seq1 = pF1KB8370.tfa, 483 bp
seq2 = pF1KB8370/gi568815578f_45308468.tfa (gi568815578f:45308468_45510137), 201670 bp

>pF1KB8370 483
>gi568815578f:45308468_45510137 (Chr20)

1-139  (100001-100139)   100% ->
140-277  (100334-100471)   100% ->
278-483  (101465-101670)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGACCCAAATCCTCGGGCCGCCCTGGAGCGCCAGCAGCTCCGCCTTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGACCCAAATCCTCGGGCCGCCCTGGAGCGCCAGCAGCTCCGCCTTCG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGAGCGGCAAAAATTCTTCGAGGACATTTTACAGCCAGAGACAGAGTTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GGAGCGGCAAAAATTCTTCGAGGACATTTTACAGCCAGAGACAGAGTTTG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TCTTTCCTCTGTCCCATCTGCATCTCGAGTCGCAGAGAC         CC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 100101 TCTTTCCTCTGTCCCATCTGCATCTCGAGTCGCAGAGACGTA...CAGCC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 CCCATAGGTAGTATCTCATCCATGGAAGTGAATGTGGACACACTGGAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100336 CCCATAGGTAGTATCTCATCCATGGAAGTGAATGTGGACACACTGGAGCA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 AGTAGAACTTATTGACCTTGGGGACCCGGATGCAGCAGATGTGTTCTTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100386 AGTAGAACTTATTGACCTTGGGGACCCGGATGCAGCAGATGTGTTCTTGC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 CTTGCGAAGATCCTCCACCAACCCCCCAGTCGTCTG         GGGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|| ||
 100436 CTTGCGAAGATCCTCCACCAACCCCCCAGTCGTCTGGTA...CAGGGATG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 GACAACCATTTGGAGGAGCTGAGCCTGCCGGTGCCTACATCAGACAGGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101470 GACAACCATTTGGAGGAGCTGAGCCTGCCGGTGCCTACATCAGACAGGAC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 CACATCTAGGACCTCCTCCTCCTCCTCCTCCGACTCCTCCACCAACCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101520 CACATCTAGGACCTCCTCCTCCTCCTCCTCCGACTCCTCCACCAACCTGC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 ATAGCCCAAATCCAAGTGATGATGGAGCAGATACGCCCTTGGCACAGTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101570 ATAGCCCAAATCCAAGTGATGATGGAGCAGATACGCCCTTGGCACAGTCG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 GATGAAGAGGAGGAAAGGGGTGATGGAGGGGCAGAGCCTGGAGCCTGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101620 GATGAAGAGGAGGAAAGGGGTGATGGAGGGGCAGAGCCTGGAGCCTGCAG

    500 
    483 C
        |
 101670 C