seq1 = pF1KB8337.tfa, 1617 bp
seq2 = pF1KB8337/gi568815590r_144673269.tfa (gi568815590r:144673269_144878168), 204900 bp

>pF1KB8337 1617
>gi568815590r:144673269_144878168 (Chr8)

(complement)

1-33  (99698-99730)   100% ->
34-160  (100005-100131)   100% ->
161-280  (100592-100711)   100% ->
281-1617  (103564-104900)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCGGCCTTGTTCCTGTCTGCCCCACCCCAG         GCCGAGGT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
  99698 ATGGCGGCCTTGTTCCTGTCTGCCCCACCCCAGGTG...CAGGCCGAGGT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     42 GACCTTCGAGGACGTGGCTGTGTACCTCTCCCGGGAGGAATGGGGCCGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100013 GACCTTCGAGGACGTGGCTGTGTACCTCTCCCGGGAGGAATGGGGCCGCC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 TGGGCCCTGCTCAGAGGGGCCTCTACAGGGACGTGATGCTGGAGACCTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100063 TGGGCCCTGCTCAGAGGGGCCTCTACAGGGACGTGATGCTGGAGACCTAC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GGGAACCTAGTCTCACTGG         GAGTAGGACCTGCAGGCCCCAA
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 100113 GGGAACCTAGTCTCACTGGGTA...CAGGAGTAGGACCTGCAGGCCCCAA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 GCCTGGAGTGATCTCGCAGTTGGAGCGAGGGGATGAGCCCTGGGTCCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100614 GCCTGGAGTGATCTCGCAGTTGGAGCGAGGGGATGAGCCCTGGGTCCTGG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 ATGTTCAGGGCACCTCTGGGAAAGAGCACCTGAGAGTCAACAGCCCAG  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 100664 ATGTTCAGGGCACCTCTGGGAAAGAGCACCTGAGAGTCAACAGCCCAGGT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    281        CTCTTGGGACCAGAACTGAGTACAAGGAGTTGACTTCACAGGA
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100714 G...CAGCTCTTGGGACCAGAACTGAGTACAAGGAGTTGACTTCACAGGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 GACATTTGGTGAGGAAGATCCCCAGGGATCTGAGCCAGTAGAAGCCTGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103607 GACATTTGGTGAGGAAGATCCCCAGGGATCTGAGCCAGTAGAAGCCTGTG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 ACCACATCAGTAAGTCAGAGGGGAGCCTGGAAAAGCTAGTGGAGCAGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103657 ACCACATCAGTAAGTCAGAGGGGAGCCTGGAAAAGCTAGTGGAGCAGAGA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 GGCCCCAGGGCAGTCACACTGACCAACGGGGAGAGCAGCAGGGAGTCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103707 GGCCCCAGGGCAGTCACACTGACCAACGGGGAGAGCAGCAGGGAGTCTGG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 GGGAAACCTCAGGTTGCTGTCAAGACCTGTTCCTGATCAGAGACCTCACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103757 GGGAAACCTCAGGTTGCTGTCAAGACCTGTTCCTGATCAGAGACCTCACA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 AATGTGATATATGTGAGCAAAGTTTTGAACAGAGATCATATCTCAACAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103807 AATGTGATATATGTGAGCAAAGTTTTGAACAGAGATCATATCTCAACAAC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 CATAAGCGTGTACACAGGTCAAAAAAAACAAATACAGTTCGTAACTCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103857 CATAAGCGTGTACACAGGTCAAAAAAAACAAATACAGTTCGTAACTCTGG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    624 GGAAATCTTCAGTGCAAACTTAGTTGTTAAAGAAGATCAGAAAATTCCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103907 GGAAATCTTCAGTGCAAACTTAGTTGTTAAAGAAGATCAGAAAATTCCTA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    674 CTGGGAAAAAATTGCATTATTGCAGTTACTGTGGGAAAACATTCAGGTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103957 CTGGGAAAAAATTGCATTATTGCAGTTACTGTGGGAAAACATTCAGGTAC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    724 AGTGCCAACCTTGTCAAGCATCAGCGGCTTCACACTGAAGAGAAGCCCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104007 AGTGCCAACCTTGTCAAGCATCAGCGGCTTCACACTGAAGAGAAGCCCTA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    774 CAAATGTGATGAGTGTGGGAAAGCCTTCAGCCAGAGCTGCGAGTTCATCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104057 CAAATGTGATGAGTGTGGGAAAGCCTTCAGCCAGAGCTGCGAGTTCATCA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    824 ATCACCGAAGGATGCACTCAGGAGAGATTCCCTACCGGTGTGACGAGTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104107 ATCACCGAAGGATGCACTCAGGAGAGATTCCCTACCGGTGTGACGAGTGT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    874 GGGAAGACATTCACCCGGAGGCCCAACCTCATGAAGCACCAGAGGATTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104157 GGGAAGACATTCACCCGGAGGCCCAACCTCATGAAGCACCAGAGGATTCA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    924 CACTGGGGAGAAACCCTACAAGTGTGGGGAGTGTGGGAAGCACTTTAGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104207 CACTGGGGAGAAACCCTACAAGTGTGGGGAGTGTGGGAAGCACTTTAGCG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    974 CCTACTCTTCCCTGATTTATCACCAGAGAATCCACACCGGAGAGAAACCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104257 CCTACTCTTCCCTGATTTATCACCAGAGAATCCACACCGGAGAGAAACCC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1024 TATAAATGTAATGACTGCGGGAAAGCCTTCAGTGATGGCTCAATCCTTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104307 TATAAATGTAATGACTGCGGGAAAGCCTTCAGTGATGGCTCAATCCTTAT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1074 CCGACATCGTCGGACTCACACCGGAGAGAAGCCATTTGAGTGCAAGGAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104357 CCGACATCGTCGGACTCACACCGGAGAGAAGCCATTTGAGTGCAAGGAAT

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1124 GTGGCAAAGGCTTTACACAAAGTTCTAACCTTATCCAACATCAGAGAATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104407 GTGGCAAAGGCTTTACACAAAGTTCTAACCTTATCCAACATCAGAGAATT

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1174 CACACTGGAGAGAAACCCTATAAATGTAATGAATGTGAGAAAGCTTTCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104457 CACACTGGAGAGAAACCCTATAAATGTAATGAATGTGAGAAAGCTTTCAT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1224 TCAAAAAACCAAACTCGTGGAACATCAGAGAAGCCACACTGGAGAGAAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104507 TCAAAAAACCAAACTCGTGGAACATCAGAGAAGCCACACTGGAGAGAAGC

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1274 CCTATGAATGCAATGACTGTGGCAAAGTTTTCAGCCAAAGCACACACCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104557 CCTATGAATGCAATGACTGTGGCAAAGTTTTCAGCCAAAGCACACACCTC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1324 ATCCAGCACCAGAGAATCCACACAGGAGAGAAGCCCTACAAGTGCAGCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104607 ATCCAGCACCAGAGAATCCACACAGGAGAGAAGCCCTACAAGTGCAGCGA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1374 GTGTGGGAAGGCCTTCCACAACAGTTCCAGACTCATCCACCACCAGAGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104657 GTGTGGGAAGGCCTTCCACAACAGTTCCAGACTCATCCACCACCAGAGGC

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1424 TGCACCACGGAGAGAAACCCTACAGATGCAGCGATTGCAAGAAAGCCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104707 TGCACCACGGAGAGAAACCCTACAGATGCAGCGATTGCAAGAAAGCCTTC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1474 AGCCAGAGCACGTACTTGATTCAGCACCGGAGGATCCACACCGGGGAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104757 AGCCAGAGCACGTACTTGATTCAGCACCGGAGGATCCACACCGGGGAGAA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1524 GCCCTACAAGTGCAGCGAGTGTGGGAAGGCCTTCCGGCACAGTTCCAACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104807 GCCCTACAAGTGCAGCGAGTGTGGGAAGGCCTTCCGGCACAGTTCCAACA

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :
   1574 TGTGTCAGCATCAGCGGATTCACCTCCGGGAGGACTTCTCCATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104857 TGTGTCAGCATCAGCGGATTCACCTCCGGGAGGACTTCTCCATG