seq1 = pF1KB8356.tfa, 1143 bp
seq2 = pF1KB8356/gi568815590r_106661040.tfa (gi568815590r:106661040_106870190), 209151 bp

>pF1KB8356 1143
>gi568815590r:106661040_106870190 (Chr8)

(complement)

1-668  (100001-100668)   100% ->
669-1143  (108677-109151)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCTCCGGGCGAAAAGGAAAGCGGGGAGGGCCCAGCCAAGAGCGCCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCTCCGGGCGAAAAGGAAAGCGGGGAGGGCCCAGCCAAGAGCGCCCT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CCGGAAGATACGCACAGCCACCCTGGTCATCAGCTTGGCCCGAGGTTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CCGGAAGATACGCACAGCCACCCTGGTCATCAGCTTGGCCCGAGGTTGGC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 AGCAGTGGGCGAATGAGAACAGCATCAGGCAGGCCCAGGAGCCTACAGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 AGCAGTGGGCGAATGAGAACAGCATCAGGCAGGCCCAGGAGCCTACAGGC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 TGGCTGCCGGGAGGGACCCAGGACTCACCTCAAGCTCCTAAACCAATCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 TGGCTGCCGGGAGGGACCCAGGACTCACCTCAAGCTCCTAAACCAATCAC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 ACCCCCTACTTCACACCAGAAAGCTCAGAGTGCCCCAAAGTCGCCACCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 ACCCCCTACTTCACACCAGAAAGCTCAGAGTGCCCCAAAGTCGCCACCCC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 GCCTGCCAGAAGGACATGGAGATGGACAAAGCTCAGAGAAAGCCCCTGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 GCCTGCCAGAAGGACATGGAGATGGACAAAGCTCAGAGAAAGCCCCTGAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 GTTTCTCACATCAAAAAGAAAGAGGTGTCCAAAACGGTGGTCAGCAAGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 GTTTCTCACATCAAAAAGAAAGAGGTGTCCAAAACGGTGGTCAGCAAGAC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 TTATGAGAGAGGAGGGGACGTGAGCCACCTCAGCCACAGGTACGAGAGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 TTATGAGAGAGGAGGGGACGTGAGCCACCTCAGCCACAGGTACGAGAGGG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 ATGCTGGTGTGCTTGAACCTGGGCAGCCAGAGAATGACATTGACAGAATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 ATGCTGGTGTGCTTGAACCTGGGCAGCCAGAGAATGACATTGACAGAATC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 CTCCACAGCCACGGCTCCCCAACGCGGAGGAGAAAATGTGCCAACCTGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 CTCCACAGCCACGGCTCCCCAACGCGGAGGAGAAAATGTGCCAACCTGGT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 GTCTGAGCTAACCAAGGGCTGGAGAGTGATGGAGCAGGAGGAGCCCACAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 GTCTGAGCTAACCAAGGGCTGGAGAGTGATGGAGCAGGAGGAGCCCACAT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 GGAGGAGTGACAGCGTAGACACAGAGGACAGCGGCTATGGAGGAGAGGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 GGAGGAGTGACAGCGTAGACACAGAGGACAGCGGCTATGGAGGAGAGGCT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 GAGGAGAGGCCCGAGCAGGATGGAGTGCAGGTGGCTGTGGTCAGGATCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 GAGGAGAGGCCCGAGCAGGATGGAGTGCAGGTGGCTGTGGTCAGGATCAA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 GCGCCCCTTGCCCTCCCA         GGTAAACAGATTTACAGAGAAAC
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 100651 GCGCCCCTTGCCCTCCCAGTA...TAGGGTAAACAGATTTACAGAGAAAC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    692 TCAACTGCAAAGCCCAACAGAAATATAGCCCAGTGGGCAACTTGAAAGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108700 TCAACTGCAAAGCCCAACAGAAATATAGCCCAGTGGGCAACTTGAAAGGG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    742 AGATGGCAGCAGTGGGCTGATGAACACATACAATCCCAGAAGCTCAATCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108750 AGATGGCAGCAGTGGGCTGATGAACACATACAATCCCAGAAGCTCAATCC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    792 TTTCAGTGAAGAGTTTGATTACGAGCTGGCCATGTCCACCCGCCTACACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108800 TTTCAGTGAAGAGTTTGATTACGAGCTGGCCATGTCCACCCGCCTACACA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    842 AAGGAGATGAGGGCTATGGCCGTCCCAAAGAAGGAACCAAAACTGCTGAA
        |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
 108850 AAGGAGATGAGGGCTATGGCCGCCCCAAAGAAGGAACCAAAACTGCTGAA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    892 AGGGCCAAGCGTGCTGAGGAGCACATCTACAGGGAAATGATGGACATGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108900 AGGGCCAAGCGTGCTGAGGAGCACATCTACAGGGAAATGATGGACATGTG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    942 CTTCATTATCTGCACAATGGCTCGCCACAGACGAGATGGCAAGATCCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108950 CTTCATTATCTGCACAATGGCTCGCCACAGACGAGATGGCAAGATCCAGG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    992 TTACTTTTGGAGATCTCTTTGACAGATACGTTCGTATTTCAGATAAAGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109000 TTACTTTTGGAGATCTCTTTGACAGATACGTTCGTATTTCAGATAAAGTA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1042 GTGGGCATTCTCATGCGTGCCAGGAAACATGGACTGGTAGACTTTGAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109050 GTGGGCATTCTCATGCGTGCCAGGAAACATGGACTGGTAGACTTTGAAGG

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1092 AGAGATGCTATGGCAAGGCCGAGATGACCATGTTGTGATTACGCTACTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109100 AGAGATGCTATGGCAAGGCCGAGATGACCATGTTGTGATTACGCTACTCA

   1150 
   1142 AG
        ||
 109150 AG