seq1 = pF1KB8338.tfa, 816 bp
seq2 = pF1KB8338/gi568815591r_27063606.tfa (gi568815591r:27063606_27265457), 201852 bp

>pF1KB8338 816
>gi568815591r:27063606_27265457 (Chr7)

(complement)

1-580  (100001-100580)   100% ->
581-816  (101617-101852)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCCACCACTGGGGCCCTGGGCAACTACTACGTGGACTCGTTCCTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCCACCACTGGGGCCCTGGGCAACTACTACGTGGACTCGTTCCTGCT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGGCGCCGACGCCGCGGATGAGCTGAGCGTTGGCCGCTATGCGCCGGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GGGCGCCGACGCCGCGGATGAGCTGAGCGTTGGCCGCTATGCGCCGGGGA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CCCTGGGCCAGCCTCCCCGGCAGGCGGCGACGCTGGCCGAGCACCCCGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CCCTGGGCCAGCCTCCCCGGCAGGCGGCGACGCTGGCCGAGCACCCCGAC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 TTCAGCCCGTGCAGCTTCCAGTCCAAGGCGACGGTGTTTGGCGCCTCGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 TTCAGCCCGTGCAGCTTCCAGTCCAAGGCGACGGTGTTTGGCGCCTCGTG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GAACCCAGTGCACGCGGCGGGCGCCAACGCTGTACCCGCTGCGGTGTACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 GAACCCAGTGCACGCGGCGGGCGCCAACGCTGTACCCGCTGCGGTGTACC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 ACCACCATCACCACCACCCCTACGTGCACCCCCAGGCGCCCGTGGCGGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 ACCACCATCACCACCACCCCTACGTGCACCCCCAGGCGCCCGTGGCGGCG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 GCGGCGCCGGACGGCAGGTACATGCGCTCCTGGCTGGAGCCCACGCCCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 GCGGCGCCGGACGGCAGGTACATGCGCTCCTGGCTGGAGCCCACGCCCGG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 TGCGCTCTCCTTCGCGGGCTTGCCCTCCAGCCGGCCTTATGGCATTAAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 TGCGCTCTCCTTCGCGGGCTTGCCCTCCAGCCGGCCTTATGGCATTAAAC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 CTGAACCGCTGTCGGCCAGAAGGGGTGACTGTCCCACGCTTGACACTCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 CTGAACCGCTGTCGGCCAGAAGGGGTGACTGTCCCACGCTTGACACTCAC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 ACTTTGTCCCTGACTGACTATGCTTGTGGTTCTCCTCCAGTTGATAGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 ACTTTGTCCCTGACTGACTATGCTTGTGGTTCTCCTCCAGTTGATAGAGA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 AAAACAACCCAGCGAAGGCGCCTTCTCTGAAAACAATGCTGAGAATGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 AAAACAACCCAGCGAAGGCGCCTTCTCTGAAAACAATGCTGAGAATGAGA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 GCGGCGGAGACAAGCCCCCCATCGATCCCA         ATAACCCAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 100551 GCGGCGGAGACAAGCCCCCCATCGATCCCAGTA...CAGATAACCCAGCA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    592 GCCAACTGGCTTCATGCGCGCTCCACTCGGAAAAAGCGGTGCCCCTATAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101628 GCCAACTGGCTTCATGCGCGCTCCACTCGGAAAAAGCGGTGCCCCTATAC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    642 AAAACACCAGACCCTGGAACTGGAGAAAGAGTTTCTGTTCAACATGTACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101678 AAAACACCAGACCCTGGAACTGGAGAAAGAGTTTCTGTTCAACATGTACC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    692 TCACCAGGGACCGCAGGTACGAGGTGGCTCGACTGCTCAACCTCACCGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101728 TCACCAGGGACCGCAGGTACGAGGTGGCTCGACTGCTCAACCTCACCGAG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    742 AGGCAGGTCAAGATCTGGTTCCAGAACCGCAGGATGAAAATGAAGAAAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101778 AGGCAGGTCAAGATCTGGTTCCAGAACCGCAGGATGAAAATGAAGAAAAT

    800     .    :    .    :    .
    792 CAACAAAGACCGAGCAAAAGACGAG
        |||||||||||||||||||||||||
 101828 CAACAAAGACCGAGCAAAAGACGAG