seq1 = pF1KB8363.tfa, 1509 bp
seq2 = pF1KB8363/gi568815583r_51110811.tfa (gi568815583r:51110811_51342912), 232102 bp

>pF1KB8363 1509
>gi568815583r:51110811_51342912 (Chr15)

(complement)

1-145  (100001-100145)   100% ->
146-296  (105904-106054)   98% ->
297-451  (114980-115134)   100% ->
452-628  (120388-120564)   99% ->
629-743  (124258-124372)   100% ->
744-858  (127096-127210)   100% ->
859-1021  (127681-127843)   100% ->
1022-1263  (130352-130593)   100% ->
1264-1509  (131857-132102)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGTTTTGGAAATGCTGAACCCGATACATTATAACATCACCAGCATCGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGTTTTGGAAATGCTGAACCCGATACATTATAACATCACCAGCATCGT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GCCTGAAGCCATGCCTGCTGCCACCATGCCAGTCCTGCTCCTCACTGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GCCTGAAGCCATGCCTGCTGCCACCATGCCAGTCCTGCTCCTCACTGGCC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TTTTTCTCTTGGTGTGGAATTATGAGGGCACATCCTCAATACCAG     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 100101 TTTTTCTCTTGGTGTGGAATTATGAGGGCACATCCTCAATACCAGGTA..

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    146     GTCCTGGCTACTGCATGGGAATTGGACCCCTCATCTCCCACGGCAG
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 .TAGGTCCTGGCTACTGCATGGGAATTGGACCCCTCATCTCCCACGGCAG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 ATTCCTGTGGATGGGGATCGGCAGTGCCTGCAACTACTACAACCGGGTGT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
 105950 ATTCCTGTGGATGGGGATCGGCAGTGCCTGCAACTACTACAACCGGGTAT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 ATGGAGAATTCATGCGAGTCTGGATCTCTGGAGAGGGAACACTCATTATC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
 106000 ATGGAGAATTCATGCGAGTCTGGATCTCTGGAGAGGAAACACTCATTATC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 AGCAA         GTCCTCAAGTATGTTCCACATAATGAAGCACAATCA
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106050 AGCAAGTG...CAGGTCCTCAAGTATGTTCCACATAATGAAGCACAATCA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 TTACAGCTCTCGATTCGGCAGCAAACTTGGGCTGCAGTGCATCGGTATGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115016 TTACAGCTCTCGATTCGGCAGCAAACTTGGGCTGCAGTGCATCGGTATGC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 ATGAGAAAGGCATCATATTTAACAACAATCCAGAGCTCTGGAAAACAACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115066 ATGAGAAAGGCATCATATTTAACAACAATCCAGAGCTCTGGAAAACAACT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 CGACCCTTCTTTATGAAAG         CTCTGTCAGGCCCCGGCCTTGT
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 115116 CGACCCTTCTTTATGAAAGGTA...CAGCTCTGTCAGGCCCCGGCCTTGT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 TCGTATGGTCACAGTCTGTGCTGAATCCCTCAAAACACATCTGGACAGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120410 TCGTATGGTCACAGTCTGTGCTGAATCCCTCAAAACACATCTGGACAGGT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 TGGAGGAGGTGACCAATGAATCGGGCTATGTGGACGTGTTGACCCTTCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120460 TGGAGGAGGTGACCAATGAATCGGGCTATGTGGACGTGTTGACCCTTCTG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 CGTCGTGTCATGCTGGACACCTCTAACACGCTCTTCTTGAGGATCTCTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
 120510 CGTCGTGTCATGCTGGACACCTCTAACACGCTCTTCTTGAGGATCCCTTT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    624 GGACG         AAAGTGCTATCGTGGTTAAAATCCAAGGTTATTTTG
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120560 GGACGGTA...CAGAAAGTGCTATCGTGGTTAAAATCCAAGGTTATTTTG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 ATGCATGGCAAGCTCTCCTCATCAAACCAGACATCTTCTTTAAGATTTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124294 ATGCATGGCAAGCTCTCCTCATCAAACCAGACATCTTCTTTAAGATTTCT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    715 TGGCTATACAAAAAGTATGAGAAGTCTGT         CAAGGATTTGAA
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 124344 TGGCTATACAAAAAGTATGAGAAGTCTGTGTA...CAGCAAGGATTTGAA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 AGATGCCATAGAAGTTCTGATAGCAGAAAAAAGACGCAGGATTTCCACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127108 AGATGCCATAGAAGTTCTGATAGCAGAAAAAAGACGCAGGATTTCCACAG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    806 AAGAGAAACTGGAAGAATGTATGGACTTTGCCACTGAGTTGATTTTAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127158 AAGAGAAACTGGAAGAATGTATGGACTTTGCCACTGAGTTGATTTTAGCA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    856 GAG         AAACGTGGTGACCTGACAAGAGAGAATGTGAACCAGTG
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127208 GAGGTA...CAGAAACGTGGTGACCTGACAAGAGAGAATGTGAACCAGTG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    897 CATATTGGAAATGCTGATCGCAGCTCCTGACACCATGTCTGTCTCTTTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127719 CATATTGGAAATGCTGATCGCAGCTCCTGACACCATGTCTGTCTCTTTGT

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    947 TCTTCATGCTATTTCTCATTGCAAAGCACCCTAATGTTGAAGAGGCAATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127769 TCTTCATGCTATTTCTCATTGCAAAGCACCCTAATGTTGAAGAGGCAATA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    997 ATAAAGGAAATCCAGACTGTTATTG         GTGAGAGAGACATAAA
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 127819 ATAAAGGAAATCCAGACTGTTATTGGTA...CAGGTGAGAGAGACATAAA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1038 GATTGATGATATACAAAAATTAAAAGTGATGGAAAACTTCATTTATGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130368 GATTGATGATATACAAAAATTAAAAGTGATGGAAAACTTCATTTATGAGA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1088 GCATGCGGTACCAGCCTGTCGTGGACTTGGTCATGCGCAAAGCCTTAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130418 GCATGCGGTACCAGCCTGTCGTGGACTTGGTCATGCGCAAAGCCTTAGAA

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1138 GATGATGTAATCGATGGCTACCCAGTGAAAAAGGGGACAAACATTATCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130468 GATGATGTAATCGATGGCTACCCAGTGAAAAAGGGGACAAACATTATCCT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1188 GAATATTGGAAGGATGCACAGACTCGAGTTTTTCCCCAAACCCAATGAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130518 GAATATTGGAAGGATGCACAGACTCGAGTTTTTCCCCAAACCCAATGAAT

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1238 TTACTCTTGAAAATTTTGCAAAGAAT         GTTCCTTATAGGTAC
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 130568 TTACTCTTGAAAATTTTGCAAAGAATGTA...TAGGTTCCTTATAGGTAC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1279 TTTCAGCCATTTGGCTTTGGGCCCCGTGGCTGTGCAGGAAAGTACATCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131872 TTTCAGCCATTTGGCTTTGGGCCCCGTGGCTGTGCAGGAAAGTACATCGC

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1329 CATGGTGATGATGAAAGCCATCCTCGTTACACTTCTGAGACGATTCCACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131922 CATGGTGATGATGAAAGCCATCCTCGTTACACTTCTGAGACGATTCCACG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1379 TGAAGACATTGCAAGGACAGTGTGTTGAGAGCATACAGAAGATACACGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131972 TGAAGACATTGCAAGGACAGTGTGTTGAGAGCATACAGAAGATACACGAC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1429 TCGTCCTTGCACCCAGATGAGACTAAAAACATGCTGGAAATGATCTTTAC
        | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132022 TTGTCCTTGCACCCAGATGAGACTAAAAACATGCTGGAAATGATCTTTAC

   1550     .    :    .    :    .    :
   1479 CCCAAGAAACTCAGACAGGTGTCTGGAACAC
        |||||||||||||||||||||||||||||||
 132072 CCCAAGAAACTCAGACAGGTGTCTGGAACAC