seq1 = pF1KB8358.tfa, 1032 bp
seq2 = pF1KB8358/gi568815581r_38635226.tfa (gi568815581r:38635226_38840402), 205177 bp

>pF1KB8358 1032
>gi568815581r:38635226_38840402 (Chr17)

(complement)

1-112  (100001-100112)   100% ->
113-209  (100721-100817)   100% ->
210-265  (101150-101205)   100% ->
266-316  (101285-101335)   100% ->
317-425  (101542-101650)   99% ->
426-480  (101808-101862)   100% ->
481-576  (101955-102050)   100% ->
577-657  (104233-104313)   100% ->
658-1032  (104803-105177)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCATCGGACTACACGGATCAAAATCACAGAGCTGAACCCCCACCTCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCATCGGACTACACGGATCAAAATCACAGAGCTGAACCCCCACCTCAT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GTGTGCCCTCTGCGGGGGGTACTTCATCGACGCCACCACTATCGTGGAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GTGTGCCCTCTGCGGGGGGTACTTCATCGACGCCACCACTATCGTGGAGT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GCCTGCATTCCT         TCTGCAAAACCTGCATCGTGCGCTACCTG
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GCCTGCATTCCTGTG...AAGTCTGCAAAACCTGCATCGTGCGCTACCTG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GAGACCAACAAATACTGCCCCATGTGTGACGTGCAGGTCCATAAAACCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100750 GAGACCAACAAATACTGCCCCATGTGTGACGTGCAGGTCCATAAAACCCG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 GCCGCTGCTGAGCATCAG         GTCTGACAAAACACTTCAAGACA
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 100800 GCCGCTGCTGAGCATCAGGTG...CAGGTCTGACAAAACACTTCAAGACA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 TTGTCTACAAATTGGTCCCTGGGCTTTTTAAAG         ATGAGATG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 101173 TTGTCTACAAATTGGTCCCTGGGCTTTTTAAAGGTA...CAGATGAGATG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    274 AAACGGCGGCGGGATTTCTATGCAGCGTACCCCCTGACGGAGG       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 101293 AAACGGCGGCGGGATTTCTATGCAGCGTACCCCCTGACGGAGGGTG...C

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    317   TCCCCAACGGCTCCAATGAGGACCGCGGCGAGGTCTTGGAGCAGGAGA
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101540 AGTCCCCAACGGCTCCAATGAGGACCGCGGCGAGGTCTTGGAGCAGGAGA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    365 AGGGGGCTCTGAGTGATGATGAGATTGTCAGCCTCGCCATCGAATTCTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
 101590 AGGGGGCTCTGAGTGATGATGAGATTGTCAGCCTCTCCATCGAATTCTAC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    415 GAAGGTGCCAG         GGACCGGGACGAGAAGAAGGGCCCCCTGGA
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 101640 GAAGGTGCCAGGCA...CAGGGACCGGGACGAGAAGAAGGGCCCCCTGGA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    456 GAATGGGGATGGGGACAAAGAGAAA         ACAGGGGTGCGCTTCC
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 101838 GAATGGGGATGGGGACAAAGAGAAAGTG...CAGACAGGGGTGCGCTTCC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    497 TGCGATGCCCAGCAGCCATGACCGTCATGCATCTTGCCAAGTTTCTCCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101971 TGCGATGCCCAGCAGCCATGACCGTCATGCATCTTGCCAAGTTTCTCCGC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    547 AACAAGATGGATGTGCCCAGCAAGTACAAG         GTGGAGGTTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 102021 AACAAGATGGATGTGCCCAGCAAGTACAAGGTG...CAGGTGGAGGTTCT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    588 GTACGAGGACGAGCCACTGAAGGAATACTACACCCTCATGGACATCGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104244 GTACGAGGACGAGCCACTGAAGGAATACTACACCCTCATGGACATCGCCT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    638 ACATCTACCCCTGGCGGCGG         AACGGGCCTCTCCCCCTCAAG
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 104294 ACATCTACCCCTGGCGGCGGGTG...CAGAACGGGCCTCTCCCCCTCAAG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    679 TACCGTGTCCAGCCAGCCTGCAAGCGGCTCACCCTAGCCACGGTGCCCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104824 TACCGTGTCCAGCCAGCCTGCAAGCGGCTCACCCTAGCCACGGTGCCCAC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    729 CCCCTCCGAGGGCACCAACACCAGCGGGGCGTCCGAGTGTGAGTCAGTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104874 CCCCTCCGAGGGCACCAACACCAGCGGGGCGTCCGAGTGTGAGTCAGTCA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    779 GCGACAAGGCTCCCAGCCCTGCCACCCTGCCAGCCACCTCCTCCTCCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104924 GCGACAAGGCTCCCAGCCCTGCCACCCTGCCAGCCACCTCCTCCTCCCTG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    829 CCCAGCCCAGCCACCCCATCCCATGGCTCTCCCAGTTCCCATGGGCCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104974 CCCAGCCCAGCCACCCCATCCCATGGCTCTCCCAGTTCCCATGGGCCTCC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    879 AGCCACCCACCCTACCTCCCCCACTCCCCCTTCGACAGCCAGTGGGGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105024 AGCCACCCACCCTACCTCCCCCACTCCCCCTTCGACAGCCAGTGGGGCCA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    929 CCACAGCTGCCAACGGGGGTAGCTTGAACTGCCTGCAGACACCATCCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105074 CCACAGCTGCCAACGGGGGTAGCTTGAACTGCCTGCAGACACCATCCTCC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    979 ACCAGCAGGGGGCGCAAGATGACTGTCAACGGCGCTCCCGTGCCCCCCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105124 ACCAGCAGGGGGCGCAAGATGACTGTCAACGGCGCTCCCGTGCCCCCCTT

   1100 
   1029 AACT
        ||||
 105174 AACT