seq1 = pF1KB8329.tfa, 645 bp
seq2 = pF1KB8329/gi568815586f_55886961.tfa (gi568815586f:55886961_56092209), 205249 bp

>pF1KB8329 645
>gi568815586f:55886961_56092209 (Chr12)

1-163  (100001-100163)   100% ->
164-315  (102987-103138)   100% ->
316-438  (103722-103844)   100% ->
439-532  (104400-104493)   100% ->
533-645  (105137-105249)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGACTAGCAGAAGCACAGCTAGGCCCAATGGGCAACCCCAGGCCAGCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGACTAGCAGAAGCACAGCTAGGCCCAATGGGCAACCCCAGGCCAGCAA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 AATTTGCCAGTTCAAATTGGTCCTGCTGGGAGAATCTGCAGTGGGAAAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 AATTTGCCAGTTCAAATTGGTCCTGCTGGGAGAATCTGCAGTGGGAAAGT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CAAGCCTGGTATTACGTTTTGTCAAAGGGCAGTTCCATGAGTACCAGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CAAGCCTGGTATTACGTTTTGTCAAAGGGCAGTTCCATGAGTACCAGGAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 AGCACCATTGGAG         CGGCCTTCCTCACCCAGTCCGTTTGTCT
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 100151 AGCACCATTGGAGGTG...TAGCGGCCTTCCTCACCCAGTCCGTTTGTCT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 AGATGACACAACAGTGAAGTTTGAGATCTGGGACACAGCTGGGCAGGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103015 AGATGACACAACAGTGAAGTTTGAGATCTGGGACACAGCTGGGCAGGAGC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 GATATCACAGCTTAGCCCCCATGTACTACAGGGGTGCCCAAGCTGCAATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103065 GATATCACAGCTTAGCCCCCATGTACTACAGGGGTGCCCAAGCTGCAATC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 GTGGTTTACGACATTACTAATCAG         GAAACCTTTGCCCGAGC
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 103115 GTGGTTTACGACATTACTAATCAGGTA...TAGGAAACCTTTGCCCGAGC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 AAAGACATGGGTGAAGGAACTACAGCGACAGGCCAGTCCTAGCATCGTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103739 AAAGACATGGGTGAAGGAACTACAGCGACAGGCCAGTCCTAGCATCGTTA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 TTGCCCTGGCAGGGAACAAAGCTGACCTGGCCAACAAACGTATGGTGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103789 TTGCCCTGGCAGGGAACAAAGCTGACCTGGCCAACAAACGTATGGTGGAG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 TATGAA         GAGGCCCAGGCATATGCAGATGACAACAGCTTATT
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103839 TATGAAGTA...CAGGAGGCCCAGGCATATGCAGATGACAACAGCTTATT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 GTTCATGGAGACTTCAGCCAAGACAGCTATGAACGTGAATGATCTCTTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104435 GTTCATGGAGACTTCAGCCAAGACAGCTATGAACGTGAATGATCTCTTCC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 TGGCAATAG         CTAAGAAGTTGCCAAAGAGTGAACCCCAGAAT
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 104485 TGGCAATAGGTA...TAGCTAAGAAGTTGCCAAAGAGTGAACCCCAGAAT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 CTGGGAGGTGCGGCAGGCCGAAGCCGGGGTGTGGATCTCCATGAACAGTC
        ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105169 CTGGGAGGTGCAGCAGGCCGAAGCCGGGGTGTGGATCTCCATGAACAGTC

    650     .    :    .    :    .    :
    615 CCAGCAGAACAAGAGCCAGTGTTGTAGCAAC
        |||||||||||||||||||||||||||||||
 105219 CCAGCAGAACAAGAGCCAGTGTTGTAGCAAC