACTGTTGAGTTATCTGCC
        |||||||||||||||||||
 392843 CACTGTTGAGTTATCTGCC