seq1 = pF1KB8364.tfa, 1449 bp
seq2 = pF1KB8364/gi568815590f_61478220.tfa (gi568815590f:61478220_61679668), 201449 bp

>pF1KB8364 1449
>gi568815590f:61478220_61679668 (Chr8)

1-1449  (100001-101449)   97%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTCCATCAGGGTGACCCAGAAGTCCTACAAGGTGTCCACCTCTGGCCC
        |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTCCATCAGGGTGATCCAGAAGTCCTACAAGGTGTCCACCTCTGGCCC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CCGGGCCTTCAGCAGCCGCTCCTACACGAGTGGGCCCGGTTCCCGCATCA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||
 100051 CCGGGCCTTCAGCAGCCGCTCCTACACGAGTGGGCCCGGTGCCCACATCA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GCTCCTCGAGCTTCTCCCGAGTGGGCAGCAGCAACTTTCGCGGTGGCCTG
        ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||
 100101 GCTCCTCGAGCTTCTCCTGAGTGGGCAGCAGCAGCTTTCGGGGTGGCCTG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GGCGGCGGCTATGGTGGGGCCAGCGGCATGGGAGGCATCACCGCAGTTAC
        || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | 
 100151 GGAGGCGGCTATAGTGGGGCCAGCGGCATGGGAGGCATCACCGCAGTCAT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GGTCAACCAGAGCCTGCTGAGCCCCCTTGTCCTGGAGGTGGACCCCAACA
        ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 GGTCAACCAGAGCCTACTGAGCCCCCTTGTCCTGGAGGTGGACCCCAACA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TCCAGGCCGTGCGCACCCAGGAGAAGGAGCAGATCAAGACCCTCAACAAC
        ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 TCCAGGCTGTGTGCACCCAGGAGAAGGAGCAGATCAAGACCCTCAACAAC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 AAGTTTGCCTCCTTCATAGACAAGGTACGGTTCCTGGAGCAGCAGAACAA
        |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 AAGTTTGCCTCCTTCACAGACAAGGTACGGTTCCTGGAGCAGCAGAACAA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 GATGCTGGAGACCAAGTGGAGCCTCCTGCAGCAGCAGAAGACGGCTCGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
 100351 GATGCTGGAGACCAAGTGGAGCCTCCTGCAGCAGCAGAAGATGGCTCGGA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 GCAACATGGACAACATGTTCGAGAGCTACATCAACAACCTTAGGCGGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 GCAACATGGACAACATGTTCGAGAGCTACATCAACAACCTTAGGCGGCAG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 CTGGAGACTCTGGGCCAGGAGAAGCTGAAGCTGGAGGCGGAGCTTGGCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 CTGGAGACTCTGGGCCAGGAGAAGCTGAAGCTGGAGGCGGAGCTTGGCAA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 CATGCAGGGGCTGGTGGAGGACTTCAAGAACAAGTATGAGGATGAGATCA
        ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 CATGCAGAGGCTGGTGGAGGACTTCAAGAACAAGTATGAGGATGAGATCA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 ATAAGCGTACAGAGATGGAGAACGAATTTGTCCTCATCAAGAAGGATGTG
        |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
 100551 ATAAGCATACAGAGATGGAGAATGAATTTGTCCTCATCAAGAAGGATGTG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 GATGTAGCTTACATGAACAAGGTAGAGCTGGAGTCTCGCCTGGAAGGGCT
        |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 GATGAAGCTTACATGAACAAGGTAGAGCTGGAGTCTCGCCTGGAAGGGCT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 GACCGACGAGATCAACTTCCTCAGGCAGCTATATGAAGAGGAGATCCGGG
        ||| |||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||
 100651 GACTGACGAGATCAACTTCCTCAGGCAGCTGTACGAAAAGGAGATCCGGG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 AGCTGCAGTCCCAGATCTCGGACACATCTGTGGTGCTGTCCATGGACAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 AGCTGCAGTCCCAGATCTCGGACACATCTGTGGTGCTGTCCATGGACAAC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 AGCCGCTCCCTGGACATGGACAGCATCATTGCTGAGGTCAAGGCACAGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 AGCCGCTCCCTGGACATGGACAGCATCATTGCTGAGGTCAAGGCACAGTA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 CGAGGATATTGCCAACCGCAGCCGGGCTGAGGCTGAGAGCATGTACCAGA
        |||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||
 100801 CGAGGATATTGCCAACCAAAGACGGGCTGAGGCTGAGAGCATGTACCAGA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 TCAAGTATGAGGAGCTGCAGAGCCTGGCTGGGAAGCACGGGGATGACCTG
        |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
 100851 TCAAGTATGAGGAGCTGCAGAGTCTGGCTGGGAAGCACGGGGATGACCTG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 CGGCGCACAAAGACTGAGATCTCTGAGATGAACCGGAACATCAGCCGGCT
         |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||
 100901 TGGCGCACAAAGACTGAGATCTCTGAGATGAACTGGAACATCAGCCAGCT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    951 CCAGGCTGAGATTGAGGGCCTCAAAGGCCAGAGGGCTTCCCTGGAGGCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100951 CCAGGCTGAGATTGAGGGCCTCAAAGGCCAGAGGGCTTCCCTGGAGGCCG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1001 CCATTGCAGATGCCGAGCAGCGTGGAGAGCTGGCCATTAAGGATGCCAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101001 CCATTGCAGATGCCGAGCAGCGTGGAGAGCTGGCCATTAAGGATGCCAAC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1051 GCCAAGTTGTCCGAGCTGGAGGCCGCCCTGCAGCGGGCCAAGCAGGACAT
        ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
 101051 GCCAAGTTGTCCGAGCTGGAGGCTGCCCTGCAGCGGGCCAAGCAGGACAT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1101 GGCGCGGCAGCTGCGTGAGTACCAGGAGCTGATGAACGTCAAGCTGGCCC
        ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101101 GGCACGGCAGCTGCGTGAGTACCAGGAGCTGATGAACGTCAAGCTGGCCC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1151 TGGACATCGAGATCGCCACCTACAGGAAGCTGCTGGAGGGCGAGGAGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||
 101151 TGGACATCGAGATCGCCACCTACAGGAAGCTGCTGGAGGGCAAAGAGAGC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1201 CGGCTGGAGTCTGGGATGCAGAACATGAGTATTCATACGAAGACCACCAG
        |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101201 CGGCTGAAGTCTGGGATGCAGAACATGAGTATTCATACGAAGACCACCAG

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1251 CGGCTATGCAGGTGGTCTGAGCTCGGCCTATGGGGGCCTCACAAGCCCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101251 CGGCTATGCAGGTGGTCTGAGCTCGGCCTATGGGGGCCTCACAAGCCCCG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1301 GCCTCAGCTACAGCCTGGGCTCCAGCTTTGGCTCTGGCGCGGGCTCCAGC
        ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
 101301 GCCTCAGCTACGGCCTGGGCTCCAGCTTTGGCTCTGGCGCAGGCTCCAGC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1351 TCCTTCAGCCGCACCAGCTCCTCCAGGGCCGTGGTTGTGAAGAAGATCGA
        ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
 101351 TCCCTCAGCCGCACCAGTTCCTCCAGGGCCGTGGTTGTGAAGAAGATCGA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .
   1401 GACACGTGATGGGAAGCTGGTGTCTGAGTCCTCTGACGTCCTGCCCAAG
        |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||
 101401 GACATGTGATGGGAAGCTGGTGTCCGAGTCCTCTGACATCCTGCCCAAG