seq1 = pF1KB8365.tfa, 1416 bp
seq2 = pF1KB8365/gi568815584r_37491368.tfa (gi568815584r:37491368_37694972), 203605 bp

>pF1KB8365 1416
>gi568815584r:37491368_37694972 (Chr14)

(complement)

1-72  (100001-100072)   100% ->
73-1416  (102262-103605)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTTAGGAACTGTGAAGATGGAAGGGCATGAAACCAGCGACTGGAACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTTAGGAACTGTGAAGATGGAAGGGCATGAAACCAGCGACTGGAACAG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CTACTACGCAGACACGCAGGAG         GCCTACTCCTCCGTCCCGG
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 100051 CTACTACGCAGACACGCAGGAGGTG...CAGGCCTACTCCTCCGTCCCGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 TCAGCAACATGAACTCAGGCCTGGGCTCCATGAACTCCATGAACACCTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102281 TCAGCAACATGAACTCAGGCCTGGGCTCCATGAACTCCATGAACACCTAC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 ATGACCATGAACACCATGACTACGAGCGGCAACATGACCCCGGCGTCCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102331 ATGACCATGAACACCATGACTACGAGCGGCAACATGACCCCGGCGTCCTT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CAACATGTCCTATGCCAACCCGGGCCTAGGGGCCGGCCTGAGTCCCGGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102381 CAACATGTCCTATGCCAACCCGGGCCTAGGGGCCGGCCTGAGTCCCGGCG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 CAGTAGCCGGCATGCCGGGGGGCTCGGCGGGCGCCATGAACAGCATGACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102431 CAGTAGCCGGCATGCCGGGGGGCTCGGCGGGCGCCATGAACAGCATGACT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 GCGGCCGGCGTGACGGCCATGGGTACGGCGCTGAGCCCGAGCGGCATGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102481 GCGGCCGGCGTGACGGCCATGGGTACGGCGCTGAGCCCGAGCGGCATGGG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 CGCCATGGGTGCGCAGCAGGCGGCCTCCATGAATGGCCTGGGCCCCTACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102531 CGCCATGGGTGCGCAGCAGGCGGCCTCCATGAATGGCCTGGGCCCCTACG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 CGGCCGCCATGAACCCGTGCATGAGCCCCATGGCGTACGCGCCGTCCAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102581 CGGCCGCCATGAACCCGTGCATGAGCCCCATGGCGTACGCGCCGTCCAAC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 CTGGGCCGCAGCCGCGCGGGCGGCGGCGGCGACGCCAAGACGTTCAAGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102631 CTGGGCCGCAGCCGCGCGGGCGGCGGCGGCGACGCCAAGACGTTCAAGCG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    492 CAGCTACCCGCACGCCAAGCCGCCCTACTCGTACATCTCGCTCATCACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102681 CAGCTACCCGCACGCCAAGCCGCCCTACTCGTACATCTCGCTCATCACCA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    542 TGGCCATCCAGCAGGCGCCCAGCAAGATGCTCACGCTGAGCGAGATCTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102731 TGGCCATCCAGCAGGCGCCCAGCAAGATGCTCACGCTGAGCGAGATCTAC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    592 CAGTGGATCATGGACCTCTTCCCCTATTACCGGCAGAACCAGCAGCGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102781 CAGTGGATCATGGACCTCTTCCCCTATTACCGGCAGAACCAGCAGCGCTG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    642 GCAGAACTCCATCCGCCACTCGCTGTCCTTCAATGACTGCTTCGTCAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102831 GCAGAACTCCATCCGCCACTCGCTGTCCTTCAATGACTGCTTCGTCAAGG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    692 TGGCACGCTCCCCGGACAAGCCGGGCAAGGGCTCCTACTGGACGCTGCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102881 TGGCACGCTCCCCGGACAAGCCGGGCAAGGGCTCCTACTGGACGCTGCAC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    742 CCGGACTCCGGCAACATGTTCGAGAACGGCTGCTACTTGCGCCGCCAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102931 CCGGACTCCGGCAACATGTTCGAGAACGGCTGCTACTTGCGCCGCCAGAA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    792 GCGCTTCAAGTGCGAGAAGCAGCCGGGGGCCGGCGGCGGGGGCGGGAGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102981 GCGCTTCAAGTGCGAGAAGCAGCCGGGGGCCGGCGGCGGGGGCGGGAGCG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    842 GAAGCGGGGGCAGCGGCGCCAAGGGCGGCCCTGAGAGCCGCAAGGACCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103031 GAAGCGGGGGCAGCGGCGCCAAGGGCGGCCCTGAGAGCCGCAAGGACCCC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    892 TCTGGCGCCTCTAACCCCAGCGCCGACTCGCCCCTCCATCGGGGTGTGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103081 TCTGGCGCCTCTAACCCCAGCGCCGACTCGCCCCTCCATCGGGGTGTGCA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    942 CGGGAAGACCGGCCAGCTAGAGGGCGCGCCGGCCCCCGGGCCCGCCGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103131 CGGGAAGACCGGCCAGCTAGAGGGCGCGCCGGCCCCCGGGCCCGCCGCCA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    992 GCCCCCAGACTCTGGACCACAGTGGGGCGACGGCGACAGGGGGCGCCTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103181 GCCCCCAGACTCTGGACCACAGTGGGGCGACGGCGACAGGGGGCGCCTCG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1042 GAGTTGAAGACTCCAGCCTCCTCAACTGCGCCCCCCATAAGCTCCGGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103231 GAGTTGAAGACTCCAGCCTCCTCAACTGCGCCCCCCATAAGCTCCGGGCC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1092 CGGGGCGCTGGCCTCTGTGCCCGCCTCTCACCCGGCACACGGCTTGGCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103281 CGGGGCGCTGGCCTCTGTGCCCGCCTCTCACCCGGCACACGGCTTGGCAC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1142 CCCACGAGTCCCAGCTGCACCTGAAAGGGGACCCCCACTACTCCTTCAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103331 CCCACGAGTCCCAGCTGCACCTGAAAGGGGACCCCCACTACTCCTTCAAC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1192 CACCCGTTCTCCATCAACAACCTCATGTCCTCCTCGGAGCAGCAGCATAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103381 CACCCGTTCTCCATCAACAACCTCATGTCCTCCTCGGAGCAGCAGCATAA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1242 GCTGGACTTCAAGGCATACGAACAGGCACTGCAATACTCGCCTTACGGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103431 GCTGGACTTCAAGGCATACGAACAGGCACTGCAATACTCGCCTTACGGCT

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1292 CTACGTTGCCCGCCAGCCTGCCTCTAGGCAGCGCCTCGGTGACCACCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103481 CTACGTTGCCCGCCAGCCTGCCTCTAGGCAGCGCCTCGGTGACCACCAGG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1342 AGCCCCATCGAGCCCTCAGCCCTGGAGCCGGCGTACTACCAAGGTGTGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103531 AGCCCCATCGAGCCCTCAGCCCTGGAGCCGGCGTACTACCAAGGTGTGTA

   1400     .    :    .    :    .
   1392 TTCCAGACCCGTCCTAAACACTTCC
        |||||||||||||||||||||||||
 103581 TTCCAGACCCGTCCTAAACACTTCC