seq1 = pF1KB8372.tfa, 495 bp
seq2 = pF1KB8372/gi568815597f_67585495.tfa (gi568815597f:67585495_67787771), 202277 bp

>pF1KB8372 495
>gi568815597f:67585495_67787771 (Chr1)

1-44  (100001-100044)   100% ->
45-146  (100531-100632)   100% ->
147-384  (100856-101093)   100% ->
385-495  (102167-102277)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGACTTTGGAGGAATTCTCGGCTGGAGAGCAGAAGACCGAAAG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 100001 ATGACTTTGGAGGAATTCTCGGCTGGAGAGCAGAAGACCGAAAGGTG...

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     45    GATGGATAAGGTGGGGGATGCCCTGGAGGAAGTGCTCAGCAAAGCCC
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100528 TAGGATGGATAAGGTGGGGGATGCCCTGGAGGAAGTGCTCAGCAAAGCCC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 TGAGTCAGCGCACGATCACTGTCGGGGTGTACGAAGCGGCCAAGCTGCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100578 TGAGTCAGCGCACGATCACTGTCGGGGTGTACGAAGCGGCCAAGCTGCTC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 AACGT         CGACCCCGATAACGTGGTGTTGTGCCTGCTGGCGGC
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100628 AACGTGTA...CAGCGACCCCGATAACGTGGTGTTGTGCCTGCTGGCGGC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 GGACGAGGACGACGACAGAGATGTGGCTCTGCAGATCCACTTCACCCTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100892 GGACGAGGACGACGACAGAGATGTGGCTCTGCAGATCCACTTCACCCTGA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 TCCAGGCGTTTTGCTGCGAGAACGACATCAACATCCTGCGCGTCAGCAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100942 TCCAGGCGTTTTGCTGCGAGAACGACATCAACATCCTGCGCGTCAGCAAC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 CCGGGCCGGCTGGCGGAGCTCCTGCTCTTGGAGACCGACGCTGGCCCCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100992 CCGGGCCGGCTGGCGGAGCTCCTGCTCTTGGAGACCGACGCTGGCCCCGC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 GGCGAGCGAGGGCGCCGAGCAGCCCCCGGACCTGCACTGCGTGCTGGTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101042 GGCGAGCGAGGGCGCCGAGCAGCCCCCGGACCTGCACTGCGTGCTGGTGA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 CG         AATCCACATTCATCTCAATGGAAGGATCCTGCCTTAAGT
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101092 CGGTA...CAGAATCCACATTCATCTCAATGGAAGGATCCTGCCTTAAGT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 CAACTTATTTGTTTTTGCCGGGAAAGTCGCTACATGGATCAATGGGTTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102206 CAACTTATTTGTTTTTGCCGGGAAAGTCGCTACATGGATCAATGGGTTCC

    500     .    :    .    :
    474 AGTGATTAATCTCCCTGAACGG
        ||||||||||||||||||||||
 102256 AGTGATTAATCTCCCTGAACGG