seq1 = pF1KB8347.tfa, 1134 bp
seq2 = pF1KB8347/gi568815579r_10291554.tfa (gi568815579r:10291554_10503479), 211926 bp

>pF1KB8347 1134
>gi568815579r:10291554_10503479 (Chr19)

(complement)

1-102  (100001-100102)   100% ->
103-378  (107277-107552)   99% ->
379-487  (107937-108045)   100% ->
488-603  (108137-108252)   100% ->
604-726  (108337-108459)   100% ->
727-909  (110039-110221)   100% ->
910-981  (110323-110394)   100% ->
982-1134  (111774-111926)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGTGGACTACAGCGTGTGGGACCACATTGAGGTGTCTGATGATGAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGTGGACTACAGCGTGTGGGACCACATTGAGGTGTCTGATGATGAAGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CGAGACGCACCCCAACATCGACACGGCCAGTCTCTTCCGCTGGCGGCATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CGAGACGCACCCCAACATCGACACGGCCAGTCTCTTCCGCTGGCGGCATC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 AG         GCCCGGGTGGAACGCATGGAGCAGTTCCAGAAGGAGAAG
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 AGGTA...CAGGCCCGGGTGGAACGCATGGAGCAGTTCCAGAAGGAGAAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GAGGAACTGGACAGGGGCTGCCGCGAGTGCAAGCGCAAGGTGGCCGAGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107316 GAGGAACTGGACAGGGGCTGCCGCGAGTGCAAGCGCAAGGTGGCCGAGTG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CCAGAGGAAACTGAAGGAGCTGGAGGTGGCCGAGGGCGGCAAGGCAGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107366 CCAGAGGAAACTGAAGGAGCTGGAGGTGGCCGAGGGCGGCAAGGCAGAGC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 TGGAGCGCCAGCAGGCCGAGGCACAGCAGCTGCGCAAGGAGGAGCGGAGC
        ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107416 TGGAGCGCCTGCAGGCCGAGGCACAGCAGCTGCGCAAGGAGGAGCGGAGC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 TGGGAGCAGAAGCTGGAGGAGATGCGCAAGAAGGAGAAGAGCATGCCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107466 TGGGAGCAGAAGCTGGAGGAGATGCGCAAGAAGGAGAAGAGCATGCCCTG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 GAACGTGGACACGCTCAGCAAAGACGGCTTCAGCAAG         AGCA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 107516 GAACGTGGACACGCTCAGCAAAGACGGCTTCAGCAAGGTG...CAGAGCA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 TGGTAAATACCAAGCCCGAGAAGACGGAGGAGGACTCAGAGGAGGTGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107941 TGGTAAATACCAAGCCCGAGAAGACGGAGGAGGACTCAGAGGAGGTGAGG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 GAGCAGAAACACAAGACCTTCGTGGAAAAATACGAGAAACAGATCAAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107991 GAGCAGAAACACAAGACCTTCGTGGAAAAATACGAGAAACAGATCAAGCA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 CTTTG         GCATGCTTCGCCGCTGGGATGACAGCCAAAAGTACC
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108041 CTTTGGTG...CAGGCATGCTTCGCCGCTGGGATGACAGCCAAAAGTACC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 TGTCAGACAACGTCCACCTGGTGTGCGAGGAGACAGCCAATTACCTGGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108173 TGTCAGACAACGTCCACCTGGTGTGCGAGGAGACAGCCAATTACCTGGTC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 ATTTGGTGCATTGACCTAGAGGTGGAGGAG         AAATGTGCACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 108223 ATTTGGTGCATTGACCTAGAGGTGGAGGAGGTG...CAGAAATGTGCACT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 CATGGAGCAGGTGGCCCACCAGACAATCGTCATGCAATTTATCCTGGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108348 CATGGAGCAGGTGGCCCACCAGACAATCGTCATGCAATTTATCCTGGAGC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 TGGCCAAGAGCCTAAAGGTGGACCCCCGGGCCTGCTTCCGGCAGTTCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108398 TGGCCAAGAGCCTAAAGGTGGACCCCCGGGCCTGCTTCCGGCAGTTCTTC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    715 ACTAAGATTAAG         ACAGCCGATCGCCAGTACATGGAGGGCTT
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 108448 ACTAAGATTAAGGTA...TAGACAGCCGATCGCCAGTACATGGAGGGCTT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 CAACGACGAGCTGGAAGCCTTCAAGGAGCGTGTGCGGGGCCGTGCCAAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110068 CAACGACGAGCTGGAAGCCTTCAAGGAGCGTGTGCGGGGCCGTGCCAAGC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    806 TGCGCATCGAGAAGGCCATGAAGGAGTACGAGGAGGAGGAGCGCAAGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110118 TGCGCATCGAGAAGGCCATGAAGGAGTACGAGGAGGAGGAGCGCAAGAAG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    856 CGGCTCGGCCCCGGCGGCCTGGACCCCGTCGAGGTCTACGAGTCCCTCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110168 CGGCTCGGCCCCGGCGGCCTGGACCCCGTCGAGGTCTACGAGTCCCTCCC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    906 TGAG         GAACTCCAGAAGTGCTTCGATGTGAAGGACGTGCAGA
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110218 TGAGGTG...CAGGAACTCCAGAAGTGCTTCGATGTGAAGGACGTGCAGA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    947 TGCTGCAGGACGCCATCAGCAAGATGGACCCCACC         GACGCA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 110360 TGCTGCAGGACGCCATCAGCAAGATGGACCCCACCGTG...CAGGACGCA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    988 AAGTACCACATGCAGCGCTGCATTGACCCTGGCCTCTGGGTCCCCAACTC
        ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
 111780 AAGTACCACATGCAGCGCTGCATTGACTCTGGCCTCTGGGTCCCCAACTC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1038 TAAGGCCAGCGAGGCCAAGGAGGGAGAGGAGGCAGGTCCTGGGGACCCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111830 TAAGGCCAGCGAGGCCAAGGAGGGAGAGGAGGCAGGTCCTGGGGACCCAT

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .
   1088 TACTGGAAGCTGTTCCCAAGACGGGCGATGAGAAGGATGTCAGTGTG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111880 TACTGGAAGCTGTTCCCAAGACGGGCGATGAGAAGGATGTCAGTGTG